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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
27/12/2016 |
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Data da última atualização: |
07/06/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
PEZENTI, L. F.; GONÇALVES, K. B.; SOUZA, R. F.; VILAS-BOAS, L. A.; SOSA-GOMEZ, D. R.; ROSA, R. da. |
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Afiliação: |
DANIEL RICARDO SOSA GOMEZ, CNPSO. |
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Título: |
Montagem de novo do transcriptoma de Anticarsia gemmatalis. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
In: ENCONTRO PARANAENSE DE GENÉTICA, 13., GENÉTICA NAS FÉRIAS, 10., 2016. Tempos modernos: anais. Londrina: UEL, 2016. |
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Páginas: |
p. 43. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Anticarsia gemmatalis Hübner 1818 (Lepidoptera: Noctuidae), conhecida como lagarta-da-soja é a desfolhadora mais comum da soja no Brasil, ocasionando perdas consideráveis na produtividade da cultura. Informações relevantes têm sido obtidas a respeito das bases genéticas e fisiológicas associadas à resistência de insetos a vários tipos de inseticidas, através da aplicação de técnicas moleculares para determinar padrões de expressão gênica. Entre elas, destaca-se o RNA-seq que permite quantificar o nível de expressão gênica, além de analisar a estrutura do transcriptoma sem a necessidade de um conhecimento prévio do genoma estudado. Dessa maneira, neste trabalho foram obtidos os transcritos de diferentes populações de A. gemmatalis (resistentes e suscetíveis, tratadas e não-tratadas com a proteína bioinseticida de Bacillus thuringiensis - Cry1Ac), e analisados o seu perfil transcricional através do RNA-seq. Foram construídas doze bibliotecas de cDNA (protocolo Illumina TruSeq Stranded mRNA LS) a partir de doze amostras de RNA extraídas conforme protocolo adaptado utilizando TRIzol® Reagent e o SV Total RNA Isolation System Promega. O sequenciamento foi realizado na plataforma Illumina HiSeq 2500 V4 com leitura paired-end de 125pb. A qualidade dos reads obtidos foram verificados com FastQC v0.11.4, e trimados com Prinseq v0.20.4. A montagem do transcriptoma foi realizada na plataforma Trinity v2.2.0 com a estratégia de novo, pois não existe um genoma de referência para o mapeamento dos transcritos e construção de contigs. Os transcritos de uma das bibliotecas foram anotados e categorizados usando o software Blast2go v3.2.7, logo após a busca por similaridade dos transcritos contra banco de dados. O transcriptoma das doze bibliotecas de A. gemmatalis apresentou 754.280 transcritos, montados a partir de 503.590.692 reads, com uma média de 41.965.891 milhões de reads por biblioteca, e N50 variando de 1146 a 1520. Os dados apresentados são preliminares, porém este estudo nos permite reportar a montagem do transcriptoma de A. gemmatalis e apresentar dados preliminares de anotação funcional. Estes resultados abrem novas perspectivas para o estudo genômico de A. gemmatalis, e possibilitará a posterior identificação de genes candidatos relacionados aos mecanismos de resistência de importantes pragas agrícolas. MenosAnticarsia gemmatalis Hübner 1818 (Lepidoptera: Noctuidae), conhecida como lagarta-da-soja é a desfolhadora mais comum da soja no Brasil, ocasionando perdas consideráveis na produtividade da cultura. Informações relevantes têm sido obtidas a respeito das bases genéticas e fisiológicas associadas à resistência de insetos a vários tipos de inseticidas, através da aplicação de técnicas moleculares para determinar padrões de expressão gênica. Entre elas, destaca-se o RNA-seq que permite quantificar o nível de expressão gênica, além de analisar a estrutura do transcriptoma sem a necessidade de um conhecimento prévio do genoma estudado. Dessa maneira, neste trabalho foram obtidos os transcritos de diferentes populações de A. gemmatalis (resistentes e suscetíveis, tratadas e não-tratadas com a proteína bioinseticida de Bacillus thuringiensis - Cry1Ac), e analisados o seu perfil transcricional através do RNA-seq. Foram construídas doze bibliotecas de cDNA (protocolo Illumina TruSeq Stranded mRNA LS) a partir de doze amostras de RNA extraídas conforme protocolo adaptado utilizando TRIzol® Reagent e o SV Total RNA Isolation System Promega. O sequenciamento foi realizado na plataforma Illumina HiSeq 2500 V4 com leitura paired-end de 125pb. A qualidade dos reads obtidos foram verificados com FastQC v0.11.4, e trimados com Prinseq v0.20.4. A montagem do transcriptoma foi realizada na plataforma Trinity v2.2.0 com a estratégia de novo, pois não existe um genoma de referência para o mapeam... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Lagarta-da-soja; Transcriptoma. |
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Thesagro: |
Genética; RNA. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/152327/1/Anais.2016.p.43.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 553 | |
| 423. |  | SOSA-GOMEZ, D. R.; LOPES, I. de O. N.; SILVA, J. J. da; OLIVEIRA, M. C. N. de. Resistência de pentatomídeos a inseticidas químicos e linhas-base de suscetibilidade determinadas mediante aplicação tópica. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 27., 2005. Cornélio Procópio. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2005. p. 131-132. (Embrapa Soja. Documentos, 257). Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Janete Lasso Ortiz, Simone Ery Grosskopf.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 424. | | KUSS-ROGGIA, R.C.R.; ZAZYCKI, L. C. F.; SOSA-GÓMEZ, D. R.; BENTO, J. M. S. Repertório comportamental de chamamento, corte e cópula de Spodoptera frugiperda (J. E. Smith, 1797) (Lepidoptera: noctuidae). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 6., 2012, Cuiabá. Soja: integração nacional e desenvolvimento sustentável: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 48, res. 62.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 425. | | KUSS-ROGGIA, R.C.R.; ZAZYCKI, L. C. F.; SOSA-GOMEZ, D. R.; BENTO, J. M. S. Repertório comportamental de chamamento, corte e cópula de Spodoptera frugiperda (J. E. Smith, 1797) (Lepidoptera: noctuidae). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 6., 2012, Cuiabá. Soja: integração nacional e desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2012. 4 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 426. | | QUEIROZ, A. P. de; SOUZA, T. D.; PESSOA, A. C. S. F.; SOUZA, M. L. de; SÓSA-GOMEZ, D. R. Parâmetros de produção de RanuNPV em Rachiplusia nu (Lepidoptera: Noctuidae, Plusiinae) a diferentes temperaturas e concentrações. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 28., 2022, Fortaleza. Anais... Fortaleza: SEB, 2022. p. 305| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 427. | | QUEIROZ, A. P. de; SOUZA, T. D.; PESSOA, A. C. W. F.; SOUZA, M. L. de; SÓSA-GOMEZ, D. R. Parâmetros de produção de RanuNPV em Rachiplusia nu (Lepidoptera: Noctuidae, Plusiinae) a diferentes temperaturas e concentrações. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 28., 2022, Fortaleza. Biodiversidade: Conhecer, conservar e utilizar. anais. Fortaleza: Sociedade Entomológica do Brasil, 2022. Edição Técnica: Nivia da Silva Dias Pini, Gerane Celly Dias Bezerra Silva, Márcio Alves Silva, Regiane Cristina Oliveira, José Wagner da Silva Melo, Flávia Rabelo Barbosa. resumo. p. 305.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 428. | | OLIVEIRA, L. J.; GARCIA, M. A.; SOSA-GOMEZ, D. R.; HOFFMANN-CAMPO, C. B.; SANTOS, B.; CORSO, I. Ocorrência, danos e manejo do coró-da-soja, Phyllophaga cuyabana Moser, 1918 (Coleoptera: Melolonthidae) In: REUNIÃO SUL BRASILEIRA SOBRE PRAGAS-DE-SOLO, 6., 1997, Santa Maria. Anais e ata. Santa Maria: UFSM-CCR, 1997. p. 138-140.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 431. | | PEZENTI, L. F.; GONÇALVES, K. B.; SOUZA, R. F.; VILAS-BOAS, L. A.; SOSA-GOMEZ, D. R.; ROSA, R. da. Montagem de novo do transcriptoma de Anticarsia gemmatalis. In: ENCONTRO PARANAENSE DE GENÉTICA, 13., GENÉTICA NAS FÉRIAS, 10., 2016. Tempos modernos: anais. Londrina: UEL, 2016. p. 43.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 432. | | CORRÊA-FERREIRA, B. S.; OLIVEIRA, C. V. P.; SOSA-GOMEZ, D. R.; MOSCARDI, F.; PAVÃO, A. L. Mortalidade natural em populações da lagarta falsa-medideira Pseudoplusia includens Walker, na cultura da soja. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 4., 2006, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2006. p. 84-85. Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Simone Ery Grosskopf.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 433. | | BUENO, A. de F.; CARVALHO, G. A.; SANTOS, A. C. dos; SOSA-GOMEZ, D. R.; SILVA, D. M. da. Pesticide selectivity to natural enemies: challenges and constraints for research and field recommendation. Ciência Rural, Santa Maria, v. 47, n. 6, e20160829, 2017. 10 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 434. | | HOFFMANN-CAMPO, C. B.; BUENO, A. de F.; CORRÊA-FERREIRA, B. S.; SOSA-GOMEZ, D. R.; HIROSE, E.; ROGIA, S. Pragas: o grande problema desta safra. Campo & Negócios Revista, Uberlândia, v. 11, n. 122, p. 36-40, abr. 2013.| Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 435. | | FORMENTINI, A. C.; SOSA-GÓMEZ, D. R.; PAULA-MORAES, S. V. de; BARROS, N. M.; SPECHT, A. Lepidoptera (Insecta) associated with soybean in Argentina, Brazil, Chile and Uruguay. Ciência Rural, Santa Maria, v. 45, n. 12, p. 2113-2120, dez. 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Soja. |
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| 437. | | DOURADO, P. M.; BACALHAU, F. B.; AMADO, D.; CARVALHO, R. A.; MARTINELLI, S.; HEAD, G. P.; SOSA-GOMEZ, D. R.; OMOTO, C. Alta suscetibilidade de Chrysodeixis includens (Walker) e Helicoverpa armigera (Hübner) e baixa frequência de alelos de resistência à soja Bt reduzem o risco de evolução de resistência no Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 26.; CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE ENTOMOLOGIA, 9., Maceio, 2016. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 91. Editores técnicos: Elio Cesar Guzzo, Marcus Vinicius Sampaio, Jader Braga Maia, Aldomário Santo Negrisoli Junior.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 438. | | MOSCARDI, F.; BUENO, A. de F.; SOSA-GOMEZ, D. R.; ROGGIA, S.; HOFFMANN-CAMPO, C. B.; POMARI, A. F.; CORSO, I. C.; YANO, S. A. C. Artrópodes que atacam as folhas da soja. In: HOFFMANN-CAMPO, C. B.; CORRÊA-FERREIRA, B. S.; MOSCARDI, F. (Ed.). Soja: manejo integrado de insetos e outros Artrópodes-praga. Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 213-334.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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| 439. | | YANO, S. A. C.; MOSCARDI, F.; DOURADO, P.; CARVALHO, R. A.; MARTINELLI, S.; HEAD, G. P.; BERGER, G. U.; SOSA-GÓMEZ, D. R. Caracterização da resposta à toxina Cry1Ac em populações de Noctuídeos pragas da soja no Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 24., 2012, Curitiba. SEB-40 anos de avanços da Ciência Entomológica Brasileira: anais. [Curitiba]: SEB, 2012. Disponível em: .| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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