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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
19/08/2021 |
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Data da última atualização: |
29/12/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
VERARDO, L. L.; SILVA, F. F. e; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; REIS, D. R. de L.; OTTO, P. I.; REGITANO, L. C. de A.; SILVA, L. O. C. da; EGITO, A. A. do; ALBUQUERQUE, M. do S. M.; ZANELLA, R.; SILVA, M. V. G. B. |
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Afiliação: |
LUCAS LIMA VERARDO, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri; FABYANO FONSECA E SILVA, Universidade Federal de Viçosa; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; JOAO CLAUDIO DO CARMO PANETTO, CNPGL; DANIELE RIBEIRO DE LIMA REIS FAZA, CNPGL; PAMELA ITAJARA OTTO, Universidade Federal de Santa Maria; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; LUIZ OTAVIO CAMPOS DA SILVA, CNPGC; ANDREA ALVES DO EGITO, CNPGC; MARIA DO SOCORRO MAUÉS ALBUQUERQUE; RICARDO ZANELLA, Universidade de Passo Fundo; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL. |
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Título: |
Genome-wide analyses reveal the genetic architecture and candidate genes of indicine, taurine, synthetic crossbreds, and locally adapted cattle in Brazil. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Genetics, v. 12, article 702822, 2021. |
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DOI: |
https://doi.org/10.3389/fgene.2021.702822 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Cattle population history, breeding systems, and geographic subdivision may be reflected in runs of homozygosity (ROH), effective population size (Ne), and linkage disequilibrium (LD) patterns. Thus, the assessment of this information has become essential to the implementation of genomic selection on purebred and crossbred cattle breeding programs. In this way, we assessed the genotype of 19 cattle breeds raised in Brazil belonging to taurine, indicine, synthetic crossbreds, and Iberian-derived locally adapted ancestries to evaluate the overall LD decay patterns, Ne, ROH, and breed composition. We were able to obtain a general overview of the genomic architecture of cattle breeds currently raised in Brazil and other tropical countries. We found that, among the evaluated breeds, different marker densities should be used to improve the genomic prediction accuracy and power of genome-wide association studies. Breeds showing low Ne values indicate a recent inbreeding, also reflected by the occurrence of longer ROH, which demand special attention in the matting schemes to avoid extensive inbreeding. Candidate genes (e.g., ABCA7, PENK, SPP1, IFNAR1, IFNAR2, SPEF2, PRLR, LRRTM1, and LRRTM4) located in the identified ROH islands were evaluated, highlighting biological processes involved with milk production, behavior, rusticity, and fertility. Furthermore, we were successful in obtaining the breed composition regarding the taurine and indicine composition using single-nucleotide polymorphism (SNP) data. MenosCattle population history, breeding systems, and geographic subdivision may be reflected in runs of homozygosity (ROH), effective population size (Ne), and linkage disequilibrium (LD) patterns. Thus, the assessment of this information has become essential to the implementation of genomic selection on purebred and crossbred cattle breeding programs. In this way, we assessed the genotype of 19 cattle breeds raised in Brazil belonging to taurine, indicine, synthetic crossbreds, and Iberian-derived locally adapted ancestries to evaluate the overall LD decay patterns, Ne, ROH, and breed composition. We were able to obtain a general overview of the genomic architecture of cattle breeds currently raised in Brazil and other tropical countries. We found that, among the evaluated breeds, different marker densities should be used to improve the genomic prediction accuracy and power of genome-wide association studies. Breeds showing low Ne values indicate a recent inbreeding, also reflected by the occurrence of longer ROH, which demand special attention in the matting schemes to avoid extensive inbreeding. Candidate genes (e.g., ABCA7, PENK, SPP1, IFNAR1, IFNAR2, SPEF2, PRLR, LRRTM1, and LRRTM4) located in the identified ROH islands were evaluated, highlighting biological processes involved with milk production, behavior, rusticity, and fertility. Furthermore, we were successful in obtaining the breed composition regarding the taurine and indicine composition using single-nucleotide pol... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Rusticidade; Rusticity. |
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Thesagro: |
Bovino; Comportamento Animal; Fertilidade Animal; Gado; Genética Animal; Genoma; Produção Leiteira. |
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Thesaurus Nal: |
Animal behavior; Animal fertility; Homozygosity; Linkage disequilibrium; Milk production; Population size. |
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Categoria do assunto: |
K Ciência Florestal e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/225349/1/Genome-wide.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 650 | |
| 641. |  | SOUZA, P. I. M.; MOREIRA. C. T.; FARIAS NETO, A. L.; ABUD, S.; SILVA, N. S.; MONTEIRO, P. M. F. O.; NEIVA, L. C. S.; ALMEIDA, A. M. R.; DIAS, W. P.; SOARES, R. M.; NUNES, M. R.; VIEIRA, N. E.; SILVA, L. O.; TOLEDO, R. M. C. P.; NUNES JÚNIOR, J.; ARANTES, N. E.; BROGIN, R.; MELLO FILHO, O. L.; ARIAS, C. A. A.; TOLEDO, J. F. F.; CARNEIRO, G. E. de S.; KASTER, M.; PÍPOLO, A. E.; MOREIRA, J. U. V.; OLIVEIRA, M. F.; CARRÃO-PANIZZI, M. C.; ABDELNOOR, R. V.; ALMEIDA, L. A. Cultivar de soja BRS Gisele RR: extensão de indicação para os estados da Bahia, do Tocantins e Maranhão. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 30., 2008, Rio Verde. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2008. p. 238-239. (Embrapa Soja. Documentos, 304).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 642. | | FARIAS NETO, A. L. de; SOUZA, P. I. de M. de; MOREIRA, C. T.; SILVA, S. A. da; SILVA, N. dos S. e.; MONTEIRO, P. M.; NEIVA, L. C. da S.; NUNES, M. R.; VIEIRA, N. E.; SILVA, L. O. e.; TOLEDO, R. M.; NUNES JÚNIOR, J.; ALMEIDA, L. A. de; ARANTES, N. E.; BROGIN, R. L.; MELLO FILHO, O. L. de; ARIAS, C. A. A.; TOLEDO, J. F. F. de; CARNEIRO, G. E.; KASTER, M.; PIPOLO, A. E.; MOREIRA, J. U. V.; OLIVEIRA, M. F. de; CARRÃO-PANIZZI, M.; ABDELNOOR, R.; ALMEIDA, A. M. R.; SOARES, R. M.; DIAS, W. P. Cultivar de soja BRSGO 7860 RR: indicação para os estados de Goiás, Minas Gerais, São Paulo e Distrito Federal. In: FALEIRO, F. G.; FARIAS NETO, A. L. de; RIBEIRO JUNIOR, W. Q. (Ed.). Livros e cultivares apresentados no II Encontro da Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas - Regional-DF. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2009. p. 59-60.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 643. | | SOUZA, P. I. M.; MOREIRA. C. T.; FARIAS NETO, A. L.; ABUD, S.; SILVA, N. E.; MONTEIRO, P. M. F. O.; NEIVA, L. C. S.; ALMEIDA, A. M. R.; DIAS, W. P.; SOARES, R. M.; NUNES, M. R.; VIEIRA, N. E.; SILVA, L. O.; TOLEDO, R. M. C. P.; NUNES JÚNIOR, J.; ALMEIDA, L. A.; ARANTES, N. E.; BROGIN, R.; MELLO FILHO, O. L.; ARIAS, C. A. A.; TOLEDO, J. F. F.; CARNEIRO, G. E. de S.; KASTER, M.; PÍPOLO, A. E.; MOREIRA, J. U. V.; OLIVEIRA, M. F.; CARRÃO-PANIZZI, M. C.; ABDELNOOR, R. V. Cultivar de soja BRSGO 7960: indicação para os estados de Goiás e Minas Gerais. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 30., 2008, Rio Verde. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2008. p. 202-203. (Embrapa Soja. Documentos, 304).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Soja. |
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| 644. | | SOUZA, P. I. de M. de; MOREIRA, C. T.; FARIAS NETO, A. L. de; SILVA, S. A. da; MONTEIRO, P. M.; NEIVA, L. C. da S.; NUNES, M. R.; VIEIRA, N. E.; SILVA, L. O. e.; TOLEDO, R. M.; NUNES JÚNIOR, J.; ARANTES, N. E.; BROGIN, R.; MELLO FILHO, O. L.; ARIAS, C. A.; TOLEDO, J. F. F. de; CARNEIRO, G. E.; KASTER, M.; ALMEIDA, A. M. R.; SOARES, R. M.; DIAS, W. P.; PIPOLO, A. E.; MOREIRA, J. U. V.; OLIVEIRA, M. F. de; CARRÃO-PANIZZI, M.; ABDELNOOR, R. V.; ALMEIDA, L. A. Cultivar de soja BRSGO 7960: indicação para os estados de Goiás e Minas Gerais. In: FALEIRO, F. G.; FARIAS NETO, A. L. de; RIBEIRO JUNIOR, W. Q. (Ed.). Livros e cultivares apresentados no II Encontro da Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas - Regional-DF. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2009. p. 61-62.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 645. | | MOREIRA, C. T.; FARIAS NETO, A. L.; SOUZA, P. I. M.; ABUD, S.; MONTEIRO, P. M. F. O.; NEIVA, L. C. S.; NUNES, M. R.; SILVA, L. O.; PIMENTA, C. B.; TOLEDO, R. M. C. P.; VIEIRA, N. E.; NUNES JÚNIOR, J.; SEII, A. H.; ARANTES, N. E.; BROGIN, R. L.; MELLO FILHO, O. L.; CARNEIRO, G. E. de S.; DIAS, W. P.; MEYER, M. C.; ANDRADE, P. J. M.; SOARES, R. M.; KASTER, M.; ALMEIDA, A. M. R.; ARIAS, C. A. A.; TOLEDO, J. F. F. de; PIPOLO, A. E.; ABDELNOOR, R. V.; CARRÃO-PANIZZI, M. C.; MOREIRA, J. U. V.; OLIVEIRA, M. F.; TEIXEIRA, R. N. Cultivar de soja BRSGO 8660: indicação para os estados de Minas Gerais, Mato Grosso, Goiás e para o Distrito Federal. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 5.; MERCOSOJA 2009, Goiânia. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p. 232, trab. 424. Editado por Adilson de Oliveira Júnior, Odilon Ferreira Saraiva, Clara Beatriz Hoffmann Campo, César de Castro.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 646. | | MOREIRA, C. T.; FARIAS NETO, A. L. de; SOUZA, P. I. de M. de; SILVA, S. A. da; MONTEIRO, P. M. F. O.; NEIVA, L. C. S.; NUNES, M. R.; SILVA, L. O.; PIMENTA, C. B.; TOLEDO, R. M. C. P.; VIEIRA, N. E.; NUNES JÚNIOR, J.; SEII, A. H.; ARANTES, N. E.; BROGIN, R. L.; MELLO FILHO, O. L.; CARNEIRO, G. E. de S.; DIAS, W. P.; MEYER, M. C.; ANDRADE, P. J. M.; SOARES, R. M.; KASTER, M.; ALMEIDA, A. M. R.; ARIAS, C. A. A.; TOLEDO, J. F. F.; PÍPOLO, A. E.; ABDELNOOR, R. V.; CARRÃO-PANIZZI, M. C.; MOREIRA, J. U. V.; OLIVEIRA, M. F.; TEIXEIRA, R. N. Cultivar de soja BRSGO 8660: indicação para os estados de Minas Gerais, Mato Grosso, Goiás e para o Distrito Federal. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 5.; MERCOSOJA 2009, 2009, Goiânia. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. 258 p. p. 232. Resumo 424.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 647. | | MOREIRA. C. T.; FARIAS NETO, A. L.; SOUZA, P. I. M.; ABUD, S.; SILVA, N. S.; MONTEIRO, P. M. F. O.; NEIVA, L. C. S.; ALMEIDA, A. M. R.; DIAS, W. P.; SOARES, R. M.; NUNES, M. R.; VIEIRA, N. E.; SILVA, L. O.; TOLEDO, R. M. C. P.; NUNES JÚNIOR, J.; ARANTES, N. E.; BROGIN, R.; MELLO FILHO, O. L.; ARIAS, C. A. A.; TOLEDO, J. F. F.; CARNEIRO, G. E. de S.; KASTER, M.; PÍPOLO, A. E.; MOREIRA, J. U. V.; OLIVEIRA, M. F.; CARRÃO-PANIZZI, M. C.; ABDELNOOR, R. V.; ALMEIDA, L. A. Cultivar de soja BRS Juliana RR: extensão de indicação para os estados da Bahia, do Tocantins e do Maranhão. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 30., 2008, Rio Verde. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2008. p. 240-241. (Embrapa Soja. Documentos, 304).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Soja. |
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| 648. | | MOREIRA, C. T.; FARIAS NETO, A. L. de; SOUZA, P. I. de M. de; SILVA, S. A. da; MONTEIRO, P. M. F. O.; NEIVA, L. C. S.; NUNES, M. R.; SILVA, L. O.; PIMENTA, C. B.; TOLEDO, R. M. C. P.; VIEIRA, N. E.; NUNES JÚNIOR, J.; SEII, A. H.; ARANTES, N. E.; BROGIN, R. L.; MELLO FILHO, O. L. de; CARNEIRO, G. E. de S.; DIAS, W. P.; MEYER, M. C.; ANDRADE, P. J. M.; SOARES, R. M.; KASTER, M.; ALMEIDA, A. M. R.; ARIAS, C. A. A.; TOLEDO, J. F. F. de; PIPOLO, A. E.; ABDELNOOR, R. V.; PANIZZI, M. C. C.; MOREIRA, J. U. V.; OLIVEIRA, M. F. de; TEIXEIRA, R. N. Cultivar de soja BRSGO 8660: indicação para os estados de Minas Gerais, Mato Grosso, Goiás e para o Distrito Federal. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 5.; MERCOSOJA 2009, Goiânia. Anais... Londrina: Embrapa Soja, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 649. | | SOUZA, P. I. de M. de; TOLEDO, J. F. F. de; MOREIRA, C. T.; FARIAS NETO, A.; SILVA, S. A. da; ARANTES, N. E.; MELLO FILHO, O. L. de; CARNEIRO, G. E. de S.; MONTEIRO, P. M. F. O.; ARIAS, C. A. A.; KASTER, M.; OLIVEIRA, M. F. de; PIPOLO, A. E.; BROGIN, R. L.; NUNES JÚNIOR, J.; ABDELNOOR, R. V.; ALMEIDA, A. M. R.; MEYER, M. C.; ANDRADE, P. J. M.; CARRAO-PANIZZI, M. C.; DIAS, W. P.; MOREIRA, J. U. V.; NEIVA, L. C. da S.; NUNES, M. R.; SEII, A. H.; SILVA, L. O. e; SILVA, N. S.; TEIXEIRA, R. N.; SOARES, R. M.; TOLEDO, R. M. C. P.; VIEIRA, N. E. Variedade de soja resistente à ferrugem (BRSGRO 7560): posicionamento da nova tecnologia. In: REUNIÃO DO CONSÓRCIO ANTIFERRUGEM SAFRA 2008-09, 2009, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p. 89-91. (Embrapa Soja. Documentos, 315). Editado por Claudia Vieira Godoy, Claudine Dinali Santos Seixas, Rafael Moreira Soares.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 650. | | GIBBS, R. A.; TAYLOR, J. F.; VAN TASSELL, C. P.; BARENDSE, W.; EVERSOLE, K. A.; GILL, C. A.; GREEN, R. D.; HAMERNIK, D. L.; KAPPES, S. M.; LIEN, S.; MATUKUMALLI, L. K.; MCEWAN, J. C.; NAZARETH, L. V.; SCHNABEL, R. D.; WEINSTOCK, G. M.; WHEELER, D. A.; AJMONE-MARSAN, P.; BOETTCHER, P. J.; CAETANO, A. R.; GARCIA, J. F.; HANOTTE, O.; MARIANI, P.; SKOW, L. C.; SONSTEGARD, T. S.; WILLIAMS, J. L.; DIALLO, B.; HAILEMARIAM, L.; MARTINEZ, M. L.; MORRIS, C. A.; SILVA, L. O. C. da; SPELMAN, R. J.; MULATU, W.; ZHAO, K.; ABBEY, C. A.; AGABA, M.; ARAUJO, F. R.; BUNCH, R. J.; BURTON, J.; GORNI, C.; OLIVIER, H.; HARRISON, B. E.; LUFF, B.; MACHADO, M. A.; MWAKAYA, J.; PLASTOW, G.; SIM, W.; SMITH, T.; THOMAZ, M. B.; VALENTINI, A.; WILLIAMS, P.; WOMACK, J.; WOOLLIAMS, J. A.; LIU, Y.; QIN, X.; WORLEY, K. C.; GAO, C.; JIANG, H.; MOORE, S. S.; REN, Y.; SONG, X.-Z.; BUSTAMANTE, C. D.; HERNANDEZ, R. D.; MUZNY, D. M.; PATIL, S.; SAN LUCAS, A.; FU, Q.; KENT, M. P.; VEGA, R.; MATUKUMALLI, A.; MCWILLIAM, S.; SCLEP, G.; BRYC, K.; CHOI, J.; GAO, H.; GREFENSTETTE, J. J.; MURDOCH, B.; STELLA, A.; VILLA-ANGULO, R.; WRIGHT, M.; AERTS, J.; JANN, O.; NEGRINI, R.; GODDARD, M. E.; HAYES, B. J.; BRADLEY, D. G.; SILVA, M. V. G. B.; LAU, L. P. L.; LIU, G. E.; LYNN, D. J.; PANZITTA, F.; DODDS, K. G. Genome-wide survey of SNP variation uncovers the genetic structure of cattle breeds. Science, v. 324, n. 5926, p. 528-532, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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