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Biblioteca(s):  Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Pesca e Aquicultura.
Data corrente:  13/10/2021
Data da última atualização:  28/10/2021
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  VARELA, E. S.; BEKAERT, M.; KIRSCHNIK, L. N. G.; TORATI, L. S.; SHIOTSUKI, L.; O'SULLIVAN, F. L. A.; VILLELA, L. C. V.; REZENDE, F. P.; BARROSO, A. da S.; FREITAS, L. E. L. de; TAGGART, J. B.; MIGAUD, H.
Afiliação:  EDUARDO SOUSA VARELA, CNPASA; MICHAËL BEKAERT; LUCIANA NAKAGHI GANECO KIRSCHNIK, CNPASA; LUCAS SIMON TORATI, CNPASA; LUCIANA SHIOTSUKI, CNPASA; FERNANDA LOUREIRO ALMEIDA OSULLIVAN, CPAA; LUCIANA CRISTINE VASQUES VILLELA, CNPASA; FABRICIO PEREIRA REZENDE, CNPASA; AURISAN DA SILVA BARROSO; LUIZ EDUARDO LIMA DE FREITAS, CNPASA; JOHN BERNARD TAGGART; HERVE MIGAUD.
Título:  A high-density linkage map and sex-linked markers for the Amazon tambaqui Colossoma macropomum.
Ano de publicação:  2021
Fonte/Imprenta:  BMC Genomics, v. 22, n. 709, 2021.
ISSN:  1471-2164
DOI:  https://doi.org/10.1186/s12864-021-08037-8
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Tambaqui (Colossoma macropomum, Cuvier, 1818) is the most economically important native freshwater fish species in Brazil. It can reach a total length of over 1 m and a weight of over 40 kg. The species displays a clear sex dimorphism in growth performance, with females reaching larger sizes at harvest. In aquaculture, the production of monosex populations in selective breeding programmes has been therefore identified as a key priority. In the present study, a genetic linkage map was generated by double digest restriction-site associated DNA (ddRAD) sequencing from 248 individuals sampled from two F1 families. The map was constructed using 14,805 informative SNPs and spanned 27 linkage groups. From this, the tambaqui draft genome was improved, by ordering the scaffolds into chromosomes, and sex-linked markers were identified. A total of 235 markers on linkage group 26 showed a significant association with the phenotypic sex, supporting an XX/XY sex determination system in the species. The four most informative sex-linked markers were validated on another 206 sexed individuals, demonstrating an accuracy in predicting sex ranging from 90.0 to 96.7%.
Palavras-Chave:  Linkage map; Monosex; Sex-linked markers.
Thesagro:  Aquicultura; Colossoma Macropomum; Peixe; Tambaqui.
Thesaurus Nal:  Aquaculture; Fish; Genetic markers; Sex determination.
Categoria do assunto:  --
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/227302/1/bmc-2021.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/226902/1/s12864-021-08037-8.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Pesca e Aquicultura (CNPASA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPASA1076 - 1UPCAP - DD20212021
CPAA38559 - 1UPCAP - DD
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Registros recuperados : 57
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1.Imagem marcado/desmarcadoSHIOTSUKI, L. Avaliação de modelos estatísticos considerando a incerteza da paternidade. 2011. 85 f. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento Animal) - Universidade Estadual Paulista, Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Jaboticabal, 2011. Orientadora Lucia Galvão de Albuquerque. Co-orientador: Fernando Flores Cardoso.
Tipo: Orientação de Tese de Pós-Graduação
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.
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2.Imagem marcado/desmarcadoSHIOTSUKI, L. Núcleo de conservação de Tambaqui (Colossoma macropomum): Embrapa Pesca e Aquicultura. In: PÁDUA, J. G.; ALBUQUERQUE, M. do S. M.; MELLO, S. C. M. de (Ed.). Bancos e coleções de germoplasma da Embrapa: conservação e uso. Brasília: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2020. p. 140. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 371).
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.
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3.Imagem marcado/desmarcadoBELCHIOR, E. B.; SHIOTSUKI, L. Melhoramento genético de base comunitária: técnicas de transferência de tecnologia para ovinos e caprinos. Brasília, DF: Embrapa, 2017. 34 p. (Sistematização de experiências: métodos de transferência de tecnologia, intercâmbio e construção do conhecimento, 8).
Tipo: Folder/Folheto/Cartilha
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Unidades Centrais.
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4.Imagem marcado/desmarcadoOLIVEIRA, D. P. de; FACO, O.; SHIOTSUKI, L. Estimativas de parâmetros genéticos para características de crescimento e reprodutivas para ovinos da raça Morada Nova. In: ENCONTRO DE PESQUISA E PÓS-GRADUAÇÃO DA UNIVERSIDADE ESTADUAL VALE DO ACARAÚ, 6., 2011, Sobral. [Anais...]. Sobral: UVA, 2011. 8 f.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos.
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5.Imagem marcado/desmarcadoCARDOSO, F. F.; SHIOTSUKI, L.; TEMPELMAN, R. J. Metodologia para estimação do mérito genético de animais com paternidade incerta sob inferência bayesiana. Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2008. 48 p. il. color. (Embrapa Pecuária Sul. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 32).
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.
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6.Imagem marcado/desmarcadoSHIOTSUKI, L.; CARDOSO, F. F.; ALBUQUERQUE, L. G. Method for the estimation of genetic merit of animals with uncertain paternity under Bayesian inference. Journal of Animal Breeding and Genetics, v. 135, n. 2, p. 116-123, 2018.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.
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7.Imagem marcado/desmarcadoSHIOTSUKI, L.; CARDOSO, F. F.; ALBUQUERQUE, L. G. Method for the estimation of genetic merit of animals with uncertain paternity under Bayesian inference. Journal of Animal Breeding and Genetics, v. 135, n. 2, p. 116-123, 2018.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.
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8.Imagem marcado/desmarcadoSOUSA, D. R. de; MARTINS JUNIOR, C. T.; LOBO, R. N. B.; SHIOTSUKI, L.; FACO, O. Associação genética negativa entre prolificidade e peso ao nascer em ovinos da raça Morada Nova criados no semiárido. In: ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO E PESQUISA DA UNIVERSIDADE ESTADUAL VALE DO ACARAÚ, 8., 2013, Sobral. Anais... [Sobral]: Universidade Estadual Vale do Acaraú, 2013. 7 f.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos.
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9.Imagem marcado/desmarcadoSHIOTSUKI, L.; CARDOSO, F. F.; SILVA, J. A.; ALBUQUERQUE, L. G. Comparison of a genetic group and unknown paternity models for growth traits in Nellore cattle. Journal of Animal Science, v. 91, n. 11, p. 5135-5143, Nov., 2013.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Pecuária Sul.
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10.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, G. F. da; SHIOTSUKI, L.; DIAS, L. T.; TEIXEIRA, R. de A. Estimativa de parâmetros genéticos para ganho de peso e comprimento em Colossoma macropomum. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 13., 2019, Salvador, BA. Anais. Salvador: SBMA, 2019.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.
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11.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, G. F.; SHIOTSUKI, L.; DIAS, L. T.; TEIXEIRA, R. A. Estimation of genetic parameters for weight and length gains in tambaqui (Colossoma macropomum). Brazilian Journal of Biology, v. 83, e277423, 2023.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 3
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.
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12.Imagem marcado/desmarcadoMENDONÇA, K. L. de; JACINTO, M. A. C.; SHIOTSUKI, L.; FACÓ, O. Influência da nutrição e da idade ao abate na qualidade de couros ovinos. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 6., 2014, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2014. p. 93
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Pecuária Sudeste.
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13.Imagem marcado/desmarcadoMUNIZ, M. M. M.; SHIOTSUKI, L.; LOBO, R. N. B.; FACO, O. Identificação das taxas de descarte em função do padrão racial de ovinos Somalis Brasileira. Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2015. 7 p. il. (Embrapa Caprinos e Ovinos. Comunicado Técnico, 152).
Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Pesca e Aquicultura.
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14.Imagem marcado/desmarcadoJACINTO, M. A. C.; MENDONÇA, K. L.; SHIOTSUKI, L.; FACO, O.; ESTEVES, S. N. Influence of nutrition and age at slaughter on sheep leather quality. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 51., 2014, Barra dos Coqueiros. A produção animal frente às mudanças climáticas e tecnológicas - anais. Barra dos coqueiros: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2014. 1 CD-ROM.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Pecuária Sudeste.
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15.Imagem marcado/desmarcadoATAIDES, K. da S.; SHIOTSUKI, L.; GARCIA, B. F.; SILVA, D. A.; VARGAS, G.; CARVALHEIRO, R. Impacto do efeito de ambiente comum em características morfométricas de tambaqui (Colossoma macropomum) avaliadas aos 6 e 12 meses de idade. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 14., 2021, Santa Catarina. Passado, presente e futuro: anais. Santa Catarina: Sociedade Brasileira de Melhoramento Animal, 2021.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.
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16.Imagem marcado/desmarcadoMATAVELI, M.; MACIEL, P. O.; EVANGELISTA, D. K. R.; SHIOTSUKI, L.; DIGMAYER, M. Boas práticas de produção de alevinos de tambaqui (Colossoma macropomum). Palmas: Embrapa Pesca e Aquicultura, 2021. 34 p. il. (Embrapa Pesca e Aquicultura. Documentos, 49).
Tipo: Documentos
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.
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17.Imagem marcado/desmarcadoMcMANUS, C.; FACO, O.; SHIOTSUKI, L.; ROLO, J. L. J. de P.; PERIPOLLI, V. Pedigree analysis of Brazilian Morada Nova hair sheep. Small Ruminant Research, v. 170, p. 37-42, Jan. 2019.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Pesca e Aquicultura.
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18.Imagem marcado/desmarcadoSHIOTSUKI, L.; CARDOSO, F. F.; SILVA, J. A. II V.; ALBUQUERQUE, L. G. Genetic analysis of growth traits considering the avarage numerator relationship matrix and a hierarchical Bayes model for Nellore cattle. In: ADSA CSAS ASAS JOINT ANNUAL MEETING, 2009, Montreal. Electronic abstracts... Champaign: ADSA: ASAS, 2009. p. 15-16. M40. Publicado em: Jornal of Animal Science, Champaign, v. 87, p. 15-16, 2009. Electronic Supplement 2.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.
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19.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, G. F. da; SHIOTSUKI, L.; DIAS, L. T.; TEIXEIRA, R. de A. Ganho genético para peso corporal em população simulada de Colossoma macropomum. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 13., 2019, Salvador, BA. Anais. Salvador: SBMA, 2019.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.
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20.Imagem marcado/desmarcadoSHIOTSUKI, L.; OLIVEIRA, D. P. de; LOBO, R. N. B.; FACO, O. Genetic parameters for growth and reproductive traits of Morada Nova sheep kept by smallholder in semi-arid Brazil. Small Ruminant Research, Amsterdam, v. 120, n. 2/3, p. 204-208, Aug. 2014.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
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