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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
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Data corrente: |
10/06/2016 |
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Data da última atualização: |
09/02/2023 |
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Autoria: |
SILVA, A. C. da. |
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Título: |
Identificação computacional e análise comparativa de genes precursores de micrornas em três espécies de palmeiras. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
2015. |
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Páginas: |
63 f. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal Rural da Amazônia, Belém, PA. |
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Conteúdo: |
MicroRNAs são pequenos RNAs que possuem 20-25 nucleotídeos de tamanho e são abundantes nos genomas, possuindo um papel funcional importante na regulação da expressão gênica. O recente sequenciamento dos genomas das espécies Elaeis guineenses, Elaeis oleifera e Phoenix dactylifera possibilitou a descoberta de genes de miRNAs que podem auxiliar na geração de ferramentas biotecnológicas para essas palmeiras. A predição in silico de precursores nos genomas de palmeiras foi realizada utilizando o pipeline do miRCat, com sequências de miRNA maduros de Arabidopsis thaliana, Oryza sativa e Zea mays disponíveis no miRBase. Um total de 338 precursores foram preditos, compreendendo 33 famílias de miRNAs com diferentes isoformas. A família do miR396 foi a mais representativa entre as palmeiras, totalizando sete isoformas do miRNA identificados em P. dactylifera. A conservação na estrutura do precursor do miR172 entre essas espécies, Arabidopsis, arroz, milho e banana também foi analisada através da ferramenta RNAfold. Essa análise mostrou que espécies mais próximas filogeneticamente apresentam maior conservação na estrutura do precursor. Os miRNAs maduros com precursores identificados nas três espécies de palmeiras foram utilizados na busca de potenciais genes-alvo através da ferramenta do psRNATarget. Os 374 possíveis alvos regulados por esses miRNAs foram anotados, principalmente, como fatores de transcrição. Uma análise de enriquecimento de função desses alvos pela ferramenta online agriGO mostrou alvos envolvidos em processos de controle do desenvolvimento vegetal, principalmente regulando o desenvolvimento de raiz. O conhecimento da função biológica desses precursores de miRNAs identificados em palmeiras pode auxiliar os programas de melhoramento genético dessas espécies. MenosMicroRNAs são pequenos RNAs que possuem 20-25 nucleotídeos de tamanho e são abundantes nos genomas, possuindo um papel funcional importante na regulação da expressão gênica. O recente sequenciamento dos genomas das espécies Elaeis guineenses, Elaeis oleifera e Phoenix dactylifera possibilitou a descoberta de genes de miRNAs que podem auxiliar na geração de ferramentas biotecnológicas para essas palmeiras. A predição in silico de precursores nos genomas de palmeiras foi realizada utilizando o pipeline do miRCat, com sequências de miRNA maduros de Arabidopsis thaliana, Oryza sativa e Zea mays disponíveis no miRBase. Um total de 338 precursores foram preditos, compreendendo 33 famílias de miRNAs com diferentes isoformas. A família do miR396 foi a mais representativa entre as palmeiras, totalizando sete isoformas do miRNA identificados em P. dactylifera. A conservação na estrutura do precursor do miR172 entre essas espécies, Arabidopsis, arroz, milho e banana também foi analisada através da ferramenta RNAfold. Essa análise mostrou que espécies mais próximas filogeneticamente apresentam maior conservação na estrutura do precursor. Os miRNAs maduros com precursores identificados nas três espécies de palmeiras foram utilizados na busca de potenciais genes-alvo através da ferramenta do psRNATarget. Os 374 possíveis alvos regulados por esses miRNAs foram anotados, principalmente, como fatores de transcrição. Uma análise de enriquecimento de função desses alvos pela ferramenta online ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Elaeis guinensis; MiRNAs; Palmeiras. |
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Thesagro: |
Elaeis Oleifera; Melhoramento genético vegetal. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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650 $aElaeis Oleifera
650 $aMelhoramento genético vegetal
653 $aElaeis guinensis
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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