|
|
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
Data corrente: |
10/06/2016 |
Data da última atualização: |
09/02/2023 |
Autoria: |
SILVA, A. C. da. |
Título: |
Identificação computacional e análise comparativa de genes precursores de micrornas em três espécies de palmeiras. |
Ano de publicação: |
2015 |
Fonte/Imprenta: |
2015. |
Páginas: |
63 f. |
Idioma: |
Português |
Notas: |
Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal Rural da Amazônia, Belém, PA. |
Conteúdo: |
MicroRNAs são pequenos RNAs que possuem 20-25 nucleotídeos de tamanho e são abundantes nos genomas, possuindo um papel funcional importante na regulação da expressão gênica. O recente sequenciamento dos genomas das espécies Elaeis guineenses, Elaeis oleifera e Phoenix dactylifera possibilitou a descoberta de genes de miRNAs que podem auxiliar na geração de ferramentas biotecnológicas para essas palmeiras. A predição in silico de precursores nos genomas de palmeiras foi realizada utilizando o pipeline do miRCat, com sequências de miRNA maduros de Arabidopsis thaliana, Oryza sativa e Zea mays disponíveis no miRBase. Um total de 338 precursores foram preditos, compreendendo 33 famílias de miRNAs com diferentes isoformas. A família do miR396 foi a mais representativa entre as palmeiras, totalizando sete isoformas do miRNA identificados em P. dactylifera. A conservação na estrutura do precursor do miR172 entre essas espécies, Arabidopsis, arroz, milho e banana também foi analisada através da ferramenta RNAfold. Essa análise mostrou que espécies mais próximas filogeneticamente apresentam maior conservação na estrutura do precursor. Os miRNAs maduros com precursores identificados nas três espécies de palmeiras foram utilizados na busca de potenciais genes-alvo através da ferramenta do psRNATarget. Os 374 possíveis alvos regulados por esses miRNAs foram anotados, principalmente, como fatores de transcrição. Uma análise de enriquecimento de função desses alvos pela ferramenta online agriGO mostrou alvos envolvidos em processos de controle do desenvolvimento vegetal, principalmente regulando o desenvolvimento de raiz. O conhecimento da função biológica desses precursores de miRNAs identificados em palmeiras pode auxiliar os programas de melhoramento genético dessas espécies. MenosMicroRNAs são pequenos RNAs que possuem 20-25 nucleotídeos de tamanho e são abundantes nos genomas, possuindo um papel funcional importante na regulação da expressão gênica. O recente sequenciamento dos genomas das espécies Elaeis guineenses, Elaeis oleifera e Phoenix dactylifera possibilitou a descoberta de genes de miRNAs que podem auxiliar na geração de ferramentas biotecnológicas para essas palmeiras. A predição in silico de precursores nos genomas de palmeiras foi realizada utilizando o pipeline do miRCat, com sequências de miRNA maduros de Arabidopsis thaliana, Oryza sativa e Zea mays disponíveis no miRBase. Um total de 338 precursores foram preditos, compreendendo 33 famílias de miRNAs com diferentes isoformas. A família do miR396 foi a mais representativa entre as palmeiras, totalizando sete isoformas do miRNA identificados em P. dactylifera. A conservação na estrutura do precursor do miR172 entre essas espécies, Arabidopsis, arroz, milho e banana também foi analisada através da ferramenta RNAfold. Essa análise mostrou que espécies mais próximas filogeneticamente apresentam maior conservação na estrutura do precursor. Os miRNAs maduros com precursores identificados nas três espécies de palmeiras foram utilizados na busca de potenciais genes-alvo através da ferramenta do psRNATarget. Os 374 possíveis alvos regulados por esses miRNAs foram anotados, principalmente, como fatores de transcrição. Uma análise de enriquecimento de função desses alvos pela ferramenta online ... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Elaeis guinensis; MiRNAs; Palmeiras. |
Thesagro: |
Elaeis Oleifera; Melhoramento genético vegetal. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02467nam a2200193 a 4500 001 2046784 005 2023-02-09 008 2015 bl uuuu m 00u1 u #d 100 1 $aSILVA, A. C. da 245 $aIdentificação computacional e análise comparativa de genes precursores de micrornas em três espécies de palmeiras. 260 $a2015.$c2015 300 $a63 f. 500 $aDissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal Rural da Amazônia, Belém, PA. 520 $aMicroRNAs são pequenos RNAs que possuem 20-25 nucleotídeos de tamanho e são abundantes nos genomas, possuindo um papel funcional importante na regulação da expressão gênica. O recente sequenciamento dos genomas das espécies Elaeis guineenses, Elaeis oleifera e Phoenix dactylifera possibilitou a descoberta de genes de miRNAs que podem auxiliar na geração de ferramentas biotecnológicas para essas palmeiras. A predição in silico de precursores nos genomas de palmeiras foi realizada utilizando o pipeline do miRCat, com sequências de miRNA maduros de Arabidopsis thaliana, Oryza sativa e Zea mays disponíveis no miRBase. Um total de 338 precursores foram preditos, compreendendo 33 famílias de miRNAs com diferentes isoformas. A família do miR396 foi a mais representativa entre as palmeiras, totalizando sete isoformas do miRNA identificados em P. dactylifera. A conservação na estrutura do precursor do miR172 entre essas espécies, Arabidopsis, arroz, milho e banana também foi analisada através da ferramenta RNAfold. Essa análise mostrou que espécies mais próximas filogeneticamente apresentam maior conservação na estrutura do precursor. Os miRNAs maduros com precursores identificados nas três espécies de palmeiras foram utilizados na busca de potenciais genes-alvo através da ferramenta do psRNATarget. Os 374 possíveis alvos regulados por esses miRNAs foram anotados, principalmente, como fatores de transcrição. Uma análise de enriquecimento de função desses alvos pela ferramenta online agriGO mostrou alvos envolvidos em processos de controle do desenvolvimento vegetal, principalmente regulando o desenvolvimento de raiz. O conhecimento da função biológica desses precursores de miRNAs identificados em palmeiras pode auxiliar os programas de melhoramento genético dessas espécies. 650 $aElaeis Oleifera 650 $aMelhoramento genético vegetal 653 $aElaeis guinensis 653 $aMiRNAs 653 $aPalmeiras
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Ocidental. |
Data corrente: |
30/05/2022 |
Data da última atualização: |
30/05/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
ALMEIDA, G. S. de; SILVA, L. I. P. da; MEIRA, A. S. F.; BOIJINK, C. de L.; DAIRIKI, J. K. |
Afiliação: |
GABRIELLA SOUZA DE ALMEIDA, Centro de Estudos da Biodiversidade Amazônica, INPA; LORENA IANKA PONTES DA SILVA, Universidade Nilton Lins; ADILA SAMARA FRAZÃO MEIRA, Universidade Nilton Lins; CHEILA DE LIMA BOIJINK, CPAA; JONY KOJI DAIRIKI, CPAA. |
Título: |
Trânsito gastrointestinal em juvenis de matrinxã (Brycon amazonicus). |
Ano de publicação: |
2022 |
Fonte/Imprenta: |
Trabalho apresentado no 31. Congresso Brasileiro de Zootecnia, Manaus, 2022. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
A matrinxã é um peixe muito consumido na região Norte do país, desta forma possui potencial de expansão na aquicultura, entretanto algumas informações da espécie ainda não estão totalmente esclarecidas como tempo de trânsito gastrointestinal que serve como embasamento para formulação de rações. Lotes de 10 juvenis de matrinxã foram alocados em aquários de 70 litros e alimentados em 5% da biomassa, posteriormente a cada 12 horas lotes eram submetidos a consecutivos abates para que fossem efetuadas laparoscopias que determinaram a posição da ingesta. Para o completo esvaziamento gastrointestinal foram decorridas 96 horas e grande parte do tempo o bolo alimentar ocupou o estômago, o jejum no intervalo das coletas pode ter reduzido a movimentação e retardado a digestão neste órgão, entretanto sugere-se que diferentes dietas, condições ambientais sejam testadas para estimar o tempo de trânsito gastrointestinal com maior precisão para matrinxã. |
Palavras-Chave: |
Alimentação de peixes; Trato gastrointestinal. |
Thesagro: |
Matrinxã; Nutrição Animal. |
Thesaurus NAL: |
Brycon amazonicus. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1143551/1/Resumo-zootec-2022-TGI-Lorena-Silva-220530-101034.pdf
|
Marc: |
LEADER 01663nam a2200217 a 4500 001 2143551 005 2022-05-30 008 2022 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aALMEIDA, G. S. de 245 $aTrânsito gastrointestinal em juvenis de matrinxã (Brycon amazonicus).$h[electronic resource] 260 $aTrabalho apresentado no 31. Congresso Brasileiro de Zootecnia, Manaus$c2022 520 $aA matrinxã é um peixe muito consumido na região Norte do país, desta forma possui potencial de expansão na aquicultura, entretanto algumas informações da espécie ainda não estão totalmente esclarecidas como tempo de trânsito gastrointestinal que serve como embasamento para formulação de rações. Lotes de 10 juvenis de matrinxã foram alocados em aquários de 70 litros e alimentados em 5% da biomassa, posteriormente a cada 12 horas lotes eram submetidos a consecutivos abates para que fossem efetuadas laparoscopias que determinaram a posição da ingesta. Para o completo esvaziamento gastrointestinal foram decorridas 96 horas e grande parte do tempo o bolo alimentar ocupou o estômago, o jejum no intervalo das coletas pode ter reduzido a movimentação e retardado a digestão neste órgão, entretanto sugere-se que diferentes dietas, condições ambientais sejam testadas para estimar o tempo de trânsito gastrointestinal com maior precisão para matrinxã. 650 $aBrycon amazonicus 650 $aMatrinxã 650 $aNutrição Animal 653 $aAlimentação de peixes 653 $aTrato gastrointestinal 700 1 $aSILVA, L. I. P. da 700 1 $aMEIRA, A. S. F. 700 1 $aBOIJINK, C. de L. 700 1 $aDAIRIKI, J. K.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Amazônia Ocidental (CPAA) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|