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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
28/01/2013 |
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Data da última atualização: |
23/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
NAGAI, L. A. E.; SILVA, F. R.; CINTRA, L. C.; GIACHETTO, P. F.; ZERLOTINI NETO, A. |
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Afiliação: |
LUÍS AUGUSTO EIJY NAGAI, Estagiário do CNPTIA; FELIPE RODRIGUES DA SILVA, CNPTIA; LEANDRO CARRIJO CINTRA, CNPTIA; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA. |
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Título: |
Using Galaxy to facilitate RNA-Seq analysis. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. |
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Páginas: |
Não paginado. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
X-MEETING 2012. |
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Conteúdo: |
In this experiment, two RNA-Seq datasets were analyzed in order to evaluate both, the Galaxy platform and the RNA-Seq analysis suite. We were able to observe that such combination of softwares is really effective on allowing two biologists researchers to perform the whole transcriptome analysis through a intuitive web interface. |
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Palavras-Chave: |
Bioinformática; Plataforma Galaxy; Sequenciamento de RNA. |
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Thesaurus Nal: |
Bioinformatics; Computer software; Sequence analysis. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/75401/1/galaxy.pdf
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Marc: |
LEADER 01163nam a2200253 a 4500
001 1946554
005 2020-01-23
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100 1 $aNAGAI, L. A. E.
245 $aUsing Galaxy to facilitate RNA-Seq analysis.$h[electronic resource]
260 $aIn: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C$c2012
300 $aNão paginado.
500 $aX-MEETING 2012.
520 $aIn this experiment, two RNA-Seq datasets were analyzed in order to evaluate both, the Galaxy platform and the RNA-Seq analysis suite. We were able to observe that such combination of softwares is really effective on allowing two biologists researchers to perform the whole transcriptome analysis through a intuitive web interface.
650 $aBioinformatics
650 $aComputer software
650 $aSequence analysis
653 $aBioinformática
653 $aPlataforma Galaxy
653 $aSequenciamento de RNA
700 1 $aSILVA, F. R.
700 1 $aCINTRA, L. C.
700 1 $aGIACHETTO, P. F.
700 1 $aZERLOTINI NETO, A.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 277 | |
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| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 63. | | SOUZA, E. C.; SALMAN, A. K. D.; CRUZ, P. G. da; CARVALHO, G. A.; SILVA, F. R. F. Ingestive behavior of Girolando heifers in integrated crop, livestock (ICL), and forestry (ICLF) systems. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, v. 73, n. 3, p. 703-710, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 64. | | PROSDOCIMI, F.; BITTENCOURT, D. M. de C.; SILVA, F. R. D.; MOTTA, P. C.; RECH FILHO, E. L. Molecular, behavioral and anatomical sophistication in spider webs: insights from spinning gland RNA-seq experiments in primitive and modern spiders. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2010. p. 67.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 65. | | LOPES, J. C.; FREITAS, A. R.; BELTRAME, R. A.; VENANCIO, L. P.; MANHONE, P. R.; SILVA, F. R. N. e. Germinação e vigor de sementes de pau d' alho sob estresse salino. Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 35, n. 82, p. 169-177, abr./jun. 2015. Nota científica.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 66. | | TEIXEIRA, L. A. J.; SILVA, F. R. da; MARQUES, E.; VIEIRA, H. B.; MORAES, W.; RODRIGUEZ, M. A. D. Fusarium wilt of banana and nutritional plant status. Fitosanidad, Havana, v. 21, n. especial, 2017. Edição dos resumos do VIII Seminario Científico Internacional de Sanidad Vegetal, Havana, 2017. Por la transición de la agricultura cubana hacia la sostenibilidad. Ref. Foc-12. p. 29-30.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 67. | | COTTA, M. G.; VERAS, H. C. T.; BARROS, L. M. G.; ABDELNOOR, R. V.; ALMEIDA, J. D.; SILVA, F. R. Finding novel tissue-specific genes using the new publically available soybean est database. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Águas de Lindóia. Charles Darwin: a origem das espécies: o livro que transformou a humanidade. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2009. p. 86.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 68. | | SANTOS, D. B. M.; ALMEIDA, J. D.; BARROS, L. M. G.; CARNEIRO, M.; SILVA, F. R. da. Identificação de ESTs tecido-específicas no banco de dados do genoma funcional de Coffea spp. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007. Biotecnologia aplicada à cadeia agroindustrial do café.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 69. | | SANTOS, D. B. M.; SILVA, F. R.; ALMEIDA, J. D.; BARROS, L. M. G.; SOBRAL, L. T. CARNEIRO, M. Identificação de ESTs tecido-específicas no banco de dados do genoma funcional de Coffea spp. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 11., 2006, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2006 p. 84.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 70. | | FERREIRA, B. C.; CASTRO, M. E. B.; REZENDE, S. H. M. S.; SILVA, F. R.; SOUZA, M. L. Identificação do gene pif, requerido na infecção oral, em clones de Anticarsia gemmatalis nucleopolyhedrovírus. In: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 10., 2007, Brasília, DF. Inovar para preservar a vida. Resumos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 250).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 71. | | LAMEGO, F. P.; CARATTI, F. C.; ROMA-BURGOS, N.; KLUMB, E. K.; DOMINGUES, R.; SILVA, F. R. da. Sequenciamento genômico de capim-annoni. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 32., 2022, Rio Verde. Plantas daninhas e suas interações nos sistemas de produção agrícola: anais. Rio Verde: SBCPD, 2022. p. 65. Editores técnicos: Guilherme Braga Pereira Braz, Naiara Guerra.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 72. | | LAMEGO, F. P.; CARATTI, F. C.; ROMA-BURGOS, N.; KLUMB, E. K.; DOMINGUES, R.; SILVA, F. R. da. Sequenciamento genômico de capim-annoni. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 32., 2022, Rio Verde. Plantas daninhas e suas interações nos sistemas de produção agrícola: anais. Rio Verde: SBCPD, 2022. p. 65. Editores técnicos: Guilherme Braga Pereira Braz, Naiara Guerra.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 73. | | CASTRO, G. M. de; BOITEUX, L. S.; FONSECA, M. E. N.; LOBO, F.; RECH, E.; SILVA, F. R. da. Serendipitomics: a new virus found on an RNA-seq library. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. [Abstracts]. San Diego: [s.n.], 2014. Não paginado. P018.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 76. | | MORO, C. F.; GASPAR, M.; SILVA, F. R. da; PATTATHIL, S.; HAHN, M. G.; SALGADO, I.; BRAGA, M. R. S-nitrosoglutathione promotes cell wall remodelling, alters the transcriptional profile and induces root hair formation in the hairless root hair defective 6 (rhd6) mutant of Arabidopsis thaliana. New Phytologist, v. 213, n. 4, p. 1771-1786, Mar. 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 79. | | XAVIER, D. S.; PRABHU, A. S.; SILVA-LOBO, V. L.; FILIPPI, M. C. C.; SILVA, F. R.; RODRIGUES, F. Á. Eficiência de casca de arroz carbonizada no controle da queima-da-bainha em arroz. Tropical Plant Pathology, v. 33, p. S 113, ago. 2008. Suplemento. ref. CAL-049. Edição dos Resumos do XLI Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Belo Horizonte, MG, ago. 2008.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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