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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
12/02/2008 |
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Data da última atualização: |
24/07/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BOASCARIOL-CAMARGO, R. L.; BERGER, I. J.; SOUZA, A. A.; AMARAL, A. M. do; CARLOS, E. F.; FREITAS-ÁSTUA, J.; TAKITA, M. A.; TARGON, M. L. P. N.; MEDINA, C. L.; REIS, M. S.; MACHADO, M. A. |
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Afiliação: |
Raquel L. Boscariol-Camargo, APTA; Irving J. Berger, APTA; Alessandra A. Souza, APTA; Alexandre M. do Amaral, CENARGEN; Eduardo F. Carlos, APTA; Juliana Freitas-Astúa, CNPMF; Marco A. Takita, APTA; Maria Luisa P.N. Targon, APTA; Camilo L. Medina, Grupo de Consultores em Citros; Marcelo S. Reis, APTA; Marcos A. Machado, APTA. |
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Título: |
In silico analysis of ESTs from roots of Rangpur lime (Citrus limonia Osbeck) under water stress. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 30, n. 3, p. 906-916, 2007. |
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ISSN: |
1415-4757 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
CitEST project resulted in the construction of cDNA libraries from different Citrus sp. tissues under various physiological conditions. Among them, plantlets of Rangpur lime were exposed to hydroponic conditions with and without water stress using PEG6000. RNA from roots was obtained and generated a total of 4,130 valid cDNA reads, with 2,020 from the non-stressed condition and 2,110 from the stressed set. Bioinformatic analyses measured the frequency of each read in the libraries and yielded an in silico transcriptional profile for each condition. A total of 40 contigs were differentially expressed and allowed to detect up-regulated homologue sequences to well known genes involved in stress response, such as aquaporins, dehydrin, sucrose synthase, and proline-related synthase. Some sequences could not be classified by using FunCat and remained with an unknown function. A large number of sequences presented high similarities to annotated genes involved with cell energy, protein synthesis and cellular transport, suggesting that Rangpur lime may sustain active cell growth under stressed condition. The presence of membrane transporters and cell signaling components could be an indication of a coordinated morphological adaptation and biochemical response during drought, helping to explain the higher tolerance of this rootstock to water stress. |
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Palavras-Chave: |
Molecular response; Rootstock; Transcription. |
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Thesaurus Nal: |
drought; expressed sequence tags. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Registro |
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Status |
URL |
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| Registros recuperados : 26 | |
| 1. |  | EIRAS, M.; TARGON, M. L. P. N.; FAJARDO, T. V. M.; FLORES, R.; KITAJIMA, E. W. Citrus exocortis viroid and Hop stunt viroid doubly infecting grapevines in Brazil. Fitopatologia Brasileira, Brasília, v. 31, n. 5, p. 440-446, 2006.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 3. | | EIRAS, M.; SILVA, S. R.; STUCHI, E. S.; TARGON, M. L. P. N.; CARVALHO, S. A. Viroides em citros. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 34, n. 5, p. 275-296, set./oct. 2009. Revisão| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 5. | | CRISTOFANI, M.; SOUZA, A. A.; KISHI, L.; TAKITA, M. A.; TARGON, M. L. P. N.; MACHADO, M. A. Genes diferencialmente expressos em híbridos de Citrus sunki vs Poncirus trifoliata resistentes ao Citrus tristeza virus detectados por hibridização subtrativa. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 29, p. S223, ago. 2004. Edição dos Resumos do XXXVII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Gramado, RS, ago. 2004.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 6. | | SILVA, S. R.; MARTINS, A. B. G.; STUCHI, E. S.; CARVALHO, S. A.; TARGON, M. L. P. N.; FRANCO, D. Sanitary characterization of "quebra-galho" tahiti acid lime and selection of candidate mother trees. In: CONFERENCE OF THE INTERNATIONAL ORGANIZATION OF CITRUS VIROLOGISTS, 17., 2007, Adana. Program [and] abstracts... Adana: IOCV, 2007. p. 182.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 7. | | BERGER, I. J.; FREITAS-ÁSTUA, J.; REIS, M. S.; TARGON, M. L. P. N.; MACHADO, M. A. In silico prediction of gene expression patterns in Citrus flavedo. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 30, n. 3, p. 752-760, 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 8. | | COLETTA-FILHO, H. D.; CARLOS, E. F.; TAKITA, M. A.; TARGON, M. L. P. N.; ALVES, K. C. S.; AMARAL, A. M. do; MACHADO, M. A. Effective detection and genome sequencing approaches of candidatus Liberibacter sp. causing Huanglongbing (HLB) in São Paulo, Brazil. In: INTERNATIONAL CITRUS CANKER AND HUANGLONGBING RESEARCH WORKSHOP, 2., 2005, Orlando. Proceedings... Orlando: Florida Citrus Mutual, 2005. p. 79| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 9. | | FREITAS-ÁSTUA, J.; BASTIANEL, M.; LOCALI-FABRIS, E. C.; NOVELLI, V. M.; SILVA-PINHATI, A. C.; BASÍLIO-PALMIERI, A. C.; TARGON, M. L. P. N.; MACHADO, M. A. Differentially expressed stress-related genes in the compatible citrus-Citrus leprosis virus interaction. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 30, n. 3, p. 980-990, 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 10. | | COLETTA-FILHO, H. D.; TARGON, M. L. P. N.; TAKITA, M. A.; DE NEGRI, J. D.; POMPEU JUNIOR, J.; MACHADO, M. A.; AMARAL, A. M.; MULLER, G. W. First report of the causal agent of Huanglongbing ("Candidatus Liberibacter asiaticus") in Brazil. Plant Disease, v. 88, n. 12, p. 1382, 2004.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 11. | | MACHADO, M. A.; ASTUA-MONGE, G.; TARGON, M. L. P. N.; TAKITA, M. A.; FREITAS-ASTUA, J.; SOUZA, A. A.; COLETA FILHO, H. D.; AMARAL, A. M. do; CRISTOFANI, M.; BASTIANEL, M. Citrus genomics in Brazil (CitEST): experiences and future perspectives. In: PLANT & ANIMAL GENOME, 13., 2005, San Diego, USA. Abstracts... San Diego: Scherago International, 2005. p. 18| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 12. | | MACHADO, M. A.; ASTUA-MONGE, G.; TARGON, M. L. P. N.; TAKITA, M. A.; FREITAS-ASTUA, J.; SOUZA, A. A.; COLETTA FILHO, H. D.; AMARAL, A. M. do; CRISTOFANI, M.; BASTIANEL, M.; PALMIERI, D. A.; BASILIO, A. C. Citrus genomics in Brazil (CitEST): experiences and future perspectives. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE BIOQUÍMICA E BIOLOGIA MOLECULAR, 34., 2005, Águas de Lindóia. Programa e índices... Águas de Lindóia: SBBq, 2005.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 13. | | SOUZA, A. A. de; TARGON, M. L. P. N.; KISHI, L. T.; ROSA, D. D.; CAMPOS, M. A.; ASTUA MONGE, G.; CRISTOFANI, M.; TAKITA, M. A.; MACHADO, M. A. Genes de Phytophthora parasitica relacionados à degradação da parede celular vegetal isolados por biblioteca de cDNA. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 29, p. S200, ago. 2004. Edição dos Resumos do XXXVII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Gramado, RS, ago. 2004.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 14. | | BOSCARIOL-CAMARGO, R. L.; SILVA-PINHATI, A. C.; SOUZA, A. A.; AMARAL, A. M. do; CARLOS, E. F.; FREITAS-ASTÚA, J.; TAKITA, M. A.; TARGON, M. L. P. N.; REIS, S. M.; MACHADO, M. A. Gene expression of Rangpur Lime (Citrus limonia Osbeck) under water stress. In: THE INTERNATIONAL CONFERENCE ON THE STATUS OF PLANT & ANIMAL GENOME RESEARCH, 16., 2008, San Diego. Final abstracts guide. San Diego: Illumina, 2008. P24| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 15. | | CAMPOS, M. A.; TARGON, M. L. P. N.; SOUZA, A. A.; MONGE, G. A.; TEIXEIRA, J. E. C.; TAKITA, M. A.; KISHI, L.; PAIVA, L. V.; MACHADO, M. A. Elicitin-like genes from Phytophthora parasitica regulated during the interaction with Cirtros sinensis 'Pêra IAC'. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 29, p. S276, ago. 2004. Edição dos Resumos do XXXVII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Gramado, RS, ago. 2004.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 16. | | BOASCARIOL-CAMARGO, R. L.; BERGER, I. J.; SOUZA, A. A.; AMARAL, A. M. do; CARLOS, E. F.; FREITAS-ÁSTUA, J.; TAKITA, M. A.; TARGON, M. L. P. N.; MEDINA, C. L.; REIS, M. S.; MACHADO, M. A. In silico analysis of ESTs from roots of Rangpur lime (Citrus limonia Osbeck) under water stress. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 30, n. 3, p. 906-916, 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 17. | | CAMARGO, R. L. B.; BERGER, I. J.; SOUZA, A. A.; AMARAL, A. M. do; CARLOS, E. F.; ASTÚA, J. F.; TAKITA, M. A.; TARGON, M. L. P. N.; MEDEDINA, C. L.; REIS, M. S.; MACHADO, M. A. In silico analysis of ESTs from roots of Rangpur lime (Citrus limonia Osbeck) under water stress. Genetics and Molecular Biology, v. 30, n. 3, suppl., p. 906-916, 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 18. | | QUECINI, V.; TORRES, G. A. M.; ROSA JUNIOR, V. E. de; GIMENES, M. A.; MACHADO, J. B. de M.; FIGUEIRA, A. V. de; BENEDITO, V.; TARGON, M. L. P. N.; CRISTAFANI YALY, M. In silico analysis of phytohormone metabolism and communication pathways in citrus transcriptome. Genetics and Molecular Biology, v. 30, n. 3, suppl., p. 713-733, 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 19. | | SOUZA, A. A.; TAKITA, M. A.; COLETTA FILHO, H. D.; TARGON, M. L. P. N.; RODRIGUES, C. M.; CARLOS, E. F.; AMARAL, A. M.; CRISTOFANI, M.; TEIXEIRA, J. E. C.; ROSA, D. D.; CAMPOS, M.; OLIVEIRA, A. C.; OLIVEIRA, R. C. de; NUNES, L. R.; FERRAZ, J. R.; FISCHER, C. N.; MACHADO, M. A. Comparative analysis of expressed sequence tags in Citrus reticulata infected with Xylella fastidiosa. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia, SP. A era da genômica: da bioestatística à bioinformática: anais. Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2005. p. 490.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 20. | | TARGON, M. L. P. N.; TAKITA, M. A.; AMARAL, A. M. do; SOUZA, A. A. de; FABRIS, E. C. L.; DORTA, S. de O.; BORGES, K. M.; SOUZA, J. M. de; RODRIGUES, C. M.; LUCHETA, A. R.; ASTÚA, J. F.; MACHADO, M. A. CitEST libraries. Genetics and Molecular Biology, v. 30, n. 3, suppl., p. 1019-1023, 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
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