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| Registros recuperados : 321 | |
| 141. |  | MORELLO, C. de L.; PEDROSA, M. B.; VASCONCELOS, O. L.; FREIRE, E. C.; SILVA FILHO, J. L. da; FERREIRA, A. F.; ALENCAR, A. R. de. Linhagens e cultivares de algodão avaliadas no vale do Iuiu, safra 2007/08. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2009. 22 p. (Embrapa Algodão. Documentos, 215).| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Algodão. |
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| 142. | | MORELLO, C. de L.; PEDROSA, M. B.; VASCONCELOS, O. L.; FREIRE, E. C.; SILVA FILHO, J. L. da; FERREIRA, A. F.; ALENCAR, A. R. de. Linhagens e cultivares de algodão avaliadas no Vale do Luiu, safra 2007/08. Campina Grande, PB: Embrapa Algodão, 2009. 22 p. (Embrapa Algodão. Documentos, 215).| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 143. | | QUEIROZ, N. L.; SILVA FILHO, J. L. da; SILVA, M. N. B. da; VIDAL NETO, F. das C.; OLIVEIRA, R. A. de. Capacidade de combinação entre genótipos de algodoeiro de diferentes bases genéticas para características de fibra. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 8.; COTTON EXPO, 1., 2011, São Paulo. Evolução da cadeia para construção de um setor forte: Anais. Campina Grande, PB: Embrapa Algodão, 2011. p.1321-1325| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 146. | | SILVA FILHO, J. L. da; PEDROSA, M. B.; SUASSUNA, N. D.; MORELLO, C. de L.; FARIAS, F. J. C.; PERINA, F. J. Avaliação de cultivares de algodoeiro no Cerrado da Bahia, safra 2015/2016. Campina Grande, PB: Embrapa Algodão, 2017. 14 p. (Embrapa Algodão. Documentos, 269).| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 147. | | MORELLO, C. de L.; PEDROSA, M. B.; FREIRE, E. C.; SILVA FILHO, J. L. da; ALENCAR, A. R. de; OLIVEIRA, W. P. Avaliação de linhagens e cultivares de algodão do programa de pesquisa em melhoramento genético no Oeste da Bahia, safra 2007/2008. Campina Grande, PB: Embrapa Algodão, 2009. 53 p. (Embrapa Algodão. Documentos, 216).| Biblioteca(s): Embrapa Algodão; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 148. | | SANTOS, J. B. dos; PEDROSA, M. B.; SILVA FILHO, J. L. da; FERREIRA, G. B.; OLIVEIRA, W. P.; TAVARES, J. A.; ALENCAR, A. R. de. Avaliação da perda em produtividade de cultivares de algodoeiro, em dois sistemas de cultivo, no Oeste da Bahia. Safra 2004/2005. In: SILVA FILHO, J. L. da; PEDROSA, M. B.; SANTOS, J. B. dos. (Coord.). Pesquisas realizadas com o algodoeiro no Estado da Bahia - safra 2004/2005. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2006. p. 87-90 (Documentos, 146)| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 149. | | PEDROSA, M. B.; SILVA FILHO, J. L. da; FREIRE, E. C.; TAVARES, J. A.; ALENCAR, A. R. de; OLIVEIRA, W. P. Avaliação de perdas por apodrecimento em cultivares e linhagens de algodão no Cerrado da Bahia, safra 2004/2005. In: SILVA FILHO, J. L. da; PEDROSA, M. B.; SANTOS, J. B. dos. (Coord.). Pesquisas realizadas com o algodoeiro no Estado da Bahia - safra 2004/2005. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2006. p. 81-86 (Documentos, 146)| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 150. | | FERREIRA, A. C. de B.; BORIN, A. L. D. C.; SILVA FILHO, J. L. da; BOGIANI, J. C.; SANTOS, T. J. de S. Densidade de plantas, cultivares e época de semeadura do algodão adensado em segunda safra. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 10., 2015, Foz do Iguaçu. Resumos. Brasília, DF: ABRAPA, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 151. | | RIBEIRO, J. L.; RIBEIRO, V. Q.; MORELLO, C. de L.; FARIAS, F. J. C.; CARVALHO, L. P. de; SILVA FILHO, J. L. da. Desempenho de cultivares e linhagens de algodoeiro herbáceo na microrregião de Chapadinha, MA, nos anos agrícolas de 2006/2007 e 2007/2008. Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2010. 5 p. (Embrapa Meio-Norte. Comunicado Técnico, 222).| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 152. | | RIBEIRO, J. L.; RIBEIRO, V. Q.; MORELLO, C. de L.; FARIAS, F. J. C.; SILVA FILHO, J. L. da; SUASSUNA, N. D.; PEDROSA, M. Desempenho de cultivares e linhagens de algodoeiro herbáceo no Município de Colinas - MA, ano agrícola 2011/12. In: Congresso Brasileiro do Algodão, 9., 2013, Brasília, DF.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 153. | | RIBEIRO, J. L.; RIBEIRO, V. Q.; MORELLO, C. de L.; FARIAS, F. J. C.; SUASSUNA, N. D.; SILVA FILHO, J. L. da; PEDROSA, M. B. Desempenho da cultura do algodoeiro herbáceo no município de Colinas, MA, nos anos agrícolas de 2008/2009, 2009/2010 e 2010/2011. Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2012. 7 p. (Embrapa Meio-Norte. Comunicado técnico, 229).| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 154. | | RIBEIRO, J. L.; RIBEIRO, V. Q.; MORELLO, C. de L.; FARIAS, F. J. C.; CARVALHO, L. P. de; SILVA FILHO, J. L. da. Desempenho da cultura do algodoeiro herbáceo no Município de São Raimundo das Mangabeiras, MA, nos anos agrícolas de 2006/2007 e 2007/2008. Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2009. 7 p. (Embrapa Meio-Norte. Comunicado Técnico, 220).| Biblioteca(s): Embrapa Algodão; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 155. | | RIBEIRO, J. L.; RIBEIRO, V. Q.; MORELLO, C. de L.; FARIAS, F. J. C.; SILVA FILHO, J. L. da; SUASSUNA, N. D.; PEDROSA, M. Desempenho produtivo de linhares finais de algodão herbáceo de fibras médias no Município de São João do Piauí - PI, ano agrícola 2001/2012. In: Congresso Brasileiro do Algodão, 9., 2013, Brasília, DF.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 156. | | MORELLO, C. de L.; SUASSUNA, N. D.; SILVA FILHO, J. L. da; PEDROSA, M. B.; SOFIATTI, V.; PERINA, F. J.; CHITARRA, L. G.; ANCELMO, J. L. Desempenho de linhagens de algodoeiro em ambientes do Cerrado do Brasil - safra 2017/2018. Campina Grande, PB: Embrapa Algodão, 2020. 46 p. (Embrapa Algodão. Documentos, 278).| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 157. | | FARIAS, F. J. C.; CARVALHO, L. P. de; MORELLO, C. de L.; SILVA FILHO, J. L. da; SUASSUNA, N. D.; PEDROSA, M. B.; RIBEIRO, J. L. Desempenho da nova cultivar de algodoeiro herbáceo BRS 416 nas condições do Semiárido nordestino. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 11., 2017, Maceió. Resumos... Inovação e rentabilidade na cotonicultura: resumos... Brasília, DF: Associação Brasileira dos Produtores de Algodão - Abrapa, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão; Embrapa Meio-Norte. |
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| 159. | | FARIAS, F. J. C.; SILVA FILHO, J. L. da; FREIRE, E. C.; RODRIGUES, S. M. M.; LIRA, A. J. da S.; CAVALCANTE. M. G. R.; SOLETTI, F. Comportamento de linhagens avançadas de algodoeiro herbáceo nas condições do cerrado safra 06-07. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 7., 2009, Foz do Iguaçu. Sustentabilidade da cotonicultura brasileira e expansão dos mercados: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2009. 1 CD-ROM| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 160. | | PEDROSA, M. B.; SILVA FILHO, J. L. da; FREIRE, E. C.; VASCONCELOS, O. L.; FERNANDES, A. L. P.; ALENCAR, A. R. de; FERREIRA, A. F.; PIRES, C. G. Comportamento de linhagens e cultivares de algodoeiro no Vale do Yuyu, região Sudoeste da Bahia safra 2005/2006. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 6., 2007, Uberlândia. Anais... Uberlândia, 2007. p. 1-6 1 CD-ROM| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| Registros recuperados : 321 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
05/10/2018 |
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Data da última atualização: |
23/06/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 2 |
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Autoria: |
ESTRADA DE LOS SANTOS, P.; PALMER, M.; CHAVEZ-RAMIREZ, B.; BEUKES, C.; STEENKAMP, E. T.; BRISCOE, L.; KHAN, N.; MALUK, M.; LAFOS, M.; HUMM, E.; ARRABIT, M.; CROOK, M.; GROSS, E.; SIMON, M. F.; REIS JUNIOR, F. B. dos; WHITMAN, W. B.; SHAPIRO, N.; POOLE, P. S.; HIRSCH, A. M.; VENTER, S. N.; JAMES, E. K. |
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Afiliação: |
Paulina Estrada-de los Santos, Instituto Politécnico Nacional, Escuela Nacional de Ciencias Biológica; Marike Palmer, University of Pretoria; Belén Chávez-Ramírez, Instituto Politécnico Nacional, Escuela Nacional de Ciencias Biológicas; Chrizelle Beukes, University of Pretoria; Emma T. Steenkamp, University of Pretoria; Leah Briscoe, University of California; Noor Khan, University of California; Marta Maluk, The James Hutton Institute; Marcel Lafos, The James Hutton Institute; Ethan Humm, University of California; Monique Arrabit, University of California; Matthew Crook, Weber State University; Eduardo Gross, Santa Cruz State University; MARCELO FRAGOMENI SIMON, Cenargen; FABIO BUENO DOS REIS JUNIOR, CPAC; William B. Whitman, University of Georgia; Nicole Shapiro, Walnut Creek; Philip S. Poole, University of Oxford; Ann M. Hirsch, University of California; Stephanus N. Venter, University of Pretoria; Euan K. James, The James Hutton Institute. |
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Título: |
Whole genome analyses suggests that Burkholderiasensu lato contains two additional novel genera (Mycetohabitans gen. nov., and Trinickia gen. nov.): implications for the evolution of diazotrophy and nodulation in the Burkholderiaceae. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Genes, v. 9, n. 8, article 389, 2018. |
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DOI: |
https://doi.org/10.3390/genes9080389 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Burkholderia sensu lato is a large and complex group, containing pathogenic, phytopathogenic, symbiotic and non-symbiotic strains from a very wide range of environmental (soil, water, plants, fungi) and clinical (animal, human) habitats. Its taxonomy has been evaluated several times through the analysis of 16S rRNA sequences, concantenated 4?7 housekeeping gene sequences, and lately by genome sequences. Currently, the division of this group into Burkholderia, Caballeronia, Paraburkholderia, and Robbsia is strongly supported by genome analysis. These new genera broadly correspond to the various habitats/lifestyles of Burkholderia s.l., e.g., all the plant beneficial and environmental (PBE) strains are included in Paraburkholderia (which also includes all the N2-fixing legume symbionts) and Caballeronia, while most of the human and animal pathogens are retained in Burkholderia sensu stricto. However, none of these genera can accommodate two important groups of species. One of these includes the closely related Paraburkholderia rhizoxinica and Paraburkholderia endofungorum, which are both symbionts of the fungal phytopathogen Rhizopus microsporus. The second group comprises the Mimosa-nodulating bacterium Paraburkholderia symbiotica, the phytopathogen Paraburkholderia caryophylli, and the soil bacteria Burkholderia dabaoshanensis and Paraburkholderia soli. In order to clarify their positions within Burkholderia sensu lato, a phylogenomic approach based on a maximum likelihood analysis of conserved genes from more than 100 Burkholderia sensu lato species was carried out. Additionally, the average nucleotide identity (ANI) and amino acid identity (AAI) were calculated. The data strongly supported the existence of two distinct and unique clades, which in fact sustain the description of two novel genera Mycetohabitans gen. nov. and Trinickia gen. nov. The newly proposed combinations are Mycetohabitans endofungorum comb. nov., Mycetohabitansrhizoxinica comb. nov., Trinickia caryophylli comb. nov., Trinickiadabaoshanensis comb. nov., Trinickia soli comb. nov., and Trinickiasymbiotica comb. nov. Given that the division between the genera that comprise Burkholderia s.l. in terms of their lifestyles is often complex, differential characteristics of the genomes of these new combinations were investigated. In addition, two important lifestyle-determining traits?diazotrophy and/or symbiotic nodulation, and pathogenesis?were analyzed in depth i.e., the phylogenetic positions of nitrogen fixation and nodulation genes in Trinickia via-à-vis other Burkholderiaceae were determined, and the possibility of pathogenesis in Mycetohabitans and Trinickia was tested by performing infection experiments on plants and the nematode Caenorhabditis elegans. It is concluded that (1) T. symbiotica nif and nod genes fit within the wider Mimosa-nodulating Burkholderiaceae but appear in separate clades and that T. caryophyllinif genes are basal to the free-living Burkholderia s.l. strains, while with regard to pathogenesis (2) none of the Mycetohabitans and Trinickia strains tested are likely to be pathogenic, except for the known phytopathogen T. caryophylli. MenosBurkholderia sensu lato is a large and complex group, containing pathogenic, phytopathogenic, symbiotic and non-symbiotic strains from a very wide range of environmental (soil, water, plants, fungi) and clinical (animal, human) habitats. Its taxonomy has been evaluated several times through the analysis of 16S rRNA sequences, concantenated 4?7 housekeeping gene sequences, and lately by genome sequences. Currently, the division of this group into Burkholderia, Caballeronia, Paraburkholderia, and Robbsia is strongly supported by genome analysis. These new genera broadly correspond to the various habitats/lifestyles of Burkholderia s.l., e.g., all the plant beneficial and environmental (PBE) strains are included in Paraburkholderia (which also includes all the N2-fixing legume symbionts) and Caballeronia, while most of the human and animal pathogens are retained in Burkholderia sensu stricto. However, none of these genera can accommodate two important groups of species. One of these includes the closely related Paraburkholderia rhizoxinica and Paraburkholderia endofungorum, which are both symbionts of the fungal phytopathogen Rhizopus microsporus. The second group comprises the Mimosa-nodulating bacterium Paraburkholderia symbiotica, the phytopathogen Paraburkholderia caryophylli, and the soil bacteria Burkholderia dabaoshanensis and Paraburkholderia soli. In order to clarify their positions within Burkholderia sensu lato, a phylogenomic approach based on a maximum likelihood a... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Genes conservados. |
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Thesagro: |
Análise Comparativa; Filogenia; Genoma. |
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Thesaurus NAL: |
Burkholderiaceae. |
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Categoria do assunto: |
V Taxonomia de Organismos |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/183636/1/Whole-Genome-Analyses-Suggests-that-Burkholderia-sensu-lato-Contains-Two-Additional-Novel-Genera-apagar.pdf
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Marc: |
LEADER 04499naa a2200433 a 4500
001 2096957
005 2022-06-23
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024 7 $ahttps://doi.org/10.3390/genes9080389$2DOI
100 1 $aESTRADA DE LOS SANTOS, P.
245 $aWhole genome analyses suggests that Burkholderiasensu lato contains two additional novel genera (Mycetohabitans gen. nov., and Trinickia gen. nov.)$bimplications for the evolution of diazotrophy and nodulation in the Burkholderiaceae.$h[electronic resource]
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520 $aBurkholderia sensu lato is a large and complex group, containing pathogenic, phytopathogenic, symbiotic and non-symbiotic strains from a very wide range of environmental (soil, water, plants, fungi) and clinical (animal, human) habitats. Its taxonomy has been evaluated several times through the analysis of 16S rRNA sequences, concantenated 4?7 housekeeping gene sequences, and lately by genome sequences. Currently, the division of this group into Burkholderia, Caballeronia, Paraburkholderia, and Robbsia is strongly supported by genome analysis. These new genera broadly correspond to the various habitats/lifestyles of Burkholderia s.l., e.g., all the plant beneficial and environmental (PBE) strains are included in Paraburkholderia (which also includes all the N2-fixing legume symbionts) and Caballeronia, while most of the human and animal pathogens are retained in Burkholderia sensu stricto. However, none of these genera can accommodate two important groups of species. One of these includes the closely related Paraburkholderia rhizoxinica and Paraburkholderia endofungorum, which are both symbionts of the fungal phytopathogen Rhizopus microsporus. The second group comprises the Mimosa-nodulating bacterium Paraburkholderia symbiotica, the phytopathogen Paraburkholderia caryophylli, and the soil bacteria Burkholderia dabaoshanensis and Paraburkholderia soli. In order to clarify their positions within Burkholderia sensu lato, a phylogenomic approach based on a maximum likelihood analysis of conserved genes from more than 100 Burkholderia sensu lato species was carried out. Additionally, the average nucleotide identity (ANI) and amino acid identity (AAI) were calculated. The data strongly supported the existence of two distinct and unique clades, which in fact sustain the description of two novel genera Mycetohabitans gen. nov. and Trinickia gen. nov. The newly proposed combinations are Mycetohabitans endofungorum comb. nov., Mycetohabitansrhizoxinica comb. nov., Trinickia caryophylli comb. nov., Trinickiadabaoshanensis comb. nov., Trinickia soli comb. nov., and Trinickiasymbiotica comb. nov. Given that the division between the genera that comprise Burkholderia s.l. in terms of their lifestyles is often complex, differential characteristics of the genomes of these new combinations were investigated. In addition, two important lifestyle-determining traits?diazotrophy and/or symbiotic nodulation, and pathogenesis?were analyzed in depth i.e., the phylogenetic positions of nitrogen fixation and nodulation genes in Trinickia via-à-vis other Burkholderiaceae were determined, and the possibility of pathogenesis in Mycetohabitans and Trinickia was tested by performing infection experiments on plants and the nematode Caenorhabditis elegans. It is concluded that (1) T. symbiotica nif and nod genes fit within the wider Mimosa-nodulating Burkholderiaceae but appear in separate clades and that T. caryophyllinif genes are basal to the free-living Burkholderia s.l. strains, while with regard to pathogenesis (2) none of the Mycetohabitans and Trinickia strains tested are likely to be pathogenic, except for the known phytopathogen T. caryophylli.
650 $aBurkholderiaceae
650 $aAnálise Comparativa
650 $aFilogenia
650 $aGenoma
653 $aGenes conservados
700 1 $aPALMER, M.
700 1 $aCHAVEZ-RAMIREZ, B.
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700 1 $aJAMES, E. K.
773 $tGenes$gv. 9, n. 8, article 389, 2018.
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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