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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Meio-Norte. |
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Data corrente: |
09/12/2019 |
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Data da última atualização: |
09/12/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GOMES, S. O.; SOUZA, I. G. B.; SANTOS, M. F.; SILVA, G. R.; ALBRECHT, M.; MCKINLEY, A. S.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. |
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Afiliação: |
SULIMARY O. GOMES; ISIS G. B. SOUZA; MICHELLI F. SANTOS; GEICE R. SILVA; MARC ALBRECHT; ALAN S. MCKINLEY; PAUL BENTZEN; FABIO MENDONCA DINIZ, CNPC. |
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Título: |
Discovery of novel NGS-mined microsatellite markers and an exploratory analysis of genetic differentiation between two Western Atlantic populations of Cardisoma guanhumi Latreille, 1825 (Decapoda: Brachyura: Gecarcinidae). |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Crustacean Biology, v. 32, n. 2, p. 1-5, 2019. |
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DOI: |
doi:10.1093/jcbiol/ruy115 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: The blue land crab Cardisoma guanhumiLatreille, 1825 is a highly valued food resource widespread in tropical and subtropical regions of the west Atlantic region. Current overharvesting, however, has played a significant role in stock decline. We describe the development of 12 new microsatellite markers, by next-generation sequencing, for evaluating genetic diversity and population structure across the geographical range of the species. A glimpse into the genetic variation in the Caribbean is also provided. The highly informative nature of these markers was also given by the mean estimate values for allelic richness (AR), gene diversity, and polymorphic information content (PIC); 3.8, 0.593, 0.518 in Florida and 2.9, 0.450, 0.385 in Puerto Rico. A preliminary genetic diversity analysis revealed high population differentiation between both locations (FST = 0.310 and DEST = 0.526). PCoA and Bayesian clustering provisionally detected two genetically distinct groups based on the two predefined populations from the Caribbean |
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Palavras-Chave: |
Blue land crab; Caranguejo azul; Cardisoma guanhumi; Conservation; Diversidade genética; Molecular markers; NGS technology. |
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Thesagro: |
Biodiversidade; Caranguejo; Marcador Molecular. |
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Thesaurus Nal: |
Crabs; Florida; Genetic markers; Molecular genetics; Population dynamics; Population genetics; Population structure; Puerto Rico. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
LEADER 02398naa a2200433 a 4500
001 2116375
005 2019-12-09
008 2019 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $adoi:10.1093/jcbiol/ruy115$2DOI
100 1 $aGOMES, S. O.
245 $aDiscovery of novel NGS-mined microsatellite markers and an exploratory analysis of genetic differentiation between two Western Atlantic populations of Cardisoma guanhumi Latreille, 1825 (Decapoda$bBrachyura: Gecarcinidae).$h[electronic resource]
260 $c2019
520 $aAbstract: The blue land crab Cardisoma guanhumiLatreille, 1825 is a highly valued food resource widespread in tropical and subtropical regions of the west Atlantic region. Current overharvesting, however, has played a significant role in stock decline. We describe the development of 12 new microsatellite markers, by next-generation sequencing, for evaluating genetic diversity and population structure across the geographical range of the species. A glimpse into the genetic variation in the Caribbean is also provided. The highly informative nature of these markers was also given by the mean estimate values for allelic richness (AR), gene diversity, and polymorphic information content (PIC); 3.8, 0.593, 0.518 in Florida and 2.9, 0.450, 0.385 in Puerto Rico. A preliminary genetic diversity analysis revealed high population differentiation between both locations (FST = 0.310 and DEST = 0.526). PCoA and Bayesian clustering provisionally detected two genetically distinct groups based on the two predefined populations from the Caribbean
650 $aCrabs
650 $aFlorida
650 $aGenetic markers
650 $aMolecular genetics
650 $aPopulation dynamics
650 $aPopulation genetics
650 $aPopulation structure
650 $aPuerto Rico
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653 $aNGS technology
700 1 $aSOUZA, I. G. B.
700 1 $aSANTOS, M. F.
700 1 $aSILVA, G. R.
700 1 $aALBRECHT, M.
700 1 $aMCKINLEY, A. S.
700 1 $aBENTZEN, P.
700 1 $aDINIZ, F. M.
773 $tJournal of Crustacean Biology$gv. 32, n. 2, p. 1-5, 2019.
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Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
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Biblioteca |
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Registro |
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Status |
URL |
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| Registros recuperados : 96 | |
| 41. |  | SILVA, G. R. da; PEREIRA, F. de M.; SOUZA, B. de A.; LOPES, M. T. do R.; CAMPELO, J. E. G.; DINIZ, F. M. Aspectos bioecológicos e genético-comportamentais envolvidos na conservação da abelha Jandaíra, Melipona subnitida Ducke (Apidae, Meliponini), e o uso de ferramentas moleculares nos estudos de diversidade. Arquivos do Instituto Biológico, São Paulo, v. 81, n. 3, p. 299-308, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 42. | | MOURA, V. G. de; SILVA, G. R. da; SOUZA, B. de A.; NUNES, L. A.; BRITTO, F. B.; PEREIRA, F. de M. Assimetria flutuante como bioindicadora de estresse ambiental em Melipona subnitida Ducke. In: JORNADA CIENTIFICA DA EMBRAPA MEIO-NORTE, 6., 2020,Teresina, PI. Anais... Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2021. p. 24 (Embrapa Meio-Norte. Documentos, 284).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 43. | | NEGREIROS, A. B.; SILVA, G. R. da; PEREIRA, F. de M.; SOUZA, B. de A.; LOPES, M. T. do R.; DINIZ, F. M. Evidence for gradients of Melipona rufiventris (Hymenoptera: Apidae) genetic diversity within the Brazilian Semiarid. Entomology and Applied Science Letters, v. 9, n. 4, p. 1-8, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 44. | | MOURA, V. G. de; NEGREIROS, A. B.; SOUZA, I. G. de B.; SILVA, G. R. da; PEREIRA, F. de M.; DINIZ, F. M. Estudo preliminar de transferabilidade de marcadores microssatélites desenvolvidos para abelhas Melipona em Frieseomelitta varia (Lepeletier). In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA MEIO-NORTE, 3., 2017, Teresina, PI. Anais da III Jornada Científica da Embrapa Meio-Norte. Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2017. p. 57.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 45. | | SILVA, R. M. de L.; UCHÔA, F. P.; FIGUEIREDO, M. C.; SILVA, G. R. da; RUDNICK, V. A. de S.; VIEIRA JUNIOR, J. R. Extratos de crotalaria e mucuna no controle de Meloidogyne incognita in vitro. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO À PESQUISA DA EMBRAPA RONDÔNIA, 10.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA RONDÔNIA, 5., 2019, Porto Velho, RO. Anais... Porto Velho, RO: Embrapa Rondônia, 2019. p. 55.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 46. | | SOUZA, I. G. de B.; SILVA, G. R. da; NEGREIROS, A. B.; PEREIRA, F. de M.; SOUZA, B. de A.; DINIZ, F. M. Genoma de abelhas-sem-ferrão em baixa cobertura - WGS (Whole Genome Sequencing). In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA MEIO-NORTE, 3., 2017, Teresina, PI. Anais da III Jornada Científica da Embrapa Meio-Norte. Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2017. p. 60.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 47. | | SILVA, G. R. da; SOUZA, I. G. de B.; PEREIRA, F. de M.; SOUZA, B. de A.; LOPES, M. T. do R.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Genome-wide discovery and characterization of microsatellite markers from Melipona fasciculata (Hymenoptera: Apidae), cross-amplifi cation and a snapshot assessment of the genetic diversity in two stingless bee populations. European Journal of Entomology, v. 115, p. 614-619, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 48. | | SILVA, G. R. da; BASSINELLO, P. Z.; CARVALHO, R. N.; UTUMI, M. M.; CASTRO, A. P. de; BORBA, T. C. de O. Busca de um sítio de fenotipagem de gessados em arroz de terras altas e a relação do defeito com a qualidade de grãos. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 15., 2021, Santo Antônio de Goiás. Resumos... Brasília, DF: Embrapa; Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2021. p. 17. Evento on-line.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 49. | | SILVA, G. R. da; BASSINELLO, P. Z.; CARVALHO, R. N.; UTUMI, M. M.; CASTRO, A. P. de; BORBA, T. C. de O. Busca de um sítio de fenotipagem de gessados em arroz de terras altas e a relação do defeito com a qualidade de grãos. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 15., 2021, Santo Antônio de Goiás. Resumos... Brasília, DF: Embrapa; Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2021. p. 17. Evento on-line.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 51. | | SILVA, T. M. e; COSTA, R. S. C. da; SILVA, L. C. da; MENONCIN, I. A.; SILVA, G. R. da; FIGUEIREDO, M. C. Produtividade do milho após o cultivo com plantas de cobertura em Porto Velho, RO. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO À PESQUISA DA EMBRAPA RONDÔNIA, 10.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA RONDÔNIA, 5., 2019, Porto Velho, RO. Anais... Porto Velho, RO: Embrapa Rondônia, 2019. p. 49.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 52. | | SILVA, G. R. da; CARNEVALLI, R. A.; MELLO, A. C. T. de; DEMICHELI, M.; MATIERO, S. C.; CUSTODIO, J. da S. Produtividade de milho para silagem em sistemas integrados de produção de leite In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 2.,2013, Sinop. Anais... Sinop, MT: Embrapa Agrossilvipastoril, 2013. 1 CD.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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| 53. | | NANDI, G.; SILVA, G. R. da; NOMURA, J. V.; ABREU, F. F. M. de; PIOTTO, K. D. B.; PIOTTO, F. A.; RAGASSI, C. F. O programa de melhoramento genético da batata na Esalq/USP. Revista Batata Show, v. 22, n. 64, p. 58-60, nov. 2022.| Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 54. | | FIGUEIREDO, M. C.; SILVA, G. R. da; UCHOA, F. P.; SILVA, R. M. de L.; RUDNICK, V. A. de S.; VIEIRA JUNIOR, J. R. Resistência dos clones Robusta Amazônico a nematoide-das-galhas. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO À PESQUISA DA EMBRAPA RONDÔNIA, 10.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA RONDÔNIA, 5., 2019, Porto Velho, RO. Anais... Porto Velho, RO: Embrapa Rondônia, 2019. p. 38.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 55. | | AMORIM, M. R.; LIMA, T. C. A.; SILVA, G. R.; ALMEIDA, G. M.; VIEIRA NETO, J. M.; LIMA, P. S. da C.; BRITTO, F. B.; DINIZ, F. M. Comparação de protocolos para extração não letal de DNA em abelhas do gênero Melipona. In: SIMPÓSIO DE PRODUÇÃO CIENTÍFICA, 7.; SEMINÁRIO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 4.; SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 5.; SEMINÁRIO DE EXTENSÃO, 1., 2007, Teresina. Produção científica na realidade comtemporânea: anais. Teresina: UESPI-PROP, 2007. 8 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 56. | | SILVA, T. M. da; UCHOA, F. P.; FIGUEIREDO, M. C.; SILVA, G. R. da; RUDNICK, V. A. de S.; VIEIRA JUNIOR, J. R. Determinação de concentração para rizobactérias in vitro no controle de Meloidogyne incognita para aplicação in vivo. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO À PESQUISA DA EMBRAPA RONDÔNIA, 10.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA RONDÔNIA, 5., 2019, Porto Velho, RO. Anais... Porto Velho, RO: Embrapa Rondônia, 2019. p. 39.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 58. | | SILVA, A. M. M. B.; SILVA, G. R. da; VELOSO, C. A. C.; BRASIL, E. C.; MULLER, C. H.; OLIVEIRA, R. P. de. Efeito da aplicação de doses N-K e calcário em mudas de aceroleira em casa de vegetação. In: ENCONTRO DO PROGRAMA DE APERFEIÇOAMENTO EM PESQUISA DA FCAP, 1., 1996, Belém, PA. Resumos. Belém, PA: FCAP, 1996. p. 21.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 59. | | GONÇALVES, A. A.; GARCIA, A. R.; ARRUDA, R. P. de; BARIONI JUNIOR, W.; LOURENÇO JUNIOR, J. de B.; KAHWAGE, P. R.; SILVA, G. R. da. Efeito do consumo de óleo de palma nas características morfofuncionais espermáticas de búfalos (Bubalus bubalis). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BUIATRIA, 10.; SEMANA DO MÉDICO VETERINÁRIO DO PARÁ, 37.; SIMPÓSIO PARAENSE DE MEDICINA VETERINÁRIA, 5., 2013, Belém. Anais... Belém: Associação Brasileira de Buiatria, 2013 1 CD-ROM| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 60. | | ANJOS, E. F. M. dos; MARIOBO, S. A. R.; RUDNICK, V. A. de S.; SILVA, G. R. da; FIGUEIREDO, M. C.; VIEIRA JUNIOR, J. R. Efeito da incorporação de Copaifera sp. e Vismia guianensis ao substrato no controle do nematoide-das-galhas do cafeeiro. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO À PESQUISA DA EMBRAPA RONDÔNIA, 10.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA RONDÔNIA, 5., 2019, Porto Velho, RO. Anais... Porto Velho, RO: Embrapa Rondônia, 2019. p. 37.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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