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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Uva e Vinho. |
Data corrente: |
12/01/2017 |
Data da última atualização: |
27/11/2017 |
Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
Autoria: |
SOUZA, E. B. de. |
Afiliação: |
Elen Bonilha de Souza. |
Título: |
Caracterização biológica e molecular de isolados de Apple stem grooving virus e construção de um clone infeccioso. |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
2016. |
Idioma: |
Português |
Notas: |
Tese (Doutorado em Fitossanidade) - Universidade Federal de Pelotas, Programa de pós-graduação em Fitossanidade. Orientador: Profª. Dra. Danielle Ribeiro de Barros Coorientadores: Dr. Osmar Nickel e Dr. Cesar Bauer Gomes |
Conteúdo: |
O Apple stem grooving virus (ASGV), espécie tipo do gênero Capillovirus, é conhecido como um vírus latente causador do acanelamento do lenho da macieira, devido ao principal sintoma observado em espécies suscetíveis, infecção podendo levar à perda de qualidade de frutos e queda na produtividade. O vírus já foi diagnosticado em diversas partes do mundo e atualmente, existem depositados no GenBank, dezoito sequências de genomas completos de isolados de ASGV, e várias sequências parciais principalmente da região da capa proteica. O presente trabalho está dividido em dois capítulos. O capítulo l teve como objetivo a caracterização biológica e molecular de dois isolados de ASGV (M219-3 e M220), e de forma mais específica, a clonagem e sequenciamento do genoma completo dos mesmos e a análise filogenética em comparação com demais sequências disponíveis. Os fragmentos foram amplificados por RT-PCR, clonados, sequenciados e analisados com os programas Clustal W e Lasergene. O capítulo ll teve como objetivo a construção de um clone infeccioso, a partir do isolado M220, utilizando-se a técnica Gibson Assembly. Ambos isolados apresentaram-se de forma similar quanto a expressão de sintomas morfológicos. Os resultados obtidos permitiram a obtenção das primeiras sequências genômicas completas de isolados brasileiros de ASGV, bem como a construção de um clone infeccioso. A identidade entre M219-3 e M220 foi de 92.2%, quando comparada a sequência de nucleotídeos, e 95.3% e 93.3%, quando comparadas as sequencias de aminoácidos da proteína de movimento e capsídeo, respectivamente. A análise filogenética da proteína de movimento dos isolados com as sequências depositadas determinou dois grupos distintos quanto ao hospedeiro. M219-3 e M220 agruparam-se juntamente com isolados cujo os hospedeiros eram predominantemente maça e pera. Dada a relevância da infecção causada por esse vírus, o trabalho contribuirá para estudos da variabilidade genética dessa espécie viral, bem como para a elucidação da associação do ASGV com a patologia já relatada na literatura. MenosO Apple stem grooving virus (ASGV), espécie tipo do gênero Capillovirus, é conhecido como um vírus latente causador do acanelamento do lenho da macieira, devido ao principal sintoma observado em espécies suscetíveis, infecção podendo levar à perda de qualidade de frutos e queda na produtividade. O vírus já foi diagnosticado em diversas partes do mundo e atualmente, existem depositados no GenBank, dezoito sequências de genomas completos de isolados de ASGV, e várias sequências parciais principalmente da região da capa proteica. O presente trabalho está dividido em dois capítulos. O capítulo l teve como objetivo a caracterização biológica e molecular de dois isolados de ASGV (M219-3 e M220), e de forma mais específica, a clonagem e sequenciamento do genoma completo dos mesmos e a análise filogenética em comparação com demais sequências disponíveis. Os fragmentos foram amplificados por RT-PCR, clonados, sequenciados e analisados com os programas Clustal W e Lasergene. O capítulo ll teve como objetivo a construção de um clone infeccioso, a partir do isolado M220, utilizando-se a técnica Gibson Assembly. Ambos isolados apresentaram-se de forma similar quanto a expressão de sintomas morfológicos. Os resultados obtidos permitiram a obtenção das primeiras sequências genômicas completas de isolados brasileiros de ASGV, bem como a construção de um clone infeccioso. A identidade entre M219-3 e M220 foi de 92.2%, quando comparada a sequência de nucleotídeos, e 95.3% e 93.3%, quando comp... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
ASGV-sequenciamento; Capillovirus Betaflexiviridae; CDNA; Gibson Assembly. |
Thesagro: |
Malus Domestica. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/153271/1/TESE-Souza-Elen-Bonilha-Versao-Defesal-11.08.-2016.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Uva e Vinho (CNPUV) |
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Registros recuperados : 42 | |
8. | | IKUMA, E. S.; AOKI, R. T.; SOUZA, E. B. de; KOMEGAWA, E. O.; SONEGO, O. R. Avaliação do controle químico das doenças foliares na cultura do trigo. In: REUNIÃO DA COMISSÃO CENTRO-SUL-BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO, 3., 1987, Cascavel. Resultados de pesquisa com trigo - 1986. Dourados: EMBRAPA-UEPAE Dourados, 1987. p. 116-118. (EMBRAPA-UEPAE Dourados. Documentos, 28). Projeto 004.82.034-6 - Avaliação de fungicidas no controle das ferrugens do trigo.Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
| |
10. | | SOUSA, P. G.; SOARES SOBRINHO, J.; LUIZ, A. J. B.; RUMIATTO, M.; SOUZA, E. B. de. Cultivares de trigo em nível estadual de experimentação. In: REUNIÃO DA COMISSÃO CENTRO-SUL-BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO, 5., 1989, Cornélio Procópio. Resultados de pesquisa com trigo - 1988. Dourados: EMBRAPA-UEPAE Dourados, 1989. p. 31-34. (EMBRAPA-UEPAE Dourados. Documentos, 39). Projeto 004.87.0116-8 - Competição de cultivares de trigo na Região Sul de Mato Grosso do Sul.Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
| |
11. | | NICKEL, O.; SOUZA, E. B. de; FAJARDO, T. V. M.; BARROS, D. R. de. Comparison of the nucleotide sequences of two isolates of apple stem grooving virus from apple plants. Virus Reviews and Research, Belo Horizonte, v. 20, p. 201, 2015. Suplemento. Abstract PIV 48. Edição dos Resumos do XXVI Brazilian Congress of Virology, X Mercour Meeting of Virology, 2015, Florianópolis.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
| |
12. | | SOUSA, P. G.; SOARES SOBRINHO, J.; LUIZ, A. J. B.; RUMIATTO, M.; SOUZA, E. B. de. Linhagens e cultivares de trigo em nível final de experimentação. In: REUNIÃO DA COMISSÃO CENTRO-SUL-BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO, 5., 1989, Cornélio Procópio. Resultados de pesquisa com trigo - 1988. Dourados: EMBRAPA-UEPAE Dourados, 1989. p. 35-43. (EMBRAPA-UEPAE Dourados. Documentos, 39). Projeto 004.87.016-8 - Competição de cultivares de trigo na Região Sul de Mato Grosso do Sul.Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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13. | | SOUSA, P. G.; SOARES SOBRINHO, J.; LUIZ, A. J. B.; RUMIATTO, M.; SOUZA, E. B. de. Linhagens de trigo em nível intermediário de experimentação. In: REUNIÃO DA COMISSÃO CENTRO-SUL-BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO, 5., 1989, Cornélio Procópio. Resultados de pesquisa com trigo - 1988. Dourados: EMBRAPA-UEPAE Dourados, 1989. p. 44-54. (EMBRAPA-UEPAE Dourados. Documentos, 39). Projeto 004.87.016-8 - Competição de cultivares de trigo na Região Sul de Mato Grosso do Sul.Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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16. | | ANTUNES, I. F.; LOPES, R. A. M.; SOUZA, E. B. de; ALVES, C. X.; BEVILAQUA, G. A. P. Indução de resistencia à antracnose em cultivares crioulas de feijão. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais... Salvador: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2010. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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17. | | NAUE, C. R.; BARBOSA, M. A. G.; BATISTA, D. da C.; SOUZA, E. B. de; MARINHO, R. de L. R. Efeito do tratamento de bacelos de videira Red Globe no controle do cancro bacteriano causado por Xanthomonas campestris pv. viticola. Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v. 36, n. 4, p. 853-861, dez. 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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18. | | SOUZA, E. B. de; CARDOSO, J. A. F.; LIMA, A. M. N.; CUNHA, T. J. F.; HERNANI, L. C. Estoques de carbono nas substâncias húmicas de Neossolo Quartzarênico sob cultivo de mangueira irrigada no Semiárido Brasileiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENGENHARIA AGRÍCOLA, 43., 2014, Campo Grande, MS. Estratégias para a redução do custo Brasil no agronegócio: trabalhos. Jaboticabal: Associação Brasileira de Engenharia Agrícola, 2014.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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19. | | SOUZA, E. B. de; CARDOSO, J. A. F.; LIMA, A. M. N.; CUNHA, T. J. F.; AMARAL, A. J. do. Estoque de carbono orgânico total e fracionamento físico da matéria orgânica do solo sob cultivo de mangueira irrigada no semiárido brasileiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENGENHARIA AGRÍCOLA, 43., 2014, Campo Grande, MS. Estratégias para a redução do custo Brasil no agronegócio: trabalhos. Jaboticabal: Associação Brasileira de Engenharia Agrícola, 2014.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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20. | | ANTUNES, I. F.; BEVILAQUA, G. P.; RIBEIRO, L. S.; SILVEIRA, N. T.; SOUZA, E. B. de; LEGÁRIO, R. L. Produtividade de grãos de linhagens de feijão selecionados em programa de melhoramento participativo na Embrapa Clima Temperado. In: REUNIÃO TÉCNICA CATARINENSE DE MILHO E FEIJÃO, 6., 2007, Concórdia. Resumos expandidos... Concórdia: EPAGRI/CEPAF, 2007.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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