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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia. |
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Data corrente: |
02/08/2023 |
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Data da última atualização: |
26/10/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GOMES, T. G.; FONSECA, F. C. de A.; ALVES, G. S. C.; SIQUEIRA, F. G. de; MILLER, R. N. G. |
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Afiliação: |
TAÍSA GODOY GOMES, Universidade de Brasília; FERNANDO CAMPOS DE ASSIS FONSECA, Universidade de Brasília; GABRIEL SERGIO COSTA ALVES, Universidade de Brasília; FELIX GONCALVES DE SIQUEIRA, CNPAE; ROBERT NEIL GERARD MILLER, Universidade de Brasília. |
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Título: |
Development of reference genes for RT-qPCR analysis of gene expression in Pleurotus pulmonarius for biotechnological applications. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 13, n. 12296, 2023. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41598-023-39115-4 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Jatropha curcas is an oilseed crop with biorefinery applications. Whilst cake generated following oil extraction offers potential as a protein source for animal feed, inactivation of toxic phorbol esters present in the material is necessary. Pleurotus pulmonarius is a detoxifying agent for jatropha cake with additional potential as animal feed, edible mushroom and for enzyme production. For the characterization of fungal genes involved in phorbol ester degradation, together with other industrial applications, reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR) is a tool that enables accurate quantification of gene expression. For this, reliable analysis requires reference genes for normalization of mRNA levels validated under conditions employed for target genes. The stability of potential reference genes ?-TUB, ACTIN, GAPDH, PHOS, EF1?, TRPHO, LAC, MNP3, MYP and VP were evaluated following growth of P. pulmonarius on toxic, non-toxic jatropha cake and a combined treatment, respectively. NormFinder and geNorm algorithms for expression stability analysis identified PHOS, EF1? and MNP3 as appropriate for normalizing gene expression. Reference gene combinations contrasting in ranking were compared following normalization of relative expression of the CHU_2040 gene, encoding an esterase enzyme potentially involved in phorbol ester degradation. The reference genes for P. pulmonarius will facilitate the elucidation of mechanisms involved in detoxification of phorbol esters as well as analysis of target genes for application in biorefinery models. MenosJatropha curcas is an oilseed crop with biorefinery applications. Whilst cake generated following oil extraction offers potential as a protein source for animal feed, inactivation of toxic phorbol esters present in the material is necessary. Pleurotus pulmonarius is a detoxifying agent for jatropha cake with additional potential as animal feed, edible mushroom and for enzyme production. For the characterization of fungal genes involved in phorbol ester degradation, together with other industrial applications, reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR) is a tool that enables accurate quantification of gene expression. For this, reliable analysis requires reference genes for normalization of mRNA levels validated under conditions employed for target genes. The stability of potential reference genes ?-TUB, ACTIN, GAPDH, PHOS, EF1?, TRPHO, LAC, MNP3, MYP and VP were evaluated following growth of P. pulmonarius on toxic, non-toxic jatropha cake and a combined treatment, respectively. NormFinder and geNorm algorithms for expression stability analysis identified PHOS, EF1? and MNP3 as appropriate for normalizing gene expression. Reference gene combinations contrasting in ranking were compared following normalization of relative expression of the CHU_2040 gene, encoding an esterase enzyme potentially involved in phorbol ester degradation. The reference genes for P. pulmonarius will facilitate the elucidation of mechanisms involved in detoxification of phorbol esters as well as... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Jatropha Curcas; Refinaria. |
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Thesaurus Nal: |
Oilseed crops. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1155580/1/Development-of-reference.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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| Registros recuperados : 329 | |
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| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 82. | | COSTA, D. S. T.; SIQUEIRA, F. C.; COSTA, E. L. N.; ABREU, L. F.; CORRÊA, N. C. F. Estudo da estabilidade da polpa de tucumã (Astrocaryum vulgare Mart.) liofilizada. In: LATIN AMERICAN SYMPOSIUM OF FOOD SCIENCE, 12., 2017, Campinas, SP. Anais... Campinas, SP: UNICAMP, 2017.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 85. | | MUDADO, M. de A.; REGITANO, L. C. de A.; SIQUEIRA, F.; ROSA, A. do N.; HIGA, R.; TIZIOTO, P. C. Finding a minimal set of SNPs for paternity identification in Nelore cattle. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 7.; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE IBEROAMERICAN SOCIETY FOR BIOINFORMATICS, 3., 2011, Florianópolis. Proceedings... Florianópolis: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2011. Não paginado. X-MEETING, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Corte. |
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| 88. | | BORGES, K. M.; MENDES, T. D.; SILVA, G. C. da; FAVARO, L. C. de L.; SIQUEIRA, F. G. de. Manutenção da coleção de macrofungos e triagem de potenciais produtores de biopigmentos. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 7., 2023, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF : Embrapa, 2023. p. 148.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 89. | | FRUGERI, A. P.; BARBOSA, G. C.; BORTOLOTTO, O. C.; SILVA, G. V.; SIQUEIRA, F.; BUENO, A. F. de. Influência da temperatura sobre os aspectos biológicos de Euschistus heros (Fabricius) (Hemiptera: Pentatomidae). In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 7., 2012, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2012. p. 25-29. (Embrapa Soja. Documentos, 333). Editado por Paula Gerón Saiz de Mello. Disponível em: .| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 91. | | TEIXEIRA, T. S.; RODRIGUES NETO, J. C.; CONCEIÇÃO, A. A.; SIQUEIRA, F. G. de; ABDELNUR, P. V. Interações fúngicas observadas através de imagem química por espectrometria de massas. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 6., 2020, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2020. p. 159-164 il.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 92. | | TEIXEIRA, T. S.; RODRIGUES NETO, J. C.; SILVA, E. A.; CONCEIÇÃO, A. A.; SIQUEIRA, F. G. de; ABDELNUR, P. V. Mass spectrometry imaging for fungal interaction analysis: Classic versus imprinting methods. Brazilian Journal of Analytical Chemistry, v. 10, n. 38, p. 71-78, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 93. | | SOUZA, M. de A.; GUIMARÃES, M. B.; RODRIGUES NETO, J. C.; MENDONCA, S.; SIQUEIRA, F. G. de; ABDELNUR, P. V. Metabolômica de Schizophyllum commune cultivados em torta do caroço de algodão por espectrometria de massas. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 6., 2020, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2020. p. 49-56 il.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 94. | | CEREIJO, C. R.; SANTANA, H.; BRUNALE, P. P. de M.; SIQUEIRA, F. G. de; BRASIL, B. dos S. A. F. Seleção de microalgas com capacidade de crescimento no efluente da lagoa de estabilização de POME. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 2., 2015, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2015. p. 67-69| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 96. | | SIQUEIRA, F.; CARDOSO, F. F.; GULIAS-GOMES, C. C.; REGITANO, L. C. de A.; MACHADO, M. A. Resistência genética de bovinos ao carrapato Rhipicephalus (boophilus) microplus. In: ANDREOTTI, R.; KOLLER, W. W. (Ed.). Carrapatos no Brasil: biologia, controle e doenças transmitidas. Brasília, DF: Embrapa, 2013. p. 85-104.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Gado de Leite. |
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| 97. | | SANTANA, H.; CEREIJO, C. R.; BRUNALE, P. P. de M.; SIQUEIRA, F. G. de; BRASIL, B. dos S. A. F. Produção de biomassa de microalgas em vinhaça e CO2 e caracterização do efluente pós-cultivo. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 2., 2015, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2015. p. 64-66| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 98. | | CONCEIÇÃO, A. A.; MENDES, T. D.; MENDONCA, S.; QUIRINO, B. F.; ALMEIDA, E. G. de A.; SIQUEIRA, F. G. de. Nutraceutical enrichment of animal feed by filamentous fungi fermentation. Fermentation, v. 8, n. 8, 402, 2022. 17 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 99. | | ARAÚJO, A. P. F.; GOMES, T. G.; ANDRADE, C. F. S.; MACHADO, E. R.; SIQUEIRA, F. G. de; MENDONCA, S. Perfil glicêmico de camundongos diabéticos alimentados com Agaricus blazei In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL SOBRE COGUMELOS NO BRASIL, 8.; SIMPÓSIO NACIONAL SOBRE COGUMELOS COMESTÍVEIS, 7., 2015, Sorocaba, SP. Anais ... Sorocaba: Uniso, 2015. Pôster 34| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 100. | | NETO, C. B. S.; BOMFIM, C. A.; FERREIRA FILHO, E. X.; VALE, H. M. M.; SIQUEIRA, F. G. de. Produção de enzimas por Aspergillus niger tendo como fonte principal de carbono resíduos agroindustriais:manipueira e engaço de bananeira. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE BIOPROCESSOS, 19.; SIMPÓSIO DE HIDRÓLISE ENZIMÁTICA DE BIOMASSA, 10., 2013, Foz de Iguaçu, PR. [Anais...]. São Paulo: Associação Brasileira de Engenharia Química, 2013. Não paginado.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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