|
|
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
Data corrente: |
09/02/2015 |
Data da última atualização: |
22/01/2020 |
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
Autoria: |
SILVA, J. M. da; GIACHETTO, P. F.; SILVA, L. O. C. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. |
Afiliação: |
JOAQUIM MANOEL DA SILVA, Unemat, IB/Unicamp, CNPTIA; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; LUIZ OTAVIO CAMPOS DA SILVA, CNPGC; SAMUEL REZENDE PAIVA, SRI; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, CENARGEN; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA. |
Título: |
Detection of copy number variations in nelore beef cattle with high-density SNP genotyping data. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2014. |
Páginas: |
Não paginado. |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
P553. |
Conteúdo: |
Genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping platforms have been widely used in studies in diverse areas, ranging from population genetics to applied genetic improvement and breeding. SNP genotyping data generated with these platforms can also be used for detecting and genotyping copy number variations (CNVs). CNVs are defined as a variable copy numbers of DNA segments ranging from 50bp to several megabases (Mbp), in comparison with a reference genome. Several studies have identified an abundance of CNVs in human and domestic animal genomes, where it has been shown that they are involved in phenotypic variability. This initial study reports a high resolution map of CNVs in Nelore beef cattle generated with the PennCNV software. CNVs were called in a dataset from 1709 animals of the Nelore breed genotyped with Illumina BovineHD BeadChip for a total of 735,242 markers. After non-restrictive quality filtering, a total of 246,290 CNVs were identified on autosomal chromosomes, representing 219,997 and 26,293 gain and loss events, respectively. CNVs lengths ranged from 20.02 Kb to 8.37 Mb with an average of 352 Kb and a median of 204.5 Kb. The number of SNPs in each detected CNV varied from 20 to 2,116 with an average of 104 and a median of 63. A total of 138,066 CNVs were present in regions with annotated genes. |
Palavras-Chave: |
Polimorfismo de nucleotídeo único. |
Thesagro: |
Gado de corte. |
Thesaurus Nal: |
Beef cattle; Nellore; Single nucleotide polymorphism. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/117503/1/Joaquim-Manoel-Silva-PAG-XXII-2014-ARC-CNVR.pdf
|
Marc: |
LEADER 02168nam a2200253 a 4500 001 2008077 005 2020-01-22 008 2014 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aSILVA, J. M. da 245 $aDetection of copy number variations in nelore beef cattle with high-density SNP genotyping data.$h[electronic resource] 260 $aIn: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.]$c2014 300 $aNão paginado. 500 $aP553. 520 $aGenome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping platforms have been widely used in studies in diverse areas, ranging from population genetics to applied genetic improvement and breeding. SNP genotyping data generated with these platforms can also be used for detecting and genotyping copy number variations (CNVs). CNVs are defined as a variable copy numbers of DNA segments ranging from 50bp to several megabases (Mbp), in comparison with a reference genome. Several studies have identified an abundance of CNVs in human and domestic animal genomes, where it has been shown that they are involved in phenotypic variability. This initial study reports a high resolution map of CNVs in Nelore beef cattle generated with the PennCNV software. CNVs were called in a dataset from 1709 animals of the Nelore breed genotyped with Illumina BovineHD BeadChip for a total of 735,242 markers. After non-restrictive quality filtering, a total of 246,290 CNVs were identified on autosomal chromosomes, representing 219,997 and 26,293 gain and loss events, respectively. CNVs lengths ranged from 20.02 Kb to 8.37 Mb with an average of 352 Kb and a median of 204.5 Kb. The number of SNPs in each detected CNV varied from 20 to 2,116 with an average of 104 and a median of 63. A total of 138,066 CNVs were present in regions with annotated genes. 650 $aBeef cattle 650 $aNellore 650 $aSingle nucleotide polymorphism 650 $aGado de corte 653 $aPolimorfismo de nucleotídeo único 700 1 $aGIACHETTO, P. F. 700 1 $aSILVA, L. O. C. da 700 1 $aPAIVA, S. R. 700 1 $aCAETANO, A. R. 700 1 $aYAMAGISHI, M. E. B.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
Registros recuperados : 399 | |
301. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | FERRAZ FILHO, P. B.; SOUZA, J. C. de; SILVA, L. O. C. da; ALENCAR, M. M. de; EUCLIDES FILHO, K.; FERNANDES, L. Tendencias genetica dos pesos aos 205 dias de idade de bovinos da raca Nelore no Mato Grosso do Sul. In: ENCONTRO DE BIOLOGOS DO CRB-1 (SP,MT,MS), 10., 1999, Sao Carlos. Programa e resumos. [S.l.]: CRB-1/UFS Car., [1999?]. p. 60. CNPGC. Resumo 01.10.Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
302. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | MENEZES, G. R. de O.; MARTIN NIETO, L.; ROSA, A. do N.; NOBRE, P. R. C.; SILVA, L. O. C. da; GONDO, A. Tendências genéticas para características de carcaça ao sobreano na raça Nelore: Programa Geneplus-Embrapa. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 10., 2013, Uberaba. Anais... Viçosa: Sociedade Brasileira de Melhoramento Animal, 2013. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/consulta/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
303. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | SILVEIRA, M. V. da; SOUZA, J. C. de; SILVA, L. O. C. da; MARTIN NIETO, L.; ROSA, A. do N.; FERRAZ FILHO, P. B. Tendências genéticas e fenotípicas para peso aos 420 dias de fêmeas da raça Nelore criadas no Mato Grosso do Sul1. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 10., 2013, Uberaba. Anais... Viçosa: Sociedade Brasileira de Melhoramento Animal, 2013. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/consulta/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
304. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | MUDADO, M. A.; TIZIOTO, P. C.; SIQUEIRA, F.; ROSA, A. do N.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SILVA, L. O. C. da; REGITANO, L. C. de A. Testing a software for paternity exclusion using a high density snp chip and nelore cattle samples. Archivos Latinoamericano de Producion Animal, v. 19, p. 220, 2011. (supl. 1). Memorias de la XXII Reunión ALPA, Montevideo, Uruguay. 24?26 octubre de 2011. ALPATipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso restrito ao objeto digital](/consulta/web/img/lock.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
305. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | MUDADU, M. de A.; TIZIOTO, F.; SIQUEIRA, A. N.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SILVA, L. O. C. da; REGITANO, L. C. de A. Testing a software for paternity exclusion using a high density snp chip and nelore cattle samples. Archivos Latinoamericano de Producion Animal, v. 19, (supl. 1), p. 220, 2011Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/consulta/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
306. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | MARÇAL, M. F.; SOUZA, J. C. de; FERRAZ FILHO, P. B.; SILVA, L. O. C. da; SILVA, R. M. da; SILVA, R. M. de; FREITAS, J. A. de. Uso de análise multivariada sobre as DEPs estimadas para características ponderais e reprodutivas em bovinos da raça Tabapuã. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendedorismo e progresso científicos na zootecnia brasileira de vanguarda: anais. Salvador: SBZ, 2010. 3 p. 1 CD-ROM. R4580.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
308. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | FAVERO, R.; GOMES, R. C.; MENEZES, G. R. O.; TORRES JUNIOR, R. A. A.; MIZUBUTI, I. Y.; BONIN, M. N.; MONTAGNER, D. B.; SILVA, L. O. C. da; MARTINS, M. W. F.; ALTRAK, G.; NIEHUES, M. B.; KAZAMA, R. Avaliação de bovinos de diferentes grupos genéticos quanto ao desempenho ponderal do nascimento ao sobreano. In: BEEFEXPO. 2015., Foz do Iguaçu, Brasil. Anais... [s.l.:s.n]., p.4-9, 2015.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/consulta/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
309. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | NOBRE, P. R. C.; PORTO, J. C. A.; MATTOS, S. de; ROSA, A. do N.; SILVA, L. O. C. da; MARIANTE, A. da S.; FIGUEIREDO, G. R. de; ABREU, G. P. de. Avaliacao do desempenho de cruzamentos entre racas taurinas e zebuinas em diferentes regioes do Brasil central. Campo Grande : EMBRAPA-CNPGC, 1984. 6p. (EMBRAPA-CNPGC. Pesquisa em Andamento, 26). CNPGC.Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/consulta/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
310. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | MOURA, W. C.; SIQUEIRA, F.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de; SILVA, L. O. C. da; FEIJÓ, G. L. D.; CARVALHO, T. D.; MACHADO, C. O. F. Análise das freqüências alélicas e genotípicas do polimorfismo LEP/Kpn2I em bovinos de corte. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008 p. 229Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/consulta/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
311. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | SILVA, A. M. da; SILVA, L. O. C. da; OKAMURA, V.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; GONDO, A.; FAVERO, R.; MENEZES, G. R. de O.; GOMES, R. da C. Associações entre eficiência alimentar e comportamento ingestivo de touros da raça Nelore confinados em baias coletivas equipadas com cochos eletrônicos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 27.; FÓRUM DE ENTIDADES DE ZOOTECNISTAS, 45.; FÓRUM DE COORDENADORES DE CURSOS DE ZOOTENCIA, 12.; SEMINÁRIO NACIONAL DE ENSINO EM ZOOTECNIA, 7.; REUNIÃO NACIONAL DE SINDICATO DE ZOOTECNIA, 5.; FÓRUM DE EMPRESAS JUNIORES DE ZOOTECNIA, 5.; FÓRUM DE ESTUDANTES DE ZOOTECNIA, 13, 2017, Santos. Santos: Associação Brasileira de Zootecnia, 2017.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/consulta/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
312. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | SILVA, A. M. da; SILVA, L. O. C. da; OKAMURA, V.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; GONDO, A.; FAVERO, R.; MENEZES, G. R. de O.; GOMES, R. da C. Associações entre eficiência alimentar e comportamento ingestivo de touros da raça Nelore confinados em baias coletivas equipadas com cochos eletrônicos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 27.; FÓRUM DE ENTIDADES DE ZOOTECNISTAS, 45.; FÓRUM DE COORDENADORES DE CURSOS DE ZOOTENCIA, 12.; SEMINÁRIO NACIONAL DE ENSINO EM ZOOTECNIA, 7.; REUNIÃO NACIONAL DE SINDICATO DE ZOOTECNIA, 5.; FÓRUM DE EMPRESAS JUNIORES DE ZOOTECNIA, 5.; FÓRUM DE ESTUDANTES DE ZOOTECNIA, 13, 2017, Santos. Santos: Associação Brasileira de Zootecnia, 2017.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/consulta/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
313. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | SUNIGA, P. A. P.; SANTIAGO, G. G.; MENEZES, G. R. de O.; MILANESI, M.; GONDO, A.; SILVA, M. V. G. B.; GARCIA, J. F.; SILVA, L. O. C. da; NOBRE, P. R. C.; SIQUEIRA, F.; EGITO, A. A. do. Acurácia em diferentes modelos para predição de valores genéticos em bovinos da raça Senepol. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 14., 2018, Campo Grande - MS. [Resumos dos trabalhos]. Brasília, DF, Embrapa, 2018 115 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 258). P. 94-95Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/consulta/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
314. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | TIZIOTO, R.; MEIRELLES, S. L.; TULLIO, R. R.; ROSA, A. do N.; MEDEIROS, S. R. de; SIQUEIRA, F.; FEIJO, G. L. D.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; REGITANO, L. C. de A. Candidate genes for procution traits in Nelore beef cattle. Genetics and Molecular Research, v. 11, n. 4, p. 4138-4144, 2012.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/consulta/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
315. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | REGITANO, L. C. de A.; TIZIOTO, P. C.; SIQUEIRA, F.; ROSA, A. do N.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JÚNIOR, R. A. de A.; CERVINI, M.; VERONI, G. B.; IBELLI, A. M. G.; ALENCAR, M. M. de. Caracterização molecular de uma amostra de touros da raça Nelore. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Águas de Lindóia. Anais... Águas de Lindóia: SBG, 2009. p. 205Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
316. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | MÉO, S. C.; TIZIOTO, P. C.; SIQUEIRA, F.; ROSA, A. do N.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; VENERONI, G. B.; IBELLI, A. M. G.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. Caracterização do haplótipo mitocondrial de uma amostra de touros da raça Nelore, representativa das principais linhagens comercializadas no Brasil. In: WORKSHOP DA REDE GENÔMICA ANIMAL, 1., 2009, Fortaleza. Anais... Fortaleza, Rede Genômica Animal, 2009.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/consulta/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
317. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | TIZIOTO, P. C.; NICIURA, S. C. M.; IBELLI, A. M. G.; VENERONI, G. B.; SIQUEIRA, F.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. Caracterização do haplótipo mitocondrial de uma amostra de touros da raça nelore, representativa das principais linhagens comercializadas no Brasil. Ciência Animal, v. 21, n. 1, p. 25-29, 2011.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/consulta/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
318. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | TIZIOTO, P. C.; NICIURA, S. C. M.; IBELLI, A. M. G.; VENERONI, G. B.; SIQUEIRA, F.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.; ROSA, A. do N. Caracterização do haplótipo mitocondrial de uma amostra de touros da raça nelore, representativa das principais linhagens comercializadas no Brasil. Ciência Animal, v. 21, n. 1, p. 25-29, 2011 25-29Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso restrito ao objeto digital](/consulta/web/img/lock.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
319. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | EUCLIDES FILHO, K.; FIGUEIREDO, G. R. de; FEIJÓ, G. L. D.; ABRÃO, M. P. C.; HONÓRIO, J. C. J.; TROVO, J. B.; RAZOOK, A.; BACHA, C. B.; SILVA, C. M. O. da; FIGUEIREDO, L.; SILVA, L. O. C. da. Características de carcaça de animais puros e mestiços. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 40., 2003, Santa Maria, RS. Otimizando a produção animal: anais. Santa Maria, RS: SBZ, 2003. 5 p. 1 CD-ROM. Melhoramento animal. CNPGC.Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
320. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | SANTOS, R. F. dos; FRIAS, D. F. R.; SILVA, T. R.; SILVA, G. C. P. da; ASSIS, N. A. de; SILVA, L. O. C. da; SOUZA, V. F. de; MATHIAS, L. A. Caracterização soroepidemiológica e molecular da infecção por Leptospira spp. em gado de corte de elite do estado de Mato Grosso do Sul: resultados preliminares In: CONSENSOS BRASILEIROS EM LEPTOSPIROSE ANIMAL, 2015., Niterói. Pôster...Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/consulta/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
Registros recuperados : 399 | |
|
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|