| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
|
Data corrente: |
11/05/2020 |
|
Data da última atualização: |
15/07/2020 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
CARMO, C. D. do; SOUSA, M. B. e; SILVA, P. P. dos S.; OLIVEIRA, G. A. F.; CEBALLOS, H.; OLIVEIRA, E. J. de. |
|
Afiliação: |
CÁTIA DIAS DO CARMO; MASSAINE BANDEIRA E SOUSA; PRISCILA PATRÍCIA DOS SANTOS SILVA; GILMARA ALVARENGA FACHARDO OLIVEIRA; HERNÁN CEBALLOS; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF. |
|
Título: |
Identification and validation of mutation points associated with waxy phenotype in cassava. |
|
Ano de publicação: |
2020 |
|
Fonte/Imprenta: |
BMC Plant Biology, v. 20, p.164, 2020. |
|
ISSN: |
1471-2229 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
BACKGROUND: The granule-bound starch synthase I (GBSSI) enzyme is responsible for the synthesis of amylose, and therefore, its absence results in individuals with a waxy starch phenotype in various amylaceous crops. The validation of mutation points previously associated with the waxy starch phenotype in cassava, as well as the identification of alternative mutant alleles in the GBSSI gene, can allow the development of molecular-assisted selection to introgress the waxy starch mutation into cassava breeding populations. RESULTS: A waxy cassava allele has been identified previously, associated with several SNPs. A particular SNP (intron 11) was used to develop SNAP markers for screening heterozygote types in cassava germplasm. Although the molecular segregation corresponds to the expected segregation at 3:1 ratio (dominant gene for the presence of amylose), the homozygotes containing the SNP associated with the waxy mutation did not show waxy phenotypes. To identify more markers, we sequenced the GBSS gene from 89 genotypes, including some that were segregated from a cross with a line carrying the known waxy allele. As a result, 17 mutations in the GBSSI gene were identified, in which only the deletion in exon 6 (MeWxEx6-del-C) was correlated with the waxy phenotype. The evaluation of mutation points by discriminant analysis of principal component analysis (DAPC) also did not completely discriminate the waxy individuals. Therefore, we developed Kompetitive Allele Specific PCR (KASP) markers that allowed discrimination between WX and wx alleles. The results demonstrated the non-existence of heterozygous individuals of the MeWxEx6-del-C deletion in the analyzed germplasm. Therefore, the deletion MeWxEx6-del-C should not be used for assisted selection in genetic backgrounds different from the original source of waxy starch. Also, the alternative SNPs identified in this study were not associated with the waxy phenotype when compared to a panel of accessions with high genetic diversity. CONCLUSION: Although the GBSSI gene can exhibit several mutations in cassava, only the deletion in exon 6 (MeWxEx6-del-C) was correlated with the waxy phenotype in the original AM206-5 source. MenosBACKGROUND: The granule-bound starch synthase I (GBSSI) enzyme is responsible for the synthesis of amylose, and therefore, its absence results in individuals with a waxy starch phenotype in various amylaceous crops. The validation of mutation points previously associated with the waxy starch phenotype in cassava, as well as the identification of alternative mutant alleles in the GBSSI gene, can allow the development of molecular-assisted selection to introgress the waxy starch mutation into cassava breeding populations. RESULTS: A waxy cassava allele has been identified previously, associated with several SNPs. A particular SNP (intron 11) was used to develop SNAP markers for screening heterozygote types in cassava germplasm. Although the molecular segregation corresponds to the expected segregation at 3:1 ratio (dominant gene for the presence of amylose), the homozygotes containing the SNP associated with the waxy mutation did not show waxy phenotypes. To identify more markers, we sequenced the GBSS gene from 89 genotypes, including some that were segregated from a cross with a line carrying the known waxy allele. As a result, 17 mutations in the GBSSI gene were identified, in which only the deletion in exon 6 (MeWxEx6-del-C) was correlated with the waxy phenotype. The evaluation of mutation points by discriminant analysis of principal component analysis (DAPC) also did not completely discriminate the waxy individuals. Therefore, we developed Kompetitive Allele Specific PCR... Mostrar Tudo |
|
Thesagro: |
Mandioca. |
|
Thesaurus Nal: |
Cassava. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
Marc: |
LEADER 02827naa a2200217 a 4500
001 2122191
005 2020-07-15
008 2020 bl uuuu u00u1 u #d
022 $a1471-2229
100 1 $aCARMO, C. D. do
245 $aIdentification and validation of mutation points associated with waxy phenotype in cassava.$h[electronic resource]
260 $c2020
520 $aBACKGROUND: The granule-bound starch synthase I (GBSSI) enzyme is responsible for the synthesis of amylose, and therefore, its absence results in individuals with a waxy starch phenotype in various amylaceous crops. The validation of mutation points previously associated with the waxy starch phenotype in cassava, as well as the identification of alternative mutant alleles in the GBSSI gene, can allow the development of molecular-assisted selection to introgress the waxy starch mutation into cassava breeding populations. RESULTS: A waxy cassava allele has been identified previously, associated with several SNPs. A particular SNP (intron 11) was used to develop SNAP markers for screening heterozygote types in cassava germplasm. Although the molecular segregation corresponds to the expected segregation at 3:1 ratio (dominant gene for the presence of amylose), the homozygotes containing the SNP associated with the waxy mutation did not show waxy phenotypes. To identify more markers, we sequenced the GBSS gene from 89 genotypes, including some that were segregated from a cross with a line carrying the known waxy allele. As a result, 17 mutations in the GBSSI gene were identified, in which only the deletion in exon 6 (MeWxEx6-del-C) was correlated with the waxy phenotype. The evaluation of mutation points by discriminant analysis of principal component analysis (DAPC) also did not completely discriminate the waxy individuals. Therefore, we developed Kompetitive Allele Specific PCR (KASP) markers that allowed discrimination between WX and wx alleles. The results demonstrated the non-existence of heterozygous individuals of the MeWxEx6-del-C deletion in the analyzed germplasm. Therefore, the deletion MeWxEx6-del-C should not be used for assisted selection in genetic backgrounds different from the original source of waxy starch. Also, the alternative SNPs identified in this study were not associated with the waxy phenotype when compared to a panel of accessions with high genetic diversity. CONCLUSION: Although the GBSSI gene can exhibit several mutations in cassava, only the deletion in exon 6 (MeWxEx6-del-C) was correlated with the waxy phenotype in the original AM206-5 source.
650 $aCassava
650 $aMandioca
700 1 $aSOUSA, M. B. e
700 1 $aSILVA, P. P. dos S.
700 1 $aOLIVEIRA, G. A. F.
700 1 $aCEBALLOS, H.
700 1 $aOLIVEIRA, E. J. de
773 $tBMC Plant Biology$gv. 20, p.164, 2020.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 93 | |
| 41. |  | OLIVEIRA, T. C. de; TAVARES, E. D.; SOUZA, F. A.; CURADO, F. F.; FREITAS NETO, J. A. de. Unidade de aprendizagem: espaço de trocas e de construção do conhecimento agroecológico no âmbito do Plano Brasil Sem Miséria, no Território Alto Sertão Sergipano. Learning unit: space for exchanges and construction of agroecological knowledge within the scope of the Brazil Without Poverty Plan, in the Alto Sertão Sergipano Territory. Cadernos de Agroecologia, v. 13, n. 1, 2018. ANAIS CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE AGROECOLOGIA, 6.; CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROECOLOGIA, 10.; SEMINÁRIO DE AGROECOLOGIA DO DISTRITO FEDERAL E ENTORNO, 5., 2017, Brasília, DF. Agroecologia na transformação dos sistemas agroalimentares...| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
|    |
| 43. | | OLIVEIRA, T. C. de; CALLE, A. C.; CURADO, F. F.; TAVARES, E. D.; SIQUEIRA, E. R. de. Uma visão da trajetória da Rede Sergipana de Agroecologia. Cadernos de Agroecologia, v. 15, n. 2. 2020. Edição dos Anais do XI Congresso Brasileiro de Agroecologia, São Cristóvão, Sergipe, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
| |
| 44. | | OLIVEIRA, T. C. de; COLLADO, A. C.; TAVARES, E. D.; CURADO, F. F.; SANTOS, A. da S. dos. Estratégias agroecológicas e a influência do acesso às políticas públicas na tragetória de agroecossistema familiar, no Estado de Sergipe, Brasil. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DE AGROECOLOGIA, 7., 2018, Córdoba. Agroecologia y soberania alimentaria (re)politizando los sistemas agroalimentarios: livro de actas. Córdoba: Unioversidad de Córdoba, 2018.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
| |
| 46. | | OLIVEIRA, T. K. de; SANTOS, F. C. B. dos; LUZ, S. A. da; OLIVEIRA, T. C. de; LESSA, L. S. Estabelecimento de espécies arbóreas nativas e exóticas sob diferentes espaçamentos na implantação de sistemas silvipastoris no Acre. In: CONFERÊNCIA DO SUBPROGRAMA DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA - SPC&T FASE II, 2008, Belém, PA. Anais... Brasília, DF: CNPq, 2009. p. 476-481.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
| |
| 47. | | SANTOS, F. C. B. dos; OLIVEIRA, T. K. de; LESSA, L. S.; OLIVEIRA, T. C. de; LUZ, S. A. Índices fisiológicos e efeito de diferentes recipientes em mudas de cupuaçuzeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 20.; ANNUAL MEETING OF THE INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HORTICULTURE, 54., 2008, Vitória. Frutas para todos : estratégias, tecnologias e visão sustentável. Vitória: INCAPER: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2008. 3 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
| |
| 48. | | OLIVEIRA, E. M. M.; SOUZA, A. M. de; RIBEIRO, F. V.; OLIVEIRA, T. C. de; NOGUEIRA, R. I. Estabilidade de placas "Ready to use" para detecção simultânea de multieventos geneticamente modificados. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DE ALIMENTOS, 25.; CIGR SESSION 6 INTERNATIONAL TECHNICAL SYMPOSIUM, 10., 2016, Gramado. Alimentação: árvore que sustenta a vida. Anais. Gramado: SBCTA Regional, 2016. 6 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos. |
|  |
| 50. | | SANTOS, F. C. B. dos; OLIVEIRA, T. K. de; LESSA, L. S.; OLIVEIRA, T. C. de; LUZ, S. A. da. Produção de mudas de cupuaçuzeiro em diferentes substratos e tubetes. Magistra, Cruz das Almas, v. 22, n. 3,4, p. 185-190, jul./dez. 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
| |
| 52. | | OLIVEIRA, T. C. de; TAVARES, E. D.; COLLADO, A. C.; CAPORAL, F. R.; SANTOS, A. da S. dos. Trajetória de um agroecossistema familiar: estratégias agroecológicas no âmbito do plano Brasil Sem Miséria (PBSM) em Gararu, Sergipe. In: CONGRESSO LATINO AMERICANO DE AGROECOLOGIA, 6.; CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROECOLOGIA, 10.; SEMINÁRIO DE AGROECOLOGIA DO DISTRITO FEDERAL E ENTORNO, 5., 2017, Brasília. Agroecologia na transformação dos sistemas agroalimentares na América Latina: memórias, saberes e caminhos para o bem viver: anais. Brasília, DF: ABA, 2017.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
| |
| 53. | | SÁ, L. R. V. de; OLIVEIRA, T. C. de; SANTOS, A. M. dos; OLIVEIRA, E. M. M.; CAMMAROTA, V. S; FERREIRA-LEITÃO, V. S. Avaliação de diferentes pré-tratamentos do inóculo para produção de H2 por bactérias anaeróbias In: LATIN AMERICAN WORKSHOP AND SYMPOSIUM ON ANAEROBIC DIGESTION, 5., 2011, Ouro Preto. Anais [...]. Ouro Preto: UFMG: UFOP, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos; Embrapa Solos. |
| |
| 54. | | OLIVEIRA, T. C. de; CALLE COLLADO, A.; CURADO, F. F.; SANTOS, A. da S. dos; SOUZA, F. A.; SA, C. O. de; SA, J. L. de. Agroecologia como promotora de saúde e segurança alimentar: uma experiência de redes sociotécnicas no nordeste do Brasil. Revista Brasileira de Agroecologia, v. 18, n. 5, p. 406-430, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Alimentos e Territórios; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
| |
| 55. | | KOLLING, M. D.; TARDIN, F. D.; OLIVEIRA, T. C. de; COSTA, J. S. da; RODRIGUES, C. L.; BARELLI, M. A. A. Caracterização de genótipos de sorgo sacarino na região de Cáceres, Mato Grosso. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 56. | | CARVALHO, A. V.; MATTIETTO, R. de A.; RIOS, A. de O.; MACIEL, R. de A.; MORESCO, K. S.; OLIVEIRA, T. C. de S. Bioactive compounds and antioxidant activity of pepper (Capsicum sp.) genotypes. Journal of Food Science and Technology, v. 52, n. 11, p. 7457-7464, Nov. 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 57. | | OLIVEIRA, T. C. de; GONÇALVES, D. de L.; RODRIGUES, A. P. S.; BARELLI, M. A. A.; TARDIN, F. D.; NEVES, L. G. Caracterização da divergência genética de sorgo sacarino na região de Cáceres-MT. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 58. | | OLIVEIRA, T. C. de; SANTOS, P. R. J. dos; KOLLING, M. D.; BARELLI, M. A. A.; TARDIN, F. D.; NEVIS, L. G.; SILVA, C. R. da. Análise de trilha no volume de caldo em genótipos de sorgo sacarino [Sorghum bicolor (L.) Moench]. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 7., 2013, Uberlândia. Variedade melhorada: a força da nossa agricultura: anais. Viçosa, MG: SBMP, 2013. p. 2385-2388.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 59. | | OLIVEIRA, T. C. de A.; COSTA, F. C. B. da; BRITO, M. A. V. P. e; SILVA, M. A. S.; MENDONCA, L. C.; LANGE, C. C. Fenótipo de resistência aos antimicrobianos de Staphylococcus aureus isolados de queijo Minas frescal e do ambiente de uma indústria de laticínios. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 18., 2016, Juiz de Fora, MG. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2016. 1 CD-ROM. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 197).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 60. | | SÁ, L. R. V. de; OLIVEIRA, T. C. de; SANTOS, T. F. dos; SANTOS, A. M. dos; CAMMAROTA, M. C.; OLIVEIRA, E. M. M.; FERREIRA-LEITÃO, V. S. Hydrogenase activity monitoring in the fermentative hydrogen production using heat pretreated sludge: a useful approach to evaluate bacterial communities performance. International Journal of Hydrogen Energy, v. 36, n. 13, p. 7543-7549, Jul. 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos; Embrapa Solos. |
| |
| Registros recuperados : 93 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
