|
|
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
27/02/2009 |
Data da última atualização: |
25/04/2024 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Autoria: |
SILVA, M. V. G. B.; TASSELL, C. P. V.; SONSTEGARD, T. S.; MATUKUMALLI, L.; SCHROEDER, S.; VANRADEN, P.; WIGGANS, G. |
Afiliação: |
Marcos Vinicius Gualberto Barbosa da Silva Embrapa Gado de Leite / USDA USA; Curtis Van Tassell USDA USA; Tad S. Sonstegard USDA USA; Lakshmi Matukumalli George Mason University USA; Steven Schroeder USDA USA; Paul VanRaden USDA USA; George Wiggans USDA USA. |
Título: |
Predição do valor genético total de touros da raça Holandesa por meio de mapas densos de marcadores. |
Ano de publicação: |
2008 |
Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA. 45., 2008, Lavras, MG. Anais... Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2008. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
A seleção genômica é a forma de seleção assistida em que os marcadores genéticos distribuídos ao longo de todo o genoma são usados na avaliação genética, esperando-se que os quantitative trait loci (QTL) estejam em desequilíbrio de ligação com pelo menos um marcador. O uso da seleção genômica tornou-se possível graças ao grande número de SNPs descorbertos durante o seqüenciamento do genoma bovino e aos novos métodos de genotipagem de SNPs em larga escala, como o novo Illumina iSelect Bovine 50K Chip. Na seleção genômica, a escolha dos indivíduos é baseada na soma das estimativas dos efeitos de todos os marcadores ao longo do genoma, ajustados como efeitos aleatórios. O objetivo desse trabalho foi usar a ridge regression para predizer o valor genético genômico de 474 touros jovens holandeses nascidos após 2000, a partir de grande número de marcadores simples em todo o genoma. Para tanto, foram usados os valores genéticos de 2.378 touros da raça Holandesa nascidos antes de 2000, publicados em Agosto/2003. Os efeitos dos marcadores foram estimados por ridge regression (solução BLUP) por meio de programas escritos nas linguagens Fortran e R environment. Pode-se concluir que a ridge regression não é metodologia mais adequada para estimação dos valores genômicos e que, provavelmente, métodos bayesianos que assumam distribuição a priori das variâncias associadas com os segmentos cromossômicos possam fornecer estimativas mais confiáveis dos valores genômicos. |
Palavras-Chave: |
Bovinos; Seleção genômica; SNP. |
Thesagro: |
Marcador Genético. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/596763/1/Predicao-do-valor-genetico-total-de-touros-da-raca-Holandesa.pdf
|
Marc: |
LEADER 02302nam a2200229 a 4500 001 1596763 005 2024-04-25 008 2008 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aSILVA, M. V. G. B. 245 $aPredição do valor genético total de touros da raça Holandesa por meio de mapas densos de marcadores.$h[electronic resource] 260 $aIn: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA. 45., 2008, Lavras, MG. Anais... Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Zootecnia$c2008 520 $aA seleção genômica é a forma de seleção assistida em que os marcadores genéticos distribuídos ao longo de todo o genoma são usados na avaliação genética, esperando-se que os quantitative trait loci (QTL) estejam em desequilíbrio de ligação com pelo menos um marcador. O uso da seleção genômica tornou-se possível graças ao grande número de SNPs descorbertos durante o seqüenciamento do genoma bovino e aos novos métodos de genotipagem de SNPs em larga escala, como o novo Illumina iSelect Bovine 50K Chip. Na seleção genômica, a escolha dos indivíduos é baseada na soma das estimativas dos efeitos de todos os marcadores ao longo do genoma, ajustados como efeitos aleatórios. O objetivo desse trabalho foi usar a ridge regression para predizer o valor genético genômico de 474 touros jovens holandeses nascidos após 2000, a partir de grande número de marcadores simples em todo o genoma. Para tanto, foram usados os valores genéticos de 2.378 touros da raça Holandesa nascidos antes de 2000, publicados em Agosto/2003. Os efeitos dos marcadores foram estimados por ridge regression (solução BLUP) por meio de programas escritos nas linguagens Fortran e R environment. Pode-se concluir que a ridge regression não é metodologia mais adequada para estimação dos valores genômicos e que, provavelmente, métodos bayesianos que assumam distribuição a priori das variâncias associadas com os segmentos cromossômicos possam fornecer estimativas mais confiáveis dos valores genômicos. 650 $aMarcador Genético 653 $aBovinos 653 $aSeleção genômica 653 $aSNP 700 1 $aTASSELL, C. P. V. 700 1 $aSONSTEGARD, T. S. 700 1 $aMATUKUMALLI, L. 700 1 $aSCHROEDER, S. 700 1 $aVANRADEN, P. 700 1 $aWIGGANS, G.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
Registros recuperados : 55 | |
4. | | BENAVIDES, M. V.; ECHEVARRIA, F. A. M.; SONSTEGARD, T. S.; VAN TESSEL, C. P.; GASBARRE, L. C. Genetic variability of a Bos taurus x Bos indicus cross population and validation of genomic regions influencing nematode resistance. In: SIMPOSIO DE RECURSOS GENETICOS PARA AMERICA LATINA Y EL CARIBE, 5., 2005, Montevideo, Uruguay. Resumenes... Montevideo: INIA :Facultad de Agronomía de la Universidad de la República, 2005. p. 105 SIRGEALC. Resumo 305.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
7. | | SILVA, M. V. G. B.; TASSELL, C. P. V.; SONSTEGARD, T. S.; MATUKUMALLI, L.; SCHROEDER, S.; VANRADEN, P.; WIGGANS, G. Predição do valor genético total de touros da raça Holandesa por meio de mapas densos de marcadores. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA. 45., 2008, Lavras, MG. Anais... Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2008.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
8. | | LIU, G. E.; LI, R. W.; SONSTEGARD, T. S.; MATUKUMALLI, L. K.; SILVA, M. V. G. B.; VAN TASSELL, C. P. Characterization of a novel microdeletion polymorphism on BTA5 in cattle. Animal Genetics, v. 39, n. 6, p. 655-658, 2008.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
10. | | O'BRIEN, A. M. P.; MÉSZÁROS, G.; UTSUNOMIYA, Y. T.; SONSTEGARD, T. S.; GARCIA, J. F.; TASSEL, C. P. V.; CARVALHEIRO, R.; SILVA, M. V. G. B.; SÖLKNER, J. Linkage disequilibrium levels in Bos indicus and Bos taurus cattle using medium and high density SNP chip data and different minor allele frequency distributions. Livestock Science, v. 166, p. 121-132, 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
11. | | PORTO NETO, L. R.; SONSTEGARD, T. S.; LIU, G.; BICKHART, D.; GONDRO, C.; SILVA, M. V. G. B.; UTSUNOMIYA, Y. T.; GARCIA, J. F.; VAN TASSELL, C. P. Genomic divergence of indicine and taurine cattle identified through high-density SNP gebotyping. In: ADSA-ASAS ANNUAL MEETINGS, 2013, Indianápolis, Indiana. Abstracts... Indianápolis: [s.n.], 2013.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
12. | | GARCIA, J. F.; CARMO, A. S. DO; UTSUNOMIYA, Y. T.; NEVES, H. H. DE R.; CARVALHEIRO, R.; TASSELL, C. V.; SONSTEGARD, T. S.; SILVA, M. V. G. B. How bioinformatics enables livestock applied sciences in the genomic era. In: BRAZILIAN SYMPOSIUM ON BIOINFORMATICS, 2012, Heidelberg. Proceedings... Porto Alegre: Sociedade Brasileira e Computação, 2012.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
13. | | ANDREOTE, A. P. D.; ROSÁRIO, M. F. do; LEDUR, M. C.; JORGE, E. C.; SONSTEGARD, T. S.; MATUKUMALLI, L.; COUTINHO, L. L. Identification and characterization of microRNAs expressed in chicken skeletal muscle. Genetics and Molecular Research, v. 6, n. 1, p. 1465-1479, 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
14. | | VENERONI, G. B.; MEIRELLES, S. L.; SANTIAGO, A. C.; SONSTEGARD, T. S.; OLIVEIRA, H. N.; YAMAGISHI, M. E. B.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. Identification of genomic regions associated with backfat thickness in synthetic cattle. In: WORKSHOP DA REDE GENÔMICA ANIMAL, 1., 2009, Fortaleza. Anais... Fortaleza, Rede Genômica Animal, 2009.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
15. | | BENAVIDES, M. V.; SONSTEGARD, T. S.; KEMP, S.; MUGAMBI, J. M.; GIBSON, J. P.; BAKER, R. L.; HANOTTE, O.; MARSHALL, K.; VAN TASSELL, C. Identification of novel loci associated with gastrointestinal parasite resistance in a Red Maasai x Dorper backcross population. Plos One, v. 10, n. 4, e0122797, Apr. 2015.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Pesca e Aquicultura. |
| |
16. | | O'BRIEN, A. M. P.; UTSUNOMIYA, Y. T.; MÉSZÁROS, G.; BICKHART, D. M.; LIU, G. E.; TASSEL, C. P. V.; SONSTEGARD, T. S.; SILVA, M. V. G. B.; GARCIA, J. F.; SÖLKNER, J. Assessing signatures of selection through variation in linkage disequilibrium between taurine and indicine cattle. Genetics Selection Evolution, v. 46, n. 19, 2014. 14 p.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
17. | | MIYATA, M.; GASPARIN, G.; COUTINHO, L. L.; MARTINEZ. M. L.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; CAMPOS, A. L.; SONSTEGARD, T. S.; REGITANO, L. C. de A. Caracterização genética de uma população experimental F2 usando marcadores moleculares no cromossomo 14 ( BTA 14) de bovinos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA , 51., 2005, Águas de Lindóia. Lindóia: SBG, 2005. p. 364Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
18. | | MYTATA, M.; GASPARIN, G.; COUTINHO, L. L.; MARTINEZ, M. L.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B. da; CAMPOS, A. L.; SONSTEGARD, T. S.; REGITANO, L. C. de A. Mapeamento de QTLS para peso ao nascimento no cromossomo 14 de bovinos. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 42., 2005, Goiânia. A Produção animal e o foco no agronegócio: anais. Goiânia: SBZ, 2005. 1 CD-ROM.Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
19. | | GASPARIN, G.; MIYATA, M.; COUTINHO, M. L.; MARTINEZ, M. L.; TEODORO, R. L.; FURLONG, J.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; SONSTEGARD, T. S.; REGITANO, L. C. de A. Mapping of quantitative trait loci controlling tick [Riphicephalus (Boophilus) microplus] resistance on bovine chromosomes 5, 7, and 14. Animal Genetics, v. 38, n. 5, p. 453-459, oct. 2007.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
20. | | GASPARIN, G.; MIYATA, M.; COUTINHO, L. L.; MARTINEZ, M. L.; TEODORO, R. L.; FURLONG, J.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B. da; SONSTEGARD, T. S.; REGITANO, L. C. de A. Mapping of quatitative trait loci controlling tick [Riphicephalus (Boophilus) microplus] resistance on bovine chromosomes 5, 7 and 14. Animal Genetics, Oxford, v. 38, n. 5, p. 453-459, 2007.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
Registros recuperados : 55 | |
|
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|