| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Amazônia Oriental. Para informações adicionais entre em contato com cpatu.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
|
Data corrente: |
30/11/2023 |
|
Data da última atualização: |
30/11/2023 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
CRUZ, J. N.; SILVA, S. G.; PEREIRA, D. S.; SOUZA FILHO, A. P. da S.; OLIVEIRA, M. S. de; LIMA, R. R.; ANDRADE, E. H. de A. |
|
Afiliação: |
JORDDY NEVES CRUZ, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARÁ; SEBASTIÃO GOMES SILVA, MUSEU PARAENSE EMÍLIO GOELDI; DANIEL SANTIAGO PEREIRA, CPATU; ANTONIO PEDRO DA SILVA SOUZA FILHO, CPATU; MOZANIEL SANTANA DE OLIVEIRA, MUSEU PARAENSE EMÍLIO GOELDI; RAFAEL RODRIGUES LIMA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARÁ; ELOISA HELENA DE AGUIAR ANDRADE, MUSEU PARAENSE EMÍLIO GOELDI. |
|
Título: |
In silico evaluation of the antimicrobial activity of thymol—major compounds in the essential oil of Lippia thymoides Mart. & Schauer (Verbenaceae). |
|
Ano de publicação: |
2022 |
|
Fonte/Imprenta: |
Molecules, v. 27, n. 15, 4768, 2022. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.3390/molecules27154768 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
In this paper, we evaluated the drug-receptor interactions responsible for the antimicrobial activity of thymol, the major compound present in the essential oil (EO) of Lippia thymoides (L. thymoides) Mart. & Schauer (Verbenaceae). It was previously reported that this EO exhibits antimicrobial activity against Candida albicans (C. albicans), Staphylococcus aureus (S. aureus), and Escherichia coli (E. coli). Therefore, we used molecular docking, molecular dynamics simulations, and free energy calculations to investigate the interaction of thymol with pharmacological receptors of interest to combat these pathogens. We found that thymol interacted favorably with the active sites of the microorganisms’ molecular targets. MolDock Score results for systems formed with CYP51 (C. albicans), Dihydrofolate reductase (S. aureus), and Dihydropteroate synthase (E. coli) were −77.85, −67.53, and −60.88, respectively. Throughout the duration of the MD simulations, thymol continued interacting with the binding pocket of the molecular target of each microorganism. The van der Waals (ΔEvdW = −24.88, −26.44, −21.71 kcal/mol, respectively) and electrostatic interaction energies (ΔEele = −3.94, −11.07, −12.43 kcal/mol, respectively) and the nonpolar solvation energies (ΔGNP = −3.37, −3.25, −2.93 kcal/mol, respectively) were mainly responsible for the formation of complexes with CYP51 (C. albicans), Dihydrofolate reductase (S. aureus), and Dihydropteroate synthase (E. coli). |
|
Palavras-Chave: |
Atividade biológica; Biological activity; Interaction mechanism; Lippia thymoides; Mecanismo de interação; Modelagem molecular; Molecular modeling; Natural products; Produtos naturais; Timol. |
|
Thesagro: |
Óleo. |
|
Thesaurus Nal: |
Thymol. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
Marc: |
LEADER 02591naa a2200349 a 4500
001 2158977
005 2023-11-30
008 2022 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.3390/molecules27154768$2DOI
100 1 $aCRUZ, J. N.
245 $aIn silico evaluation of the antimicrobial activity of thymol—major compounds in the essential oil of Lippia thymoides Mart. & Schauer (Verbenaceae).$h[electronic resource]
260 $c2022
520 $aIn this paper, we evaluated the drug-receptor interactions responsible for the antimicrobial activity of thymol, the major compound present in the essential oil (EO) of Lippia thymoides (L. thymoides) Mart. & Schauer (Verbenaceae). It was previously reported that this EO exhibits antimicrobial activity against Candida albicans (C. albicans), Staphylococcus aureus (S. aureus), and Escherichia coli (E. coli). Therefore, we used molecular docking, molecular dynamics simulations, and free energy calculations to investigate the interaction of thymol with pharmacological receptors of interest to combat these pathogens. We found that thymol interacted favorably with the active sites of the microorganisms’ molecular targets. MolDock Score results for systems formed with CYP51 (C. albicans), Dihydrofolate reductase (S. aureus), and Dihydropteroate synthase (E. coli) were −77.85, −67.53, and −60.88, respectively. Throughout the duration of the MD simulations, thymol continued interacting with the binding pocket of the molecular target of each microorganism. The van der Waals (ΔEvdW = −24.88, −26.44, −21.71 kcal/mol, respectively) and electrostatic interaction energies (ΔEele = −3.94, −11.07, −12.43 kcal/mol, respectively) and the nonpolar solvation energies (ΔGNP = −3.37, −3.25, −2.93 kcal/mol, respectively) were mainly responsible for the formation of complexes with CYP51 (C. albicans), Dihydrofolate reductase (S. aureus), and Dihydropteroate synthase (E. coli).
650 $aThymol
650 $aÓleo
653 $aAtividade biológica
653 $aBiological activity
653 $aInteraction mechanism
653 $aLippia thymoides
653 $aMecanismo de interação
653 $aModelagem molecular
653 $aMolecular modeling
653 $aNatural products
653 $aProdutos naturais
653 $aTimol
700 1 $aSILVA, S. G.
700 1 $aPEREIRA, D. S.
700 1 $aSOUZA FILHO, A. P. da S.
700 1 $aOLIVEIRA, M. S. de
700 1 $aLIMA, R. R.
700 1 $aANDRADE, E. H. de A.
773 $tMolecules$gv. 27, n. 15, 4768, 2022.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 222 | |
| 161. |  | SOUZA FILHO, A. P. da S.; RODRIGUES, L. R. de A.; RODRIGUES, T. de J. D.; REIS, R. A.; PUZOTTI, M. A. M. Influencias alelopáticas do assa-peixe, sobre três gramíneas forrageiras. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FISIOLOGIA VEGETAL, 5., 1995, Lavras. Resumos. Lavras: SBFV, 1995. p. 319.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
|    |
| 162. | | RODRIGUES, I. M. da C.; LUZ, S. de M.; FERREIRA, R. da C.; FERREIRA, F. A.; SOUZA FILHO, A. P. da S. Influência da luz na germinação de sementes de Senna alata e Pueraria phaseoloides. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 26.; CONGRESO DE LA ASOCIACIÓN LATINO-AMERICANA DE MALEZAS, 18., 2008, Ouro Preto. Trabalhos... Sete Lagoas: SBCPD: Embrapa Milho e Sorgo, 2008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 163. | | RIPARDO FILHO, H. S.; COSTA, N. L. S.; SANTOS, J. C. L.; BRASIL, R. B.; SOUZA FILHO, A. P. da S.; SANTOS, L. S. Ensaios alelopáticos realizados com extratos obtidos do caule de Salácia impressifolia. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE QUÍMICA, 47., 2007, Natal. Recursos não renováveis: anais. Natal: ABQ: UFRN, 2007. Disponível também on-line.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 166. | | PEREIRA, S. G.; PACHECO, L. C.; SILVA, I. de S.; JESUS, R. A.; GUILHON, G. M. P.; SOUZA FILHO, A. P. da S.; SANTOS, L. S. Estudo fitoquímico e alelopático dos extratos e frações de folhas e cascas de Lecythis usitata. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE QUÍMICA, 35., 2012, Águas de Lindóia. Responsabilidade, ética e progresso social: trabalhos. [São Paulo]: SBQ, 2012. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 168. | | SOUZA FILHO, A. P. da S.; MAULI, M. M.; MENEGHETTI, A. M.; TREZZI, M.; MOURÃO JUNIOR, M.; NÓBREGA, L. H. P. Padrão de atividade alelopática em Poáceas e Fabáceas. Revista Varia Scientia Agrárias, v. 3, n. 2, p. 115-134, jul./dez. 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
|  |
| 170. | | PEREIRA, D. S.; HOLANDA NETO, J. P. de; OLIVEIRA, M. S. de; PEREIRA, N. S.; MARACAJÁ, P. B.; SOUZA FILHO, A. P. da S. Phytotoxic potential of the geopropolis extracts of the jandaira stingless bee (Melipona subnitida) in weeds. Revista Caatinga, Mossoró, v. 30, n. 4, p. 876-884, out./dez. 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 171. | | PEREIRA, S. G.; SOARES, A. M. dos S.; GUILHON, G. M. S. P.; SANTOS, L. S.; PACHECO, L. C.; SOUZA FILHO, A. P. da S. Phytotoxic potential of piperine and extracts from fruits of Piper tuberculatum Jaq. on Senna obtusifolia and Mimosa pudica plants. Allelopathy Journal, v. 38, n. 1, p. 91-102, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 172. | | PEREIRA, S. G.; GUILHON, M. S. P.; SANTOS, L. S.; COSTA-JUNIOR, L. M.; CORDEIRO, J. A. F.; ARRUDA, M. M. S.; SOUZA FILHO, A. P. da S. Potencial alelopático do ácido cinâmico isolado de Crescentia cujete L. (Bignoniaceae). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE QUÍMICA, 51., 2011, São Luís. Meio ambiente e energia: anais. [São Luís]: ABQ, 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 177. | | SANTOS, L. S.; VEIGA, T. A. M.; CORRÊA, M. J. C.; GUILHON, G. M. S. P.; SOUZA FILHO, A. P. da S.; ALVES, S. de M. Triterpenos das folhas de Brachiaria brizanta (Gramineae). In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE QUÍMICA, 24., 2001, Poços de Caldas. [Resumos]. [S.l.]: Sociedade Brasileira de Química, 2001. PN-163.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 178. | | MAULI, M. M.; NÓBREGA, L. H. P.; SOUZA FILHO, A. P. da S.; MENEGHETTI, A. M.; ROSA, D. M.; TONINI, M. Soil moisture on emergence and initial development of Bidens pilosa. Tropical and Subtropical Agroecosystems, v. 21, n. 2, p. 141-149, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 179. | | MAULI, M. M.; NOBREGA, L. H. P.; SOUZA FILHO, A. P. da S.; STEIN, L. D. do N.; SILVA, C. T. A. C.; PACHECO, F. P. Seeds germination and early development of beggartick on extracted soil solution from an area with cover crops. African Journal of Agricultural research, v. 10, n. 32, p. 3123-3133, Aug. 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 180. | | CRUZ, J. N.; SILVA, S. G.; PEREIRA, D. S.; SOUZA FILHO, A. P. da S.; OLIVEIRA, M. S. de; LIMA, R. R.; ANDRADE, E. H. de A. In silico evaluation of the antimicrobial activity of thymol—major compounds in the essential oil of Lippia thymoides Mart. & Schauer (Verbenaceae). Molecules, v. 27, n. 15, 4768, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| Registros recuperados : 222 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
