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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
13/07/2018 |
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Data da última atualização: |
13/07/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
ROMANO, G. de S.; LORENZETTI, W. R.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; MORES, M. A. Z.; SAVOLDI, I. R.; CARMO, K. B. do; LOPES, J. S.; PEDROSA, V. B.; CANTAO, M. E.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. |
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Afiliação: |
GABRIELI DE SOUZA ROMANO, UFBA; WILLIAM RAPHAEL LORENZETTI, UDESC/Chapecó; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; JANE DE OLIVEIRA PEIXOTO, CNPSA; MARCOS ANTONIO ZANELLA MORES, CNPSA; IGOR RICARDO SAVOLDI, UNC/Concórdia; KAMILLA BLEIL DO CARMO, UNC/Concórdia; JADER SILVA LOPES, BRF/Curitiba; VICTOR BRENO PEDROSA, UFPG; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; LUIZ LEHMMAN COUTINHO, ESALQ; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA. |
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Título: |
The involvement of muscle-related genes in the occurrence of scrotal hernia in pigs. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 11., 2018, Auckland, New Zealand. Proceedings... Massey University, 2018. Digital Archive. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: The incidence of scrotal hernia is still a problem in the swine production, leading to economic losses and reducing the animal welfare. Although some QTLs and candidate genes have already been associated to scrotal hernia, the genetic mechanisms and genes controlling this pathology remain to be clarified. Therefore, this study aimed to identify genes involved in the scrotal hernia occurrence in pigs. Thus, two experiments were performed: 1) RNA-Seq analysis of the inguinal ring tissue from eight 60-days-old Landrace pigs (4 healthy and 4 affected with scrotal hernia) that were sequenced in the Illumina HiSeq 2500 and 2) quantitative PCR (qPCR) of 8 candidate genes chosen from the inguinal ring transcriptome in 18 MS115 30-days-old pigs (9 normal and 9 affected with scrotal hernia). Based on the differentially expressed (DE) genes in this transcriptome, some candidate genes related to muscle development biological processes (BP), including the muscle structure (ACTA1), intracellular transport (RYR1, MYBPC1), cell adhesion (COL13A1) and apoptosis (MAP1LC3) were found. The expression profile of the DE genes was consistent with the anatomical alterations related to the scrotal hernia development, such as the weakness of the inguinal canal and non-obliteration of the processus vaginalis. In the qPCR analysis, the MYH1 was the only DE gene identified. The downregulation of the MYH1gene might be one of the possible causes of scrotal hernia in swine since its expression had already been reduced in 30-days-old affected pigs. Therefore, the DE genes identified in our study related to muscle development bioprocesses are possibly involved in the occurrence of scrotal hernia in pigs. Resumo: A incidência de hérnia escrotal ainda é um problema na produção de suínos, levando a perdas econômicas e reduzindo o bem-estar animal. Embora alguns QTLs e genes candidatos já tenham sido associados à hérnia escrotal, os mecanismos genéticos e os genes que controlam esta patologia ainda precisam ser esclarecidos. Portanto, este estudo teve como objetivo identificar genes envolvidos na ocorrência de hérnia escrotal em suínos. Assim, foram realizadas duas experiências: 1) Análise de RNA-Seq do tecido anelar inguinal de oito suínos Landrace com 60 dias de idade (4 saudáveis ??e 4 afetados com hérnia escrotal) que foram sequenciados no Illumina HiSeq 2500 e 2) PCR quantitativa (qPCR) de 8 genes candidatos escolhidos do transcriptoma do anel inguinal em 18 porcos MS115 com 30 dias de idade (9 normais e 9 afetados com hérnia escrotal). Com base nos genes diferencialmente expressos (DE) neste transcriptoma, alguns genes candidatos relacionaram-se aos processos biológicos (BP) de desenvolvimento muscular, incluindo a estrutura muscular (ACTA1), transporte intracelular (RYR1, MYBPC1), adesão celular (COL13A1) e apoptose ( MAP1LC3) foram encontrados. O perfil de expressão dos genes DE foi consistente com as alterações anatômicas relacionadas ao desenvolvimento da hérnia escrotal, como a fraqueza do canal inguinal e a não obliteração do processo vaginal. Na análise qPCR, o MYH1 foi o único gene DE identificado. O downregulation do gene MYH1 pode ser uma das possíveis causas de hérnia escrotal em suínos, uma vez que sua expressão já havia sido reduzida em suínos afetados com 30 dias de idade. Portanto, os genes DE identificados em nosso estudo relacionados a bioprocessos de desenvolvimento muscular estão possivelmente envolvidos na ocorrência de hérnia escrotal em suínos. MenosAbstract: The incidence of scrotal hernia is still a problem in the swine production, leading to economic losses and reducing the animal welfare. Although some QTLs and candidate genes have already been associated to scrotal hernia, the genetic mechanisms and genes controlling this pathology remain to be clarified. Therefore, this study aimed to identify genes involved in the scrotal hernia occurrence in pigs. Thus, two experiments were performed: 1) RNA-Seq analysis of the inguinal ring tissue from eight 60-days-old Landrace pigs (4 healthy and 4 affected with scrotal hernia) that were sequenced in the Illumina HiSeq 2500 and 2) quantitative PCR (qPCR) of 8 candidate genes chosen from the inguinal ring transcriptome in 18 MS115 30-days-old pigs (9 normal and 9 affected with scrotal hernia). Based on the differentially expressed (DE) genes in this transcriptome, some candidate genes related to muscle development biological processes (BP), including the muscle structure (ACTA1), intracellular transport (RYR1, MYBPC1), cell adhesion (COL13A1) and apoptosis (MAP1LC3) were found. The expression profile of the DE genes was consistent with the anatomical alterations related to the scrotal hernia development, such as the weakness of the inguinal canal and non-obliteration of the processus vaginalis. In the qPCR analysis, the MYH1 was the only DE gene identified. The downregulation of the MYH1gene might be one of the possible causes of scrotal hernia in swine since its expression ha... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Congenital disorder; Distúrbio congênito; Hérnia escrotal; QPCR; RNA-Seq; Scrotal hernia. |
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Thesagro: |
Melhoramento Genético Animal; Suíno. |
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Thesaurus Nal: |
Animal genetic resources; Swine. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/179754/1/final8691.pdf
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Marc: |
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100 1 $aROMANO, G. de S.
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 22. | | HUL, L. M.; IBELLI, A. M. G.; SAVOLDI, I. R.; MARCELINO, D. E. P.; FERNANDES, L. T.; PEIXOTO, J. O.; CANTAO, M. E.; HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Differentially expressed genes in the femur cartilage transcriptome clarify the understanding of femoral head separation in chickens. Scientific Reports, v. 11, n. 1, p. 1-13. 2021. Article number: 17965.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Suínos e Aves. |
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| 23. | | SAVOLDI, I. R.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; MORES, M. A. Z.; LAGOS, E. B.; LOPES, J. S.; ZANELLA, R.; LEDUR, M. C. A joint analysis using exome and transcriptome data identifiescandidate polymorphisms and genes involved with umbilical hernia in pigs. BMC Genomics, v. 22, n. 818, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 24. | | PEIXOTO, J. de O.; SAVOLDI, I. R.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; JAENISCH, F. R. F.; GIACHETTO, P. F.; SETTLES, M. L.; ZANELLA, R.; MARCHESI, J. A. P.; PANDOLFI, J. R. C.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Proximal femoral head transcriptome reveals novel candidate genes related to epiphysiolysis in broiler chickens. BMC Genomics, v. 20, p. 1-17, 2019. Na publicação: José Rodrigo Pandolfi. Article number: 1031.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 26. | | DAL PIZZOL, M. S.; IBELLI, A. M. G.; SALMÓRIA, L. A.; MORES, M. A. Z.; PEIXOTO, J. de O.; SAVOLDI, I. R.; PERTILLE, F.; MARIANI, P. D. S. C.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Perfil de metilação diferencial em suínos normais e afetados com osteocondrose latens. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL ON-LINE, 14., 2021. Anais... Chapecó: UDESC: Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2022.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 27. | | SOUZA, M. R.; IBELLI, A. M. G.; SAVOLDI, I. R.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; MORES, M. A. Z.; LOPES, J. S.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Transcriptome analysis identifies genes involved with the development of umbilical hernias in pigs. Plos One, v. 15, n. 5, e0232542, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 28. | | SILVA, A. N. da; IBELLI, A. M. G.; SAVOLDI, I. R.; CANTAO, M. E.; ZANELLA, E. L.; MARQUES, M. G.; SILVA, M. V. G. B.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C.; LOPES, J. S.; VARGAS, J. E.; ZANELLA, R. Whole-exome sequencing indicated new candidate genes associated with unilateral cryptorchidism in pigs. Sexual Development, 9 Feb 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 3 |
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