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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
09/01/2023 |
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Data da última atualização: |
09/01/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, L. de F.; ALKIMIM, E. R.; BARREIRO, P. R. R. M.; LEICHTWEIS, B. G.; SILVA, A. C. A.; SILVA, R. A. da; SOUSA, T. V.; NASCIMENTO, M.; CAIXETA, E. T. |
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Afiliação: |
LETÍCIA DE FARIA SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; EMILLY RUAS ALKIMIM, UNIVERSIDADE FEDERAL TRIÂNGULO MINEIRO; PEDRO RICARDO ROSSI MARQUES BARREIRO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; BRUNO GRESPAN LEICHTWEIS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; ANA CAROLINA ANDRADE SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; RUANE ALICE DA SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; TIAGO VIEIRA SOUSA, INSTITUTO FEDERAL DO TRIÂNGULO MINEIRO; MOYSÉS NASCIMENTO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA MOURA, CNPCa. |
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Título: |
Genome-wide association study of plant architecture and diseases resistance in Coffea canephora. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Euphytica, v. 218, jun. 2022. |
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Páginas: |
13 p. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Genome wide association studies (GWAS) have been traditionally used for the identification and comprehension of loci associate with phenotypic variation and identification of markers useful in genetic breeding programs. The GWAS was used in this work to identify chromosomal regions with significant associations with the main agronomic trait of Coffea canephora. The studied population comprised 165 clones of the two varietal groups Conilon and Robusta and intervarietal hybrids from crosses between these groups. Coffee trees were genotyped using 17 885 single nucleotide polymorphisms (SNP) markers distributed throughout the genome and phenotyped with eight morpho agronomic traits. Significant SNPs were found associated with plant height, diameter of the canopy projection, vegetative vigor, rust incidence, and cercosporiosis incidence. SNP marker distribution was quite uniform, with few gaps in the centromeric regions, with 27.72% and 9.09% present in intergenic and coding regions, respectively; the latter led to 70% amino acid exchanges and 30% silent mutations. Candidate genes, in which SNP markers were inserted, were identified and their function was related to traits of plant architecture and coffee diseases resistance. SNPs with significant associations were found in all chromosomes of the species, especially in chromosomes 0, 2, 6, 9, and 11. This methodology was efficient in C. canephora populations and helped identify several SNPs in candidate genes involved in important biological processes of coffee. Therefore, these SNPs can be used as strategies to accelerate the coffee breeding program through molecular marker assisted selection. MenosGenome wide association studies (GWAS) have been traditionally used for the identification and comprehension of loci associate with phenotypic variation and identification of markers useful in genetic breeding programs. The GWAS was used in this work to identify chromosomal regions with significant associations with the main agronomic trait of Coffea canephora. The studied population comprised 165 clones of the two varietal groups Conilon and Robusta and intervarietal hybrids from crosses between these groups. Coffee trees were genotyped using 17 885 single nucleotide polymorphisms (SNP) markers distributed throughout the genome and phenotyped with eight morpho agronomic traits. Significant SNPs were found associated with plant height, diameter of the canopy projection, vegetative vigor, rust incidence, and cercosporiosis incidence. SNP marker distribution was quite uniform, with few gaps in the centromeric regions, with 27.72% and 9.09% present in intergenic and coding regions, respectively; the latter led to 70% amino acid exchanges and 30% silent mutations. Candidate genes, in which SNP markers were inserted, were identified and their function was related to traits of plant architecture and coffee diseases resistance. SNPs with significant associations were found in all chromosomes of the species, especially in chromosomes 0, 2, 6, 9, and 11. This methodology was efficient in C. canephora populations and helped identify several SNPs in candidate genes involved in importan... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Coffea Canephora. |
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Thesaurus Nal: |
Disease resistance; Phenotypic variation; Plant breeding. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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| Registros recuperados : 35 | |
| 3. |  | IKEDA, F. S.; SILVA, A. C. A. da; CANEZIN, A. C. O.; SANCHEZ, F. B.; WOIAND, H. M. G.; LUDWIG, T. D.; GHENO, E. A.; CAVALIERI, S. D. Controle de soja voluntária com doses e épocas de aplicação de atrazine em consórcio de milho e Crotalaria ochroleuca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 9., 2022, Foz do iguaçu, PR. Desafios para a produtividade sustentável no Mercosul: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2022. p. 255. resumo 233. Editores técnicos: Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite, Adeney de Freitas Bueno.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 4. | | IKEDA, F. S.; SILVA, A. C. A. da; CANEZIN, A. C. O.; SANCHEZ, F. B.; WOIAND, H. M. G.; LUDWIG, T. D.; GHENO, E. A.; CAVALIERI, S. D. Controle de soja voluntária com doses e épocas de aplicação de atrazine em consórcio de milho e Crotalaria ochroleuca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 9., 2022, Foz do iguaçu, PR. Desafios para a produtividade sustentável no Mercosul: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2022. p. 255. resumo 233. Editores técnicos: Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite, Adeney de Freitas Bueno.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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| 5. | | WOIAND, H. M. G.; SILVA, A. C. A. da; CANEZIN, A. C. O.; SANCHEZ, F. B.; LUDWIG, T. D.; GHENO, E. A.; CAVALIERI, S. D.; IKEDA, F. S. Controle de soja voluntária com doses e modalidades de aplicação de atrazine em consórcio de milho e Crotalaria ochroleuca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 9., 2022, Foz do iguaçu, PR. Desafios para a produtividade sustentável no Mercosul: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2022. p. 260. resumo 238. Editores técnicos: Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite, Adeney de Freitas Bueno.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 6. | | WOIAND, H. M. G.; SILVA, A. C. A. da; CANEZIN, A. C. O.; SANCHEZ, F. B.; LUDWIG, T. D.; GHENO, E. A.; CAVALIERI, S. D.; IKEDA, F. S. Controle de soja voluntária com doses e modalidades de aplicação de atrazine em consórcio de milho e Crotalaria ochroleuca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 9., 2022, Foz do iguaçu, PR. Desafios para a produtividade sustentável no Mercosul: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2022. p. 260. resumo 238. Editores técnicos: Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite, Adeney de Freitas Bueno.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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| 7. | | IKEDA, F. S.; WOIAND, H. M. G.; SANCHEZ, F. B.; SILVA, A. C. A. da; SGUARIO, C.; MOCELIN, G.; CAVALIERI, S. D. Controle de soja voluntária e tolerância de crotalária ocroleuca com a aplicação de atrazine em diferentes épocas e modalidades de aplicação. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 32., 2022, Rio Verde. Plantas daninhas e suas interações nos sistemas de produção agrícola: anais. Londrina: SBCPD; Rio Verde, GO: Universidade de Rio Verde, 2022. p. 236. Editores técnicos: Guilherme Braga Pereira Braz, Naiara Guerra.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 8. | | IKEDA, F. S.; WOIAND, H. M. G.; SANCHEZ, F. B.; SILVA, A. C. A. da; SGUARIO, C.; MOCELIN, G.; CAVALIERI, S. D. Controle de soja voluntária e tolerância de crotalária ocroleuca com a aplicação de atrazine em diferentes épocas e modalidades de aplicação. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 32., 2022, Rio Verde. Plantas daninhas e suas interações nos sistemas de produção agrícola: anais. Londrina: SBCPD; Rio Verde, GO: Universidade de Rio Verde, 2022. p. 236. Editores técnicos: Guilherme Braga Pereira Braz, Naiara Guerra.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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| 9. | | SANCHEZ, F. B.; IKEDA, F. S.; CAVALIERI, S. D.; WOIAND, H. M. G.; PRADO, R.; LUDWIG, T. D.; SILVA, A. C. A. da. Screening para distribuição geográfica de biótipos resistentes de buva (Conyza sumatrensis) a herbicidas. In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS, 6.; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 11., 2022. Sinop. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2022. p. 48.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 10. | | SANCHEZ, F. B.; IKEDA, F. S.; CAVALIERI, S. D.; WOIAND, H. M. G.; PRADO, R.; LUDWIG, T. D.; SILVA, A. C. A. da. Screening para distribuição geográfica de biótipos resistentes de buva (Conyza sumatrensis) a herbicidas. In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS, 6.; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 11., 2022. Sinop. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2022. p. 48.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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| 11. | | SGUARIO, C.; IKEDA, F. S.; CAVALIERI, S. D.; WOIAND, H. M. G.; MOCELIN, G.; BERGAMIN, F. A.; SANCHEZ, F. B.; LUDWIG, T. D.; SILVA, A. C. A. da. Screening para frequência de dispersão de biótipos resistentes de eleusine indica a inibidores da accase e epsps em Primavera do Leste, Mato Grosso. In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS, 6.; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 11., 2022. Sinop. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2022. p. 49.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 12. | | SGUARIO, C.; IKEDA, F. S.; CAVALIERI, S. D.; WOIAND, H. M. G.; MOCELIN, G.; BERGAMIN, F. A.; SANCHEZ, F. B.; LUDWIG, T. D.; SILVA, A. C. A. da. Screening para frequência de dispersão de biótipos resistentes de eleusine indica a inibidores da accase e epsps em Primavera do Leste, Mato Grosso. In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS, 6.; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 11., 2022. Sinop. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2022. p. 49.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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| 13. | | SILVA, A. C. A. da; IKEDA, F. S.; CAVALIERI, S. D.; GHENO, E. A.; MENEZES JUNIOR, J. A. de; SANCHEZ, F. B.; WOIAND, H. M. G. Tolerância de cultivares e linhagens de feijão-caupi ao herbicida Imazamox. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 32, 2022, Rio Verde. Anais... Rio Verde, GO: SBCPD, 2022. p. 246. resumo.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 14. | | SILVA, A. C. A. da; IKEDA, F. S.; CAVALIERI, S. D.; GHENO, E. A.; MENEZES JUNIOR, J. A. de; SANCHEZ, F. B.; WOIAND, H. M. G. Tolerância de cultivares e linhagens de feijão-caupi ao herbicida Imazamox. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 32., 2022, Rio Verde. Plantas daninhas e suas interações nos sistemas de produção agrícola: anais. Londrina: SBCPD; Rio Verde, GO: Universidade de Rio Verde, 2022. p. 246.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril; Embrapa Meio-Norte. |
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| 15. | | SILVA, L. de F.; ALKIMIM, E. R.; BARREIRO, P. R. R. M.; LEICHTWEIS, B. G.; SILVA, A. C. A.; SILVA, R. A. da; SOUSA, T. V.; NASCIMENTO, M.; CAIXETA, E. T. Genome-wide association study of plant architecture and diseases resistance in Coffea canephora. Euphytica, v. 218, jun. 2022. 13 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 16. | | TRINDADE, R. dos S.; GUIMARAES, L. J. M.; NETTO, D. A. M.; SOUZA, I. R. P. de; GUIMARAES, P. E. de O.; SILVA, A. C. A. da; GUIMARÃES, S. A.; MARIZ, B. L. Características agronômicas de indutores de haploidia adaptados ao ambiente tropical. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2017. 36 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 161).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 17. | | TRINDADE, R. dos S.; SILVA, A. C. A. da; MARIZ, B. L.; GUIMARAES, L. J. M.; SOUZA, I. R. P. de; GUIMARAES, P. E. de O.; NETTO, D. A. M. Características agronômicas de indutores de haploidia androgenéticos e gimnogenéticos adaptados ao ambiente tropical. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 8., 2015, Goiânia. O melhoramento de plantas, o futuro da agricultura e a soberania nacional: anais. Goiânia: UFG: SBMP, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 18. | | WOIAND, H. M. G.; LUDWIG, T. D.; SANCHEZ, F. B.; SILVA, A C. A. da; BERGAMIN, F. A.; IKEDA, F. S.; RAMOS JUNIOR, E. U.; ZITO, R. K.; CAVALIERI, S. D. Seletividade inicial e controle de plantas daninhas em soja não transgênica com s-metolachlor em pré-emergência e chlorimuron e associações em pós-emergência. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 9., 2022, Foz do iguaçu, PR. Desafios para a produtividade sustentável no Mercosul: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2022. Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite, Adeney de Freitas Bueno, editores técnicos. resumo 239. p. 261.| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril; Embrapa Algodão. |
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| 19. | | WOIAND, H. M. G.; LUDWIG, T. D.; SANCHEZ, F. B.; SILVA, A. C. A. da; BERGAMIN, F. A.; IKEDA, F. S.; RAMOS JUNIOR, E. U.; ZITO, R. K.; CAVALIERI, S. D. Seletividade inicial e controle de plantas daninhas em soja não transgênica com s-metolachlor em pré-emergência e chlorimuron e associações em pós-emergência. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 9., 2022, Foz do iguaçu, PR. Desafios para a produtividade sustentável no Mercosul: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2022. p. 261. resumo 239. Editores técnicos: Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite, Adeney de Freitas Bueno.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril; Embrapa Soja. |
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| 20. | | CAVALIERI, S. D.; LUDWIG, T. D.; SANCHEZ, F. B.; WOIAND, H. M. G.; SILVA, A C. A. da; BERGAMIN, F. A.; IKEDA, F. S.; RAMOS JUNIOR, E. U.; ZITO, R. K. Seletividade inicial e eficácia de programas de controle químico de plantas daninhas em soja tolerante a sulfoniluréias. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 9., 2022, Foz do iguaçu, PR. Desafios para a produtividade sustentável no Mercosul: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2022. p. 265. resumo 243. Editores técnicos: Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite, Adeney de Freitas Bueno.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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