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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
05/12/2019 |
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Data da última atualização: |
10/09/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
CARNEIRO, F. de A.; AQUINO, S. O. de; MATTOS, N. G.; VALERIANO, J. C.; CARNEIRO, W. W. de J.; RODRIGUES, G. C.; CARVALHO, M. A. de F.; VEIGA, A. D.; GRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da; MARRACCINI, P.; VIEIRA JUNIOR, I. C.; BALESTRE, M.; ANDRADE, A. C. |
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Afiliação: |
FERNANDA DE ARAÚJO CARNEIRO, Ufla; SINARA OLIVEIRA DE AQUINO, Ufla; NATHÁLIA GOMES MATTOS, Ufla; JÉSSICA COELHO VALERIANO, Ufla; WENDEL WILLIAM DE JESUS CARNEIRO, Bolsista Consórcio Pesquisa Café; GUSTAVO COSTA RODRIGUES, CNPTIA; MILENE ALVES DE FIGUEIREDO CARVALHO, CNPCa; ADRIANO DELLY VEIGA, CPAC; DARIO GRATTAPAGLIA, Cenargen; ORZENIL BONFIM DA SILVA JUNIOR, Cenargen; PIERRE MARRACCINI, Cirad; INDALECIO CUNHA VIEIRA JUNIOR, Ufla; MARCIO BALESTRE, Ufla; ALAN CARVALHO ANDRADE, CNPCa. |
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Título: |
Estudo de associação genômica ampla para importantes características agronômicas em Coffea canephora. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória, ES. Pesquisa, inovação e sustentabilidade dos cafés do Brasil. Brasília, DF: Embrapa Café, 2019. |
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Páginas: |
5 p. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Título em inglês: Genome-wide association studies for important agronomic traits in Coffea canephora. |
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Conteúdo: |
RESUMO: O Estudo de Associação Genômica Ampla (Genome-Wide Association Studies ? GWAS) surgiu com o intuito de capturar o efeito de genes na determinação de determinada característica fenotípica. Para isso, os indivíduos selecionados são genotipados em escala genômica e fenotipados para as características de interesse e então, a partir de análises estatísticas entre os polimorfismos de DNA e a variação no fenótipo, os genes que controlam essas características podem ser identificados. Por se tratar de uma espécie perene e de ciclo longo, os programas de melhoramento genético convencional do cafeeiro são demorados (vários anos) e de custo elevado. A geração de cultivares superiores via melhoramento genético ainda lida com o desafio de agregar simultaneamente diversas características quantitativas de relevância agronômica, assim como a qualidade de bebida. Neste contexto, na tentativa de identificar genes/regiões genômicas associadas à características agronômicas importantes, 1.319 indivíduos da Embrapa Cerrados foram genotipados e fenotipados, e posteriormente, realizou-se um estudo de GWAS com os softwares TASSEL e rrBLUP. Um número diferente de marcadores associados foi identificado com as duas estratégias utilizadas. Foram identificados marcadores tanto em regiões intergênicas como em regiões gênicas, sendo que, nesta última, os marcadores estavam presentes em genes já caracterizados e descritos na literatura para outras espécies como estando relacionados às características agronômicas aqui analisadas. MenosRESUMO: O Estudo de Associação Genômica Ampla (Genome-Wide Association Studies ? GWAS) surgiu com o intuito de capturar o efeito de genes na determinação de determinada característica fenotípica. Para isso, os indivíduos selecionados são genotipados em escala genômica e fenotipados para as características de interesse e então, a partir de análises estatísticas entre os polimorfismos de DNA e a variação no fenótipo, os genes que controlam essas características podem ser identificados. Por se tratar de uma espécie perene e de ciclo longo, os programas de melhoramento genético convencional do cafeeiro são demorados (vários anos) e de custo elevado. A geração de cultivares superiores via melhoramento genético ainda lida com o desafio de agregar simultaneamente diversas características quantitativas de relevância agronômica, assim como a qualidade de bebida. Neste contexto, na tentativa de identificar genes/regiões genômicas associadas à características agronômicas importantes, 1.319 indivíduos da Embrapa Cerrados foram genotipados e fenotipados, e posteriormente, realizou-se um estudo de GWAS com os softwares TASSEL e rrBLUP. Um número diferente de marcadores associados foi identificado com as duas estratégias utilizadas. Foram identificados marcadores tanto em regiões intergênicas como em regiões gênicas, sendo que, nesta última, os marcadores estavam presentes em genes já caracterizados e descritos na literatura para outras espécies como estando relacionados às características... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Diversidade genética; Genetic diversity; Genome Wide Association Studies; Nucleotídeo de polimorfismo único. |
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Thesagro: |
Café; Coffea Canephora. |
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Thesaurus Nal: |
Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/204557/1/Estudo-associacao-genomica.pdf
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Marc: |
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500 $aTítulo em inglês: Genome-wide association studies for important agronomic traits in Coffea canephora.
520 $aRESUMO: O Estudo de Associação Genômica Ampla (Genome-Wide Association Studies ? GWAS) surgiu com o intuito de capturar o efeito de genes na determinação de determinada característica fenotípica. Para isso, os indivíduos selecionados são genotipados em escala genômica e fenotipados para as características de interesse e então, a partir de análises estatísticas entre os polimorfismos de DNA e a variação no fenótipo, os genes que controlam essas características podem ser identificados. Por se tratar de uma espécie perene e de ciclo longo, os programas de melhoramento genético convencional do cafeeiro são demorados (vários anos) e de custo elevado. A geração de cultivares superiores via melhoramento genético ainda lida com o desafio de agregar simultaneamente diversas características quantitativas de relevância agronômica, assim como a qualidade de bebida. Neste contexto, na tentativa de identificar genes/regiões genômicas associadas à características agronômicas importantes, 1.319 indivíduos da Embrapa Cerrados foram genotipados e fenotipados, e posteriormente, realizou-se um estudo de GWAS com os softwares TASSEL e rrBLUP. Um número diferente de marcadores associados foi identificado com as duas estratégias utilizadas. Foram identificados marcadores tanto em regiões intergênicas como em regiões gênicas, sendo que, nesta última, os marcadores estavam presentes em genes já caracterizados e descritos na literatura para outras espécies como estando relacionados às características agronômicas aqui analisadas.
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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| 61. |  | GUIMARAES, P. M.; BRASILEIRO, A. C. M.; MORGANTE, C. V.; ROBERTS, P. A.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; SILVA JUNIOR, O. B. da; BERTIOLI, S. C. de M. L.; MARTINS, A.; BERTIOLI, D. Global transcriptome analysis of peanut wild species under biotic and abiotic stress. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE PEANUT RESEARCH COMMUNITY ON ADVANCES IN ARACHIS THROUGH GENOMICS AND BIOTECNOLOGY, 5., 2011, Brasília, DF. Book of abstracts... Brasília, DF: Embrapa Genetic Researces and Biotecnology, 2011. p. 33.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 62. | | GUIMARAES, P. M.; BRASILEIRO, A. C. M.; MORGANTE, C. V.; ROBERTS, P. A.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; SILVA JUNIOR, O. B. da; BERTIOLI, S. C. de M. L.; MARTINS, A.; BERTIOLI, D. Global transcriptome analysis of peanut wild species under biotic and abiotic stress. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE PEANUT RESEARCH COMMUNITY ON ADVANCES IN ARACHIS THROUGH GENOMICS AND BIOTECNOLOGY, 5., 2011, Brasília, DF. Book of abstracts... Brasília, DF: Embrapa Genetic Researces and Biotecnology, 2011. p. 33.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 63. | | GUIMARAES, P. M.; BRASILEIRO, A. C. M.; MORGANTE, C. V.; ROBERTS, P. A.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; SILVA JUNIOR, O. B. da; BERTIOLI, S. C. de M. L.; MARTINS, A.; MORETZSOHN, M. de C.; BERTIOLI, D. Global transcriptome analysis of two peanut wild species (Arachis stenosperma and A. duranensis) under biotic and abiotic stress. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 3., 2011, Ilhéus. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 64. | | GUIMARAES, P. M.; BRASILEIRO, A. C. M.; MORGANTE, C. V.; ROBERTS, P. A.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; SILVA JUNIOR, O. B. da; BERTIOLI, S. C. de M. L.; MARTINS, A.; MORETZSOHN, M. de C.; BERTIOLI, D. Global transcriptome analysis of two peanut wild species (Arachis stenosperma and A. duranensis) under biotic and abiotic stress. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 3., 2011, Ilhéus. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2011. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 65. | | PETROLI, C. D.; SANSALONI, C. P; CARLING, J.; STEANE, D. A.; VAILLANCOURT, R. E.; MYBURG, A. M.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J.; KILIAN, A.; GRATTAPAGLIA, D. Genomic characterization of DArT markers based on high-density linkage analysis and physical mapping to the Eucalyptus genome. PLoS ONE, v. 7, n. 9, set. 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 66. | | AGUIAR, A. V. de; TEIXEIRA-FREITAS, D. M. A.; ALMEIDA FILHO, J. E. de; SOUSA, V. A. de; RESENDE, M. D. V. de; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D. Genomic prediction of growth traits in Pinus taeda using genome-wide sequence-based DArT-seq markers. In: IUFRO TREE BIOTECHNOLOGY CONFERENCE, 2015, Florence. Forests: the importance to the planet and society. [S.l.]: IBBR: ICCOM, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 67. | | AGUIAR, A. V. de; TEIXEIRA-FREITAS, D. M. A.; ALMEIDA FILHO, J. E. de; SOUSA, V. A. de; RESENDE, M. D. V. de; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D. Genomic prediction of growth traits in Pinus taeda using genome-wide sequence-based DArT-seq markers. In: IUFRO TREE BIOTECHNOLOGY CONFERENCE, 2015, Florence. Forests: the importance to the planet and society. [S.l.]: IBBR: ICCOM, 2015. Pen-drive.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 68. | | GUIMARAES, P. M.; MORGANTE, C. V.; ROBERTS, P. A.; SILVA JUNIOR, O. B. da; ARRAIS, L; BERTIOLI, S. C. de M. L.; ARAUJO, A. C. G. de; MORETZSOHN, M. de C.; BERTIOLI, D.; BRASILEIRO, A. C. M. Gene expression revealed during the interaction of resistant Arachis stenosperma and Meloidogyne arenaria. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON LEGUME GENETICS AND GENOMICS, 6., 2012, Hyderabad, India. Programe & Abstract book...Hyderabad: ICRISAT, 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 73. | | BUTLER, J. B.; FREEMAN, J. S.; POTTS, B. M.; VAILLANCOURT, R. E.; GRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da; SIMMONS, B. A.; HEALEY, A. L.; SCHMUTZ, J.; BARRY, K. W.; LEE, D. J.; HENRY, R. J.; KING, G. J.; BATEN, A.; SHEPHERD, M. Annotation of the Corymbia terpene synthase gene family shows broad conservation but dynamic evolution of physical clusters relative to Eucalyptus. Heredity, v. 121, n. 1, p. 87-104, 2018. Na publicação: Orzenil B. Silva-Junior.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 74. | | PASSOS, M. A. N.; CRUZ, V. O. de; EMEDIATO, F. L.; TEIXEIRA, C. C. de; AZEVEDO, V. C. R.; BRASILEIRO, A. C. M.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; MARTINS, N. F.; TOGAWA, R. C.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; SILVA JUNIOR, O. B. da; MILLER, R. T N. G. Analysis of the leaf transcriptome of Musa acuminata during interaction with Mycosphaerella musicola: gene assembly, annotation and marker development. BMC Genomics, v.14, n.78, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 75. | | BUTLER, J. B.; FREEMAN, J. S.; POTTS, B. M.; VAILLANCOURT, R. E.; GRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da; SIMMONS, B.; SCHMUTZ, J.; BARRY, K. W.; LEE, D. J.; HEALEY, A.; FURTADO, A.; HENRY, R. J.; BATEN, A.; KING, G.; SHEPHERD, M. Comparative analysis of the terpene synthase gene family between Eucalyptus and Corymbia. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 25., 2017, San Diego. [Abstracts...]. San Diego, CA: [s.n.], 2017. P0598.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 76. | | MILLER, R. N. G.; PASSOS, M. A. N.; IMEDIATO, F. L.; CRUZ, V. O.; TEIXEIRA, C. de C.; FIGUEIREDO, L. F. de A.; MARTINS, N. F.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J. Keynote: understanding plant immunity: transcriptome profiling in Musa-pathogen interactions using next generation sequencing. In: PROMUSA SYMPOSIUM, 2011, Salvador. Bananas and plantains: toward sustainable global production and improved uses: abstracts. [Montepellier.]: [Bioversity International, 2011. p. 116-117.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 77. | | MARTINS, A. C. Q.; MORGANTE, C. V.; SILVA, A. K.; GALHARDO, I. C.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; SILVA JUNIOR, O. B. da; BERTIOLI, S. C. de M. L.; BERTIOLI, D. J.; MILLER, R. N. G.; BRASILEIRO, A. C. M.; GUIMARAES, P. M. Large scale transcriptome analysis of wild peanut (Arachis stenosperma) inoculated with Passalora personata, the causal agent of late leaf spot. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE PEANUT RESEARCH COMMUNITY ON ADVANCES IN ARACHIS THROUGH GENOMICS AND BIOTECNOLOGY, 5., 2011, Brasília, DF. Book of abstracts... Brasília, DF: Embrapa Genetic Researces and Biotecnology, 2011. p. 76.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 78. | | MARTINS, A. C. Q.; MORGANTE, C. V.; SILVA, A. K.; GALHARDO, I. C.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; SILVA JUNIOR, O. B. da; BERTIOLI, S. C. de M. L.; BERTIOLI, D. J.; MILLER, R. N. G.; BRASILEIRO, A. C. M.; GUIMARAES, P. M. Large scale transcriptome analysis of wild peanut (Arachis stenosperma) inoculated with Passalora personata, the causal agent of late leaf spot. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE PEANUT RESEARCH COMMUNITY ON ADVANCES IN ARACHIS THROUGH GENOMICS AND BIOTECNOLOGY, 5., 2011, Brasília, DF. Book of abstracts... Brasília, DF: Embrapa Genetic Researces and Biotecnology, 2011. p. 76.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 79. | | HEALEY, A. L.; SHEPHERD, M.; KING, G. J.; BUTLER, J. B.; FREEMAN, J. S.; LEE, D. J.; POTTS, B. M.; SILVA JUNIOR, O. B. da; BATEN, A.; JENKINS, J.; SHU, S.; LOVELL, J. T.; SREEDASYAM, A.; GRIMWOOD, J.; FURTADO, A.; GRATTAPAGLIA, D.; BARRY, K. W.; HUNDLEY, H.; SIMMONS, B. A.; SCHMUTZ, J.; VAILLANCOURT, R. E.; HENRY, R. J. Pests, diseases, and aridity have shaped the genome of Corymbia citriodora. Communications Biology, v. 4, 537, 2021. Na publicação: Orzenil B. Silva-Junior.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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