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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte. |
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Data corrente: |
27/12/2022 |
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Data da última atualização: |
23/01/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
AONO, A. H.; FERREIRA, R. C. U.; MORAES, A. da C. L.; LARA, L. A. de C.; PIMENTA, R. J. G.; COSTA, E. A.; PINTO, L. R.; LANDELL, M. G. de A.; SANTOS, M. F.; JANK, L.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B.; CHIARI, L.; GARCIA, A. A. F.; KUROSHU, R. M.; LORENA, A. C.; GORJANC, G.; SOUZA, A. P. de. |
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Afiliação: |
ALEXANDRE HILD AONO, UNIVERSIDADE DE CAMPINAS, UNIVERSITY OF EDINBURGH; REBECCA CAROLINE ULBRICHT FERREIRA, UNIVERSDIDADE DE CAMPINAS; ALINE DA COSTA LIMA MORAES, UNIVERSIDADE DE CAMPINAS; LETÍCIA APARECIDA DE CASTRO LARA, ESCOLA SUPERIOR DE AGRICULTURA "LUIZ DE QUEIROZ"; RICARDO JOSÉ GONZAGA PIMENTA, UNIVERSIDADE DE CAMPINAS; ESTELAARAUJO COSTA, UNIVEDRSIDADE FEDERAL DE SÃO PAULO; LUCIANA ROSSINI PINTO, INSTITUTO AGRONÔMICO DE CAMPINAS; MARCOS GUIMARÃES DE ANDRADE LANDELL, INSTITUTO AGRONÔMICO DE CAMPINAS; MATEUS FIGUEIREDO SANTOS, CNPGC; LIANA JANK, CNPGC; SANZIO CARVALHO LIMA BARRIOS, CNPGC; CACILDA BORGES DO VALLE, CNPGC; LUCIMARA CHIARI, CNPGC; ANTONIO AUGUSTO FRANCO GARCIA, ESCOLA SUPERIOR DE AGRICULTURA "LUIZ DE QUEIROZ"; REGINALDO MASSANOBU KUROSHU, UNIVERSIDADE FERDERAL DE SÃO PAULO; ANA CAROLINA LORENA, INSTITUTO TECNOLÓGICO DE AERONÁUTICA; GREGOR GORJANC, UNIVERSITY OF EDINBURGH; ANETE PEREIRA DE SOUZA, UNIVERSIDADE DE CAMPINAS. |
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Título: |
A joint learning approach for genomic prediction in polyploid grasses. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, 12, article 12499, 2022. |
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Páginas: |
17 p. |
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ISSN: |
2045-2322 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41598-022-16417-7 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Poaceae, among the most abundant plant families, includes many economically important polyploid species, such as forage grasses and sugarcane (Saccharum spp.). These species have elevated genomic complexities and limited genetic resources, hindering the application of marker-assisted selection strategies. Currently, the most promising approach for increasing genetic gains in plant breeding is genomic selection. However, due to the polyploidy nature of these polyploid species, more accurate models for incorporating genomic selection into breeding schemes are needed. This study aims to develop a machine learning method by using a joint learning approach to predict complex traits from genotypic data. Biparental populations of sugarcane and two species of forage grasses (Urochloa decumbens, Megathyrsus maximus) were genotyped, and several quantitative traits were measured. High-quality markers were used to predict several traits in diferent cross-validation scenarios. By combining classifcation and regression strategies, we developed a predictive system with promising results. Compared with traditional genomic prediction methods, the proposed strategy achieved accuracy improvements exceeding 50%. Our results suggest that the developed methodology could be implemented in breeding programs, helping reduce breeding cycles and increase genetic gains. |
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Thesagro: |
Cana de Açúcar; Gramínea Forrageira; Recurso Genético. |
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Thesaurus Nal: |
Forage grasses; Genetic resources; Plant breeding; Poaceae; Polyploidy; Saccharum; Sugarcane. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1150365/1/Joint-learning-approach-genomic-2022.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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| Registros recuperados : 176 | |
| 6. |  | PIOVEZAN, U.; URBANETZ, C.; SOUZA, A. P. de; FEIDEN, A. Estudos para o controle do caramujo africano (Achatina fulica, Bowdich 1822) na APA Baia Negra, Ladário, MS. Cadernos de Agroecologia, Porto Alegre, v. 13, n. 1, jul. 2018. Não paginado. Edição dos anais do VI Congresso Latino-Americano (CLAA), X Congresso Brasileiro (CBA), V Seminário do DF e Entorno (SEMDF), set. 2017, Brasília, DF.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 7. | | PIOVEZAN, U.; URBANETZ, C.; SOUZA, A. P. de; FEIDEN, A. Estudos para o controle do caramujo africano (Achatina fulica, Bowdich 1822) na APA Baia Negra, Ladário, MS. Cadernos de Agroecologia, Porto Alegre, v. 13, n. 1, jul. 2018. Não paginado. Edição dos anais do VI Congresso Latino-Americano de Agroecologia (CLAA), X Congresso Brasileiro de Agroecologia (CBA), V Seminário de Agroecologia do Distrito Federal e Entorno (SEMDF), set. 2017, Brasília, DF.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 11. | | CASTAGNA, D.; VENDRUSCULO, L. G.; SOUZA, A. P. de. Índice de erosividade para o município de Sorriso, Mato Grosso. In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS, 4.; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 9., 2020, Sinop. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2020. p. 12.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 12. | | CASTAGNA, D.; VENDRUSCULO, L. G.; SOUZA, A. P. de. Índice de erosividade para o município de Sorriso, Mato Grosso. In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS, 4.; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 9., 2020, Sinop. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2020. p. 12.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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| 15. | | RIEGER, F. A.; ZOLIN, C. A.; PAULINO, J.; JÚNIOR CAZARIN, A.; SOUZA, A. P. de. Avaliação do escoamento superficial em diferentes usos e coberturas do solo In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENGENHARIA AGRÍCOLA, 42., 2013, Fortaleza. Anais... Fortaleza, CE: CONBEA, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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| 16. | | CARDOSO, M. O.; OLIVEIRA, A. P. de; PEREIRA, W. E.; SOUZA, A. P. de. Análise de componentes principais aplicada aos teores de macronutrientes e nitrato em frutos de berinjela cultivada com esterco bovino e termofosfato magnesiano. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE OLERICULTURA, 46., 2006, Goiânia. [Anais... ]. Horticultura Brasileira, v. 24, n. 1, p. 3142-3145, jul. 2006. Supl. CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 17. | | CARDOSO, M. O.; OLIVEIRA, A. P. de; PEREIRA, W. E.; SOUZA, A. P. de. Análise de componentes principais aplicada aos teores de macronutrientes e nitrato em frutos de berinjela cultivada com esterco bovino e termofosfato magnesiano. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE OLERICULTURA, 46., 2006, Goiânia. [Anais... ]. Horticultura Brasileira, v. 24, n. 1, p. 253, jul. 2006. Suplemento. Resumo 785.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 18. | | CARDOSO, M. O.; PEREIRA, W. E.; OLIVEIRA, A. P. de; SOUZA, A. P. de. Análise de componentes principais aplicada ao crescimento da berinjela cultivada com esterco bovino e termofosfato magnesiano. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE OLERICULTURA, 47.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE CUCURBITÁCEAS, 4., 2007, Porto Seguro, BA. Resgatando e valorizando as hortaliças subutilizadas. Horticultura Brasileira, v. 25, n. 1, ago. 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 19. | | CARDOSO, M. O.; PEREIRA, W. E.; OLIVEIRA, A. P. de; SOUZA, A. P. de. Análise de componentes principais aplicada ao crescimento da berinjela cultivada com esterco bovino e termofosfato magnesiano. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE OLERICULTURA, 47.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE CUCURBITÁCEAS, 4., 2007, Porto Seguro, BA. Resgatando e valorizando as hortaliças subutilizadas. Horticultura Brasileira, v. 25, n. 1, s67, ago. 2007. Suplemento.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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