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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
01/08/2014 |
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Data da última atualização: |
19/06/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ZULETA, L. F. G.; CUNHA, C. de O.; CARVALHO, F. M. de; CIAPINA, L. P.; SOUZA, R. C; MERCANTE, F. M.; FARIA, S. M. de; BALDANI, J. I.; STRALIOTTO, R.; HUNGRIA, M.; VASCONCELOS, A. T. R. de. |
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Afiliação: |
LUIZ FERNANDO GODA ZULETA, LNCC; CLÁUDIO DE OLIVEIRA CUNHA, UFCE / CNPQ; FABÍOLA MARQUES DE CARVALHO, LNCC; LUCIANE PRIOLI CIAPINA, LNCC; RANGEL CELSO SOUZA, LNCC; FABIO MARTINS MERCANTE, CPAO; SERGIO MIANA DE FARIA, CNPAB; JOSE IVO BALDANI, CNPAB; ROSANGELA STRALIOTTO, CNPAB; MARIANGELA HUNGRIA DA CUNHA, CNPSO; ANA TEREZA RIBEIRO DE VASCONCELOS, LNCC. |
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Título: |
The complete genome of Burkholderia phenoliruptrix strain BR3459a, a symbiont of Mimosa flocculosa: highlighting the coexistence of symbiotic and pathogenic genes. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, v.15, p. 535, Jun. 2014. |
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ISSN: |
1471-2164 |
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DOI: |
10.1186/1471-2164-15-535 |
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Idioma: |
Inglês
Português |
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Conteúdo: |
BACKGROUND: Burkholderia species play an important ecological role related to xenobiosis, the promotion of plant growth, the biocontrol of agricultural diseases, and symbiotic and non-symbiotic biological nitrogen fixation. Here, we highlight our study as providing the first complete genome of a symbiotic strain of B. phenoliruptrix, BR3459a (=CLA1), which was originally isolated in Brazil from nodules of Mimosa flocculosa and is effective in fixing nitrogen in association with this leguminous species. RESULTS: Genomic comparisons with other pathogenic and non-pathogenic Burkholderia strains grouped B. phenoliruptrix BR3459a with plant-associated beneficial and environmental species, although it shares a high percentage of its gene repertoire with species of the B. cepacia complex (Bcc) and "pseudomallei" group. The genomic analyses showed that the bce genes involved in exopolysaccharide production are clustered together in the same genomic region, constituting part of the Group III cluster of non-pathogenic bacteria. Regarding environmental stresses, we highlight genes that might be relevant in responses to osmotic, heat, cold and general stresses. Furthermore, a number of particularly interesting genes involved in the machinery of the T1SS, T2SS, T3SS, T4ASS and T6SS secretion systems were identified. The xenobiotic properties of strain BR3459a were also investigated, and some enzymes involved in the degradation of styrene, nitrotoluene, dioxin, chlorocyclohexane, chlorobenzene and caprolactam were identified. The genomic analyses also revealed a large number of antibiotic-related genes, the most important of which were correlated with streptomycin and novobiocin. The symbiotic plasmid showed high sequence identity with the symbiotic plasmid of B. phymatum. Additionally, comparative analysis of 545 housekeeping genes among pathogenic and non-pathogenic Burkholderia species strongly supports the definition of a new genus for the second branch, which would include BR3459a. CONCLUSIONS: The analyses of B. phenoliruptrix BR3459a showed key property of fixing nitrogen that together with genes for high tolerance to environmental stresses might explain a successful strategy of symbiosis in the tropics. The strain also harbours interesting sets of genes with biotechnological potential. However, the resemblance of certain genes to those of pathogenic Burkholderia raise concerns about large-scale applications in agriculture or for bioremediation. MenosBACKGROUND: Burkholderia species play an important ecological role related to xenobiosis, the promotion of plant growth, the biocontrol of agricultural diseases, and symbiotic and non-symbiotic biological nitrogen fixation. Here, we highlight our study as providing the first complete genome of a symbiotic strain of B. phenoliruptrix, BR3459a (=CLA1), which was originally isolated in Brazil from nodules of Mimosa flocculosa and is effective in fixing nitrogen in association with this leguminous species. RESULTS: Genomic comparisons with other pathogenic and non-pathogenic Burkholderia strains grouped B. phenoliruptrix BR3459a with plant-associated beneficial and environmental species, although it shares a high percentage of its gene repertoire with species of the B. cepacia complex (Bcc) and "pseudomallei" group. The genomic analyses showed that the bce genes involved in exopolysaccharide production are clustered together in the same genomic region, constituting part of the Group III cluster of non-pathogenic bacteria. Regarding environmental stresses, we highlight genes that might be relevant in responses to osmotic, heat, cold and general stresses. Furthermore, a number of particularly interesting genes involved in the machinery of the T1SS, T2SS, T3SS, T4ASS and T6SS secretion systems were identified. The xenobiotic properties of strain BR3459a were also investigated, and some enzymes involved in the degradation of styrene, nitrotoluene, dioxin, chlorocyclohexane, chlorobe... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Comparative genomics; FBN; Genômica; Nitrogen fixing; Pathogenic Bacteria. |
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Thesagro: |
Fixação de Nitrogênio. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/107252/1/BR3459.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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| Registros recuperados : 168 | |
| 141. |  | MONAIA, L. de S.; ROCHA, W. S. D. da; MARTINS, C. E.; SOUZA SOBRINHO, F. de; SANTOS, A. M. B. dos; ALENCAR, C. A. B. de; SILVA, R. O. da; NOGUEIRA, M. G. C.; SOUZA, R. C. V. de. Produtividade de silagem de milho consorciado com Brachiaria decumbens e solteiro em diferentes lâminas de irrigação. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 5., 2010, Juiz de Fora, MG. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2010. 1 CD-ROM. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 141.). p. 61-63.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 142. | | SILVA, R. O.; MARTINS, C. E.; ROCHA, W. S. D. da; SOUZA SOBRINHO, F. de; BRIGHENTI, A. M.; MONAIA, L. DE S.; CANTARINO, M. A.; OLIVEIRA, T. H. S. DE; CARVALHO, A. C. B. DE; SOUZA, R. C. V. DE. Produtividade de sorgo em um sistema de integração lavoura-pecuária com diferentes doses e fontes de potássio de rochas silicatadas. In: Workshop de Iniciação Científica da Embrapa Gado de Leite, 8., 2011, Juiz de Fora. Anais... Documentos, 151.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 143. | | MARTINS, C. E.; ROCHA, W. S. D.; SOUZA SOBRINHO, F.; SANTOS, A. M. B.; ALENCAR, C. A. B.; DERESZ, F.; MIGUEL, P. S. B.; ARAÚJO, J. P. M.; OLIVEIRA, A. V.; SOUZA, R. C. V.; CARVALHO, C. A. Produtividade de Brachiaria decumbens consorciada com feijão, milho, milheto e sorgo e solteiro em diferentes lâminas de irrigação. In: MINAS LEITE. SUSTENTABILIDADE DA PRODUÇÃO DE LEITE NA AGRICULTURA FAMILIAR. 10. 2008, Anais. Juiz de Fora. Embrapa Gado de Leite, 2008. 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 144. | | ROCHA, W. S. D. da; MARTINS, C. E.; SOUZA SOBRINHO, F. de; BRIGHENTI, A. M.; MIGUEL, P. S. B.; ARAUJO, J. P. M.; OLIVEIRA, A. V. DE; SOUZA, F. A. M.; BORGES, R. A.; SOUZA, R. C. V. de. Produtividade de Brachiaria decumbens, na entressafra, em um sistema de integração lavoura-pecuária com diferentes rochas silicáticas como fonte de potássio. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ROCHAGEM, 1., 2009, Brasilia. Anais... Brasilia: MME, 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 145. | | MARTINS, C. E.; ROCHA, W. S. D. da; CÓSER, A. C.; SOUZA SOBRINHO, F. de; OLIVEIRA, J. S. e; ALMEIDA, M.; ALVES, D. B.; MIGUEL, P. S. B.; ARAÚJO, J. P. M.; CUNHA, R. A.; SOUZA, R. C. V. Produtividade de brachiaria decumbens em um sistema de integração agricultura-pecuária com diferentes rochas silicáticas como fonte de potássio. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 31., 2007, Gramado. Conquistas e desafios da ciência do solo brasileira: anais. Porto Alegre: UFRGS, 2007.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 146. | | MARTINS, C. E.; ROCHA, W. S. D. da; CÓSER, A. C.; SOUZA SOBRINHO, F. de; OLIVEIRA, J. S. e; ALMEIDA, M.; ALVES, D. B.; MIGUEL, P. S. B.; ARAÚJO, J. P. M.; CUNHA, R. A.; SOUZA, R. C. V. Produtividade de brachiaria decumbens em um sistema de integração agricultura-pecuária com diferentes rochas silicáticas como fonte de potássio. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 31., 2007, Gramado. Conquistas e desafios da Ciêcia do Solo brasileira: resumos. Porto Alegre: UFRGS, 2007. p. 162.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 147. | | MARTINS, C. E.; ROCHA, W. S. D.; SOUZA SOBRINHO, F.; VILELA, D.; BRUSCHI, J. H.; SANTOS, A. M. B.; MIGUEL, P. S. B.; OLIVEIRA, A. V.; ARAÚJO, J. P. M.; BORGES, R. A.; SOUZA, R. C. V. Deposição de liteira e de esterco durante o verão em áreas cultivadas com Panicum maximum e Brachiaria brizantha em pastejo rotacionado. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS. FERTBIO 2008. DESAFIOS PARA O USO DO SOLO COM EFICIÊNCIA E QUALIDADE AMBIENTAL, 28., 2008, Londrina. Anais... Londrina: SBCS, 2008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 148. | | MARTINS, C. E.; ROCHA, W. S. D.; SOUZA SOBRINHO, F.; VILELA, D.; BRUSCHI, J. H.; BRIGHENTI, A. M.; MIGUEL, P. S. B.; OLIVEIRA, A. V.; ARAÚJO, J. P. M.; BORGES, R. A.; SOUZA, R. C. V. Deposição de liteira e de esterco durante o verão em áreas cultivadas com Panicum maximum e Brachiaria brizantha em pastejo rotativo. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS. FERTBIO 2008. DESAFIOS PAA O USO DO SOLO COM EFICIÊNCIA E QUALIDADE AMBIENTAL. 28. 2008, Resumos. Londrina. SBCS, 2008. p. 99| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 149. | | SILVA, C. F. da; SOUZA, R. C. de; PEREIRA, M. G.; PINTO, L. A. da S. R.; FERREIRA, R.; CORREIA, M. E. F.; MENEZES, C. E. G.; MARCELO ANTONIOL FONTES; SILVA, T. P. da. Edaphic attributes indicative of edge effect in Semideciduous tropical forest. Acta Oecologica, v. 113, 103776, November 2021,| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 150. | | ROCHA, W. S. D. da; MARTINS, C. E.; SOUZA SOBRINHO, F. de; BRIGHENTI, A. M.; DERESZ, F.; SILVA, R. O.; MONAIA, L. de S.; SOUZA, R. C. V. de. Doses de nitrogênio e o desenvolvimento de Brachiaria brizantha Cv. Xaraés. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 33., 2011, Uberlândia. Solos nos biomas brasileiros: sustentabilidade e mudanças climáticas: anais. Uberlândia: SBCS: UFU, ICIAG, 2011. 3 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 151. | | SÁ, D. de G. C. F. de; SOUZA, R. C. DE; SANTIAGO, M. C. P. de A.; BORGUINI, R. G.; NASCIMENTO, L. da S. de M. do; PACHECO, S.; GODOY, R. L. de O. Effect of jabuticaba (Myrciaria jaboticaba (Vell) O. Berg) and jamelão (Syzygium cumini (L.) Skeels) peel powders as colorants on color-flavor congruence and acceptability of yogurts. LWT - Food Science and Technology, n. 96, p. 215-221, 2018. p. 215-221| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos. |
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| 152. | | ROCHA, W. S. D.; MARTINS, C. E.; SOUZA SOBRINHO, F.; BRIGHENTI, A. M.; DERESZ, F.; CARVALHO, C. A.; CUNHA, R. A.; MIGUEL, P. S. B.; ARAÚJO, J. P. M.; SOUZA, R. C. V. Efeito da irrigação na produtividade de milho, sorgo, feijão e Brachiaria decumbens em um sistema de integração lavoura e pecuária. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DO LEITE, 6., 2007, Resende. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2007. 1 CD.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
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| 153. | | PINTO, F. G. S.; CHUEIRE, L. M. O.; VASCONCELOS, A. T. R.; NICOLÁS, M. F.; ALMEIDA, L. G. P.; SOUZA, R. C.; MENNA, P.; BARCELLOS, F. G.; MEGÍAS, M.; HUNGRIA, M. Novel genes related to nodulation, secretion systems, and surface structures revealed by a genome draft of Rhizobium tropici strain PRF 81. Functional & Integrative Genomics, Heidelberg, v. 9, n. 2, p. 263-270, May 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 154. | | ROCHA, W. S. D.; MARTINS, C. E.; CÓSER, A. C.; OLIVEIRA, J. S.; SOUZA SOBRINHO, F.; ALMEIDA, M.; ALVES, D. B.; MIGUEL, P. S. B.; ARAÚJO, J. P. M.; CUNHA, R. A.; LANES, É. C. M.; SOUZA, R. C. V. Rochas silicáticas como fonte de potássio e a produtividade de milho num sistema de integração agricultura-pecuária. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 31., 2007, Gramado. Conquistas e desafios da Ciêcia do Solo brasileira: resumos. Porto Alegre: UFRGS, 2007. p. 158-159.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 155. | | ROCHA, W. S. D.; MARTINS, C. E.; SOUZA SOBRINHO, F.; SANTOS, A. M. B.; MIGUEL, P. S. B.; ARAÚJO, J. P. M.; CARVALHO, C. A.; OLIVEIRA, A. V.; DERESZ, F.; SOUZA, R. C. V. Rochas silicáticas como fonte de potássio e a produtividade de milho em um Sistema de Integração Lavoura-Pecuária. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MILHO E SORGO. 27. 2008, Resumos. Londrina. ABMS, 2008. p. 472| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 156. | | MARTINS, C. E.; ROCHA, W. S. D. da; SOUZA SOBRINHO, F. de; BRIGHENTI, A. M.; MIGUEL, P. S. B.; ARAUJO, J. P. M.; OLIVEIRA, A. V. DE; SOUZA, F. A. M. DE; BORGES, R. A.; SOUZA, R. C. V. de. Rochas silicáticas e a produtividade de sorgo na entressafra em um sistema de integração lavoura-pecuária. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ROCHAGEM, 1., 2009, Brasilia. Anais... Brasília, MME/Petrobras/Embrapa/MCT, 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 157. | | BINDE, D. R.; CHUEIRE, L. M. O.; LUCASI. H.; NICOLÁS, M. F.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. P.; SOUZA, R. C.; MARTINEZ-ROMERO, E.; FERNANDO GOMES BARCELLOS, F. G.; SILVA, M. F.; GARCIA, J. E.; HUNGRIA, H. Seqüenciamento do plasmídeo simbiótico da estirpe CFN 299 de Rhizobium tropici. In: SEMANA DE BIOTECNOLOGIA, 1., 2005, Londrina. [Resumos]. Londrina: UEL, 2005. 1 CD-ROM. Resumo - Pdf. 41.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 158. | | MARTINS, C. E.; ROCHA, W. S. D.; SOUZA SOBRINHO, F.; SANTOS, A. M. B.; ALENCAR, C. A. B.; DERESZ, F.; MIGUEL, P. S. B.; ARAÚJO, J. P. M.; OLIVEIRA, A. V.; SOUZA, R. C. V.; CARVALHO, C. A.; BORGES, R. A. Altura e produtividade de Cynodon nemfluensis solteiro e consorciado com diferentes densidades de milho. In: MINAS LEITE. SUSTENTABILIDADE DA PRODUÇÃO DE LEITE NA AGRICULTURA FAMILIAR. 10. 2008, Anais. Juiz de Fora. Embrapa Gado de Leite, 2008. 1 p. 1 CD.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 159. | | SILVA, R. O. DA; NOGUEIRA, M. G. C.; MONAIA, L. DE S.; MARTINS, C. E.; ROCHA, W. S. D. da; SOUZA SOBRINHO, F. de; SANTOS, A. M. B. dos; ALENCAR, C. A. B. DE; SOUZA, R. C. V. de; GOMES, F. T. Integração milho com Brachiaria decumbens em diferentes lâminas de irrigação. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 61., 2010, Manaus. Diversidade vegetal brasileira: conhecimento, conservação e uso. Manaus: Sociedade Brasileira de Botânica, 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 160. | | ORMEÑO-ORRILLO, E.; MENNA, P.; ALMEIDA, L. G. P.; JAVIER OLLERO, F.; NICOLÁS, M. F.; RODRIGUES, E. P.; NAKATANI, A. S.; BATISTA, J. S. S.; CHUEIRE, L. M. de O.; SOUZA, R. C.; VASCONCELOS, A. T. R.; MEGÍAS, M.; HUNGRIA, M.; MARTÍNEZ-ROMERO, E. Genomic basis of broad host range and environmental adaptability of Rhizobium tropici CIAT 899 and Rhizobium sp. PRF 81 which are used in inoculants for common bean (Phaseolus vulgaris L.). BMC Genomics, v. 13, n. 735, 2012. 26 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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