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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
Data corrente: |
09/08/2019 |
Data da última atualização: |
02/10/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
CAMARGO, A. P.; SOUZA, R. S. C. de; COSTA, P. de B.; GERHARDT, I. R.; DANTE, R. A.; TEODORO, G. S.; ABRAHÃO, A.; LAMBERS, H.; CARAZZOLLE, M. F.; HUNTEMANN, M.; CLUM, A.; FOSTER, B.; FOSTER, B.; ROUX, S.; PALANIAPPAN, K.; VARGHESE, N.; MUKHERJEE, S.; REDDY, T. B. K.; DAUM, C.; COPELAND, A.; CHENM U, M. A.; IVANOVA, N. N.; KYRPIDES, N. C.; PENNACCHIO, C.; ELOE-FADROSH, E. A.; ARRUDA, P.; OLIVEIRA, R. S. |
Afiliação: |
ANTONIO PEDRO CAMARGO, Unicamp; RAFAEL SOARES CORREA DE SOUZA, Unicamp; PATRÍCIA DE BRITTO COSTA, Unicamp, University of Western Australia; ISABEL RODRIGUES GERHARDT, CNPTIA, Unicamp; RICARDO AUGUSTO DANTE, CNPTIA, Unicamp; GRAZIELLE SALES TEODORO, UFPA; ANNA ABRAHÃO, Unicamp, University of Western Australia; HANS LAMBERS, University of Western Australia; MARCELO FALSARELLA CARAZZOLLE, Unicamp; MARCEL HUNTEMANN, Department of Energy Joint Genome Institute; ALICIA CLUM, Department of Energy Joint Genome Institute; BRIAN FOSTER, Department of Energy Joint Genome Institute; BRYCE FOSTER, Department of Energy Joint Genome Institute; SIMON ROUX, Department of Energy Joint Genome Institute; KRISHNAVENI PALANIAPPAN, Department of Energy Joint Genome Institute; NEHA VARGHESE, Department of Energy Joint Genome Institute; SUPRATIM MUKHERJEE, Department of Energy Joint Genome Institute; T. B. K. REDDY, Department of Energy Joint Genome Institute; CHRIS DAUM, Department of Energy Joint Genome Institute; ALEX COPELAND, Department of Energy Joint Genome Institute; I.-MIN A. CHEN, Department of Energy Joint Genome Institute; NATALIA N. IVANOVA, Department of Energy Joint Genome Institute; NIKOS C. KYRPIDES, Department of Energy Joint Genome Institute; CHRISTA PENNACCHIO, Department of Energy Joint Genome Institute; EMILEY A. ELOE-FADROSH, Department of Energy Joint Genome Institute; PAULO ARRUDA, Unicamp; RAFAEL SILVA OLIVEIRA, Unicamp, University of Western Australia. |
Título: |
Microbiomes of Velloziaceae from phosphorus-impoverished soils of the campos rupestres, a biodiversity hotspot. |
Ano de publicação: |
2019 |
Fonte/Imprenta: |
Scientific Data, v. 6, p. 1-11, 2019. |
DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41597-019-0141-3 |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
Article number: 140. |
Conteúdo: |
The rocky, seasonally-dry and nutrient-impoverished soils of the Brazilian campos rupestres impose severe growth-limiting conditions on plants. Species of a dominant plant family, Velloziaceae, are highly specialized to low-nutrient conditions and seasonal water availability of this environment, where phosphorus (P) is the key limiting nutrient. Despite plant-microbe associations playing critical roles in stressful ecosystems, the contribution of these interactions in the campos rupestres remains poorly studied. Here we present the first microbiome data of Velloziaceae spp. thriving in contrasting substrates of campos rupestres. We assessed the microbiomes of Vellozia epidendroides, which occupies shallow patches of soil, and Barbacenia macrantha, growing on exposed rocks. The prokaryotic and fungal profiles were assessed by rRNA barcode sequencing of epiphytic and endophytic compartments of roots, stems, leaves and surrounding soil/rocks. We also generated root and substrate (rock/soil)-associated metagenomes of each plant species. We foresee that these data will contribute to decipher how the microbiome contributes to plant functioning in the campos rupestres, and to unravel new strategies for improved crop productivity in stressful environments. |
Palavras-Chave: |
Campos rupestres brasileiros; Condições extremas; DNA sequencing; Microbioma de plantas; Sequenciamento genético; Soils; Solos; Stressful environments. |
Thesagro: |
Microrganismo. |
Thesaurus Nal: |
Microbiome; Microorganisms; Velloziaceae. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/200538/1/AP-Microbiomes-Velloziaceae.pdf
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Marc: |
LEADER 02937naa a2200601 a 4500 001 2111238 005 2019-10-02 008 2019 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1038/s41597-019-0141-3$2DOI 100 1 $aCAMARGO, A. P. 245 $aMicrobiomes of Velloziaceae from phosphorus-impoverished soils of the campos rupestres, a biodiversity hotspot.$h[electronic resource] 260 $c2019 500 $aArticle number: 140. 520 $aThe rocky, seasonally-dry and nutrient-impoverished soils of the Brazilian campos rupestres impose severe growth-limiting conditions on plants. Species of a dominant plant family, Velloziaceae, are highly specialized to low-nutrient conditions and seasonal water availability of this environment, where phosphorus (P) is the key limiting nutrient. Despite plant-microbe associations playing critical roles in stressful ecosystems, the contribution of these interactions in the campos rupestres remains poorly studied. Here we present the first microbiome data of Velloziaceae spp. thriving in contrasting substrates of campos rupestres. We assessed the microbiomes of Vellozia epidendroides, which occupies shallow patches of soil, and Barbacenia macrantha, growing on exposed rocks. The prokaryotic and fungal profiles were assessed by rRNA barcode sequencing of epiphytic and endophytic compartments of roots, stems, leaves and surrounding soil/rocks. We also generated root and substrate (rock/soil)-associated metagenomes of each plant species. We foresee that these data will contribute to decipher how the microbiome contributes to plant functioning in the campos rupestres, and to unravel new strategies for improved crop productivity in stressful environments. 650 $aMicrobiome 650 $aMicroorganisms 650 $aVelloziaceae 650 $aMicrorganismo 653 $aCampos rupestres brasileiros 653 $aCondições extremas 653 $aDNA sequencing 653 $aMicrobioma de plantas 653 $aSequenciamento genético 653 $aSoils 653 $aSolos 653 $aStressful environments 700 1 $aSOUZA, R. S. C. de 700 1 $aCOSTA, P. de B. 700 1 $aGERHARDT, I. R. 700 1 $aDANTE, R. A. 700 1 $aTEODORO, G. S. 700 1 $aABRAHÃO, A. 700 1 $aLAMBERS, H. 700 1 $aCARAZZOLLE, M. F. 700 1 $aHUNTEMANN, M. 700 1 $aCLUM, A. 700 1 $aFOSTER, B. 700 1 $aFOSTER, B. 700 1 $aROUX, S. 700 1 $aPALANIAPPAN, K. 700 1 $aVARGHESE, N. 700 1 $aMUKHERJEE, S. 700 1 $aREDDY, T. B. K. 700 1 $aDAUM, C. 700 1 $aCOPELAND, A. 700 1 $aCHENM U, M. A. 700 1 $aIVANOVA, N. N. 700 1 $aKYRPIDES, N. C. 700 1 $aPENNACCHIO, C. 700 1 $aELOE-FADROSH, E. A. 700 1 $aARRUDA, P. 700 1 $aOLIVEIRA, R. S. 773 $tScientific Data$gv. 6, p. 1-11, 2019.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Registros recuperados : 11 | |
3. | | SOUZA, R. S. C. de; TONON, R. V.; STEPHAN, M. P.; SILVA, C. M.; PENTEADO, A. L.; CABRAL, L. M. C.; KUROZAWA, L. E. Avaliação do potencial antioxidante de proteínas do soro de leite concentradas por ultrafiltração e hidrolisadas por diferentes proteases comerciais. Brazilian Journal of Food Technology, v. 22, e2018021, 2019.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos; Embrapa Meio Ambiente. |
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4. | | CAMARGO, A. P.; SOUZA, R. S. C. de; JOSE, J.; GERHARDT, I. R.; DANTE, R. A.; MUKHERJEE, S.; HUNTEMANN, M.; KYRPIDES, N. C.; CARAZZOLLE, M. F.; ARRUDA, P. Plant microbiomes harbor potential to promote nutrient turnover in impoverished substrates of a Brazilian biodiversity hotspot. The ISME Journal, v. 17, n. 3, p. 354-370, Mar. 2023.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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5. | | PEREZ, J. B.; SOUZA, R. S. C. de; ANTONIASSI, R.; BIZZO, H. R.; GAMA, M. A. S. da; LOPES, F. C. F. Perfil de ácidos graxos em cultivares de capim elefante utilizados na alimentação de vacas leiteiras. In: REUNIãO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE QUíMICA, 33., 2010, Águas de Lindóia. Anais... Águas de Lindóia: SBQ, 2010.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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6. | | PEREZ, J. B.; SOUZA, R. S. C. de; ANTONIASSI, R.; BIZZO, H. R.; GAMA, M. A. S. da; LOPES, F. C. F. Perfil de ácidos graxos em cultivares de capim elefante utilizados na alimentação de vacas leiteiras. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE QUÍMICA, 33., 2010, Águas de Lindóia. A Química construindo um futuro melhor. São Paulo: Sociedade Brasileira de Química, 2010. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos. |
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7. | | YASSITEPE, J. E. de C. T.; DANTE, R. A.; GERHARDT, I. R.; FERNANDES, F. R.; SOUZA, R. S. C. de; SILVA, V. C. H. da; RIBEIRO, A. P.; SILVA, M. J. da; ARRUDA, P. Centro de pesquisa em genômica aplicada a mudanças climáticas. In: SOTTA, E. D.; SAMPAIO, F. G.; MARZALL, K.; SILVA, W. G. da (org.). Estratégias de adaptação às mudanças do clima dos sistemas agropecuários brasileiros. Brasília, DF: MAPA, 2021. p. 62-63.Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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8. | | YASSITEPE, J. E. de C. T.; DANTE, R. A.; GERHARDT, I. R.; FERNANDES, F. R.; SOUZA, R. S. C. de; ARMANHI, J. S. L.; SILVA, V. C. H. da; RIBEIRO, A. P.; SILVA, M. J. da; ARRUDA, P. Genomics applied to climate change: Biotechnology for digital agriculture. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MEIRA, C. A. A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; BOLFE, E. L. (ed.). Digital agriculture: research, development and innovation in production chains. Brasília, DF: Embrapa, 2023. cap. 11, p. 195-208.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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9. | | YASSITEPE, J. E. de C. T.; DANTE, R. A.; GERHARDT, I. R.; FERNANDES, F. R.; SOUZA, R. S. C. de; SILVA, V. C. H. da; RIBEIRO, A. P.; SILVA, M. J. da; ARRUDA, P. Genomics applied to climate change research center. In: SOTTA, E. D.; SAMPAIO, F. G.; MARZALL, K.; SILVA, W . G. da (ed.). Adapting to climate change: strategies for Brazilian agricultural and livestock systems. Brasília, DF: MAPA, 2021. p. 62-63.Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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10. | | YASSITEPE, J. E. de C. T.; DANTE, R. A.; GERHARDT, I. R.; FERNANDES, F. R.; SOUZA, R. S. C. de; ARMANHI, J. S. L.; SILVA, V. C. H. da; RIBEIRO, A. P.; SILVA, M. J. da; ARRUDA, P. Genômica aplicada às mudanças climáticas: biotecnologia para a agricultura digital. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MEIRA, C. A. A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; BOLFE, E. L. (Ed.). Agricultura digital: pesquisa, desenvolvimento e inovação nas cadeias produtivas. Brasília, DF: Embrapa, 2020. cap. 11, p. 258-276.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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11. | | CAMARGO, A. P.; SOUZA, R. S. C. de; COSTA, P. de B.; GERHARDT, I. R.; DANTE, R. A.; TEODORO, G. S.; ABRAHÃO, A.; LAMBERS, H.; CARAZZOLLE, M. F.; HUNTEMANN, M.; CLUM, A.; FOSTER, B.; FOSTER, B.; ROUX, S.; PALANIAPPAN, K.; VARGHESE, N.; MUKHERJEE, S.; REDDY, T. B. K.; DAUM, C.; COPELAND, A.; CHENM U, M. A.; IVANOVA, N. N.; KYRPIDES, N. C.; PENNACCHIO, C.; ELOE-FADROSH, E. A.; ARRUDA, P.; OLIVEIRA, R. S. Microbiomes of Velloziaceae from phosphorus-impoverished soils of the campos rupestres, a biodiversity hotspot. Scientific Data, v. 6, p. 1-11, 2019. Article number: 140.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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