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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia; Embrapa Meio-Norte. |
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Data corrente: |
26/01/2022 |
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Data da última atualização: |
21/02/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, T. L. C. da; SILVA, V. N. B.; BRAGA, I. de O.; RODRIGUES NETO, J. C.; LEAO, A. P.; RIBEIRO, J. A. de A.; VALADARES, L. F.; ABDELNUR, P. V.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. |
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Afiliação: |
THALLITON LUIZ CARVALHO DA SILVA, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal, Universidade Federal de Lavras, MG, Brasil.; VIVIANNY NAYSE BELO SILVA, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal, Universidade Federal de Lavras, MG, Brasil.; ÍTALO DE OLIVEIRA BRAGA, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal, Universidade Federal de Lavras, MG, Brasil.; JORGE CANDIDO RODRIGUES NETO, Instituto de Química, Universidade Federal de Goiás, Goiânia, GO, Brasil.; ANDRE PEREIRA LEAO, CNPAE; JOSE ANTONIO DE AQUINO RIBEIRO, CNPAE; LEONARDO FONSECA VALADARES, CNPAE; PATRICIA VERARDI ABDELNUR, CNPAE; CARLOS ANTONIO FERREIRA DE SOUSA, CPAMN; MANOEL TEIXEIRA SOUZA JUNIOR, CNPAE. |
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Título: |
Integration of metabolomics and transcriptomics data to further characterize Gliricidia sepium (Jacq.) Kunth under high salinity stress. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Plant Genome, e20182, 2021. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Soil salinity is one abiotic stress that threatens agriculture in more than 100 countries. Gliricidia [Gliricidia sepium (Jacq.) Kunth] is a multipurpose tree known for its ability to adapt to a wide range of soils; however, its tolerance limits and responses to salt stress are not yet well understood. In this study, after characterizing the morphophysiological responses of young gliricidia plants to salinity stress, leaf metabolic and transcription profiles were generated and submitted to single and integrated analyses. RNA from leaf samples were subjected to RNA sequencing using an Illumina HiSeq platform and the paired-end strategy. Polar and lipidic fractions from leaf samples were extracted and analyzed on an ultra-high-performance liquid chromatography (UHPLC) coupled with electrospray ionization quadrupole time-offlight high-resolution mass spectrometry (MS) system. Acquired data were analyzed using the OmicsBox, XCMS Online, MetaboAnalyst, and Omics Fusion platforms. The substrate salinization protocol used allowed the identification of two distinct responses to salt stress: tolerance and adaptation. Single analysis on transcriptome and metabolome data sets led to a group of 5,672 transcripts and 107 metabolites differentially expressed in gliricidia leaves under salt stress. The phenylpropanoid biosynthesis was the most affected pathway, with 15 metabolites and three genes differentially expressed. Results showed that the differentially expressed metabolites and genes from this pathway affect mainly short-term salt stress (STS). The single analysis of the transcriptome identified 12 genes coding for proteins that might play a role in gliricidia response at both STS and long-termsalt stress (LTS). Further studies are needed to reveal the mechanisms behind the adaptation response. MenosSoil salinity is one abiotic stress that threatens agriculture in more than 100 countries. Gliricidia [Gliricidia sepium (Jacq.) Kunth] is a multipurpose tree known for its ability to adapt to a wide range of soils; however, its tolerance limits and responses to salt stress are not yet well understood. In this study, after characterizing the morphophysiological responses of young gliricidia plants to salinity stress, leaf metabolic and transcription profiles were generated and submitted to single and integrated analyses. RNA from leaf samples were subjected to RNA sequencing using an Illumina HiSeq platform and the paired-end strategy. Polar and lipidic fractions from leaf samples were extracted and analyzed on an ultra-high-performance liquid chromatography (UHPLC) coupled with electrospray ionization quadrupole time-offlight high-resolution mass spectrometry (MS) system. Acquired data were analyzed using the OmicsBox, XCMS Online, MetaboAnalyst, and Omics Fusion platforms. The substrate salinization protocol used allowed the identification of two distinct responses to salt stress: tolerance and adaptation. Single analysis on transcriptome and metabolome data sets led to a group of 5,672 transcripts and 107 metabolites differentially expressed in gliricidia leaves under salt stress. The phenylpropanoid biosynthesis was the most affected pathway, with 15 metabolites and three genes differentially expressed. Results showed that the differentially expressed metabolites and gen... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Adaptation; Salinization protocol. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/230514/1/The-Plant-Genome-2022-Integration.pdf
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Marc: |
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520 $aSoil salinity is one abiotic stress that threatens agriculture in more than 100 countries. Gliricidia [Gliricidia sepium (Jacq.) Kunth] is a multipurpose tree known for its ability to adapt to a wide range of soils; however, its tolerance limits and responses to salt stress are not yet well understood. In this study, after characterizing the morphophysiological responses of young gliricidia plants to salinity stress, leaf metabolic and transcription profiles were generated and submitted to single and integrated analyses. RNA from leaf samples were subjected to RNA sequencing using an Illumina HiSeq platform and the paired-end strategy. Polar and lipidic fractions from leaf samples were extracted and analyzed on an ultra-high-performance liquid chromatography (UHPLC) coupled with electrospray ionization quadrupole time-offlight high-resolution mass spectrometry (MS) system. Acquired data were analyzed using the OmicsBox, XCMS Online, MetaboAnalyst, and Omics Fusion platforms. The substrate salinization protocol used allowed the identification of two distinct responses to salt stress: tolerance and adaptation. Single analysis on transcriptome and metabolome data sets led to a group of 5,672 transcripts and 107 metabolites differentially expressed in gliricidia leaves under salt stress. The phenylpropanoid biosynthesis was the most affected pathway, with 15 metabolites and three genes differentially expressed. Results showed that the differentially expressed metabolites and genes from this pathway affect mainly short-term salt stress (STS). The single analysis of the transcriptome identified 12 genes coding for proteins that might play a role in gliricidia response at both STS and long-termsalt stress (LTS). Further studies are needed to reveal the mechanisms behind the adaptation response.
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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| Registros recuperados : 106 | |
| 81. |  | MARTINS, P. K.; DIAS, B. B. A.; RIBEIRO, A. P.; SHINOZAKI, K. Y.; NAKASHIMA, K.; NEPOMUCENO, A. L.; SOUSA, C. A. F. de; KOBAYASHI, A. K.; MOLINARI, H. B. C. Overexpression of AtDREB2A CA gene in sugarcane. In: GERMPLASM AND BREEDING, 11.; MOLECULAR BIOLOGY ISSCT WORKSHOP, 8., 2015, Saint-Gilles Réunion Island. Pushing the frontiers of sugarcane improvement: abstract. [S.l]: Ercane, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 83. | | PEREIRA, F. de M.; FREITAS, B. M.; VIEIRA NETO, J. M.; SOUSA, C. A. F. de; LOPES, M. T. do R.; RIBEIRO, V. Q.; CAMARGO, R. C. R. de. Sucedâneo de leite pra bezerro na alimentação de Apis mellifera. n: CONGRESSO BRASILEIRO DE APICULTURA, 17.; MELIPONICULTURA, 3., 2008, Belo Horizonte. [Resumos...]. Belo Horizonte: Confederação Brasileira de Apicultura, 2008. 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 84. | | SOUSA, C. A. F. de; ANDRADE JUNIOR, A. S. de; BASTOS, E. A.; CASARI, R. A. das C. N.; KOBAYASHI, A. K.; MOLINARI, H. B. C.; SOUZA JUNIOR, M. T.; SANTOS, T. T. Uso de câmeras térmicas embarcadas em aeronaves remotamente pilotadas, visando à fenotipagem de plantas. Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2020. 29 p. (Embrapa Meio-Norte. Documentos, 269).| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Agroenergia; Embrapa Meio-Norte. |
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| 85. | | CASARI, R. A. C. N.; SILVA, V. N. B.; FERREIRA, T. M. M.; KOBAYASHI, A. K.; DIAS, B. B. A.; SANTOS, T. T.; MOLINARI, H. B. C.; SOUZA JUNIOR, M. T.; SOUSA, C. A. F. de. Use of thermal imaging for discrimination of maize genotypes submitted to water deficit stress. In: LATIN-AMERICAN CONFERENCE ON PLANT PHENOTYPING AND PHENOMICS FOR PLANT BREEDING, 2., 2017, São Carlos, SP. Proceedings... São Carlos: Embrapa Instrumentação, 2017. p. 27.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 86. | | DIAS, B. B. A.; MARTINS, P. K.; RIBEIRO, A. P.; Yamaguchi-Shinozaki, K.; Nakashima, K.; Fujita, Y.; NEPOMUCENO, A. L.; SOUSA, C. A. F. de; KOBAYASHI, A. K.; MOLINARI, H. B. C. Water deficit induced expression of AREB gene in sugarcane. In: GERMPLASM AND BREEDING, 11.; MOLECULAR BIOLOGY ISSCT WORKSHOP, 8., 2015, Saint-Gilles Réunion Island. Pushing the frontiers of sugarcane improvement: abstract. [S.l]: Ercane, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 87. | | TAVARES, C. J.; RIBEIRO JUNIOR, W. Q.; RAMOS, M. L. G.; PEREIRA, L. F.; MULLER, O.; CASARI, R. A. das C. N.; SOUSA, C. A. F. de; SILVA, A. R. da. Water stress alters physiological, spectral, and agronomic indexes of wheat genotypes. Plants, v. 12, n. 20), 3571, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Meio-Norte. |
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| 88. | | SOUSA, V. F. de; BELMINO, C. S.; SOUSA, C. A. F. de; CARNEIRO, J. D. S.; SILVA, P. H. S. da; VASCONCELOS, L. F. L.; SOUSA, H. U. de; MAIA, C. B.; ELOI, W. M.; VIANA, S. R. S.; BARBOSA, F. R.; MOREIRA, A. N.; TAVARES, S. C. C. de H.; MOUCO, M. A. do C.; SILVA, D. J.; ASSIS, J. S. de. Produção integrada de manga no Estado do Piauí: documentos de referência. Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2005. 140 p. (Embrapa Meio-Norte. Documentos, 106).| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 89. | | SOUSA, V. F. de; BELMINO, C. S.; SOUSA, C. A. F. de; CARNEIRO, J. da S.; SILVA, P. H. S. da; VASCONCELOS, L. F. L.; SOUSA, H. U. de; MAIA, C. B.; ELOI, W. M.; VIANA, S. R. S.; BARBOSA, F. R.; MOREIRA, A. N.; TAVARES, S. C. C. de H.; MOUCO, M. A. do C.; SILVA, D. J. da; ASSIS, J. S. de. Produção integrada de manga no Estado do Piauí: documentos de referência. Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2005. 140 p. (Embrapa Meio-Norte. Documentos, 106).| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 90. | | SOUSA, V. F. de; SOUSA, C. A. F. de; BELMINO, C. S.; CARNEIRO, J. da S.; SILVA, P. H. S. da; VASCONCELOS, L. F. L.; SOUSA, H. U. de; MAIA, C. B.; ELOI, W. M.; VIANA, S. R. S.; BARBOSA, F. R.; MOREIRA, A. N.; TAVARES, S. C. C. de H.; MOUCO, M. A. do C.; SILVA, D. J. da; ASSIS, J. S. de. Produção integrada de manga no Estado do Piauí. Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2004. 44 p. (Embrapa Meio-Norte. Documentos, 90).| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 91. | | SOUSA, V. F. de; SOUSA, C. A. F. de; BELMINO, C. S.; CARNEIRO, J. da S.; SILVA, P. H. S. da; VASCONCELOS, L. F. L.; SOUSA, H. U.; MAIA, C. B.; ELOI, W. M.; VIANA, S. R. S.; MOREIRA, F. R. B.; MOREIRA, A. N.; TAVARES, S. C. C. de H.; MOUCO, M. A. do C.; SILVA, D. J.; ASSIS, J. S. de. Produção integrada de manga no Estado do Piauí. Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2004. 44 p. (Embrapa Meio-Norte. Documentos, 90).| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 92. | | PEREIRA, L. F.; RIBEIRO JUNIOR, W. Q.; RAMOS, M. L. G.; SANTOS, N. Z. dos; SOARES, G. F.; CASARI, R. A. das C. N.; MULLER, O.; TAVARES, C. J.; MARTINS, E. de S.; RASCHER, U.; GUIMARÃES, C. A. de L.; PEREIRA, A. F.; MERTZ-HENNING, L. M.; SOUSA, C. A. F. de. Physiological changes in soybean cultivated with soil remineralizer in the Cerrado under variable water regimes. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 56, e01455, 2021. Título em português: Alterações fisiológicas de soja cultivada com remineralizador de solo no Cerrado sob regimes hídricos variáveis.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Soja; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 93. | | REIS, R. R.; DIAS, B. B. A.; MARTINS, P. K.; MARTINS, M. T. B.; ALEKCEVETCH, J. C.; JÚNIOR, A. C.; ANDRADE, A. C.; RIBEIRO, A. P.; QIND, F.; MIZOI, J.; SHINOZAKI, K. I.; NAKASHIMA, K.; CARVALHO, J. de F. C.; SOUSA, C. A. F. de; NEPOMUCENO, A. L.; KOBAYASHI, A. K.; MOLINARI, H. B. C. Induced over-expression of AtDREB2A CA improves drought tolerancein sugarcane. Plant Science, v. 221-222, p. 59-68, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 94. | | REIS, R. R.; CUNHA, B. A. D. B. da; MARTINS, P. K.; MARTINS, M. T. B.; ALEKCEVETCH, J. C.; CHALFUN-JÚNIOR, A.; ANDRADE, A. C.; RIBEIRO, A. P.; QIN, F.; MIZOI, J.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; NAKASHIMA, K.; CARVALHO, J. de F. C.; SOUSA, C. A. F. de; NEPOMUCENO, A. L.; KOBAYASHI, A. K.; MOLINARI, H. B. C. Induced over-expression of AtDREB2A CA improves drought tolerance in sugarcane. Plant Science, Limerick, v. 221-222, p. 59-68, May, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 95. | | REIS, R. R.; DIAS, B. B. A.; MARTINS, P. K.; MARTINS, M. T. B.; ALEKCEVETCH, J. C.; JÚNIOR, A. C.; ANDRADE, A. C.; RIBEIRO, A. P.; QIND, F.; MIZOI, J.; SHINOZAKI, K. I.; NAKASHIMA, K.; CARVALHO, J. de F. C.; SOUSA, C. A. F. de; NEPOMUCENO, A. L.; KOBAYASHI, A. K.; MOLINARI, H. B. C. Induced over-expression of AtDREB2A CA improves drought tolerance in sugarcane. Plant Science, v. 221-222, p. 59-68, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 96. | | BASSO, M. F.; DIAS, B. B. A.; RIBEIRO, A. P.; MARTINS, P. K.; SOUZA, W. R.; OLIVEIRA, N. G. DE.; NAKAYAMA, T. J.; CASARI, R. A das C. N.; SANTIAGO, T. R.; VINECKY, F.; JUNGMANN, L.; SOUSA, C. A. F. de; OLIVEIRA, P. A. de; SOUZA, S. A. C. D. de; CANCADO, G. M. de A.; KOBAYASHI, A. K.; MOLINARI, H. B. C. Improved genetic transformation of sugarcane (Saccharum spp.) embryogenic callus mediated by Agrobacterium tumefaciens. Current Protocols in Plant Biology, v. 2, n. 3, p. 221-239, Sept. 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Agroenergia. |
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| 97. | | RODRIGUES NETO, J. C.; SALGADO, F. F.; BRAGA, I. DE O.; SILVA, T. L. C. DA; SILVA, V. N. B.; LEAO, A. P.; RIBEIRO, J. A. de A.; ABDELNUR, P. V.; VALADARES, L. F.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Osmoprotectants play a major role in the Portulaca oleracea resistance to high levels of salinity stress-insights from a metabolomics and proteomics integrated approach. Frontiers in Plant Science, v. 14, 1187803, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Meio-Norte. |
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| 98. | | RIBEIRO, A. P.; SOUZA, W. R. de; MARTINS, P. K.; VINECKY, F.; DUARTE, K. E.; BASSO, M. F.; CUNHA, B. A. D. B. da; CAMPANHA, R. B.; OLIVEIRA, P. A. de; CENTENO, D. C.; CANÇADO, G. M. A.; MAGALHÃES, J. V. de; SOUSA, C. A. F. de; ANDRADE, A. C.; KOBAYASHI, A. K.; MOLINARI, H. B. C. Overexpression of BdMATE Gene improves aluminum tolerance in Setaria viridis. Frontiers in Plant Science, v. 8, artigo 685, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 99. | | RIBEIRO, A. P.; SOUZA, W. R. de; MARTINS, P. K.; VINECKY, F.; DUARTE, K. E.; BASSO, M. F.; DIAS, B. B. A.; CAMPANHA, R. B.; OLIVEIRA, P. A. de; CENTENO, D. C.; CANÇADO, G. M. de A.; MAGALHÃES, J. V. de; SOUSA, C. A. F. de; ANDRADE, A. C.; KOBAYASHI, A. K.; MOLINARI, H. B. C. Overexpression of BdMATE gene improves aluminum tolerance in Setaria viridis. Frontiers in Plant Science, v. 8, p. 1-12, June 2017. 12 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 100. | | MOLINARI, H. B. C.; DIAS, B. B. A.; BATISTA, L. M. T.; RIBEIRO JUNIOR, W. Q.; RAMOS, M. L. G.; BUFON, V. B.; DEUNER, S.; SANTOS, J. D.; SOUSA, R. Z.; SANTOS, J. M.; KOYAMA, C. M.; SILVA, H. D. S.; KOBAYASHI, A. K.; SOUSA, C. A. F. de; SILVA, S. D. dos A. e; SHINOZAKI, K. Y. Phenotyping sugarcane plants fot drought tolerance. In:PHENODAYS, Wageningen- NL, 2012, Program & abstract book. Hosted by Phenofab, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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