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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
25/03/2008 |
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Data da última atualização: |
05/07/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
LESCOT, M.; PIFFANELLI, P.; CIAMPI, A. Y.; RUIZ, M.; BLANC, G.; LEEBENS-MACK, J.; SILVA, F. R. da; SANTOS, C. M. R.; D'HONT, A.; GARSMEUR, O.; VILARINHOS, A. D.; KANAMORI, H.; MATSUMOTO, T.; RONNING, C. M.; CHEUNG, F.; HAAS, B. J.; ALTHOFF, R.; ARBOGAST, T.; HIRE, E.; PAPPAS JUNIOR, G.; SASAKI, T.; SOUZA JUNIOR, M. T.; MILLER, R. N. G.; GLASZMANN, J. C.; TOWN, C. D. |
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Afiliação: |
Magali Lescot, CIRAD/IBSM; Pietro Piffanelli, CIRAD/PADANO; Ana Y. Ciampi, CENARGEN; Manuel Ruiz, CIRAD; Guillaume Blanc, IGS; Jim Leebens-Mack, University of Georgia; Felipe R. da Silva, CENARGEN; Candice M. R. Santos, CENARGEN; Angélique D'Hont, CIRAD; Olivier Garsmeur, CIRAD; Alberto Duarte Vilarinhos, CNPMF; Hiroyuki Kanamori, RGP; Takashi Matsumoto, RGP; Catherine M. Ronning, J. Craig Venter Institute; Foo Cheung, J. Craig Venter Institute; Brian J. Haas, J. Craig Venter Institute; Ryan Althoff, J. Craig Venter Institute; Tammy Arbogast, J. Craig Venter Institute; Erin Hine, J. Craig Venter Institute; Georgios J. Pappas Junior, UCB; Takuji Sasaki, RGP; Manoel T. Souza Junior, CENARGEN; Robert N. G. Miller, UCB; Jean-Christophe Glaszmann, CIRAD; Christopher D. Town, J. Craig Venter Institute. |
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Título: |
Insights into the Musa genome: syntenic relationships to rice and between Musa species. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, London, v. 9, 2007. |
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Descrição Física: |
il. |
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ISSN: |
1471-2164 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Musa species (Zingiberaceae, Zingiberales) including bananas and plantains are collectively the fourth most important crop in developing countries. Knowledge concerning Musa genome structure and the origin of distinct cultivars has greatly increased over the last few years. Until now, however, no large-scale analyses of Musa genomic sequence have been conducted. This study compares genomic sequence in two Musa species with orthologous regions in the rice genome.We produced 1.4 Mb of Musa sequence from 13 BAC clones, annotated and analyzed them along with 4 previously sequenced BACs. The 443 predicted genes revealed that Zingiberales genes share GC content and distribution characteristics with eudicot and Poaceae genomes. Comparison with rice revealed microsynteny regions that have persisted since the divergence of the Commelinid orders Poales and Zingiberales at least 117 Mya. The previously hypothesized large-scale duplication event in the common ancestor of major cereal lineages within the Poaceae was verified. The divergence time distributions for Musa-Zingiber (Zingiberaceae, Zingiberales) orthologs and paralogs provide strong evidence for a large-scale duplication event in the Musa lineage after its divergence from the Zingiberaceae approximately 61 Mya. Comparisons of genomic regions from M. acuminata and M. balbisiana revealed highly conserved genome structure, and indicated that these genomes diverged circa 4.6 Mya. These results point to the utility of comparative analyses between distantly-related monocot species such as rice and Musa for improving our understanding of monocot genome evolution. Sequencing the genome of M. acuminata would provide a strong foundation for comparative genomics in the monocots. In addition a genome sequence would aid genomic and genetic analyses of cultivated Musa polyploid genotypes in research aimed at localizing and cloning genes controlling important agronomic traits for breeding purposes. MenosMusa species (Zingiberaceae, Zingiberales) including bananas and plantains are collectively the fourth most important crop in developing countries. Knowledge concerning Musa genome structure and the origin of distinct cultivars has greatly increased over the last few years. Until now, however, no large-scale analyses of Musa genomic sequence have been conducted. This study compares genomic sequence in two Musa species with orthologous regions in the rice genome.We produced 1.4 Mb of Musa sequence from 13 BAC clones, annotated and analyzed them along with 4 previously sequenced BACs. The 443 predicted genes revealed that Zingiberales genes share GC content and distribution characteristics with eudicot and Poaceae genomes. Comparison with rice revealed microsynteny regions that have persisted since the divergence of the Commelinid orders Poales and Zingiberales at least 117 Mya. The previously hypothesized large-scale duplication event in the common ancestor of major cereal lineages within the Poaceae was verified. The divergence time distributions for Musa-Zingiber (Zingiberaceae, Zingiberales) orthologs and paralogs provide strong evidence for a large-scale duplication event in the Musa lineage after its divergence from the Zingiberaceae approximately 61 Mya. Comparisons of genomic regions from M. acuminata and M. balbisiana revealed highly conserved genome structure, and indicated that these genomes diverged circa 4.6 Mya. These results point to the utility of comparative a... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Species. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 184 | |
| 61. |  | FARIA, J. M.; GUSMÃO, A. R. E.; FARIA, F. M. de; BORBA, T. C. de O.; FONSECA, J. R. Características agronômicas, botânicas, e fenológicas de genótipos de arroz-vermelho. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 5., 2009, Guarapari. O melhoramento e os novos cenários da agricultura: anais. Vitória: Incaper, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 62. | | ROSA, T. M.; BORBA, T. C. O.; BRONDANI, R. P. V.; RANGEL, P. H. N.; BRONDANI, C. Caracterização molecular de populações de O. glumaepatula nativas de Tocantins e Roraima por marcadores SSR. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 5., 2011, Santo Antônio de Goiás. Resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2011. p. 25. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 270).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 64. | | FARIA, J. M.; GUSMÃO, A. R. E.; MAESHIMA, F. H. S.; FONSECA, J. R.; BORBA, T. C. de O. Caracterização morfoagronômica e fenológica de acessos de tipos especiais de arroz da Embrapa Arroz e Feijão. In: CONGRESSO DE PESQUISA, ENSINO E EXTENSÃO, 6., 2009, Goiânia. Ciência e desenvolvimento regional: anais... Goiânia: Universidade Federal de Goiás, 2009. p. 5018-5022.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 66. | | BORBA, T. C. de O.; BRONDANI, C.; BRONDANI, R. P. V.; RANGEL, P. H. N.; BUENO, L. G. Caracterização molecular e agronômica de linhagens e cultivares da coleção nuclear de arroz da Embrapa. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasilia, DF. Anais...Brasilia, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. p. 149.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 67. | | FARIA, J. M.; GUSMÃO, A. R. E.; FARIA, F. M. de; FONSECA, J. R.; BORBA, T. C. de O. Características das sementes de acessos de arroz (Oryza sativa L.) do banco de germoplasma da Embrapa. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasilia, DF. Anais...Brasilia, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. p. 161.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 68. | | RAMOS, M. R. F.; MENDONÇA, J. A.; PANTALIÃO, G. F.; BORBA, T. C. de O.; BRONDANI, C. Cruzamentos em dialelo de genótipos de arroz. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 9., 2015, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2015. p. 112. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 309).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 69. | | SILVA, D. R. A.; BORBA, T. C. de O.; GARCIA, A. L. B.; PANTALIÃO, G. F.; BRONDANI, C. Análise dos dados moleculares genotipados via GBS da populaçao RIL de arroz para uma posterior análise de QTL. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 8., 2015, Goiânia. O melhoramento de plantas, o futuro da agricultura e a soberania nacional: anais. Goiânia: UFG: SBMP, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 70. | | BRONDANI, R. P. V.; RANGEL, P. H. N.; ZUCCHI, M. I.; MAGALHÃES, M. R.; BORBA, T. C. O.; BRONDANI, C. Análise da variabilidade genética de populações brasileiras de Oryza glumaepatula utilizando microssatélites. In: CONGRESSO DA CADEIA PRODUTIVA DE ARROZ, 1.; REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DE ARROZ - RENAPA, 7., 2002, Florianópolis. Anais... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2002. p. 232-235. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 134).| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 71. | | BORBA, T. C. de O.; ZUCCHI, M. I.; BRONDANI, R. V.; RANGEL, P. H. N.; MAGALHÃES, M. R.; BRONDANI, C. Análise da variabilidade genética de variedades tradicionais de arroz (Oryza sativa L.) através de marcadores moleculares microssatélites. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 2., 2003, Porto Seguro. Melhoramento e qualidade de vida: [anais]. Porto Seguro: SBMP, 2003. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 72. | | PANTALIÃO, G. F.; BORBA, T. C. de O.; GUIMARÃES, C. M.; NARCISO, M. G.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C. Análise de associação genômica ampla (GWAS) da produtividade em arroz sob déficit hídrico. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 8., 2015, Goiânia. O melhoramento de plantas, o futuro da agricultura e a soberania nacional: anais. Goiânia: UFG: SBMP, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 73. | | TEIXEIRA, C. de J. V.; PEREIRA, H. S.; MELO, L. C.; VIANELLO, R. P.; BORBA, T. C. de O. Análise de polimorfismo de locos microssátelites em feijoeiro comum. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 5., 2011, Santo Antônio de Goiás. Resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2011. p. 15. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 270).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 74. | | MOREIRA, A. M.; BORBA, T. C. de O.; CASTRO, A. P. de; BRESEGHELLO, F.; BASSINELLO, P. Z. Mapeamento de QTL para qualidade de grãos de uma população de arroz de terras altas. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 5., 2011, Santo Antônio de Goiás. Resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2011. p. 56. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 270).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 75. | | FONSECA, R. C.; KOAKUZU, S. N.; CARVALHO, R. N.; BORBA, T. C. de O.; CALIARI, M.; BASSINELLO, P. Z. Relação da amilose com o padrão culinário e molecular de arroz de terras altas. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 8., 2014, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2014. p. 115. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 306).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 76. | | SANTOS, T. C.; RANGEL, P. H. N.; BRONDANI, R. P. V.; BORBA, T. C. O.; BRONDANI, C. Seleção assistida por marcadores moleculares SSR na geração RC2F5 Oryza sativa BG 90-2 x Oryza glumaepatula RS-16. In: CONGRESSO DA CADEIA PRODUTIVA DE ARROZ, 1.; REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DE ARROZ - RENAPA, 7., 2002, Florianópolis. Anais... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2002. p. 198-200. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 134).| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 77. | | FARIA, J. M.; GUSMÃO, A. R. E.; FARIA, F. M. de; FONSECA, J. R.; BORBA, T. C. de O. Descrição morfoagronômica de variedades tradicionais de arroz coletadas em diferentes regiões produtoras brasileiras. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasilia, DF. Anais...Brasilia, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. p. 173.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 78. | | BORBA, T. C. O.; BRONDANI, C.; RANGEL, P. H. N.; BRONDANI, R. P. V.; SANTOS, T. C. Determinação da conservação genômica do gênero Oryza via marcadores SSR e STS. In: CONGRESSO DA CADEIA PRODUTIVA DE ARROZ, 1.; REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DE ARROZ - RENAPA, 7., 2002, Florianópolis. Anais... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2002. p. 262-265. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 134).| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 80. | | ABREU, A. G.; DUITAMA, J.; BORBA, T. C. O.; RODRIGUES, L. A.; COSTA, S. P. P.; MELLO, R. N. Development and molecular characterizationof a rice mapping populationfor blast resistance. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 11., 2019. Balneário Camboriú, SC. Inovação e desenvolvimento na orizicultura: anais eletrônico. Itajaí: Epagri: Sosbai, 2019. Ciência em notícia.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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