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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia. |
Data corrente: |
10/12/2021 |
Data da última atualização: |
10/12/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SANTOS, A. dos; RODRIGUES, E. V.; LAVIOLA, B. G.; TEODORO, L. P. R.; TEODORO, P. E.; BHERING, L. L. |
Afiliação: |
ADRIANO DOS SANTOS, A&E Statistical Analysis and Consulting; ERINA VITÓRIO RODRIGUES, Universidade de Brasília; BRUNO GALVEAS LAVIOLA, CNPAE; LARISSA PEREIRA RIBEIRO TEODORO, Universidade Federal do Mato Grosso do Sul; PAULO EDUARDO TEODORO, Universidade Federal do Mato Grosso do Sul; LEONARDO LOPES BHERING, Universidade Federal de Viçosa. |
Título: |
Increasing selection gain and accuracy of harvest prediction models in Jatropha through genome-wide selection. |
Ano de publicação: |
2021 |
Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 11, 13583, 2021. |
Páginas: |
9 p. |
DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41598-021-93022-0 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Abstract: Genome-wide selection (GWS) has been becoming an essential tool in the genetic breeding of long-life species, as it increases the gain per time unit. This study had a hypothesis that GWS is a tool that can decrease the breeding cycle in Jatropha. Our objective was to compare GWS with phenotypic selection in terms of accuracy and efficiency over three harvests. Models were developed throughout the harvests to evaluate their applicability in predicting genetic values in later harvests. For this purpose, 386 individuals of the breeding population obtained from crossings between 42 parents were evaluated. The population was evaluated in random block design, with six replicates over three harvests. The genetic effects of markers were predicted in the population using 811 SNP's markers with call rate = 95% and minor allele frequency (MAF) > 4%. GWS enables gains of 108 to 346% over the phenotypic selection, with a 50% reduction in the selection cycle. This technique has potential for the Jatropha breeding since it allows the accurate obtaining of GEBV and higher efficiency compared to the phenotypic selection by reducing the time necessary to complete the selection cycle. In order to apply GWS in the first harvests, a large number of individuals in the breeding population are needed. In the case of few individuals in the population, it is recommended to perform a larger number of harvests. |
Palavras-Chave: |
Genome-wide selection. |
Thesaurus Nal: |
Accuracy; Breeding and Genetic Improvement; Genome; Jatropha. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/228886/1/Increasing-selection-gain-and-accuracy-2021.pdf
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Marc: |
LEADER 02244naa a2200265 a 4500 001 2137473 005 2021-12-10 008 2021 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1038/s41598-021-93022-0$2DOI 100 1 $aSANTOS, A. dos 245 $aIncreasing selection gain and accuracy of harvest prediction models in Jatropha through genome-wide selection.$h[electronic resource] 260 $c2021 300 $a9 p. 520 $aAbstract: Genome-wide selection (GWS) has been becoming an essential tool in the genetic breeding of long-life species, as it increases the gain per time unit. This study had a hypothesis that GWS is a tool that can decrease the breeding cycle in Jatropha. Our objective was to compare GWS with phenotypic selection in terms of accuracy and efficiency over three harvests. Models were developed throughout the harvests to evaluate their applicability in predicting genetic values in later harvests. For this purpose, 386 individuals of the breeding population obtained from crossings between 42 parents were evaluated. The population was evaluated in random block design, with six replicates over three harvests. The genetic effects of markers were predicted in the population using 811 SNP's markers with call rate = 95% and minor allele frequency (MAF) > 4%. GWS enables gains of 108 to 346% over the phenotypic selection, with a 50% reduction in the selection cycle. This technique has potential for the Jatropha breeding since it allows the accurate obtaining of GEBV and higher efficiency compared to the phenotypic selection by reducing the time necessary to complete the selection cycle. In order to apply GWS in the first harvests, a large number of individuals in the breeding population are needed. In the case of few individuals in the population, it is recommended to perform a larger number of harvests. 650 $aAccuracy 650 $aBreeding and Genetic Improvement 650 $aGenome 650 $aJatropha 653 $aGenome-wide selection 700 1 $aRODRIGUES, E. V. 700 1 $aLAVIOLA, B. G. 700 1 $aTEODORO, L. P. R. 700 1 $aTEODORO, P. E. 700 1 $aBHERING, L. L. 773 $tScientific Reports$gv. 11, 13583, 2021.
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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22. | | GIUSTINA, L. D.; BALDONI, A. B.; GREGOLIN, F. S.; TARDIN, F. D.; TONINI, H.; TEODORO, P. E.; NEVES, L. G. Agrupamento de progênies de diferentes matrizes de castanheira-do-Brasil quanto a germinação e desenvolvimento inicial. Revista Científica Intelletto, Venda Nova do Imigrante, ES, v. 2, n. 2, p. 35-44, 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril; Embrapa Milho e Sorgo. |
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23. | | TORRES, F. E.; TEODORO, P. E.; CARGNELUTTI FILHO, A.; SANTOS, A. dos; ROCHA, M. de M.; SAGRILO, E. Adaptability and phenotypic stability of semi-prostate cowpea genotypes in Mato Grosso do Sul. Bioscience Journal, Uberlândia, v. 32, n. 6, p. 1435-1441, Nov./Dec. 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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24. | | ABREU, H. K. A. de; CECCON, G.; CORREA, A. M.; FACHINELLI, R.; YAMAMOTO, E. L. M.; TEODORO, P. E. Adaptability and stability of cowpea genotypes via REML/BLUP and GGE BIPLOT. Bioscience Journal, v. 35, n. 4, p. 1071-1082, 2019.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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26. | | TEODORO, P. E.; SILVA, K. J. da; ZANATTO, I. B.; SPONCHIADO, S.; MENEZES, C. B. de; TARDIN, F. D. Correlações canônicas na identificação de caracteres relacionados à precocidade e produtividade em híbridos de sorgo granífero. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 31., 2016, Bento Gonçalves. Milho e sorgo: inovações, mercados e segurança alimentar: anais. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2016.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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27. | | COSTA, A. F.; TEODORO, P. E.; BHERING, L. L.; LEAL, N. R.; TARDIN, F. D.; DAHER, R. F. Biplot analysis of strawberry genotypes recommended for the State of Espírito Santo. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 15, n. 3, p. 1-9, 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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28. | | RIBEIRO, L. P.; TARDIN, F. D.; MENEZES, C. B. de; BALDONI, A. B.; TEODORO, P. E.; BHERING, L. L. Combining yield, earliness and plant height in a single genotype: a proposal for breeding in grain sorghum (Sorghum bicolor L.). Revista de la Facultad de Ciencias Agrarias UNCuyo, v. 53, n. 1, p. 11-21, 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril; Embrapa Milho e Sorgo. |
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30. | | SANTOS, A. dos; CECCON, G.; RODRIGUES, E. V.; RIBEIRO, L. P.; CASTRO, K. S.; TEODORO, P. E. Genetic divergence between sweet sorghum genotypes by the WARD-MLM procedure. Bioscience Journal, v. 34, n. 5, p. 1326-1333 , Sept./Oct. 2018.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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31. | | TEODORO, P. E.; BARROSO, L. M. A.; NASCIMENTO, M.; TORRES, F. E.; SAGRILO, E.; SANTOS, A. dos; RIBEIRO, L. P. Redes neurais artificiais para identificar genótipos de feijão-caupi semiprostrado com alta adaptabilidade e estabilidade fenotípicas. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 50, n. 11, p. 1054-1060, nov. 2015.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte; Embrapa Unidades Centrais. |
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32. | | SILVA, K. J. da; TEODORO, P. E.; ZANATTO, I. B.; SPONCHIADO, S.; MENEZES, C. B. de; TARDIN, F. D. Predição de ganhos genéticos em híbridos de sorgo granífero. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 31., 2016, Bento Gonçalves. Milho e sorgo: inovações, mercados e segurança alimentar: anais. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2016.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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33. | | CARVALHO, L. P. de; FARIAS, F. J. C.; RODRIGUES, J. I. da S.; SUASSUNA, N. D.; TEODORO, P. E. Diversidade de acessos exóticos de algodão quanto a caracteres qualitativos e quantitativos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 11., 2017, Maceió. Resumos... Inovação e rentabilidade na cotonicultura: resumos... Brasília, DF: Associação Brasileira dos Produtores de Algodão - Abrapa, 2017.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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37. | | SPONCHIADO, S.; TARDIN, F. D.; FERREIRA, L. U.; MENEZES, C. B. de; BALDONI, A. B.; TEODORO, P. E. Seleção de híbridos de sorgo mais produtivos com o uso de modelos mistos em Sinop, MT. In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 6., 2017, Sinop, MT. Resumos... Sinop, MT: Embrapa Agrossilpastoril, 2017. p. 38-40.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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38. | | SPONCHIADO, S.; TARDIN, F. D.; FERREIRA, L. U.; MENEZES, C. B. de; BALDONI, A. B.; TEODORO, P. E. Seleção de híbridos de sorgo mais produtivos com o uso de modelos mistos em Sinop, MT. In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 6., 2017, Sinop, MT. Resumos... Sinop, MT: Embrapa Agrossilpastoril, 2017. p. 38-40.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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39. | | RODRIGUES, E. V.; LAVIOLA, B. G.; FALCAO, R.; TEODORO, P. E.; MARANA, J. C.; ALVES, A. A. Seleção de famílias e genitores de Jatropha curcas L. para produção de grãos via modelos mistos. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 3., 2016, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 56-62.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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40. | | SPONCHIADO, S.; TARDIN, F. D.; FERREIRA, L. U.; MENEZES, C. B. de; BALDONI, A. B.; TEODORO, P. E. Seleção de parentais para geração de híbridos de sorgo mais produtivos com o uso de modelos mistos em Sete Lagoas, MG. In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 6., 2017, Sinop, MT. Resumos... Sinop, MT: Embrapa Agrossilpastoril, 2017. p. 34-37.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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