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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
12/02/2015 |
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Data da última atualização: |
15/03/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
SILVA, J. M. da; GIACHETTO, P. F.; SILVA, L. O. C. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. |
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Afiliação: |
JOAQUIM MANOEL DA SILVA, Unemat, IB/Unicamp, CNPTIA; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; LUIZ OTAVIO CAMPOS DA SILVA, CNPGC; SAMUEL REZENDE PAIVA, SRI; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, CENARGEN; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA. |
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Título: |
Detection of copy number variations in nelore beef cattle with high-density SNP genotyping data. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. [Abstracts]. San Diego: [s.n.], 2014. |
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Páginas: |
Não paginado. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
P553. |
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Conteúdo: |
Genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping platforms have been widely used in studies in diverse areas, ranging from population genetics to applied genetic improvement and breeding. SNP genotyping data generated with these platforms can also be used for detecting and genotyping copy number variations (CNVs). CNVs are defined as a variable copy numbers of DNA segments ranging from 50bp to several megabases (Mbp), in comparison with a reference genome. Several studies have identified an abundance of CNVs in human and domestic animal genomes, where it has been shown that they are involved in phenotypic variability. This initial study reports a high resolution map of CNVs in Nelore beef cattle generated with the PennCNV software. CNVs were called in a dataset from 1709 animals of the Nelore breed genotyped with Illumina BovineHD BeadChip for a total of 735,242 markers. After non-restrictive quality filtering, a total of 246,290 CNVs were identified on autosomal chromosomes, representing 219,997 and 26,293 gain and loss events, respectively. CNVs lengths ranged from 20.02 Kb to 8.37 Mb with an average of 352 Kb and a median of 204.5 Kb. The number of SNPs in each detected CNV varied from 20 to 2,116 with an average of 104 and a median of 63. A total of 138,066 CNVs were present in regions with annotated genes. |
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Palavras-Chave: |
Polimorfismo de nucleotídeo único. |
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Thesagro: |
Gado de corte. |
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Thesaurus Nal: |
Beef cattle; Nellore; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/117503/1/Joaquim-Manoel-Silva-PAG-XXII-2014-ARC-CNVR.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 399 | |
| 301. |  | SOUZA, J. C. de; RAMOS, A. de A.; SILVA, L. O. C. da; EUCLIDES FILHO, K.; ALENCAR, M. M. de; FERRAZ FILHO, P. B. Tendência genética do peso ao desmame de bezerros da raça Nelore. In: REUNIÃO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 35., 1998, Botucatu-SP. Anais... Botucatu: SBZ, 1998: SBZ, p.231-233. Resumo expandido| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 302. | | FERRAZ FILHO, P. B.; SOUZA, J. C. de; SILVA, L. O. C. da; ALENCAR, M. M. de; EUCLIDES FILHO, K.; FERNANDES, L. Tendência genética dos pesos aos 205 dias de idade de bovinos da raça Nelore no Mato Grosso do Sul. In: ENCONTRO DE BIOLOGIA, 10., 1999, Sao Carlos, SP. Anais... Sao Carlos: UFSCar, 1999. p.60.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 303. | | FERRAZ FILHO, P. B.; SOUZA, J. C. de; SILVA, L. O. C. da; ALENCAR, M. M. de; EUCLIDES FILHO, K.; FERNANDES, L. Tendencias genetica dos pesos aos 205 dias de idade de bovinos da raca Nelore no Mato Grosso do Sul. In: ENCONTRO DE BIOLOGOS DO CRB-1 (SP,MT,MS), 10., 1999, Sao Carlos. Programa e resumos. [S.l.]: CRB-1/UFS Car., [1999?]. p. 60. CNPGC. Resumo 01.10.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 304. | | MENEZES, G. R. de O.; MARTIN NIETO, L.; ROSA, A. do N.; NOBRE, P. R. C.; SILVA, L. O. C. da; GONDO, A. Tendências genéticas para características de carcaça ao sobreano na raça Nelore: Programa Geneplus-Embrapa. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 10., 2013, Uberaba. Anais... Viçosa: Sociedade Brasileira de Melhoramento Animal, 2013. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 305. | | SILVEIRA, M. V. da; SOUZA, J. C. de; SILVA, L. O. C. da; MARTIN NIETO, L.; ROSA, A. do N.; FERRAZ FILHO, P. B. Tendências genéticas e fenotípicas para peso aos 420 dias de fêmeas da raça Nelore criadas no Mato Grosso do Sul1. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 10., 2013, Uberaba. Anais... Viçosa: Sociedade Brasileira de Melhoramento Animal, 2013. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 306. | | SOUZA JUNIOR, M. D. de; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SILVA, L. O. C. da; NOBRE, P. R. C.; GONDO, A.; NIETO, L. M.; FREITAS, D. V. UTilização dos dados de avaliação genética e ferramentas do Software Geneplus nos acasalamentos de matrizes canchim. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 6., 2010, Campo Grande, MS. Ética na pesquisa científica: [Anais da ...]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2010. 1 CD-ROM. Coordenadora: Vanessa Felipe de Souza 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 307. | | SILVA, L. O. C. da; NOBRE, P. R. C.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; GONDO, A.; MENEZES, G. R. de O. Uso dos sumários de avaliação genética nos processos de seleção e acasalamento. In: ROSA, A. do N.; MARTINS. E. N.; MENEZES, G. R. de O.; SILVA, L. O. C. da (Ed.). Melhoramento genético aplicado em gado de corte: Programa Geneplus-Embrapa. Brasília, DF: Embrapa; Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2013. Capítulo 14. p. 167-177.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 308. | | SUNIGA, P. A. P.; SANTIAGO, G. G.; MENEZES, G. R. de O.; MILANESI, M.; GONDO, A.; SILVA, M. V. G. B.; GARCIA, J. F.; SILVA, L. O. C. da; NOBRE, P. R. C.; SIQUEIRA, F.; EGITO, A. A. do. Acurácia em diferentes modelos para predição de valores genéticos em bovinos da raça Senepol. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 14., 2018, Campo Grande - MS. [Resumos dos trabalhos]. Brasília, DF, Embrapa, 2018 115 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 258). P. 94-95| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 309. | | MOURA, W. C.; SIQUEIRA, F.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de; SILVA, L. O. C. da; FEIJÓ, G. L. D.; CARVALHO, T. D.; MACHADO, C. O. F. Análise das freqüências alélicas e genotípicas do polimorfismo LEP/Kpn2I em bovinos de corte. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008 p. 229| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 310. | | SILVA, A. M. da; SILVA, L. O. C. da; OKAMURA, V.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; GONDO, A.; FAVERO, R.; MENEZES, G. R. de O.; GOMES, R. da C. Associações entre eficiência alimentar e comportamento ingestivo de touros da raça Nelore confinados em baias coletivas equipadas com cochos eletrônicos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 27.; FÓRUM DE ENTIDADES DE ZOOTECNISTAS, 45.; FÓRUM DE COORDENADORES DE CURSOS DE ZOOTENCIA, 12.; SEMINÁRIO NACIONAL DE ENSINO EM ZOOTECNIA, 7.; REUNIÃO NACIONAL DE SINDICATO DE ZOOTECNIA, 5.; FÓRUM DE EMPRESAS JUNIORES DE ZOOTECNIA, 5.; FÓRUM DE ESTUDANTES DE ZOOTECNIA, 13, 2017, Santos. Santos: Associação Brasileira de Zootecnia, 2017.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 311. | | SILVA, A. M. da; SILVA, L. O. C. da; OKAMURA, V.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; GONDO, A.; FAVERO, R.; MENEZES, G. R. de O.; GOMES, R. da C. Associações entre eficiência alimentar e comportamento ingestivo de touros da raça Nelore confinados em baias coletivas equipadas com cochos eletrônicos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 27.; FÓRUM DE ENTIDADES DE ZOOTECNISTAS, 45.; FÓRUM DE COORDENADORES DE CURSOS DE ZOOTENCIA, 12.; SEMINÁRIO NACIONAL DE ENSINO EM ZOOTECNIA, 7.; REUNIÃO NACIONAL DE SINDICATO DE ZOOTECNIA, 5.; FÓRUM DE EMPRESAS JUNIORES DE ZOOTECNIA, 5.; FÓRUM DE ESTUDANTES DE ZOOTECNIA, 13, 2017, Santos. Santos: Associação Brasileira de Zootecnia, 2017.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 312. | | NOBRE, P. R. C.; PORTO, J. C. A.; MATTOS, S. de; ROSA, A. do N.; SILVA, L. O. C. da; MARIANTE, A. da S.; FIGUEIREDO, G. R. de; ABREU, G. P. de. Avaliacao do desempenho de cruzamentos entre racas taurinas e zebuinas em diferentes regioes do Brasil central. Campo Grande : EMBRAPA-CNPGC, 1984. 6p. (EMBRAPA-CNPGC. Pesquisa em Andamento, 26). CNPGC.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 313. | | FAVERO, R.; GOMES, R. C.; MENEZES, G. R. O.; TORRES JUNIOR, R. A. A.; MIZUBUTI, I. Y.; BONIN, M. N.; MONTAGNER, D. B.; SILVA, L. O. C. da; MARTINS, M. W. F.; ALTRAK, G.; NIEHUES, M. B.; KAZAMA, R. Avaliação de bovinos de diferentes grupos genéticos quanto ao desempenho ponderal do nascimento ao sobreano. In: BEEFEXPO. 2015., Foz do Iguaçu, Brasil. Anais... [s.l.:s.n]., p.4-9, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 314. | | SOUZA, J. C. de; SILVA, L. O. C. da; FREITAS, J. A. de; MALHADO, C. H. M.; GONDO, A.; P. B. FERRAZ FILHO; R. L. WEABER; LAMBERSON, W. R. Genotype x environmental interaction to Nellore cattle raised in two Brazilian regions. In: ADSA-PSA-AMPA-ASAS JOINT ANNUAL MEETING, 2008, Indianapolis. Abstracts. Indianapolis: ADSA: ASAS, 2008. Disponível em:< http://adsa.asas.org/meetings/2008/abstracts/TOC.htm > Acesso em: 26 mar. 2009. Publicado em: Journal of Animal Science, Champaign, v. 86, E-Supplement 2; Journal of Dairy Science, Champaign, v. 91, E-Supplement 1. p. 205 1 CD-ROM. Breeding and gnetics II. O202. Trabalho W40.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 315. | | TIZIOTO, P. C.; SANTIAGO, A. C.; SIQUEIRA, F.; ROSA, A. do N.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; VENERONI, G. B.; IBELLI, A. M. G.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. Estimativa de coeficiente de endogamia (Fis) de uma amostra de touros representativa das principais linhagens da raça Nelore. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA SÃO CARLOS, 2009, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste: Embrapa Instrumentação Agropecuária, 2009. p. 35. (Embrapa Pecuária Sudeste. Documento 90).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 316. | | OKAMURA, V.; MENEZES, G. R. de O.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SANTANA JUNIOR, M. L.; PEREIRA, R. J.; SILVA, L. O. C. da; GONDO, A.; NOBRE, P. R. C. Estrutura da população Senepol no Brasil. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 10., 2014, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2014. p. 90-91. 2 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 208). Comissão organizadora: Grácia Maria Soares Rosinha, Alexandra Rocha de Oliveir, Rodrigo Carvalho Alva.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 317. | | VALENTE, B. D.; SILVA, M. A.; SILVA, L. O. C. da; BERGMANN, J. A. G.; PEREIRA, J. C. C.; FRIDRICH, A. B.; FERREIRA, I. C.; G. S. S. CORRÊA. Estruturas de covariância de peso em função da idade de animais Nelore das regiões Sudeste e Centro-Oeste do Brasil. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, Belo Horizonte, v. 60, n. 2, p. 389-400, abr. 2008. Título em inglês: Covariance structure of body weight in function of age for Nellore animals from Southeast and Center West of Brazil.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 318. | | SOUZA, J. C. de; STORCK, D. E.; SILVA, L. O. C. da; SERENO, J. R. B.; FERAZ FILHO, P. B.; GONDO, A.; MALHADO, C. H. M.; FREITAS, J. A. de; PEROTTO, D. Estimativa de pesos de animais da raça nelore, usando curvas de crescimento. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 43., 2006, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBZ; UFPB, 2006. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 319. | | SOUZA, J. C.; GADINI, C. H.; SILVA, L. O. C. da; RAMOS, A. de A.; EUCLIDES FILHO, K.; ALENCAR, M. M. de; FERRAZ FILHO, P. B.; VLECK L. D. Van. Estimates of genetic parameters and an evaluation of genotype x environment interaction for weaning weight in Nellore cattle. Archivos Latinoamericanos de Produccion Animal, v. 11, n. 2, p. 94-100, ago. 2003.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 320. | | SOUZA, J. C.; SILVA, L. O. C. da; RAMOS, K. E. F. A. de; ALENCAR, M. M. de; GADINI, C. H.; VELAZSCO GUTIERREZ, R. R.; VLECK, L. D. van. Estudio de las correlaciones genéticas y de ambiente para el peso al destete en bovinos de la raza Nelore en el Brazil. Arch. Latinoam. Prod. Anim., v.5, Supl.1, p.485-487, 1997.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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