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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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Data corrente: |
27/09/2019 |
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Data da última atualização: |
07/11/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
AZEVEDO, D. A. A. de; MONTEIRO, J. P.; PINHEIRO, R. R.; MUDADU, M. de A.; ANDRIOLI, A.; ARAÚJO, J. F.; SOUSA, A. L. M. de; SIDER, L. H.; PEIXOTO, R. M.; TEIXEIRA, M. F. da S. |
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Afiliação: |
DALVA ALANA ARAGÃO DE AZEVEDO, Universidade Estadual do Ceará (UECE) - Fortaleza, CE, Brazil; JOMAR PATRICIO MONTEIRO, CNPC; RAYMUNDO RIZALDO PINHEIRO, CNPC; MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CNPTIA; ALICE ANDRIOLI, CNPC; JUSCILÂNIA FURTADO ARAÚJO, Northeast Biotechnology Network, Universidade Estadual do Ceará (UECE) - Fortaleza, CE, Brazil; ANA LÍDIA MADEIRA DE SOUSA, Universidade Estadual do Ceará (UECE) - Fortaleza, CE, Brazil; LUCIA HELENA SIDER, CNPC; RENATO MESQUITA PEIXOTO, Universidade Federal do Acre (UFAC) - Rio Branco, AC, Brazil; MARIA FÁTIMA DA SILVA TEIXEIRA, Universidade Estadual do Ceará (UECE) - Fortaleza, CE, Brazil. |
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Título: |
Molecular characterization of circulating strains of small ruminant lentiviruses in Brazil based on complete gag and pol genes. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Small Ruminant Research, v. 177, p. 160-166, 2019. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.smallrumres.2019.06.011 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Small ruminant lentiviruses (SRLV) are widely distributed in the world and cause productive and economic losses. These pathogens have high genetic variability, which hinders diagnosis by molecular methods. Molecular characterization studies are good strategies for elaborating programs aimed to control or eradicate diseases. Hence, this study aimed to sequence, characterize and compare strains of SRLV, which were isolated from naturally infected goats from the states of Ceará, Rio Grande do Norte and Minas Gerais, Brazil, based on total nucleotide sequences of gag and pol genes. SRLV isolates from the microbiological collection of Sheep and Goat of Embrapa were cultured in goat synovial membrane. Supernatants containing cells were stored and viral particles were purified with sucrose density gradient centrifugation for RNA extraction. Then, sequencing in HiSeq 2500 platform (Illumina) was performed to obtain the total genome of the SRLV strains. The software MEGA version 7.0 was used for sequence editing and phylogeny analysis. A total of 17 isolates were multiplied in cellular culture and six were viable, which were two from Minas Gerais (MG), one from Rio Grande do Norte (RN) and three from Ceará (CE). Two sequences were obtained from the sequencing by synthesis, one from MG (BRMG CNPC) and one from RN (BRRN CNPC). From the total SRLV genome (9,200 bases), sample BRMG CNPC generated a consensus of 6,378 bases, approximately 69,34% of the viral genome and sample BRRN CNPC generated a consensus of 5,351 bases, which comprised 58.16% of the total genome. Samples in this study demonstrated closer phylogenetic relation with genotype B (B1 group). The remaining strains sequenced in Brazil are also present in the same group with the exception of three samples from genotype A. Immunodominant regions of gag gene and motifs of pol gene were similar to the standard CAEV Cork strain. For the first time, the complete gag and pol genes were sequenced in Brazil from the strain BRMG CNPC isolated in Minas Gerais state. In addition, 2490 bases from the total of 3316 bases were sequenced from the pol gene of the BRRN CNPC sample from Rio Grande do Norte. MenosAbstract: Small ruminant lentiviruses (SRLV) are widely distributed in the world and cause productive and economic losses. These pathogens have high genetic variability, which hinders diagnosis by molecular methods. Molecular characterization studies are good strategies for elaborating programs aimed to control or eradicate diseases. Hence, this study aimed to sequence, characterize and compare strains of SRLV, which were isolated from naturally infected goats from the states of Ceará, Rio Grande do Norte and Minas Gerais, Brazil, based on total nucleotide sequences of gag and pol genes. SRLV isolates from the microbiological collection of Sheep and Goat of Embrapa were cultured in goat synovial membrane. Supernatants containing cells were stored and viral particles were purified with sucrose density gradient centrifugation for RNA extraction. Then, sequencing in HiSeq 2500 platform (Illumina) was performed to obtain the total genome of the SRLV strains. The software MEGA version 7.0 was used for sequence editing and phylogeny analysis. A total of 17 isolates were multiplied in cellular culture and six were viable, which were two from Minas Gerais (MG), one from Rio Grande do Norte (RN) and three from Ceará (CE). Two sequences were obtained from the sequencing by synthesis, one from MG (BRMG CNPC) and one from RN (BRRN CNPC). From the total SRLV genome (9,200 bases), sample BRMG CNPC generated a consensus of 6,378 bases, approximately 69,34% of the viral genome and sample BR... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Caracterização molecular; Molecular characterization; SRLV. |
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Thesaurus Nal: |
Genome; Goats; Lentivirus; Phylogeny; Sheep. |
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Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
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Marc: |
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001 2112529
005 2019-11-07
008 2019 bl uuuu u00u1 u #d
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520 $aAbstract: Small ruminant lentiviruses (SRLV) are widely distributed in the world and cause productive and economic losses. These pathogens have high genetic variability, which hinders diagnosis by molecular methods. Molecular characterization studies are good strategies for elaborating programs aimed to control or eradicate diseases. Hence, this study aimed to sequence, characterize and compare strains of SRLV, which were isolated from naturally infected goats from the states of Ceará, Rio Grande do Norte and Minas Gerais, Brazil, based on total nucleotide sequences of gag and pol genes. SRLV isolates from the microbiological collection of Sheep and Goat of Embrapa were cultured in goat synovial membrane. Supernatants containing cells were stored and viral particles were purified with sucrose density gradient centrifugation for RNA extraction. Then, sequencing in HiSeq 2500 platform (Illumina) was performed to obtain the total genome of the SRLV strains. The software MEGA version 7.0 was used for sequence editing and phylogeny analysis. A total of 17 isolates were multiplied in cellular culture and six were viable, which were two from Minas Gerais (MG), one from Rio Grande do Norte (RN) and three from Ceará (CE). Two sequences were obtained from the sequencing by synthesis, one from MG (BRMG CNPC) and one from RN (BRRN CNPC). From the total SRLV genome (9,200 bases), sample BRMG CNPC generated a consensus of 6,378 bases, approximately 69,34% of the viral genome and sample BRRN CNPC generated a consensus of 5,351 bases, which comprised 58.16% of the total genome. Samples in this study demonstrated closer phylogenetic relation with genotype B (B1 group). The remaining strains sequenced in Brazil are also present in the same group with the exception of three samples from genotype A. Immunodominant regions of gag gene and motifs of pol gene were similar to the standard CAEV Cork strain. For the first time, the complete gag and pol genes were sequenced in Brazil from the strain BRMG CNPC isolated in Minas Gerais state. In addition, 2490 bases from the total of 3316 bases were sequenced from the pol gene of the BRRN CNPC sample from Rio Grande do Norte.
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Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
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| 4. |  | ARAÚJO, J. F.; AZEVEDO, D. A. A. de; SOUSA, A. L. M. de; SOUZA, T. S. de; ANDRIOLI, A. Análise proteica bidimensional de antígeno do vírus Maedi-Visna. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CAPRINOS E OVINOS, 2., 2013, Sobral. Resumos... Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2013. p. 59-60. (Embrapa Caprinos e Ovinos. Documentos, 109).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 5. | | ARAÚJO, J. F.; SOUSA, A. L. M. de; AZEVEDO, D. A. A. de; SANTOS, V. W. de S.; ALVES, F. S. F.; PINHEIRO, R. R. Avaliação da sensibilidade de testes de imunodiagnósticos para detecção de anticorpos contra o vírus da artrite encefalite caprina. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CAPRINOS E OVINOS, 3., 2014, Sobral. Anais... Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2014. p. 42.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 6. | | ALBUQUERQUE, V. de A.; MEDEIROS, R. H. G.; PINHEIRO, R. R.; AZEVEDO, D. A. A. de; SOUSA, A. L. M. de; FACCIOLI-MARTINS, P. Y. Avaliação de ferramenta nanotecnológica para o controle de linfadenite caseosa; dados preliminares. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CAPRINOS E OVINOS, 6., 2017, Sobral. Anais... Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2017. p. 60-61. [PATRICIA YOSHIDA FACCIOLI MARTINS].| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 7. | | AZEVEDO, D. A. A.; SOUSA, A. L. M. de; ARAÚJO, J. F.; SANTOS, V. W. S. dos; ANDRIOLI, A.; PINHEIRO, R. R. Antígenos de cepas nacionais de lentivirus de pequenos ruminantes: análise protéica. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CAPRINOS E OVINOS, 1., 2012, Sobral. Resumos... Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2012. p. 53-54. (Embrapa Caprinos e Ovinos. Documentos, 104).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 8. | | ARAÚJO, J. F.; AZEVEDO, D. A. A. de; SOUSA, A. L. M. de; SANTIAGO, L. B.; ANDRIOLI, A.; PINHEIRO, R. R. Análise imunogênica de antígeno do vírus Maedi-visna pelo Western Blot 2-D. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CAPRINOS E OVINOS, 2., 2013, Sobral. Resumos... Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2013. p. 57-58. (Embrapa Caprinos e Ovinos. Documentos, 109).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 9. | | LOPES, A. K. C.; ARAÚJO, J. F.; PEIXOTO, R. M.; SOUSA, A. L. M. de; LIMA, A. M. C.; AMARAL, G. P.; VASCONCELOS, A. M. de; ANDRIOLI, A. Evaluation of maternal-filial stress in a dairy goat herd with small ruminant lentivirus infection in the Brazilian northeastern semiarid region. Journal of Veterinary Behavior, v. 46, 54–61, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 10. | | PEIXOTO, R. M.; ANDRIOLI, A.; PINHEIRO, R. R.; SOUZA, K. C. de; ARAÚJO, J. F.; SOUSA, A. L. M. de; LOPES, A. K. C.; SOUZA, S. C. R. Immune response dynamics of recent and chronic small ruminant lentivirus infection in the male reproductive system. Semina: Ciências Agrárias, v. 44, n. 1, p. 185-202, jan./fev. 2023. Título em português: Dinâmica da resposta imunológica da infecção recente e crônica por lentivírus de pequenos ruminantes no sistema reprodutor de machos.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
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| 11. | | AZEVEDO, D. A. A. de; ARAÚJO, J. F.; SOUSA, A. L. M. de; DIAS, R. P.; SOUZA, T. S. de; ANDRIOLI, A.; PINHEIRO, R. R. Produção de antígeno de lentivírus de pequenos ruminantes através da cultura celular de membrana nictitante caprina. Revista Brasileira de Medicina Veterinária, v. 37, n. 4, p. 316-320, out./dez. 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
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| 12. | | AZEVEDO, D. A. A. de; SOUSA, A. L. M. de; ARAÚJO, J. F.; MUNIZ, F.; MARANGUAPE, R.; ANDRIOLI, A.; CRUZ, J. C. M. da; PINHEIRO, R. R. Perfil eletroforético bidimensional do antígeno de lentivírus de pequenos ruminantes: dados preliminares. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 7.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 13., 2012, Maceió. Anais... Maceió: Sociedade Nordestina de Produção Animal, 2012. 3 f. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 13. | | PEIXOTO, R. M.; TEIXEIRA, M. F. da S.; ANDRIOLI, A.; PINHEIRO, R. R.; SILVA, A. A. de S.; AGUIAR, T. D. de F.; SOUSA, A. L. M. de. Perspectivas do uso de fitoterápicos no tratamento do sêmen caprino infectado pelo vírus da Artrite Encefalite Caprina. Medicina Veterinária (UFRPE), v. 12, n. 3, p. 193-201, jul/set. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
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| 14. | | SOUSA, A. L. M. de; AZEVEDO, D. A. A. de; ARAÚJO, J. F.; ANDRIOLI, A. A.; SIDER, L. H.; PINHEIRO, R. R. Perfil imunogênico bidimensional de antígeno da artrite encefalite caprina produzido com cepa nativa do estado do Ceará. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CAPRINOS E OVINOS, 2., 2013, Sobral. Resumos... Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2013. p. 63-64. (Embrapa Caprinos e Ovinos. Documentos, 109).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 15. | | SOUSA. A. L. M. de; AZEVEDO, D. A. A. de; AZEVEDO, D. A. A. de; ARAÚJO, J. F.; ANDRIOLI, A.; SIDER, L. H.; PINHEIRO, R. R. Perfil proteico bidimensional de antígeno da Artrite Encefalite Caprina produzido a partir de isolados do Estado do Ceará. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CAPRINOS E OVINOS, 2., 2013, Sobral. Resumos... Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2013. p. 61-62. (Embrapa Caprinos e Ovinos. Documentos, 109).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 16. | | ARAÚJO, J. F.; SOUSA, A. L. M. de; AZEVEDO, D. A. A. de; SOUZA, T. S. de; ANDRIOLI, A.; PINHEIRO, R. R. Titulação de cepas do vírus da Artrite Encefalite Caprina isolados do estado do Ceará. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CAPRINOS E OVINOS, 1., 2012, Sobral. Resumos... Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2012. p. 13-14. (Embrapa Caprinos e Ovinos. Documentos, 104).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 18. | | AZEVEDO, D. A. A. de; SANTOS, V. W. S. dos; SOUSA, A. L. M. de; PEIXOTO, R. M.; PINHEIRO, R. R.; ANDRIOLI, A.; TEIXEIRA, M. F. da S. Small ruminant lentiviruses: economic and productive losses, consequences of the disease. Arquivos do Instituto Biológico, v. 84, p. 1-10, e0552016, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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