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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
01/07/2021 |
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Data da última atualização: |
01/07/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
SOUZA, D. D. de. |
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Afiliação: |
DANIELA DOMINGOS DE SOUZA. |
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Título: |
Caracterização molecular de dois isolados de Rice stripe necrosis virus. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
2021. |
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Páginas: |
51 p. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Dissertação (Mestrado em Agronomia) - Escola de Agronomia, Universidade Federal de Goiás, Goiânia. Orientador: Érico de Campos Dianese; Coorientadora: Raquel Neves de Mello, CNPAF. |
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Conteúdo: |
Rice stripe necrosis virus (RSNV) é um benyvirus transmitido pelo plasmodioforomiceto Polymyxa graminis Ledingham e que causa a doença conhecida como encarquilhamento do arroz. O genoma do RSNV é composto por dois segmentos de RNA de fita simples, poliadenilados e de sentido positivo que são encapsidados individualmente em partículas em formato de bastonete. A reemergência do vírus na África e na América do Sul e sua recente disseminação para além da região Sul do Brasil indicam a necessidade de entender sua variabilidade genética a fim de gerar informações que auxiliem na diagnose e controle da virose. Assim, os objetivos deste trabalho foram caracterizar molecularmente dois isolados de RSNV obtidos de arroz no estado de Goiás e analisar a variabilidade genética deste vírus. Para tanto, amostras de duas plantas sintomáticas, coletadas em experimentos da Embrapa Arroz e Feijão em Goianira e Santo Antônio de Goiás, GO, foram submetidas a extração de RNA total, enriquecimento de dsRNA e sequenciamento de alto desempenho (HTS), resultando em 27 e 66 milhões de leituras de cada amostra. Após montagem com o programa Tadpole, dez contigs foram obtidos, correspondendo a dois genomas virais, cada um composto por dois segmentos de RNA (RNA1 e RNA2). A organização genômica e tamanho do genoma dos isolados estudados foram similares àqueles de outros seis isolados de RSNV previamente caracterizados. As sequências de aminoácidos das proteínas do capsídeo dos dois isolados apresentaram identidade superior a 95% com outras sequências de RSNV e a identidade geral das sequências de nucleotídeos dos RNA1 e RNA2 foi igual ou superior a 95%. Análises executadas com o programa RDP4 não detectaram eventos de recombinação nos isolados estudados. Árvores filogenéticas baseadas nas sequências completas dos RNA1 e RNA2 e da região codificadora do motivo helicase revelaram estreita relação filogenética entre os isolados de RSNV caracterizados neste trabalho e aqueles previamente caracterizados e indicaram um padrão de agrupamento de acordo com a origem geográfica dos isolados. Estes resultados colaboram para ampliar o entendimento da diversidade molecular de isolados de RSNV e, assim, contribuir para o seu controle. MenosRice stripe necrosis virus (RSNV) é um benyvirus transmitido pelo plasmodioforomiceto Polymyxa graminis Ledingham e que causa a doença conhecida como encarquilhamento do arroz. O genoma do RSNV é composto por dois segmentos de RNA de fita simples, poliadenilados e de sentido positivo que são encapsidados individualmente em partículas em formato de bastonete. A reemergência do vírus na África e na América do Sul e sua recente disseminação para além da região Sul do Brasil indicam a necessidade de entender sua variabilidade genética a fim de gerar informações que auxiliem na diagnose e controle da virose. Assim, os objetivos deste trabalho foram caracterizar molecularmente dois isolados de RSNV obtidos de arroz no estado de Goiás e analisar a variabilidade genética deste vírus. Para tanto, amostras de duas plantas sintomáticas, coletadas em experimentos da Embrapa Arroz e Feijão em Goianira e Santo Antônio de Goiás, GO, foram submetidas a extração de RNA total, enriquecimento de dsRNA e sequenciamento de alto desempenho (HTS), resultando em 27 e 66 milhões de leituras de cada amostra. Após montagem com o programa Tadpole, dez contigs foram obtidos, correspondendo a dois genomas virais, cada um composto por dois segmentos de RNA (RNA1 e RNA2). A organização genômica e tamanho do genoma dos isolados estudados foram similares àqueles de outros seis isolados de RSNV previamente caracterizados. As sequências de aminoácidos das proteínas do capsídeo dos dois isolados apresentaram id... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Rice stripe necrosis virus. |
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Thesagro: |
Arroz; Doença de Planta; Marcador Molecular; Oryza Sativa; Polymyxa Graminis; RNA. |
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Thesaurus Nal: |
Benyvirus; Rice. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Biblioteca |
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Cutter |
Registro |
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Status |
URL |
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| Registros recuperados : 534 | |
| 124. |  | PORTO, W. S.; CARVALHO, C. G. P. de; DORTA, E. O.; ARIAS, C. A. A.; TOLEDO, J. F. F. Avaliação do nível de resistência à mancha parda em linhagens de soja dos ensaios intermediários 2001/02. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 2.; MERCOSOJA 2002, 2002, Foz do Iguaçu. Perspectivas do agronegócio da soja: resumos. Londrina: Embrapa Soja, 2002. p.89. (Embrapa Soja. Documentos, 181). Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Clara Beatriz Hoffmann-Campo.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 125. | | PIEROZZI, P. H. B.; RIBEIRO, A. S.; MOREIRA, J. U. V.; ARIAS, C. A. A.; TOLEDO, J. F. F. de. Avaliação do desempenho de genótipos de soja em campo experimental na presença de ferrugem asiática. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52.; CONGRESO DE LA ASOCIACIÓN LATINOAMERICANA DE GENÉTICA, 12., 2006, Foz do Iguaçu. Resumos... Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2006. 1 CD-ROM. Área:Plantas - pdf 995| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 126. | | HOFFMANN-CAMPO, C. B.; ARIAS, C. A. A.; LOPES, I. de O. N.; CORREA-FERREIRA, B. S. Análises para subsidiar a elaboração de protocolo para seleção a campo de soja tolerante a percevejos sugadores de sementes. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 27.; CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE ENTOMOLOGIA, 10., 2018, Gramado, RS. Saúde, ambiente e agricultura: anais. Santo Antonio de Goiás: SEB: UFSM, 2018. v. 2. resumo. p. 1392.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 127. | | MOREIRA, J. U. V.; ARIAS, C. A. A.; OLIVEIRA, M. F. de; CARNEIRO, G. E. de S.; KASTER, M. Em busca da cultivar inatingível. A Granja, Porto Alegre, v. 65, n. 731, p. 48-50, nov. 2009.| Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 128. | | OLIVEIRA, L. J.; HOFFMANN-CAMPO, C. B.; ARIAS, C. A.; TONON, O.; MENDES, A. C. M.; SILVA, S. H. da. Avaliação de germoplasma de soja resistente a insetos (04.2000.336-01). In: HOFFMANN-CAMPO, C. B.; SARAIVA, O. F. (Org.). Resultados de pesquisa da Embrapa Soja - 2002: entomologia. Londrina: Embrapa Soja, 2003. p. 47-51. (Embrapa Soja. Documentos, 212). Nome correto do terceiro autor ARIAS, C. A. A.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 129. | | PRIOLLI, R. H. G.; ZUCCHI, M. I.; PINHEIRO, J. B.; CATELLI, L.; ARIAS, C. A. A.; VELLO, N. A. Caracterização de locos EST-SSR e SSR genômicos em cultivares brasileiras de soja. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 4., 2007, São Lourenço. Anais... São Lourenço: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, 2007. 1 CD-ROM. Pdf. 176.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 130. | | ARIAS, C. A. A.; MIRANDA, Z. F. S.; TRILLER, C.; OLIVEIRA, M. F. de; TOLEDO, J. F. F. de. Estudo genético do teor de óleo em grãos de soja. In: CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA, 41., 1995, Caxambu. Programa e resumos... Revista Brasileira de Genética, v. 18, n. 3, p. 100, set. 1995. Suplemento. A.30.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 133. | | TOLEDO, J. F. F. de; ARIAS, C. A. A.; OLIVEIRA, M. F. de; TRILLER, C.; MIRANDA, Z. de F. S. Genetical and environmental analyses of yield in six biparental soybean crosses. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v. 35, n. 9, p. 1783-1796, set. 2000.| Biblioteca(s): Embrapa Soja; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 135. | | DIAS, W. P.; CAMPOS, V. P.; KIIHL, R. A. S.; ARIAS, C. A. A.; TOLEDO, J. F. F. Genética da resistência da soja à raça 4+ do nematóide de cisto Heterodera glycines. Nematologia Brasileira, v. 29, n. 1, p. 109, jun. 2005. Resumo apresentado no XXV Congresso Brasileiro de Nematologia, Piracicaba, fev. 2005.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 136. | | DIAS, W. P.; CAMPOS, V. P.; KIIHL, R. A. S.; ARIAS, C. A. A.; TOLEDO, J. F. F. Genetic control in soybean of resistance to soybean cyst nematode race 4+. Euphytica, Dordrecht, v. 145, n. 3, p. 321-329, Oct. 2005.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 140. | | ALMEIDA, L. A.; KIIHL, R. A. S.; PÍPOLO, A. E.; DOMIT, L.; VIEIRA, O. V.; KASTER, M.; ARIAS, C. A. Desenvolvimento de cultivares e linhagens de soja para a região centro-sul do Brasil (04.2000.321-02). In: HOFFMANN-CAMPO, C.B.; SARAIVA, O.F. (Org.). Resultados de pesquisa da Embrapa Soja - 2000: melhoramento. Londrina: Embrapa Soja, 2001. p. 9-12. (Embrapa Soja. Documentos, 156).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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