|
|
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
16/02/2016 |
Data da última atualização: |
03/02/2024 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
KIM, E. S.; SONSTEGARD, T. S.; SILVA, M. V. G. B.; GASBARRE, L. C.; TASSEL, C. P. V. |
Afiliação: |
Eui-Soo Kim; Tad S. Sonstegard; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; Louis C. Gasbarre; Curtis P. Van Tassell. |
Título: |
Genome-wide scan of gastrointestinal nematode resistance in closed Angus population selected for minimized influence of MHC. |
Ano de publicação: |
2015 |
Fonte/Imprenta: |
PLoS One, v. 10, n. 3, : e0119380, 2015. |
Páginas: |
18 p. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Genetic markers associated with parasite indicator traits are ideal targets for study of marker assisted selection aimed at controlling infections that reduce herd use of anthelminthics. For this study, we collected gastrointestinal (GI) nematode fecal egg count (FEC) data from post-weaning animals of an Angus resource population challenged to a 26 week natural exposure on pasture. In all, data from 487 animals was collected over a 16 year period between 1992 and 2007, most of which were selected for a specific DRB1 allele to reduce the influence of potential allelic variant effects of the MHC locus. A genome-wide association study (GWAS) based on BovineSNP50 genotypes revealed six genomic regions located on bovine Chromosomes 3, 5, 8, 15 and 27; which were significantly associated (-log10 p=4.3) with Box-Cox transformed mean FEC (BC-MFEC). DAVID analysis of the genes within the significant genomic regions suggested a correlation between our results and annotation for genes involved in inflammatory response to infection. Furthermore, ROH and selection signature analyses provided strong evidence that the genomic regions associated BC-MFEC have not been affected by local autozygosity or recent experimental selection. These findings provide useful information for parasite resistance prediction for young grazing cattle and suggest new candidate gene targets for development of disease-modifying therapies or future studies of host response to GI parasite infection. |
Thesaurus Nal: |
cattle; genetic markers; heritability. |
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/139139/1/Cnpgl-2015-PlosOne-Genome-wide.pdf
|
Marc: |
LEADER 02131naa a2200217 a 4500 001 2037193 005 2024-02-03 008 2015 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aKIM, E. S. 245 $aGenome-wide scan of gastrointestinal nematode resistance in closed Angus population selected for minimized influence of MHC.$h[electronic resource] 260 $c2015 300 $a18 p. 520 $aGenetic markers associated with parasite indicator traits are ideal targets for study of marker assisted selection aimed at controlling infections that reduce herd use of anthelminthics. For this study, we collected gastrointestinal (GI) nematode fecal egg count (FEC) data from post-weaning animals of an Angus resource population challenged to a 26 week natural exposure on pasture. In all, data from 487 animals was collected over a 16 year period between 1992 and 2007, most of which were selected for a specific DRB1 allele to reduce the influence of potential allelic variant effects of the MHC locus. A genome-wide association study (GWAS) based on BovineSNP50 genotypes revealed six genomic regions located on bovine Chromosomes 3, 5, 8, 15 and 27; which were significantly associated (-log10 p=4.3) with Box-Cox transformed mean FEC (BC-MFEC). DAVID analysis of the genes within the significant genomic regions suggested a correlation between our results and annotation for genes involved in inflammatory response to infection. Furthermore, ROH and selection signature analyses provided strong evidence that the genomic regions associated BC-MFEC have not been affected by local autozygosity or recent experimental selection. These findings provide useful information for parasite resistance prediction for young grazing cattle and suggest new candidate gene targets for development of disease-modifying therapies or future studies of host response to GI parasite infection. 650 $acattle 650 $agenetic markers 650 $aheritability 700 1 $aSONSTEGARD, T. S. 700 1 $aSILVA, M. V. G. B. 700 1 $aGASBARRE, L. C. 700 1 $aTASSEL, C. P. V. 773 $tPLoS One$gv. 10, n. 3, : e0119380, 2015.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
Registros recuperados : 535 | |
62. | | COSTA, C. N.; COBUCI, J. A.; FREITAS, A. F. DE; SILVA, M. V. G. B.; KERN, E. L.; CARVALHEIRA, J. Parametros geneticos para a produção de leite do dia do controle da primeira lactação de vacas girolando estimados por regressão aleatória com polinomios de legendre. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
65. | | ARBEX, W. A.; CARVALHO, L. A. V. de; SILVA, M. V. G. B.; YAMAGISHI, M. E. B. Modelagem difusa para suporte à decisão na descoberta de SNPs em sequências de cDNA. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROINFORMÁTICA, 7., 2009, Viçosa, MG. Anais... Viçosa, MG: UFV, 2009. Não paginado. SBIAgro 2009. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
73. | | SCHETTINO, G. M.; SILVEIRA JÚNIOR, L.; MOREIRA, L. H.; SCHETTINO, H. V.; SILVA, M. V. G. B. Quantificação de gordura, de proteína e de matéria seca do leite bovino utilizando espectroscopia Raman: uma possibilidade de aplicação em campo. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 52., 2015, Belo Horizonte. Zootecnia: otimizando recursos e potencialidades: anais. Belo Horizonte: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2015. 3 p.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
74. | | SILVA, M. V. G. B.; TASSELL, C. P. V.; SONSTEGARD, T. S.; MATUKUMALLI, L.; SCHROEDER, S.; VANRADEN, P.; WIGGANS, G. Predição do valor genético total de touros da raça Holandesa por meio de mapas densos de marcadores. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA. 45., 2008, Lavras, MG. Anais... Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2008.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
75. | | SILVA, T. R. da; CARMO, A. do; ARBEX, W. A.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B. Seleção genômica: incorporando o DNA na avaliação genética de bovinos leiteiros. Leite Integral, Piracicaba, v. 9, n. 76, p. 62-65, 2015.Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
76. | | FREITAS, A. F.; MELLO, F. de; FONSECA, I.; SILVA, M. V. G. B.; GUIMARAES, M. F. M.; ARBEX, W. A. Seleção Genômica nos Programas de Melhoramento Genético de Raças Bovinas Leiteiras. O Girolando, Belo Horizonte, v. 11, n. 70, p. 16, 2009.Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
77. | | SANTOS, K. C. L. DOS; ARBEX, W. A.; NASCIMENTO, E. DE O.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B. SireDNA: um sistema de informação para armazenamento e recuperação de dados do banco de DNA de bovinos de leite. In: ENCONTRO NACIONAL SOBRE METODOLOGIAS E GESTÃO DE LABORATÓRIOS DA EMBRAPA, 19.; SIMPÓSIO SOBRE PROCEDIMENTOS ANALÍTICOS E A RASTREABILIDADE DOS RESULTADOS DA AGROPECUÁRIA, 6., 2014, Fortaleza, CE. Unir talentos para ultrapassar fronteiras. Fortaleza: Embrapa Agroindústria Tropical, 2014. p. 9.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
78. | | PERIPOLLI, E.; MUNARI, D. P.; SILVA, M. V. G. B.; LIMA, A. L.; IRGANG, R.; BALDI, F. Runs of homozygosity: current knowledge and applications in livestock. Animal Genetics, v. 48, n. 3, p. 255-271, 2017. Publicado online em 1 dez. 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
Registros recuperados : 535 | |
|
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|