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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Unidades Centrais. |
Data corrente: |
10/11/2023 |
Data da última atualização: |
26/01/2024 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
OLIVEIRA, L. B. DE; OLIVEIRA, S. A. S. de; MOREIRA, R. F. C.; DIAMANTINO, M. S. A. S.; RAMOS, A. P. de S.; SOARES, T. L.; FERREIRA, C. F. |
Afiliação: |
LAÍS BARRETO DE OLIVEIRA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO RECÔNCAVO DA BAHIA; SAULO ALVES SANTOS DE OLIVEIRA, CNPMF; RICARDO FRANCO CUNHA MOREIRA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO RECÔNCAVO DA BAHIA; MARIA SELMA ALVES SILVA DIAMANTINO, CNPMF; ANDRESA PRISCILA DE SOUZA RAMOS, CNPMF; TALIANE LEILA SOARES, CNPMF; CLAUDIA FORTES FERREIRA, CNPMF. |
Título: |
Genetic diversity of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis populations using rep-PCR and VNTR molecular markers. |
Ano de publicação: |
2023 |
Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 58, e03299, 2023. |
DOI: |
https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2023.v58.03299 |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
Título em português: Diversidade genética de populações de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis em mandioca por meio de marcadores rep-PCR e VNTRs. |
Conteúdo: |
ABSTRACT - The objective of this work was to evaluate the genetic diversity of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) from eight populations from
five cassava producing states in Brazil, through the rep-PCR (BOX-PCR and ERIC-PCR) and variable number of tandem repeat (VNTR) markers. Cassava leaves with symptoms of cassava bacterial blight were collected in eight municipalities, and the Xpm isolates were identified by amplification with primers specific for these isolates. The identity of the Xpm isolates was confirmed with the BOX-PCR, ERIC-PCR, and VNTR markers. The observed selection pressure, together with the mode of reproduction and the mechanisms that increase genetic variability, allows of the pathogen populations to adapt according to microclimate variation, contributing to a differentiated reproductive success. ERIC-PCR and VNTRs are the best markers for evaluating the genetic variability in the eight studied Xpm populations. However, ERIC-PCR is the marker that best separated the groups by population and presented a higher similarity between the isolates of the same population. The study of the genetic diversity of Xpm is key to improve disease monitoring and management strategies in cassava crops.
RESUMO - O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) de oito populações de cinco estados produtores de mandioca no Brasil, por meio de marcadores rep-PCR (BOXPCR e ERIC-PCR) e variable number of tandem repeats (VNTRs). Folhas de mandioca com sintomas de crestamento bacteriano foram coletadas em oito municípios, e os isolados Xpm foram identificados por amplificação com iniciadores específicos para esses isolados. A identidade dos isolados Xmp foi confirmada com os marcadores BOX-PCR, ERIC-PCR e VNTRs. A pressão de seleção observada, junto com o modo de reprodução e os mecanismos que aumentam a variabilidade genética, permite que as populações do patógeno se adaptem de acordo com a variação dos microclimas, o que contribui para o sucesso reprodutivo diferenciado. ERIC-PCR e VNTRs são os melhores marcadores para avaliar a variabilidade genética das oito populações Xpm estudadas. No entanto, ERIC-PCR é o marcador que melhor separou os grupos por população e apresentou maior similaridade entre os isolados de uma mesma população. O estudo da diversidade genética de Xpm é fundamental para delinear estratégias de manejo e monitoramento de doenças na cultura da mandioca. MenosABSTRACT - The objective of this work was to evaluate the genetic diversity of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) from eight populations from
five cassava producing states in Brazil, through the rep-PCR (BOX-PCR and ERIC-PCR) and variable number of tandem repeat (VNTR) markers. Cassava leaves with symptoms of cassava bacterial blight were collected in eight municipalities, and the Xpm isolates were identified by amplification with primers specific for these isolates. The identity of the Xpm isolates was confirmed with the BOX-PCR, ERIC-PCR, and VNTR markers. The observed selection pressure, together with the mode of reproduction and the mechanisms that increase genetic variability, allows of the pathogen populations to adapt according to microclimate variation, contributing to a differentiated reproductive success. ERIC-PCR and VNTRs are the best markers for evaluating the genetic variability in the eight studied Xpm populations. However, ERIC-PCR is the marker that best separated the groups by population and presented a higher similarity between the isolates of the same population. The study of the genetic diversity of Xpm is key to improve disease monitoring and management strategies in cassava crops.
RESUMO - O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) de oito populações de cinco estados produtores de mandioca no Brasil, por meio de marcadores rep-PCR (BOXPCR e ERIC-PCR) e variable number of tandem repeat... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Diversidade genética. |
Thesagro: |
Mandioca; Manihot Esculenta; Marcador Molecular; Xanthomonas Phaseoli. |
Thesaurus Nal: |
Cassava; Plant genetics. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1158220/1/Genetic-diversity-Xanthomonas-phaseoli-2023.pdf
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Marc: |
LEADER 03593naa a2200301 a 4500 001 2158220 005 2024-01-26 008 2023 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2023.v58.03299$2DOI 100 1 $aOLIVEIRA, L. B. DE 245 $aGenetic diversity of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis populations using rep-PCR and VNTR molecular markers.$h[electronic resource] 260 $c2023 500 $aTítulo em português: Diversidade genética de populações de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis em mandioca por meio de marcadores rep-PCR e VNTRs. 520 $aABSTRACT - The objective of this work was to evaluate the genetic diversity of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) from eight populations from five cassava producing states in Brazil, through the rep-PCR (BOX-PCR and ERIC-PCR) and variable number of tandem repeat (VNTR) markers. Cassava leaves with symptoms of cassava bacterial blight were collected in eight municipalities, and the Xpm isolates were identified by amplification with primers specific for these isolates. The identity of the Xpm isolates was confirmed with the BOX-PCR, ERIC-PCR, and VNTR markers. The observed selection pressure, together with the mode of reproduction and the mechanisms that increase genetic variability, allows of the pathogen populations to adapt according to microclimate variation, contributing to a differentiated reproductive success. ERIC-PCR and VNTRs are the best markers for evaluating the genetic variability in the eight studied Xpm populations. However, ERIC-PCR is the marker that best separated the groups by population and presented a higher similarity between the isolates of the same population. The study of the genetic diversity of Xpm is key to improve disease monitoring and management strategies in cassava crops. RESUMO - O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) de oito populações de cinco estados produtores de mandioca no Brasil, por meio de marcadores rep-PCR (BOXPCR e ERIC-PCR) e variable number of tandem repeats (VNTRs). Folhas de mandioca com sintomas de crestamento bacteriano foram coletadas em oito municípios, e os isolados Xpm foram identificados por amplificação com iniciadores específicos para esses isolados. A identidade dos isolados Xmp foi confirmada com os marcadores BOX-PCR, ERIC-PCR e VNTRs. A pressão de seleção observada, junto com o modo de reprodução e os mecanismos que aumentam a variabilidade genética, permite que as populações do patógeno se adaptem de acordo com a variação dos microclimas, o que contribui para o sucesso reprodutivo diferenciado. ERIC-PCR e VNTRs são os melhores marcadores para avaliar a variabilidade genética das oito populações Xpm estudadas. No entanto, ERIC-PCR é o marcador que melhor separou os grupos por população e apresentou maior similaridade entre os isolados de uma mesma população. O estudo da diversidade genética de Xpm é fundamental para delinear estratégias de manejo e monitoramento de doenças na cultura da mandioca. 650 $aCassava 650 $aPlant genetics 650 $aMandioca 650 $aManihot Esculenta 650 $aMarcador Molecular 650 $aXanthomonas Phaseoli 653 $aDiversidade genética 700 1 $aOLIVEIRA, S. A. S. de 700 1 $aMOREIRA, R. F. C. 700 1 $aDIAMANTINO, M. S. A. S. 700 1 $aRAMOS, A. P. de S. 700 1 $aSOARES, T. L. 700 1 $aFERREIRA, C. F. 773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira$gv. 58, e03299, 2023.
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Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
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