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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
02/01/2012 |
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Data da última atualização: |
19/07/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BALDAUF, C.; CIAMPI, M. B.; VIGNA, B. B. Z.; MORI, G. M.; GUEDES, J. P. P.; SOUZA, A. P. de; SANTOS, F. A. M. dos. |
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Afiliação: |
CRISTNA BALDAUF, UNICAMP/CAMPINAS; MAÍSA B. CIAMPI, ESALQ/PIRACICABA; BIANCA BACCILI ZANOTTO VIGNA, CPPSE; GUSTAVO M. MORI, UNICAMP/CAMPINAS; JULIAN P. P. GUEDES, PUC/CAMPINAS; ANETE P. DE SOUZA, UNICAMP/CAMPINAS; FALVIO A. M. DOS SANTOS, UNICAMP/CAMPINAS. |
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Título: |
Characterization of microsatellite loci in Himatanthus drasticus (Apocynaceae), a medicinal plant from the Brazilian savanna. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
American Journal of botany, v. 98, n. 9, p. 244-246, Sep. 2011. |
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DOI: |
https://doi.org/10.3732/ajb.1100135 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
? Premise of the study: We developed a new set of microsatellite markers for studying the genome of the janaguba tree, Himatanthus drasticus (Mart.) Plumel, which is used in folk medicine in northeastern Brazil. These novel markers are being used to evaluate the effect of harvesting on the genetic structure and diversity of natural populations of this species. ? Methods and Results: Microsatellite loci were isolated from an enriched H. drasticus genomic library. Nine primer pairs successfully amplified polymorphic microsatellite regions, with an average of 8.5 alleles per locus. The average values of observed and expected heterozygosity were 0.456 and 0.601, respectively. ? Conclusions: The microsatellite markers described here are valuable tools for population genetics studies of H. drasticus. The majority of the primers also amplified sequences in the genome of another species of the same genus. This new set of markers may be useful in designing a genetic conservation strategy and a sustainable management plan for the species. |
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Palavras-Chave: |
Conservation; Molecular markers; Sustainable management. |
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Thesaurus Nal: |
harvesting; medicinal plants. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/51478/1/PROCI-2011.00299.pdf
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Marc: |
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520 $a? Premise of the study: We developed a new set of microsatellite markers for studying the genome of the janaguba tree, Himatanthus drasticus (Mart.) Plumel, which is used in folk medicine in northeastern Brazil. These novel markers are being used to evaluate the effect of harvesting on the genetic structure and diversity of natural populations of this species. ? Methods and Results: Microsatellite loci were isolated from an enriched H. drasticus genomic library. Nine primer pairs successfully amplified polymorphic microsatellite regions, with an average of 8.5 alleles per locus. The average values of observed and expected heterozygosity were 0.456 and 0.601, respectively. ? Conclusions: The microsatellite markers described here are valuable tools for population genetics studies of H. drasticus. The majority of the primers also amplified sequences in the genome of another species of the same genus. This new set of markers may be useful in designing a genetic conservation strategy and a sustainable management plan for the species.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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| Registros recuperados : 176 | |
| 161. |  | OLIVEIRA, J. C. de; SILVA, A. L. D. da; SILVA, L. M. da; FORMIGHIERI, E. F.; PETERS, L. P.; ASSIS, G. M. L. de; SILVA, C. C. da; SOUZA, A. P. DE; CAMPOS, T. de. Novel microsatellite markers derived from Arachis pintoi transcriptome sequencing for cross-species transferability and varietal identification. Plant Molecular Biology Reporter, v. 41, n. 4, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 162. | | OLIVEIRA, J. C. de; SILVA, A. L. D. da; SILVA, L. M. da; FORMIGHIERI, E. F.; PETERS, L. P.; ASSIS, G. M. L. de; SILVA, C. C. da; SOUZA, A. P. de; CAMPOS, T. de. Novel microsatellite markers derived from Arachis pintoi transcriptome sequencing for cross-species transferability and varietal identification. Plant Molecular Biology Reporter, v. 42, p. 183-192, Mar. 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 163. | | SILVA, V. B. da; BOMFIM, C. S. G.; SENA, P. T. S.; SANTOS, J. C. S.; MATTOS, W. da S.; GAVA, C. A. T.; SOUZA, A. P. de; FERNANDES JUNIOR, P. I. Vigna spp. root-nodules harbor potential pathogenic fungi controlled by co-habiting bacteria. Current Microbiology, v. 78, n. 5, p. 1835-1845, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 164. | | MARTINS, F. B.; MORAES, A. C. L.; AONO, A. H.; FERREIRA, R. C. U.; CHIARI, L.; SIMEÃO, R. M.; BARRIOS, S. C. L.; SANTOS, M. F.; JANK, L.; VALLE, C. B. do; VIGNA, B. B. Z.; SOUZA, A. P. DE. A semi-automated SNP-based approach for contaminant identification in biparental Polyploid Populations of tropical forage grasses. Frontiers in Plant Science, v.12, article 737919, 2021. 19 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 165. | | JUNGMANN, L.; VIGNA, B. B. Z.; BOLDRINI, K. R.; SOUZA, A. C. B.; VALLE, C. B. do; RESENDE, R. M. S.; PAGLIARINI, M. S.; ZUCCHI, M. I.; SOUZA, A. P. de. A survey of a germplasm collection of Brachiaria humidicola (Rendle) Scweick. using microssatellite markers, cytogenetics, morphological traits and geographical origin. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON THE MOLECULAR BREEDING OF FORAGE AND TURF: MBFT, 2010, 6., 2010, Buenos Aires. [Resumos...]. Buenos Aires: Ediciones INTA, 2010. p. 22-23| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 166. | | SANTOS-GARCIA, M. O.; TOLEDO-SILVA, G. de; SASSAKI, R. P.; FERREIRA, T. H.; RESENDE, R. M. S.; CHIARI, L.; KARIA, C. T.; CARVALHO, M. A.; FALEIRO, F. G.; ZUCCHI, M. I.; SOUZA, A. P. de. Using genetic diversity information to establish core collections of Stylosanthes capitata and Stylosanthes macrocephala. Genetics and Molecular Biology, São Paulo, v.35, n.4, p.847-861,Nov. 2012| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 167. | | LIMA, J. A. M. de C.; CONCEIÇÃO, A. M. da S. B.; COUTO, J. L. do; SILVA, E. de J. da; MATIAS, M. I. de A. S.; SOUZA, A. P. de S. B. e; BOMFIM, M. R.; SANTOS, J. A. G.; SOUZA, L. da S. Avaliação da qualidade de solos para o suprimento de nutrientes em uma topossequência cultivada com citrus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios: anais. Fortaleza: SBCS: UFC, 2009. 1 CD-ROM. Trabalho 3102.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 168. | | SILVA, E. de J. da; BOMFIM, M. R.; COUTO, J. L. do; SOUZA, A. P. de S. B. e; LIMA, J. A. M. de C.; CONCEIÇÃO, A. M. da S. B.; CARVALHO, Z. S. de; SANTOS, J. A. G.; SOUZA, L. da S. Atributos físicos na determinação do índice de qualidade de solo em uma topossequência cultivada com citros. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios: anais. Fortaleza: SBCS: UFC, 2009. 1 CD-ROM. Trabalho 3147.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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