Data/hora: 23/09/2024 02:44:14

Biblioteca(s): 	Embrapa Café.	
Data corrente: 	23/10/2019	
Data da última atualização: 	23/10/2019	
Autoria: 	GUIMARÃES, P. de S.; SCHENK, J. C. M.; GIACHETTO, P. F.; PADILHA, L.; SILVAROLLA, M. B.; MALUF, M. P.	
Afiliação: 	Paula de Sousa Guimarães, Bolsista do Consórcio Pesquisa Café; Juliana Camargo Martinati Schenk, Instituto Agronômico de Campinas - IAC. Bolsista INCT/CNPq; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; LILIAN PADILHA, CNPCa; Maria Bernadete Silvarolla, Instituto Agronômico de Campinas - IAC; MIRIAN PEREZ MALUF, CNPCa.	
Título: 	Validação de retrotransposons ativos em café-efeitos de estresse abiótico e baixa cafeína na expressão gênica.	
Ano de publicação: 	2019	
Fonte/Imprenta: 	In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória. Pesquisa, Inovação e Sustentabilidade dos Cafés do Brasil. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2019.	
Idioma: 	Português	
Notas: 	Título em inglês: Validation of active retrotransposons in coffee-effects of abiotic stress and low caffeine content on gene expression.	
Conteúdo: 	A identificação de perfis de expressão gênica diferenciais e redes metabólicas é uma ferramenta valiosa para a caracterização genética de caracteres agronômicos. Neste estudo, utilizamos análises de expressão em larga-escala para identificar processos biológicos alterados em plantas com teores reduzidos de cafeína. A expressão diferencial de genes selecionados observada in silico foi então validada em experimentos in vivo. O primeiro passo foi o sequenciamento em larga-escala de RNA extraído de tecidos jovens e em desenvolvimento, de plantas sem cafeína e de plantas com concentrações normais do composto. As sequências obtidas foram agrupadas, a partir de análises in silico, para identificação de genes com expressão diferencial entre os tratamentos e de redes metabólicas associadas aos teores de cafeína. Para a validação das análises in silico, selecionamos 3 genes de famílias de retrotransposons para análises de qRT-PCR em gemas e folhas coletadas de plantas normais (MN) e sem cafeína (AC), tanto em condições normais quanto durante déficit hídrico. O perfil de expressão dos genes estabelecido por qRT-PCR foi distinto do observado nas análises de RNAseq. Além disso, os resultados sugerem que plantas AC possuem uma maior suscetibilidade ao estresse hídrico, uma vez que a expressão de retrotransposons é mais alta em folhas e gemas de plantas AC do que em MN.	
Palavras-Chave: 	Assisted-selection; Melhoramento molecular; Molecular breeding; RNAseq; Seleção-assistida.	
Categoria do assunto: 	--	
Registro original: 	Embrapa Café (CNPCa)	
Exemplares: 	CNPCa - (1328-1) - UPC - PC - DD -  -  -  - DIS