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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
Data corrente: |
05/12/2011 |
Data da última atualização: |
11/04/2018 |
Autoria: |
ALVARENGA, S. M.; CAIXETA, E. T.; HUFNAGEL, B.; THIEBAUT, F.; MACIEL-ZAMBOLIM, E.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S. |
Afiliação: |
Samuel Mazzinghy Alvarenga, Universidade Federal de Viçosa - UFV/Instituto de Biotecnologia Aplicada à Agropecuária; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA, CNPCa; Bárbara Hufnagel, Universidade Federal de Viçosa - UFV/Instituto de Biotecnologia Aplicada à Agropecuária; Flávia Thiebaut, Universidade Federal de Viçosa - UFV/Instituto de Biotecnologia Aplicada à Agropecuária; Eunize Maciel?Zambolim, UFV/Departamento de Fitopatologia; Laércio Zambolim, UFV/Departamento de Fitopatologia; Ney Sussumu Sakiyama, UFV/Departamento de Fitotecnia. |
Título: |
Marcadores moleculares derivados de sequências expressas do genoma café potencialmente envolvidas na resistência à ferrugem. |
Ano de publicação: |
2011 |
Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 8, p. 890-898, ago. 2011. |
Idioma: |
Português |
Notas: |
Título em inglês: Molecular markers from coffee genome expressed sequences potentially involved in resistance to rust. |
Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi identificar marcadores moleculares relacionados à resistência do cafeeiro (Coffea arabica) à ferrugem (Hemileia vastatrix). Foram identificadas sequências de DNA potencialmente envolvidas na resistência do cafeeiro a doenças, por meio de análise "in silico", a partir das informações geradas pelo Projeto Brasileiro do Genoma Café. A partir das sequências mineradas, foram desenhados 59 pares de iniciadores para amplificá-las. Os 59 iniciadores foram testados em 12 cafeeiros resistentes e 12 susceptíveis a H. vastatrix. Vinte e sete iniciadores resultaram em bandas únicas e bem definidas, enquanto um deles amplificou fragmento de DNA em todos os cafeeiros resistentes, mas não nos suscetíveis. Esse marcador molecular polimórfico amplificou uma região do DNA que corresponde a uma janela aberta de leitura parcial do genoma de C. arabica que codifica uma proteína de resistência a doenças. O marcador CARF 005 é capaz de diferenciar os cafeeiros analisados em resistentes e susceptíveis a H. vastatrix. |
Palavras-Chave: |
Bioinformática; Data mining; EST-PCR; EST?PCR; Gene de resistência; Mineração de dados; Resistance genes. |
Thesagro: |
Coffea Arábica; Hemileia Vastatrix. |
Thesaurus Nal: |
Bioinformatics. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/49140/1/46n08a15.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
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