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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
06/03/2014 |
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Data da última atualização: |
06/07/2017 |
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Autoria: |
MACHADO, E. L.; SILVA, S. A. |
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Afiliação: |
Edna Lôbo Machado, Universidade Federal do Recôncavo da Bahia, Centro de Ciências Agrárias, Ambientais e Biológicas, Núcleo de Melhoramento Genético e Biotecnologia; Simone Alves Silva, Universidade Federal do Recôncavo da Bahia, Centro de Ciências Agrárias, Ambientais e Biológicas, Núcleo de Melhoramento Genético e Biotecnologia. |
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Título: |
Desenho e validação de iniciadores microssatélites SSR para mamoneira. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 48, n. 11, p. 1457-1463, nov. 2013. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Título em inglês: Design and validation of SSR microsatellite primers for castor bean. |
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Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi desenhar, validar e otimizar pares de iniciadores microssatélites SSR para mamoneira. O desenho dos pares de iniciadores foi feito por meio do aplicativo Websat, a partir de sequências depositadas no GenBank do National Center for Biotechnology Information (GenBank/NCBI), e a sua qualidade foi aferida com uso do aplicativo web NetPrimer. Foram utilizadas diferentes concentrações de DNA, cloreto de magnésio, pares de iniciadores, dNTPs e temperatura de anelamento para otimização das condições de PCR. Um total de 30 pares de iniciadores SSR foi desenhado, sintetizado e otimizado. O gel de agarose foi utilizado para detecção dos produtos amplificados, e o gel desnaturante de poliacrilamida, na otimização das condições de PCR e na identificação de polimorfismo. Os pares de iniciadores apresentaram percentagem média de guanina/citosina (GC) igual a 47,29% e produtos amplificados com tamanhos entre 128 e 381 pb. Vinte e nove pares de iniciadores SSR (96,7%) foram validados, dos quais nove foram polimórficos (23,3%). As concentrações otimizadas para amplificação são: DNA, 25 ng; cloreto de magnésio, 1,2 mmol L‑1; iniciadores Forward e Reverse, 0,4 mmol L‑1; dNTPs, 0,1 mmol L‑1; e temperatura de anelamento, 62 a 64ºC. As ferramentas de bioinformática Websat e Net Primer podem ser utilizadas para desenvolver iniciadores microssatélites de qualidade, para a mamoneira, a partir de sequências depositadas no GenBank/NCBI. |
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Palavras-Chave: |
GenBank/NCBI. |
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Thesagro: |
Genoma; Ricinus communis. |
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Thesaurus Nal: |
Genome. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/98681/1/Desenho-e-validacao-de-iniciadores.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Algodão. Para informações adicionais entre em contato com cnpa.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Algodão. |
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Data corrente: |
08/10/2007 |
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Data da última atualização: |
12/01/2011 |
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Autoria: |
QUIJANO, E. B.; CAICEDO, A. M.; RIVERA, J. J.; TORRES, J. C. |
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Título: |
Determinación de factores abióticos que definen las zonas de mejor oferta ambiental para la producción y calidad de fibra con énfasis en potasio para el algodonero en el Valle Calido del Alto Magdalena, Colombia |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 6., 2007, Uberlândia. Anais... Uberlândia, 2007. |
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Páginas: |
p. 1-7 |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM |
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Idioma: |
Espanhol |
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Conteúdo: |
El propósito del proyecto fue determinar para las condiciones del Valle Cálido del Alto
Magdalena las zonas que proporcionen la mejor oferta ambiental para la producción y calidad de fibra del Algodonero, utilizándose para el cumplimiento de este fin el análysis geoestadístico (covariograma, kriging), y como estudio de caso el municipio de Natagaima. Por disponibilidad de potasio, todas las zonas productoras del Valle cálido del alto Magdalena presentan deficiencia a nivel del suelo. Respecto a la disponibilidad de oxigeno las zonas productoras de Natagaima, coinciden con su mayor valor: Para
la producción de algodón-semilla el sur del municipio presento los mayores rendimientos, por mayor oferta en la disponibilidad de oxigeno. Con base en las variables evaluadas se puede hacer coincidir la oferta ambiental con la demanda vegetal, conduciendo mediante la intervención del hombre en un eficiente manejo agronómico del cultivo del algodón. |
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Palavras-Chave: |
Geoestatística; Potássio no algodão. |
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Thesagro: |
Algodão. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aEl propósito del proyecto fue determinar para las condiciones del Valle Cálido del Alto Magdalena las zonas que proporcionen la mejor oferta ambiental para la producción y calidad de fibra del Algodonero, utilizándose para el cumplimiento de este fin el análysis geoestadístico (covariograma, kriging), y como estudio de caso el municipio de Natagaima. Por disponibilidad de potasio, todas las zonas productoras del Valle cálido del alto Magdalena presentan deficiencia a nivel del suelo. Respecto a la disponibilidad de oxigeno las zonas productoras de Natagaima, coinciden con su mayor valor: Para la producción de algodón-semilla el sur del municipio presento los mayores rendimientos, por mayor oferta en la disponibilidad de oxigeno. Con base en las variables evaluadas se puede hacer coincidir la oferta ambiental con la demanda vegetal, conduciendo mediante la intervención del hombre en un eficiente manejo agronómico del cultivo del algodón.
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Registro original: |
Embrapa Algodão (CNPA) |
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