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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
08/01/2014 |
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Data da última atualização: |
08/01/2014 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
YUYAMA, P. M.; POT, D.; DEREEPER, A.; POINTET, S.; SILVA, J. B. G. D. da; SERA, G. H.; SERA, T.; CHARMETANT, P.; DOMINGUES, D. S.; LEROY, T.; PEREIRA, L. F. P. |
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Afiliação: |
PRISCILA MARY YUYAMA, CAPES; DAVID POT, CIRAD; ALEXIS DEREEPER, IRD; STÉPHANIE POINTET, CIRAD; JOÃO BATISTA GONÇALVES DIAS DA SILVA, COCARI; GUSTAVO HIROSHI SERA, IAPAR; TUMORU SERA, IAPAR; PIERRE CHARMETANT, CIRAD; DOUGLAS SILVA DOMINGUES, IAPAR; THIERRY LEROY, CIRAD; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, SAPC. |
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Título: |
Identificação de polimorfismos em genótipos de Coffea arabica de uma coleção da Etiópia. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 8., 2013, Salvador. Sustentabilidade e inclusão Social. Brasília, DF: Embrapa Café, 2013. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Os marcadores moleculares são ferramentas importantes para acelerar os programas de melhoramento. Para o cafeeiro, uma espécie perene, o uso de marcadores é particularmente desejável devido ao tempo e recursos gastos para o lançamento de uma nova cultivar. Duas espécies do gênero Coffea são responsáveis por quase toda a produção de café: Coffea arabica e C. canephora. Contudo, para C. arabica, o número de marcadores polimórficos é relativamente baixo comparado a C. canephora e outras culturas, uma vez que a espécie apresenta baixa diversidade genética. Muitos estudos com marcadores genéticos foram feitos para analisar a diversidade da C. arabica, mas os resultados não foram eficientes para a discriminação genotípica detalhada e mapeamento genético. O Instituto Agronômico do Paraná (IAPAR) possui uma coleção de 132 acessos de C. arabica originários da Etiópia, que apresentam variabilidade fenotípica com potencial para serem utilizados para exploração da diversidade. Neste sentido, este estudo buscou analisar a diversidade nucleotídica pela identificação de polimorfismos, SNPs e INDELs, de uma população do centro de origem de C. arabica, associado com o sequenciamento de nova geração. O RNA-seq de dois tecidos, frutos e folhas, de quatro genótipos de C. arabica de uma população da Etiópia, C. arabica cv. Mundo Novo e de um dos seus ancestrais de C. arabica ? C. eugenioides, foram sequenciados pela metodologia Illumina HiSeq2000. Os reads obtidos foram processados e posteriormente as sequências foram mapeadas em uma referência de C. canephora para identificação dos polimorfismos. Foram feitas duas estratégias: i) na primeira estratégia, foi utilizado uma ferramenta chamada SNiPloid com critérios de cobertura para o polimorfismo identificado e ii) uma segunda estratégia que considera os polimorfismos encontrados diretamente dos arquivos de detecção dos polimorfismos. Os resultados identificaram um número grande de polimorfismos. Na primeira estratégia, foram encontrados pelo menos 5.500 SNPs potenciais para a genotipagem e na segunda, 103.791 SNPs potenciais. Para essa última, ainda é necessário estabelecer critérios e filtros para escolher os polimorfismos que serão inicialmente genotipados. Os dados também mostraram a importância de utilizar um grupo mais diverso de genótipos associado com o sequenciamento de nova geração para detecção de SNPs. Este trabalho será importante para direcionar futuros trabalhos na caracterização da diversidade genética em C. arabica, além de estudos de mapeamento genético por associação. MenosOs marcadores moleculares são ferramentas importantes para acelerar os programas de melhoramento. Para o cafeeiro, uma espécie perene, o uso de marcadores é particularmente desejável devido ao tempo e recursos gastos para o lançamento de uma nova cultivar. Duas espécies do gênero Coffea são responsáveis por quase toda a produção de café: Coffea arabica e C. canephora. Contudo, para C. arabica, o número de marcadores polimórficos é relativamente baixo comparado a C. canephora e outras culturas, uma vez que a espécie apresenta baixa diversidade genética. Muitos estudos com marcadores genéticos foram feitos para analisar a diversidade da C. arabica, mas os resultados não foram eficientes para a discriminação genotípica detalhada e mapeamento genético. O Instituto Agronômico do Paraná (IAPAR) possui uma coleção de 132 acessos de C. arabica originários da Etiópia, que apresentam variabilidade fenotípica com potencial para serem utilizados para exploração da diversidade. Neste sentido, este estudo buscou analisar a diversidade nucleotídica pela identificação de polimorfismos, SNPs e INDELs, de uma população do centro de origem de C. arabica, associado com o sequenciamento de nova geração. O RNA-seq de dois tecidos, frutos e folhas, de quatro genótipos de C. arabica de uma população da Etiópia, C. arabica cv. Mundo Novo e de um dos seus ancestrais de C. arabica ? C. eugenioides, foram sequenciados pela metodologia Illumina HiSeq2000. Os reads obtidos foram processados e posteriorme... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Etiópia; SNPs. |
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Thesagro: |
Coffea arabica; Polimorfismo. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/94857/1/Identificacao-de-polimorfismos.pdf
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Marc: |
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520 $aOs marcadores moleculares são ferramentas importantes para acelerar os programas de melhoramento. Para o cafeeiro, uma espécie perene, o uso de marcadores é particularmente desejável devido ao tempo e recursos gastos para o lançamento de uma nova cultivar. Duas espécies do gênero Coffea são responsáveis por quase toda a produção de café: Coffea arabica e C. canephora. Contudo, para C. arabica, o número de marcadores polimórficos é relativamente baixo comparado a C. canephora e outras culturas, uma vez que a espécie apresenta baixa diversidade genética. Muitos estudos com marcadores genéticos foram feitos para analisar a diversidade da C. arabica, mas os resultados não foram eficientes para a discriminação genotípica detalhada e mapeamento genético. O Instituto Agronômico do Paraná (IAPAR) possui uma coleção de 132 acessos de C. arabica originários da Etiópia, que apresentam variabilidade fenotípica com potencial para serem utilizados para exploração da diversidade. Neste sentido, este estudo buscou analisar a diversidade nucleotídica pela identificação de polimorfismos, SNPs e INDELs, de uma população do centro de origem de C. arabica, associado com o sequenciamento de nova geração. O RNA-seq de dois tecidos, frutos e folhas, de quatro genótipos de C. arabica de uma população da Etiópia, C. arabica cv. Mundo Novo e de um dos seus ancestrais de C. arabica ? C. eugenioides, foram sequenciados pela metodologia Illumina HiSeq2000. Os reads obtidos foram processados e posteriormente as sequências foram mapeadas em uma referência de C. canephora para identificação dos polimorfismos. Foram feitas duas estratégias: i) na primeira estratégia, foi utilizado uma ferramenta chamada SNiPloid com critérios de cobertura para o polimorfismo identificado e ii) uma segunda estratégia que considera os polimorfismos encontrados diretamente dos arquivos de detecção dos polimorfismos. Os resultados identificaram um número grande de polimorfismos. Na primeira estratégia, foram encontrados pelo menos 5.500 SNPs potenciais para a genotipagem e na segunda, 103.791 SNPs potenciais. Para essa última, ainda é necessário estabelecer critérios e filtros para escolher os polimorfismos que serão inicialmente genotipados. Os dados também mostraram a importância de utilizar um grupo mais diverso de genótipos associado com o sequenciamento de nova geração para detecção de SNPs. Este trabalho será importante para direcionar futuros trabalhos na caracterização da diversidade genética em C. arabica, além de estudos de mapeamento genético por associação.
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
23/10/2020 |
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Data da última atualização: |
27/10/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 1 |
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Autoria: |
SASS, A. L.; BASSACO, M. V. M.; MOTTA, A. C. V.; MAEDA, S.; BARBOSA, J. Z.; BOGNOLA, I. A.; GOMES, J. B. V.; GOULARTE, G. D.; PRIOR, S. A. |
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Afiliação: |
Anne Luize Sass, UFPR; Marcos Vinícius Martins Bassaco, Faculdade de Jaguariaíva; Antonio Carlos Vargas Motta, UFPR; SHIZUO MAEDA, CNPF; Julierme Zimmer Barbosa, Instituto Federal do Sudoeste de Minas Gerais; ITAMAR ANTONIO BOGNOLA, CNPF; JOAO BOSCO VASCONCELLOS GOMES, CNPF; Gabriel Democh Goularte, UFPR; Stephen Arthur Prior, USDA-ARS. |
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Título: |
Cellulosic industrial waste to enhance Pinus taeda nutrition and growth: a study in subtropical Brazil. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Scientia Forestalis, v. 48, n. 126, e3165, 2020. 16 p. |
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DOI: |
https://doi.org/10.18671/scifor.v48n126.13 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Os objetivos deste trabalho foram avaliar a influência de um composto (70% de lodo e 30% de cinza de caldeira) no desenvolvimento de árvores de Pinus taeda em locais de baixo crescimento no Brasil subtropical que apresentavam sintomas de deficiência em ciclos anteriores, e avaliar como o composto influencia as características químicas do solo. Seis meses após o transplante das mudas, foram aplicadas manualmente cinco doses do composto (controle, 14, 25, 49 e 60 Mg ha-1). Nos três anos seguintes, amostras de solo e acículas foram coletadas para análise de nutrientes, juntamente com as medidas dendrométricas das plantas. A análise do solo indicou pequeno aumento na disponibilidade de K e diminuição do Al trocável. Grandes melhorias no crescimento foram observadas em termos de altura e diâmetro na altura do peito, e a clorose da acícula desapareceu quando o composto foi aplicado. Após três anos de aplicação do composto, o volume de tronco aumentou de 13 m3 ha-1do controle para 37 m3 ha-1 no tratamento com 49 Mg ha-1. O crescimento de P. taeda foi inversamente relacionado ao Mn e diretamente relacionado à concentração foliar de K e B. Os resultados sugerem que a aplicação de composto deve ser realizada, uma vez que aumenta o crescimento inicial de P. taeda, sendo uma maneira importante de utilizar resíduos da indústria de polpa celulósica e contribuir para um manejo mais sustentável de solos de baixa fertilidade. |
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Palavras-Chave: |
Acumulação de manganês; Adubação orgânica; Equilíbrio nutricional; Manganese accumulation; Nutritional balance; Organic fertilization; Reforestation production; Sandy soil. |
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Thesagro: |
Pinus Taeda; Reflorestamento; Resíduo Industrial; Solo Arenoso. |
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Categoria do assunto: |
K Ciência Florestal e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/216977/1/Maeda-2020-Anne-Pinus-residue-2318-1222-scifor-48-126-e3165-2.pdf
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Marc: |
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520 $aOs objetivos deste trabalho foram avaliar a influência de um composto (70% de lodo e 30% de cinza de caldeira) no desenvolvimento de árvores de Pinus taeda em locais de baixo crescimento no Brasil subtropical que apresentavam sintomas de deficiência em ciclos anteriores, e avaliar como o composto influencia as características químicas do solo. Seis meses após o transplante das mudas, foram aplicadas manualmente cinco doses do composto (controle, 14, 25, 49 e 60 Mg ha-1). Nos três anos seguintes, amostras de solo e acículas foram coletadas para análise de nutrientes, juntamente com as medidas dendrométricas das plantas. A análise do solo indicou pequeno aumento na disponibilidade de K e diminuição do Al trocável. Grandes melhorias no crescimento foram observadas em termos de altura e diâmetro na altura do peito, e a clorose da acícula desapareceu quando o composto foi aplicado. Após três anos de aplicação do composto, o volume de tronco aumentou de 13 m3 ha-1do controle para 37 m3 ha-1 no tratamento com 49 Mg ha-1. O crescimento de P. taeda foi inversamente relacionado ao Mn e diretamente relacionado à concentração foliar de K e B. Os resultados sugerem que a aplicação de composto deve ser realizada, uma vez que aumenta o crescimento inicial de P. taeda, sendo uma maneira importante de utilizar resíduos da indústria de polpa celulósica e contribuir para um manejo mais sustentável de solos de baixa fertilidade.
650 $aPinus Taeda
650 $aReflorestamento
650 $aResíduo Industrial
650 $aSolo Arenoso
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653 $aAdubação orgânica
653 $aEquilíbrio nutricional
653 $aManganese accumulation
653 $aNutritional balance
653 $aOrganic fertilization
653 $aReforestation production
653 $aSandy soil
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700 1 $aPRIOR, S. A.
773 $tScientia Forestalis$gv. 48, n. 126, e3165, 2020. 16 p.
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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