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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
Data corrente: |
29/11/2018 |
Data da última atualização: |
30/11/2018 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
OKINO, C. H.; GIGLIOTI, R.; Silva, P. C.; OLIVEIRA, H. N. de; OLIVEIRA, M. C. de S. |
Afiliação: |
CINTIA HIROMI OKINO, CPPSE; Rodrigo Giglioti, UNESP; Pamella Cristini Silva, UNICEP; Henrique Nunes de Oliveira, UNESP; MARCIA CRISTINA DE SENA OLIVEIRA, CPPSE. |
Título: |
Comparative evaluation of DNA extraction kit, matrix sample and qPCR assays for bovine babesiosis monitoring. |
Ano de publicação: |
2018 |
Fonte/Imprenta: |
Molecular Biology Reports, v. 45, n. 6, p. 2671-2680, 2018. |
DOI: |
10.1007/s11033-018-4436-9 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Bovine babesiosis caused by protozoan parasites Babesia bovis and B. bigemina is one of the most important causes of losses for the livestock industry in tropical and subtropical regions of the world. Therefore, highly sensitive and specific tools for these hemoparasites detection and monitoring are required, especially in carrier animals, in which low parasite levels were usually present. In this context, qPCR assays have been successfully and fairly used in last years. Aiming to improve the performance of Babesia levels monitoring by qPCR, some of main aspects of this methodology that may influence results were tested: DNA extraction kits, whole blood EDTA pre-treatment, blood source (tip of tail or jugular vein), erythrocytes isolation, FTA card interference and qPCR system of detection. Under our experimental conditions, both EDTA pre-treatment and FTA card application have no influence on the sensitivity of detection, and two DNA extraction kits provided higher sensitivity compared to others. As expected, blood samples collected from the tip of tail vessels presented higher levels of B. bovis DNA compared to those obtained from the jugular vein, and erythrocytes processed isolated has also improved the sensitivity compared to whole blood. Moreover, both qPCR assays here developed using hydrolysis probes for B. bovis and B. bigemina detection, presented enhanced reproducibility compared to qPCR assays using intercalating dye system. Even, qPCR for B. bigemina using hydrolysis probe here developed presented higher sensitivity compared to intercalating dye system. This study has contributed to the improvement of molecular diagnosis of bovine babesiosis, which may improve epidemiological studies related to these pathogens. MenosBovine babesiosis caused by protozoan parasites Babesia bovis and B. bigemina is one of the most important causes of losses for the livestock industry in tropical and subtropical regions of the world. Therefore, highly sensitive and specific tools for these hemoparasites detection and monitoring are required, especially in carrier animals, in which low parasite levels were usually present. In this context, qPCR assays have been successfully and fairly used in last years. Aiming to improve the performance of Babesia levels monitoring by qPCR, some of main aspects of this methodology that may influence results were tested: DNA extraction kits, whole blood EDTA pre-treatment, blood source (tip of tail or jugular vein), erythrocytes isolation, FTA card interference and qPCR system of detection. Under our experimental conditions, both EDTA pre-treatment and FTA card application have no influence on the sensitivity of detection, and two DNA extraction kits provided higher sensitivity compared to others. As expected, blood samples collected from the tip of tail vessels presented higher levels of B. bovis DNA compared to those obtained from the jugular vein, and erythrocytes processed isolated has also improved the sensitivity compared to whole blood. Moreover, both qPCR assays here developed using hydrolysis probes for B. bovis and B. bigemina detection, presented enhanced reproducibility compared to qPCR assays using intercalating dye system. Even, qPCR for B. bigemina using hydro... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
DNA extraction; Hydrolysis probe; Matrix sample; QPCR. |
Thesagro: |
Babesia Bovis. |
Thesaurus Nal: |
Babesiosis. |
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
Marc: |
LEADER 02517naa a2200253 a 4500 001 2100307 005 2018-11-30 008 2018 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1007/s11033-018-4436-9$2DOI 100 1 $aOKINO, C. H. 245 $aComparative evaluation of DNA extraction kit, matrix sample and qPCR assays for bovine babesiosis monitoring.$h[electronic resource] 260 $c2018 520 $aBovine babesiosis caused by protozoan parasites Babesia bovis and B. bigemina is one of the most important causes of losses for the livestock industry in tropical and subtropical regions of the world. Therefore, highly sensitive and specific tools for these hemoparasites detection and monitoring are required, especially in carrier animals, in which low parasite levels were usually present. In this context, qPCR assays have been successfully and fairly used in last years. Aiming to improve the performance of Babesia levels monitoring by qPCR, some of main aspects of this methodology that may influence results were tested: DNA extraction kits, whole blood EDTA pre-treatment, blood source (tip of tail or jugular vein), erythrocytes isolation, FTA card interference and qPCR system of detection. Under our experimental conditions, both EDTA pre-treatment and FTA card application have no influence on the sensitivity of detection, and two DNA extraction kits provided higher sensitivity compared to others. As expected, blood samples collected from the tip of tail vessels presented higher levels of B. bovis DNA compared to those obtained from the jugular vein, and erythrocytes processed isolated has also improved the sensitivity compared to whole blood. Moreover, both qPCR assays here developed using hydrolysis probes for B. bovis and B. bigemina detection, presented enhanced reproducibility compared to qPCR assays using intercalating dye system. Even, qPCR for B. bigemina using hydrolysis probe here developed presented higher sensitivity compared to intercalating dye system. This study has contributed to the improvement of molecular diagnosis of bovine babesiosis, which may improve epidemiological studies related to these pathogens. 650 $aBabesiosis 650 $aBabesia Bovis 653 $aDNA extraction 653 $aHydrolysis probe 653 $aMatrix sample 653 $aQPCR 700 1 $aGIGLIOTI, R. 700 1 $aSilva, P. C. 700 1 $aOLIVEIRA, H. N. de 700 1 $aOLIVEIRA, M. C. de S. 773 $tMolecular Biology Reports$gv. 45, n. 6, p. 2671-2680, 2018.
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Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Registros recuperados : 167 | |
101. | | MOREIRA, N. H.; BRASIL, O. O.; SILVA, P. C. P.; SANTOS, R. dos S.; TORTORELLA, R. D.; RAMOS, A. F. Diferentes protocolos de indução do estro, durante as estações chuvosa e seca, em ovelhas Santa Inês. In. CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Resumo. 365. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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102. | | GUABIRABA, I. R.; MACIEL, S. P. O.; CORRÊA, J. F. V.; SILVA, P. C. da; LIRA-GUEDES, A. C. Distribuição diamétrica e densidade de andirobeiras em duas fitofisionomias florestais. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAPÁ, 7., 2021, Macapá. Transversalidade da ciência, tecnologia e inovações para o planeta: resumos. Macapá: Embrapa Amapá, 2022. p. 41-42. Editoras técnicas: Cristiane Ramos de Jesus, Ana Cláudia Lira-Guedes e Adelina do Socorro Serrão Belém. ODS-15.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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103. | | CORRÊA, J. F. V.; SILVA, P. C. da; MACIEL, S. P. O.; GUABIRABA, I. R.; LIRA-GUEDES, A. C. Distribuição diamétrica e produção de sementes de andirobeiras em floresta de terra firme. In: JORNADA DE BOTÂNICA E ECOLOGIA, 2.; JORNADA AMAPAENSE DE BOTÂNICA, 2., 2020, Macapá. Anais... Macapá: UEAP, 2022. p. 191-197Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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104. | | GIGLIOTI, R.; OKINO, C. H.; BASSETTO, C. C.; SILVA, P. C.; OLIVEIRA, H. N. de; OLIVEIRA, M. C. de S. New Loop-mediated isothermal amplification (lamp) method for the rapid identification of anaplasma marginale. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA, 20., 2018, Londrina, PR. Anais...Londrina, PR: CBPV, 2018. p. 259Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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105. | | TONNEAU, J.-P.; SILVA, P. C. G. da; BARROS, E. da R.; PIRAUX, M.; AZEVEDO, S. G. de. Pesquisa, desenvolvimento e inovação para o desenvolvimento territorial e convivência com o Semiárido brasileiro: metodologia de pesquisa participativa. In: NASCIMENTO, P. P.; SICOLI, A. H.; MARTINS, M. A. G.; BALSADI, O. V.; SILVA JÚNIOR, C. D. da. (Ed.). Inovações em desenvolvimento territorial: novos desafios para a Embrapa. Brasília, DF: Embrapa Informação Tecnológica: Embrapa Departamento de Transferência de Tecnologia, 2011. cap. 3, p. 91-111. il.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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106. | | FABRIS, L. B.; FOLONI, J. S. S.; CALONEGO, J. C.; SANTOS, D. H.; SANTOS, G. S.; SILVA, P. C. G. Produtividade e desempenho de cana soca cultivada em diferentes espaçamentos e doses de adubação nitrogenada em cobertura. Revista Agrarian, Dourados, v. 6, n. 21, p. 252-258, 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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107. | | BIANCHINI, P. C.; TAKAGI, M.; PIRAUX, M.; TONNEAU, J.-P.; BIANCHINI, F.; FERREIRA, M. A. J. F.; SILVA, P. C. G. da. Agricultura familiar, territórios e políticas públicas: diretrizes para uma agenda de pesquisa. Petrolina: Embrapa Semiárido, 2016. 25 p. il. (Embrapa Semiárido. Documentos, 275).Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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108. | | SILVA, P. C. G. da; AZEVEDO, S. G. de; MOREIRA, J. N.; TONNEAU, J. P.; CORREIA, R. C.; SILVA, A. F. A abordagem territorial nas atividades de Pesquisa, Desenvolvimento & Inovação da Embrapa Semiárido. In: SA, I. B.; SILVA, P. C. G. da. (Ed.). Semiárido brasileiro: pesquisa, desenvolvimento e inovação. Petrolina: Embrapa Semiárido, 2010. cap. 11, p. 373-402.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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109. | | RODRIGUES, D. C. A.; MONTES, A. C. de; BARBOSA, T. de J.; DIAS, C. B. S.; SILVA, P. C. G. da. Apicultura: a experiência de começar a criar abelhas em meio a seca severa. In: SIMPÓSIO DO BIOMA CAATINGA, 2., 2018, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2019. p. 280. (Embrapa Semiárido. Documentos, 287).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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110. | | SILVA, P. C. G. da; LEAO, P. C. de S.; CERDAN, C.; SAUTIER, D.; CHOUDHURY, M. M.; BENTZEN, M. da C. P.; BARRETO, M. C. A cadeia produtiva da uva de mesa do Nordeste do Brasil. In: CASTRO, A. M. G.; de; LIMA, S. M. V.; GOEDERT, W. J.; FREITAS FILHO, A. de; VASCONCELOS, J. R. P. (Ed.). Cadeias produtivas e sistemas naturais: prospeccao tecnologica. Brasilia, DF: EMBRAPA-SPI: EMBRAPA-DPD, 1998. cap. 20, p. 527-564.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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111. | | SILVA, P. C. G. da; CERDAN, C.; LEAO, P. C. de S.; BARRETO, M. C.; BENTZEN, M. da C. P.; CHOUDHURY, M. M.; SAUTIER, D. Cadeia produtiva da uva de mesa no Nordeste. In: SEMINARIO NACIONAL SOBRE PROSPECCAO TECNOLOGICA, 1997, Brasilia, DF. Anais... Brasilia, DF: EMBRAPA, 1997. p.83-84.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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112. | | MOREIRA, N. H.; BRASIL, O. O.; SILVA, P. C. P.; SILVA, J. P. da; PAIVA NETO, M. A.; NASCIMENTO, N. V. do; RAMOS, A. F. Avaliação da sincronização do estro e ovulação, utilizando FSH:LH, durante as estações chuvosa e seca, em ovelhas Santa Inês. In. CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Resumo. 364. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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113. | | TORTORELLA, R. D.; NOGUEIRA, G. de P.; MODESTO, M. R.; SILVA, P. C. P.; SILVA, J. P. da; NEVES, J. P.; RAMOS, A. F. Characterizing emergence and divergence in the first follicular wave in a tropically adapted Bos taurus breed. Theriogenology, v. 88, p. 9-17, 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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115. | | SILVA, P. C. P.; SILVA, B. D. M. da; MOREIRA, N. H.; BARBOSA, E. A.; SPRICIGO, J. F. W.; DODE, M. A. N.; RAMOS, A. F. Coleta seriada de embriões suínos por laparotomia. In. CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Resumo. 585. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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116. | | SILVA, P. C. P.; SILVA, B. D. M.; MOREIRA, N. H.; SPRICIGO, J. F. W.; DODE, M. A. N.; RAMOS, A. F. Coleta de embriões em suínos nacionais por laparotomia. In. CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Resumo. 363. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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117. | | SILVA, P. C. A.; OLIVEIRA, J. P.; DUTRA, G. A.; PAIVA, S. O.; CARAM, D. F.; JUNQUEIRA, R. G. C.; JACOB, J. D. F. Taxa de recuperação e características morfológicas de embriões muares (Equus caballus x Equus asinus). Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 38, n. 7, p. 1453-1457, julho 2018 Título em inglês: Recovery rate and morphologic features of cross bred embryos (Equus caballus x Equus asinus).Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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118. | | HOLANDA JÚNIOR, E. V.; OLIVEIRA, C. A. V.; SILVA, P. C. G. da; GUEDES, C. T. S.; ARAUJO, G. G. L. de; SILVA, C. N.; CEZIMBRA, C. M. Tipologia e estrutura da renda de caprino-ovinocultores de base familiar no Sertão baiano do São Francisco. In: ENCONTRO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE SISTEMAS DE PRODUÇÃO, 6., 2004, Aracaju. Anais... Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2004. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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119. | | VIVALLO PINARE, A. G.; HONORIO, A. P. M.; ARAUJO, F. P. de; SILVA, C. A. da; SILVA, P. C. G. da; QUEIROZ, M. A. de. Métodos de pesquisa de comercialização agrícola: o caso do feijão na região de Ouricuri- PE. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ECONOMIA E SOCIOLOGIA RURAL, 24., 1986, Lavras. Uma nova politica agricola? anais. Brasilia, DF: SOBER, 1986. p. 147.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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