| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia. |
|
Data corrente: |
02/08/2023 |
|
Data da última atualização: |
26/10/2023 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
GOMES, T. G.; FONSECA, F. C. de A.; ALVES, G. S. C.; SIQUEIRA, F. G. de; MILLER, R. N. G. |
|
Afiliação: |
TAÍSA GODOY GOMES, Universidade de Brasília; FERNANDO CAMPOS DE ASSIS FONSECA, Universidade de Brasília; GABRIEL SERGIO COSTA ALVES, Universidade de Brasília; FELIX GONCALVES DE SIQUEIRA, CNPAE; ROBERT NEIL GERARD MILLER, Universidade de Brasília. |
|
Título: |
Development of reference genes for RT-qPCR analysis of gene expression in Pleurotus pulmonarius for biotechnological applications. |
|
Ano de publicação: |
2023 |
|
Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 13, n. 12296, 2023. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41598-023-39115-4 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Jatropha curcas is an oilseed crop with biorefinery applications. Whilst cake generated following oil extraction offers potential as a protein source for animal feed, inactivation of toxic phorbol esters present in the material is necessary. Pleurotus pulmonarius is a detoxifying agent for jatropha cake with additional potential as animal feed, edible mushroom and for enzyme production. For the characterization of fungal genes involved in phorbol ester degradation, together with other industrial applications, reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR) is a tool that enables accurate quantification of gene expression. For this, reliable analysis requires reference genes for normalization of mRNA levels validated under conditions employed for target genes. The stability of potential reference genes ?-TUB, ACTIN, GAPDH, PHOS, EF1?, TRPHO, LAC, MNP3, MYP and VP were evaluated following growth of P. pulmonarius on toxic, non-toxic jatropha cake and a combined treatment, respectively. NormFinder and geNorm algorithms for expression stability analysis identified PHOS, EF1? and MNP3 as appropriate for normalizing gene expression. Reference gene combinations contrasting in ranking were compared following normalization of relative expression of the CHU_2040 gene, encoding an esterase enzyme potentially involved in phorbol ester degradation. The reference genes for P. pulmonarius will facilitate the elucidation of mechanisms involved in detoxification of phorbol esters as well as analysis of target genes for application in biorefinery models. MenosJatropha curcas is an oilseed crop with biorefinery applications. Whilst cake generated following oil extraction offers potential as a protein source for animal feed, inactivation of toxic phorbol esters present in the material is necessary. Pleurotus pulmonarius is a detoxifying agent for jatropha cake with additional potential as animal feed, edible mushroom and for enzyme production. For the characterization of fungal genes involved in phorbol ester degradation, together with other industrial applications, reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR) is a tool that enables accurate quantification of gene expression. For this, reliable analysis requires reference genes for normalization of mRNA levels validated under conditions employed for target genes. The stability of potential reference genes ?-TUB, ACTIN, GAPDH, PHOS, EF1?, TRPHO, LAC, MNP3, MYP and VP were evaluated following growth of P. pulmonarius on toxic, non-toxic jatropha cake and a combined treatment, respectively. NormFinder and geNorm algorithms for expression stability analysis identified PHOS, EF1? and MNP3 as appropriate for normalizing gene expression. Reference gene combinations contrasting in ranking were compared following normalization of relative expression of the CHU_2040 gene, encoding an esterase enzyme potentially involved in phorbol ester degradation. The reference genes for P. pulmonarius will facilitate the elucidation of mechanisms involved in detoxification of phorbol esters as well as... Mostrar Tudo |
|
Thesagro: |
Jatropha Curcas; Refinaria. |
|
Thesaurus Nal: |
Oilseed crops. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1155580/1/Development-of-reference.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02270naa a2200217 a 4500
001 2155580
005 2023-10-26
008 2023 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1038/s41598-023-39115-4$2DOI
100 1 $aGOMES, T. G.
245 $aDevelopment of reference genes for RT-qPCR analysis of gene expression in Pleurotus pulmonarius for biotechnological applications.$h[electronic resource]
260 $c2023
520 $aJatropha curcas is an oilseed crop with biorefinery applications. Whilst cake generated following oil extraction offers potential as a protein source for animal feed, inactivation of toxic phorbol esters present in the material is necessary. Pleurotus pulmonarius is a detoxifying agent for jatropha cake with additional potential as animal feed, edible mushroom and for enzyme production. For the characterization of fungal genes involved in phorbol ester degradation, together with other industrial applications, reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR) is a tool that enables accurate quantification of gene expression. For this, reliable analysis requires reference genes for normalization of mRNA levels validated under conditions employed for target genes. The stability of potential reference genes ?-TUB, ACTIN, GAPDH, PHOS, EF1?, TRPHO, LAC, MNP3, MYP and VP were evaluated following growth of P. pulmonarius on toxic, non-toxic jatropha cake and a combined treatment, respectively. NormFinder and geNorm algorithms for expression stability analysis identified PHOS, EF1? and MNP3 as appropriate for normalizing gene expression. Reference gene combinations contrasting in ranking were compared following normalization of relative expression of the CHU_2040 gene, encoding an esterase enzyme potentially involved in phorbol ester degradation. The reference genes for P. pulmonarius will facilitate the elucidation of mechanisms involved in detoxification of phorbol esters as well as analysis of target genes for application in biorefinery models.
650 $aOilseed crops
650 $aJatropha Curcas
650 $aRefinaria
700 1 $aFONSECA, F. C. de A.
700 1 $aALVES, G. S. C.
700 1 $aSIQUEIRA, F. G. de
700 1 $aMILLER, R. N. G.
773 $tScientific Reports$gv. 13, n. 12296, 2023.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
|
Data corrente: |
03/12/2014 |
|
Data da última atualização: |
03/12/2014 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Circulação/Nível: |
B - 5 |
|
Autoria: |
SANTOS, D. B. dos; VOLTOLINI, T. V.; SANTOS, R. M.; AZEVEDO, D. O; OLIVEIRA, R. G.; CHAGAS, E. C. de O.; SANTOS, F. M. dos; NOGUEIRA, D. M. |
|
Afiliação: |
DELFRAN BATISTA DOS SANTOS, Instituto Federal Baiano, Campus Senhor do Bonfim, BA; TADEU VINHAS VOLTOLINI, CPATSA; ROBERTA MACHADO SANTOS, UNIVASF; DELKA OLIVEIRA AZEVEDO, Instituto Federal Baiano, Campus Senhor do Bonfim, BA; ROGÉRIO GONÇALVES OLIVEIRA, UNIVASF; ELIO CELESTINO DE OLIVEIRA CHAGAS, Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Sertão Pernambucano; FLORISVALDO MESQUITA DOS SANTOS, Instituto Federal Baiano, Campus Senhor do Bonfim, BA; DANIEL MAIA NOGUEIRA, CPATSA. |
|
Título: |
Características produtivas e qualitativas do estilozantes campo grande submetido ao estresse salino. |
|
Ano de publicação: |
2014 |
|
Fonte/Imprenta: |
Global Science and Technology, Rio Verde, v. 7, n. 2, p. 1-7, maio/ago. 2014. |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
O semiárido é caracterizado pela frequência de longas estiagens, tornando assim, os sistemas de produção dessa região bastante vulneráveis. Diante dessa ressalva e da vocação pecuária do semiárido brasileiro, este trabalho teve por objetivo avaliar o efeito da salinidade da água de irrigação sobre as características produtivas e qualitativas do estilosantes Campo Grande cultivado em ambiente protegido no semiárido baiano. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado com sete níveis de salinidade da água de irrigação (0,03; 0,55; 1,08; 1,70; 2,62; 3,52 e 5,0 dS m-1) e três repetições. Concluiu-se que a composição bromatológica do estilosantes Campo Grande foi afetada pelo aumento da salinidade de água de irrigação e o aumento da salinidade na água de irrigação reduz a massa fresca de forragem, os teores de matéria orgânica e proteína bruta e aumenta o teor de minerais do estilosantes Campo Grande. |
|
Palavras-Chave: |
Estilosantes Campo Grande; Semiárido. |
|
Thesagro: |
Água Salina; Forragem; Matéria Orgânica; Produção animal; Proteína Bruta. |
|
Thesaurus NAL: |
Animal production. |
|
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/112907/1/Tadeu-3.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 01870naa a2200301 a 4500
001 2001440
005 2014-12-03
008 2014 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aSANTOS, D. B. dos
245 $aCaracterísticas produtivas e qualitativas do estilozantes campo grande submetido ao estresse salino.$h[electronic resource]
260 $c2014
520 $aO semiárido é caracterizado pela frequência de longas estiagens, tornando assim, os sistemas de produção dessa região bastante vulneráveis. Diante dessa ressalva e da vocação pecuária do semiárido brasileiro, este trabalho teve por objetivo avaliar o efeito da salinidade da água de irrigação sobre as características produtivas e qualitativas do estilosantes Campo Grande cultivado em ambiente protegido no semiárido baiano. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado com sete níveis de salinidade da água de irrigação (0,03; 0,55; 1,08; 1,70; 2,62; 3,52 e 5,0 dS m-1) e três repetições. Concluiu-se que a composição bromatológica do estilosantes Campo Grande foi afetada pelo aumento da salinidade de água de irrigação e o aumento da salinidade na água de irrigação reduz a massa fresca de forragem, os teores de matéria orgânica e proteína bruta e aumenta o teor de minerais do estilosantes Campo Grande.
650 $aAnimal production
650 $aÁgua Salina
650 $aForragem
650 $aMatéria Orgânica
650 $aProdução animal
650 $aProteína Bruta
653 $aEstilosantes Campo Grande
653 $aSemiárido
700 1 $aVOLTOLINI, T. V.
700 1 $aSANTOS, R. M.
700 1 $aAZEVEDO, D. O
700 1 $aOLIVEIRA, R. G.
700 1 $aCHAGAS, E. C. de O.
700 1 $aSANTOS, F. M. dos
700 1 $aNOGUEIRA, D. M.
773 $tGlobal Science and Technology, Rio Verde$gv. 7, n. 2, p. 1-7, maio/ago. 2014.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
