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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia; Embrapa Soja. |
Data corrente: |
08/12/2022 |
Data da última atualização: |
08/12/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
DUARTE, K E. D.; BASSO, M. F.; OLIVEIRA, N. G. de; SILVA, J. C. F. da; GARCIA, B. de O.; DIAS, B. B. A.; CARDOSO, T. B.; NEPOMUCENO, A. L.; KOBAYASHI, A. K.; SANTIAGO, T. R.; SOUZA, W. R. de; MOLINARI, H. B. C. |
Afiliação: |
KAROLINE ESTEFANI DUARTE, Federal University of ABC; MARCOS FERNANDO BASSO, Mato Grosso Cotton Institute; NELSON GERALDO DE OLIVEIRA, EMBRAPA AGROENERGY; JOSÉ CLEYDSON FERREIRA DA SILVA, FEDERAL UNIVERSITY OF VIÇOSA; BRUNO DE OLIVEIRA GARCIA, Federal University of Viçosa; BARBARA ANDRADE DIAS BRITO DA CUNHA, CNPAE; THIAGO BERGAMO CARDOSO, Sempre AGTECH; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, CNPSO; ADILSON KENJI KOBAYASHI, CNPAE; THAÍS RIBEIRO SANTIAGO, UNIVERSITY OF BRASÍLIA; WAGNER RODRIGO DE SOUZA, Federal University of ABC; HUGO BRUNO CORREA MOLINARI, Sempre AGTECH. |
Título: |
MicroRNAs expression profiles in early responses to different levels of water deficit in Setaria viridis. |
Ano de publicação: |
2022 |
Fonte/Imprenta: |
Physiology and Molecular Biology of Plants, v. 28, n. 8, p. 1607-1624, 2022. |
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s12298-022-01226-z |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Water deficit is a major constraint for crops of economic importance in almost all agricultural regions. However, plants have an active defense system to adapt to these adverse conditions, acting in the reprogramming of gene expression responsible for encoding microRNAs (miRNAs). These miRNAs promote the regulation to the target gene expression by the post-transcriptional (PTGS) and transcriptional gene silencing (TGS), modulating several pathways including defense response to water deficit. The broader knowledge of the miRNA expression profile and its regulatory networks in response to water deficit can provide evidence for the development of new biotechnological tools for genetic improvement of several important crops. In this study, we used Setaria viridis accession A10.1 as a C4 model plant to widely investigate the miRNA expression profile in early responses to different levels of water deficit. Ecophysiological studies in Setaria viridis under water deficit and after rewatering demonstrated a drought tolerant accession, capable of a rapid recovery from the stress. Deep small RNA sequencing and degradome studies were performed in plants submitted to drought to identify differentially expressed miRNA genes and their predicted targets, using in silico analysis. Our findings showed that several miRNAs were differentially modulated in response to distinctive levels of water deficit and after rewatering. The predicted mRNA targets mainly corresponded to genes related to cell wall remodeling, antioxidant system and drought-related transcription factors, indicating that these genes are rapidly regulated in early responses to drought stress. The implications of these modulations are extensively discussed, and higher-effect miRNAs are suggested as major players for potential use in genetic engineering to improve drought tolerance in economically important crops, such as sugarcane, maize, and sorghum. MenosWater deficit is a major constraint for crops of economic importance in almost all agricultural regions. However, plants have an active defense system to adapt to these adverse conditions, acting in the reprogramming of gene expression responsible for encoding microRNAs (miRNAs). These miRNAs promote the regulation to the target gene expression by the post-transcriptional (PTGS) and transcriptional gene silencing (TGS), modulating several pathways including defense response to water deficit. The broader knowledge of the miRNA expression profile and its regulatory networks in response to water deficit can provide evidence for the development of new biotechnological tools for genetic improvement of several important crops. In this study, we used Setaria viridis accession A10.1 as a C4 model plant to widely investigate the miRNA expression profile in early responses to different levels of water deficit. Ecophysiological studies in Setaria viridis under water deficit and after rewatering demonstrated a drought tolerant accession, capable of a rapid recovery from the stress. Deep small RNA sequencing and degradome studies were performed in plants submitted to drought to identify differentially expressed miRNA genes and their predicted targets, using in silico analysis. Our findings showed that several miRNAs were differentially modulated in response to distinctive levels of water deficit and after rewatering. The predicted mRNA targets mainly corresponded to genes related to cell... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Bioenergia; Setária. |
Thesaurus Nal: |
Abiotic stress; Bioenergy; Drought; Setaria viridis. |
Categoria do assunto: |
-- X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1149404/1/MicroRNAs.pdf
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Marc: |
LEADER 02948naa a2200337 a 4500 001 2149404 005 2022-12-08 008 2022 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s12298-022-01226-z$2DOI 100 1 $aDUARTE, K E. D. 245 $aMicroRNAs expression profiles in early responses to different levels of water deficit in Setaria viridis.$h[electronic resource] 260 $c2022 520 $aWater deficit is a major constraint for crops of economic importance in almost all agricultural regions. However, plants have an active defense system to adapt to these adverse conditions, acting in the reprogramming of gene expression responsible for encoding microRNAs (miRNAs). These miRNAs promote the regulation to the target gene expression by the post-transcriptional (PTGS) and transcriptional gene silencing (TGS), modulating several pathways including defense response to water deficit. The broader knowledge of the miRNA expression profile and its regulatory networks in response to water deficit can provide evidence for the development of new biotechnological tools for genetic improvement of several important crops. In this study, we used Setaria viridis accession A10.1 as a C4 model plant to widely investigate the miRNA expression profile in early responses to different levels of water deficit. Ecophysiological studies in Setaria viridis under water deficit and after rewatering demonstrated a drought tolerant accession, capable of a rapid recovery from the stress. Deep small RNA sequencing and degradome studies were performed in plants submitted to drought to identify differentially expressed miRNA genes and their predicted targets, using in silico analysis. Our findings showed that several miRNAs were differentially modulated in response to distinctive levels of water deficit and after rewatering. The predicted mRNA targets mainly corresponded to genes related to cell wall remodeling, antioxidant system and drought-related transcription factors, indicating that these genes are rapidly regulated in early responses to drought stress. The implications of these modulations are extensively discussed, and higher-effect miRNAs are suggested as major players for potential use in genetic engineering to improve drought tolerance in economically important crops, such as sugarcane, maize, and sorghum. 650 $aAbiotic stress 650 $aBioenergy 650 $aDrought 650 $aSetaria viridis 650 $aBioenergia 650 $aSetária 700 1 $aBASSO, M. F. 700 1 $aOLIVEIRA, N. G. de 700 1 $aSILVA, J. C. F. da 700 1 $aGARCIA, B. de O. 700 1 $aDIAS, B. B. A. 700 1 $aCARDOSO, T. B. 700 1 $aNEPOMUCENO, A. L. 700 1 $aKOBAYASHI, A. K. 700 1 $aSANTIAGO, T. R. 700 1 $aSOUZA, W. R. de 700 1 $aMOLINARI, H. B. C. 773 $tPhysiology and Molecular Biology of Plants$gv. 28, n. 8, p. 1607-1624, 2022.
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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Registros recuperados : 15 | |
1. | | CAMPO, R. J.; MOSTASSO, F. L.; HUNGRIA, M. Eficiência agronômica do inoculante Biagro em pré-inoculação da soja. In: REUNIÃO DA REDE DE LABORATÓRIOS PARA RECOMENDAÇÃO, PADRONIZAÇÃO E DIFUSÃO DE TECNOLOGIA DE INOCULANTES MICROBIANOS DE INTERESSE AGRÍCOLA (RELARE), 13., 2006, Londrina. Anais... Londrina: Embrapa Soja, 2007. p. 23. (Embrapa Soja. Documentos, 290). Organizado por Rubens José Campo, Mariângela Hungria.Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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2. | | MOSTASSO, F. L.; COLOZZI-FILHO, A.; HUNGRIA, M. Efeito de exsudatos de soja, feijão, milho e trigo sobre a germinação e crescimento micelial de Gigaspora gigantea "in vitro". In: SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 3.; REUNIÃO DE LABORATÓRIOS PARA RECOMENDAÇÃO DE ESTIRPES DE RHIZOBIUM E BRADYRHIZOBIUM, 6., 1994, Londrina. Resumos... Londrina: IAPAR, 1994. Não paginado. Trabalho n. 106.Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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5. | | CAMPO, R. J.; MORETTI, E. M.; MOSTASSO, F. L.; MIURA, L. M.; HUNGRIA, M. Recuperação de células de Bradyrhizobium em semente de soja inoculada, armazenada e tratada com fungicidas e micronutrientes. In: REUNIÃO DA REDE DE LABORATÓRIOS PARA RECOMENDAÇÃO, PADRONIZAÇÃO E DIFUSÃO DE TECNOLOGIA DE INOCULANTES MICROBIANOS DE INTERESSE AGRÍCOLA (RELARE), 13., 2006, Londrina. Anais... Londrina: Embrapa Soja, 2007. p. 51-52. (Embrapa Soja. Documentos, 290). Organizado por Rubens José Campo, Mariângela Hungria.Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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6. | | CAMPO, R. J.; MORETTI, E. M.; MOSTASSO, F. L.; MIURA, L. M.; HUNGRIA, M. Recuperação de células de Bradyrhizobium em semente de soja tratada inoculada e armazenada. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 27.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 11.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 9.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 6., 2006, Bonito, MS. A busca das raízes: anais. Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2006. 1 CD-ROM. (Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 82).Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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8. | | CAMPO, R. J.; ARAÚJO, R. S.; MOSTASSO, F. L.; HUNGRIA, M. Efeito da população de células na nodulação e rendimento da soja. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 30., 2008, Rio Verde. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2008. p. 302-304. (Embrapa Soja. Documentos, 304). Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, César de Castro, Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite, Fábio Alvares de Oliveira.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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10. | | CAMPO, R. J.; ARAUJO, R. S.; MOSTASSO, F. L.; HUNGRIA, M. Efeito da população de células na nodulação da soja. In: REUNIÃO DA REDE DE LABORATÓRIOS PARA RECOMENDAÇÃO, PADRONIZAÇÃO E DIFUSÃO DE TECNOLOGIA DE INOCULANTES MICROBIOLÓGICOS DE INTERESSE AGRÍCOLA, 14., 2008, Bonito. Anais... Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2010. p. 43. RELARE. Organizado por Fábio M. Mercante, Oscar F. de Lima Filho, Suelma P. da S. Bonatto.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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11. | | HUNGRIA, M.; ARAUJO, R. S.; MOSTASSO, F. L.; CAMPO, R. J. Efeito dos fungicidas na sobrevivência de Bradyrhizobium e na nodução e fixação biológica do nitrogênio com a cultura da soja: incompatibilidade com a aplicação na semente e dose de inoculante para a aplicação no sulco. In: REUNIÃO DA REDE DE LABORATÓRIOS PARA RECOMENDAÇÃO, PADRONIZAÇÃO E DIFUSÃO DE TECNOLOGIA DE INOCULANTES MICROBIOLÓGICOS DE INTERESSE AGRÍCOLA, 15., 2010, Curitiba. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 53-54.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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12. | | CHUEIRE, L. M. O.; BANGEL, E. V.; MOSTASSO, F. L.; CAMPO, R, J.; PEDROSA, F. O.; HUNGRIA, M. Classificação taxonômica das estirpes de rizóbio recomendadas para as culturas da soja e do feijoeiro braseada no sequenciamento do gene 16S rRNA. Revista Brasileira de Ciência do Solo, Viçosa, v. 27, n. 5. p. 833-840, set./out. 2003.Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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13. | | TORRES, A. R.; ARAÚJO, W. L.; CURSINO, L.; HUNGRIA, M.; PLOTEGHER, F.; MOSTASSO, F. L.; AZEVEDO, J. L. Diversity of endophytic enterobacteria associated with different host plants. The Journal of Microbiology, Korea, v. 46, n. 4, p. 373-379, Ago. 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
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14. | | CHUEIRE, L. M. de O.; BANGEL, E.; FERREIRA, M. C.; GRANGE, L.; CAMPO, R. J.; MOSTASSO, F. L.; ANDRADE, D. de S.; PEDROSA, F. O.; HUNGRIA, M. Classificacao taxonomica, baseada na caracterizacao molecular, das estirpes de rizobio recomendadas para as culturas da soja e do feijoeiro. Londrina: Embrapa Soja, 2000. 32 p. (Embrapa Soja. Boletim de Pesquisa, 3).Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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15. | | HUNGRIA, M.; CHUEIRE, L. M. de O.; CAMPO, R. J.; FERREIRA, M. C.; BANGEL, E.; MOSTASSO, F. L.; PEDROSA, F. de O.; SOUSA, L. J.; CONCEIÇÃO, R. B. Caracterização genética, fisiológica e bioquímica de estirpes de Bradyrhizobium para a cultura da soja de solos da região sul e do cerrado e com maior eficiência de fixação do nitrogênio e capacidade competitiva (04.1994.322-02). In: EMBRAPA SOJA. Resultados de pesquisa da Embrapa Soja, 1999. Londrina, 2000. p. 220-225. (Embrapa Soja. Documentos, 142).Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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