| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
|
Data corrente: |
13/11/2017 |
|
Data da última atualização: |
08/05/2018 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
SILVA, P. R. A.; ARAUJO, J. L. S. de; VIDAL, M. S.; CRUZ, L. M.; SOUZA, E. M. de; BALDANI, J. I. |
|
Afiliação: |
PAULA RENATA ALVES DA SILVA, UFRRJ; JEAN LUIZ SIMOES DE ARAUJO, CNPAB; MARCIA SOARES VIDAL, CNPAB; LEONARDO MAGALHÃES CRUZ, UFPR; EMANUEL MALTEMPI DE SOUZA, UFPR; JOSE IVO BALDANI, CNPAB. |
|
Título: |
Draft genome sequence of Paraburkholderia tropica Ppe8 strain, a sugarcane endophytic diazotrophic bacterium. |
|
Ano de publicação: |
2018 |
|
Fonte/Imprenta: |
Brazilian Journal of Microbiology, v. 49, n. 2, p. 2010-2011, Apr./Jun. 2018. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.bjm.2017.07.005 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Paraburkholderia tropica (syn Burkholderia tropica) are nitrogen-fixing bacteria commonly found in sugarcane. The Paraburkholderia tropica strain Ppe8 is part of the sugarcane inoculant consortium that has a beneficial effect on yield. Here, we report a draft genome sequence of this strain elucidating the mechanisms involved in its interaction mainly with Poaceae. A genome size of approximately 8.75 Mb containing 7844 protein coding genes distributed in 526 subsystems was de novo assembled with ABySS and annotated by RAST. Genes related to the nitrogen fixation process, the secretion systems (I, II, III, IV, and VI), and related to a variety of metabolic traits, such as metabolism of carbohydrates, amino acids, vitamins, and proteins, were detected, suggesting a broad metabolic capacity and possible adaptation to plant association. |
|
Palavras-Chave: |
Diazotrophic; Next generation sequencing; Nitrogen fixing; Secretion system. |
|
Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/176513/1/JEAN-IVO-MARCIA-Draft-genome.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 01634naa a2200241 a 4500
001 2079611
005 2018-05-08
008 2018 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1016/j.bjm.2017.07.005$2DOI
100 1 $aSILVA, P. R. A.
245 $aDraft genome sequence of Paraburkholderia tropica Ppe8 strain, a sugarcane endophytic diazotrophic bacterium.$h[electronic resource]
260 $c2018
520 $aParaburkholderia tropica (syn Burkholderia tropica) are nitrogen-fixing bacteria commonly found in sugarcane. The Paraburkholderia tropica strain Ppe8 is part of the sugarcane inoculant consortium that has a beneficial effect on yield. Here, we report a draft genome sequence of this strain elucidating the mechanisms involved in its interaction mainly with Poaceae. A genome size of approximately 8.75 Mb containing 7844 protein coding genes distributed in 526 subsystems was de novo assembled with ABySS and annotated by RAST. Genes related to the nitrogen fixation process, the secretion systems (I, II, III, IV, and VI), and related to a variety of metabolic traits, such as metabolism of carbohydrates, amino acids, vitamins, and proteins, were detected, suggesting a broad metabolic capacity and possible adaptation to plant association.
653 $aDiazotrophic
653 $aNext generation sequencing
653 $aNitrogen fixing
653 $aSecretion system
700 1 $aARAUJO, J. L. S. de
700 1 $aVIDAL, M. S.
700 1 $aCRUZ, L. M.
700 1 $aSOUZA, E. M. de
700 1 $aBALDANI, J. I.
773 $tBrazilian Journal of Microbiology$gv. 49, n. 2, p. 2010-2011, Apr./Jun. 2018.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 364 | |
| 221. |  | CARVALHO, H. W. L. de; GAMA, E. E. G. e; LEAL, M. de L. da S.; SOUZA, E. M. de; OLIVEIRA, V. D. de; RIBEIRO, S. S. Melhoramento genético da variedade de milho BR 5011 Sertanejo no Nordeste brasileiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 4., 2007, São Lurenço. Anais... São Lourenço: UFLA, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
|   |
| 222. | | REGO, J. I. de S.; SOUZA, E. M. C. de; NASCIMENTO, J. H. B.; LIMA, M. A. C. de; LEAO, P. C. de S. Produção, características agronômicas e qualidade da uva BRS Núbia durante o quarto e quinto ciclos de produção no Submédio do Vale do São Francisco. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 10., 2015, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2015. p. 279-284. 1 CD-ROM. (Embrapa Semiárido. Documentos, 264).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
|  |
| 223. | | NASCIMENTO, J. H. B.; BARBOSA, B. D. R.; REGO, J. I. de S.; SOUZA, E. M. de C.; COSTA, J. P. D.; LEAO, P. C. de S. Produção e características físico-químicas de uvas sem sementes durante o quinto ciclo de produção. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 11., 2016, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2016. p. 267-273. (Embrapa Semiárido. Documentos, 271).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
| 224. | | NASCIMENTO, J. H. B.; NUNEZ, B. T. G.; REGO, J. I. de S.; SOUZA, E. M. de C.; LEAO, P. C. de S. Produção e características físico-químicas de uvas sem sementes durante o terceiro ciclo de produção. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 10., 2015, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2015. p. 297-302. 1 CD-ROM. (Embrapa Semiárido. Documentos, 264).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
| 225. | | RABELLO, F. R.; RABELLO, A. R.; RANGEL, P. H. N.; GUIMARÃES, C. M.; SOUZA, E. M. de; PEDROSA, F.; FERREIRA, M. E.; MEHTA, A. Proteômica de folhas de arroz (Oryza sativa L.) tolerante ao estresse hídrico. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008. p. 326 1 CD-ROM. Apresentado também no: In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 13., 2008, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. Resumo 051.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 226. | | RABELLO, F. R.; RABELLO, A. R.; RANGEL, P. H. N.; GUIMARÃES, C. M.; SOUZA, E. M. de; PEDROSA, F.; FERREIRA, M. E.; MEHTA, A. Proteômica de folhas de arroz (Oryza sativa L.) tolerante ao estresse hídrico. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008. p. 326. E em: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 13., 2008, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. p. 91. Resumo 051.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 227. | | TONIETTO, A.; SATO, J. H.; TEIXEIRA, J. B.; SOUZA, E. M. de; PEDROSA, F. O.; FRANCO, O. L.; REIS, A. M. dos. Proteomic analysis of developing somatic embryos of Coffea Arabica. Plant Molecular Biology Reporter, v. 30, p. 1393-1399, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 228. | | JESUS, E. da C.; ETTO, R. M.; CRUZ, L. M.; GALVÃO, C. W.; SOUZA, E. M.; PEDROSA, F. O.; STEFFENS, M. B. R. Prokaryotic communities of acidic peatlands from the southern Brazilian atlantic forest. Brazilian journal of Microbiology, v. 43, n. 2, p. 661-674, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
| |
| 229. | | RAMOS, H. J. O.; SOUZA, E. M.; SOARES-RAMOS, J. R. L.; HUNGRIA, M.; VARGAS, M. A. T.; PEDROSA, F. O. Nodulation competitiveness of Bradyrhizobium strains harbouring an additional heterologous nifA gene. In: INTERNATIONAL CONGRESS ON NITROGEN FIXATION, 12., 1999, Foz do Iguacu. Nitrogen fixation: from molecules to crop productivity: proceedings. Dordrechet: Kluwer, 2000. p. 627. (Current Plant Science and Biotechnology in Agriculture, 38). Editado por Fabio O. Pedrosa, Mariangela Hungria, Geoffrey Yates, William E. Newton.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 230. | | RAMOS, H. J. O.; SOUZA, E. M.; SOARES-RAMOS, J.R.L.; HUNGRIA, M.; VARGAS, M. A. T.; PEDROSA, F. O. Nodulation competitiveness os Bradyrhizobium strains harbouring an additional heterologous nif A gene. In: INTERNATIONAL CONGRESS ON NITROGEN FIXATION, 12., 1999, Foz do Iguacu. Nitrogen fixation: from molecules to crop productivity - proceedings. Dordrechet: Kluwer, 2000. p.627. (Current Plant Science and Biotechnology in Agriculture, v.38). Editado por Fabio O. Pedrosa, Mariangela Hungria, Geoffrey Yates, William E. Newton.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 231. | | RAMOS, H. J. O.; SOUZA, E. M.; SOARES-RAMOS, J. R. L.; HUNGRIA, M.; VARGAS, M. A. T.; PEDROSA, F. O. Nodulation competitiveness of Bradyrhizobium strains harbouring an addtional heterologous nifA gene in plasmids and chromosome. In: INTERNATIONAL CONGRESS ON NITROGEN FIXATION, 12., 1999, Foz do Iguacu, PR. Book of abstracts. p. 66.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 232. | | FERRÃO, M. A. G.; FONSECA, A. F. A. da; FERRÃO, R. G.; RIVA-SOUZA, E. M.; POLONINI, A. M.; FAZUOLI, L. C.; PEREIRA, A. A. 'Obatã IAC 1669-20', 'Tupi IAC 1669-33', 'Paraíso MG H419-1: novas cultivares de café arábica recomendadas para o Estado do Espírito Santo. Vitória: INCAPER; Embrapa Café, 2008. (INCAPER. Documento, 166).| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| 233. | | LEAO, P. C. de S.; NUNES, B. T. G.; NASCIMENTO, J. H. B.; REGO, J. I. de S.; SOUZA, E. M. de C. Seleção de híbridos para o desenvolvimento de novas cultivares de uvas sem sementes no Semiárido brasileiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 8., 2015, Goiânia. O melhoramento de plantas, o futuro da agricultura e a soberania nacional: anais. Goiânia: UFG: SBMP, 2015. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
| 234. | | ETTO, R. M.; CRUZ, L. M.; JESUS, E. da C.; GALVÃO, C. W.; GALVÃO, F.; SOUZA, E. M.; PEDROSA, F. de O.; STEFFENS, M. B. R. Seasonal changes in dominant bacterial taxa from acidic peatlands of the Atlantica Rain Forest. Research in Microbiology, 22 may, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
| |
| 236. | | LEAO, P. C. de S.; NUNES, B. T. G.; SOUZA, E. M. C. de; REGO, J. I. de S.; NASCIMENTO, J. H. B. do. BRS Isis: new seedless grape cultivar for the tropical viticulture in Northeastern of Brazil. BIO Web of Conferences, v. 7, p. 1-4, oct. 2016. Edição do 39 World Congress of Vine and Wine, Bento Gonçalves, oct. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
| 237. | | CARVALHO, H. W. L. de; CARDOSO, M. J.; SANTOS, M. X. dos; SANTOS, D. M. dos; TABOSA, J. N.; LIRA, M. A.; SOUZA, E. M. de. Comportamento de cultivares de milho no Nordeste do Brasil no ano agrícola de 2003. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 25.; SIMPOSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 1., 2004, Cuiabá, MT. Da agricultura familiar ao agronegócio: tecnologia, competitividade e sustentabilidade: resumos. Sete Lagoas: ABMS: Embrapa Milho e Sorgo; Cuiabá: Empaer, 2004. p. 264.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 238. | | SANTOS, D. M. dos; CARVALHO, H. W. L. de; ALBUQUERQUE, M. M. de; SANTOS, M. X. dos; SOUZA, E. M. de. Comportamento de cultivares de milho nos Tabuleiros Costeiros de Alagoas no ano agrícola de 2003. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 25.; SIMPOSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 1., 2004, Cuiabá, MT. Da agricultura familiar ao agronegócio: tecnologia, competitividade e sustentabilidade: [resumos expandidos]. Sete Lagoas: ABMS: Embrapa Milho e Sorgo; Cuiabá: Empaer, 2004. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 239. | | SANTOS, A. R. F. dos; MANN, R. S.; FERREIRA, R. A.; CARVALHO, S. V. A.; GÓIS, I. B.; SOUZA, E. M. de; SILVA, A. V. C. da. Diversidade genética de jenipapo (Genipa americana) em trecho de mata ciliar do baixo curos do rio São Francisco sergipano. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 20.; ANNUAL MEETING OF THE INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HORTICULTURE, 54., 2008, Vitória. Frutas para todos: estratégias, tecnologias e visão sustentável. Vitória: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2008. Melhoramento genético - bioestatístitca. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
| |
| Registros recuperados : 364 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
