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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos. |
Data corrente: |
23/08/2023 |
Data da última atualização: |
24/08/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
LEÃO, U. S.; BUENO, L. G.; NEGREIROS, A. B.; SILVA, G. R.; MAGGIONI, R.; BRITTO. F. B.; SARMENTO, J. L. R.; GALVANI, D. B.; DINIZ, F. M. |
Afiliação: |
UESLEI S. LEÃO, Northeast Biotechnology Network (RENORBIO); UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ; LUICE GOMES BUENO GALVANI, CNPC; ALINE B. NEGREIROS, Northeast Biotechnology Network (RENORBIO); UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ; GEICE R. SILVA; RODRIGO MAGGIONI, INSTITUTE OF MARINE SCIENCES (LABOMAR), UNIVERSIDADE FEDERAL DO CEARÁ; FABIO B. BRITTO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ; JOSE L. R. SARMENTO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ; DIEGO BARCELOS GALVANI, CNPC; FABIO MENDONCA DINIZ, CNPC. |
Título: |
Unveiling the demographic background and genetic diversity of Urochloa mosambicensis (Poaceae) through genome-wide identification of simple sequence repeats and molecular marker development. |
Ano de publicação: |
2023 |
Fonte/Imprenta: |
Conservation Genetics Resources, v. 15, p. 1-9, Aug. 2023. |
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s12686-023-01312-8 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Abstract: The first set of simple sequence repeat (SSR) markers for Urochloa mosambicensis (Hack.) Dandy is described in this study. SSRs were isolated from a genomic library with 3491 contigs obtained by high-throughput sequencing. Primers were designed for twenty loci, and all primer pairs were successfully amplified in 39 genotypes, yielding an average of 4.95 alleles per locus. The mean polymorphic information content (PIC) was 0.559, and the mean discriminating power (DP) was 0.520 for all loci considering also all U. mosambicensis genotypes. The non?Bayesian clustering analysis has confirmed clustering consistency of the individuals and provides enough support for the existence of the pattern that also emerged from PCoA and UPGMA. These markers demonstrated potential transferability to U. advena, U. oligotricha, U. brachyura and U. xantholeuca. Our findings showed that the set of molecular markers described here have strong potential for fingerprinting and characterizing genetic diversity in intra-specific plant collections, whose breeding programs could be accelerated by the effective use of these molecular tools, not only in U. mosambicensis, but also within the genus Urochloa. |
Palavras-Chave: |
Capim-corrente; Genetic diversity; High-throughput sequencing; Microsatellites; Next-generation sequencing; SSR; Transferability. |
Thesagro: |
Capim Urochloa; Genética Molecular; Gramínea Forrageira; Marcador Genético; Marcador Molecular; Urochloa Mosambicensis. |
Thesaurus Nal: |
Forage grasses; Genetic markers; Molecular genetics; Plant genetics; Sequence analysis. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
Marc: |
LEADER 02618naa a2200445 a 4500 001 2156061 005 2023-08-24 008 2023 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s12686-023-01312-8$2DOI 100 1 $aLEÃO, U. S. 245 $aUnveiling the demographic background and genetic diversity of Urochloa mosambicensis (Poaceae) through genome-wide identification of simple sequence repeats and molecular marker development.$h[electronic resource] 260 $c2023 520 $aAbstract: The first set of simple sequence repeat (SSR) markers for Urochloa mosambicensis (Hack.) Dandy is described in this study. SSRs were isolated from a genomic library with 3491 contigs obtained by high-throughput sequencing. Primers were designed for twenty loci, and all primer pairs were successfully amplified in 39 genotypes, yielding an average of 4.95 alleles per locus. The mean polymorphic information content (PIC) was 0.559, and the mean discriminating power (DP) was 0.520 for all loci considering also all U. mosambicensis genotypes. The non?Bayesian clustering analysis has confirmed clustering consistency of the individuals and provides enough support for the existence of the pattern that also emerged from PCoA and UPGMA. These markers demonstrated potential transferability to U. advena, U. oligotricha, U. brachyura and U. xantholeuca. Our findings showed that the set of molecular markers described here have strong potential for fingerprinting and characterizing genetic diversity in intra-specific plant collections, whose breeding programs could be accelerated by the effective use of these molecular tools, not only in U. mosambicensis, but also within the genus Urochloa. 650 $aForage grasses 650 $aGenetic markers 650 $aMolecular genetics 650 $aPlant genetics 650 $aSequence analysis 650 $aCapim Urochloa 650 $aGenética Molecular 650 $aGramínea Forrageira 650 $aMarcador Genético 650 $aMarcador Molecular 650 $aUrochloa Mosambicensis 653 $aCapim-corrente 653 $aGenetic diversity 653 $aHigh-throughput sequencing 653 $aMicrosatellites 653 $aNext-generation sequencing 653 $aSSR 653 $aTransferability 700 1 $aBUENO, L. G. 700 1 $aNEGREIROS, A. B. 700 1 $aSILVA, G. R. 700 1 $aMAGGIONI, R. 700 1 $aBRITTO. F. B. 700 1 $aSARMENTO, J. L. R. 700 1 $aGALVANI, D. B. 700 1 $aDINIZ, F. M. 773 $tConservation Genetics Resources$gv. 15, p. 1-9, Aug. 2023.
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Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
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Registros recuperados : 48 | |
5. | | MOURA, J. de O.; CAMPELO, J. E. G.; BAJAY, M. M.; SARMENTO, J. L. R.; ARAUJO, A. M. de. Population genomics and gene introgression in goat herds naturally adapted to Brazil. Revista Ciência Agronômica, Fortaleza, v. 50, n. 3, p. 476-483, jul./set. 2019.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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6. | | OLIVEIRA, J. C. V.; ABREU, U. G. P.; SARMENTO, J. L. R.; ROCHA, L. L.; RIBEIRO, M. N. Utilização de modelos lineares generalizados na descrição fenotípica de caprinos nativos, nos municípios de Ibimirim e Serra Talhada no estado de Pernambuco. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE CONSERVAÇÃO DE RECURSOS GENÉTICOS: RAÇAS NATIVAS PARA O SEMI-ÁRIDO, 1., 2004, Recife, PE. Resumos... Recife: UFRPE, 2004. p.186Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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7. | | CARVALHO, D. A. de; BONAFÉ, C. M.; RODRIGUEZ-RODRIGUEZ, M. Del P.; ALMEIDA, M. J. de O.; SARMENTO, J. L. R.; BRITO, F. B.; SILVA, M. de A. Caracterização genética e estrutura populacional de galinhas crioulas Canela-Preta. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 51, n. 11, p. 1899-1906, nov. 2016. Título em inglês: Genetic characterization and population structure of Canela-Preta creole chicken,Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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8. | | MAGALHÃES, A. F. B.; LOBO, R. N. B.; FACO, O.; MORAIS, O. R. de; ALBUQUERQUE, F. H. M. A. R. de; SARMENTO, J. L. R. Comparação de dois modelos estatísticos para uso do peso a desmama como critério de seleção em ovinos da raça Somalis Brasileira. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 21., 2011, Maceió. Inovações tecnológicas e mercado consumidor: anais. Maceió: Associação Brasileira de Zootecnistas, 2011. 3 f. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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9. | | SARMENTO, J. L. R.; TORRES, R. de A.; LOBO, R. N. B.; ALBUQUERQUE, L. G. de; SOUSA, W. H. de; SOUSA, J. E. R. de. Comparação de homogeneidade e heteroneneidade de variância residual em modelos de regressão aleatória na descrição do crescimento de ovinos Santa Inês. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 45., 2008, Lavras. Biotecnologia e sustentabilidade: anais. Brasília, DF: SBZ; Lavras: UFLA, 2008. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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10. | | ROCHA, A. O.; SARMENTO, J. L. R.; CARVALHO, D. A. de; CAMACHO, M. E.; ALMEIDA, M. J. de O.; BERMEJO, J. V. D.; MARTÍNEZ, A. M. M. Diferenciação genética entre galinhas Canela-Preta, raças exóticas e linhagem industrial: resultados preliminares. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA MEIO-NORTE, 5., 2019,Teresina, PI. Anais... Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2022. 96 p. (Embrapa Meio-Norte. Documentos, 285). p. 59.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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11. | | SANTOS, N. P. da S.; BRANCO, J. da F. C.; CAMPELO, J. E. G.; SARMENTO, J. L. R.; ARAUJO, A. M. de; MACHADO, T. M. M. Descrição da caprinocultura em sistema extensivo de criação no Estado do Piauí. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendedorismo e progresso científicos na zootecnia brasileira de vanguarda: anais. Salvador: SBZ, 2010. 3 p.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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12. | | MALHADO, C. H. M.; CARNEIRO, P. L. S.; CRUZ, J. F. da; OLIVEIRA, D. F. de; AZEVEDO, D. M. M. R.; SARMENTO, J. L. R. Curvas de crescimento para caprinos da raça Anglo-Nubiana criados na caatinga: rebanho de elite e comercial. Revista Brasileira de Saúde e Produção Animal, Salvador, v. 9, n. 4, p. 662-671, out/dez. 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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13. | | PIRES, A. M.; MALHADO, C. H. M.; CARNEIRO, P. L. S.; CRUZ, J. F. da; OLIVEIRA, D. F. de; AZEVEDO, D. M. M. R.; SARMENTO, J. L. R. Modelos não lineares para descrever o crescimento de caprinos da raça Anglo Nubiana criados na caatinga: rebanho elite e comercial. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 5.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 11.; SIMPÓSIO SERGIPANO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 1., 2008, Aracaju. Anais... Aracaju: Sociedade Nordestina de Produção Animal: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2008. 3 p.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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14. | | SARMENTO, J. L. R.; TORRES, R. de A.; LOBO, R. N. B.; ALBUQUERQUE, L. G. de; SOUSA, W. H. de; SOUSA, J. E. R. de. Modelos de regressão aleatória na avaliação genética do crescimento de ovinos da raça Santa Inês. Revista Brasileira de Zootecnia, v. 39, n. 8, p. 1723-1732, 2010.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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15. | | MENEZES, G. R. de O.; TORRES, R. de A.; SARMENTO, J. L. R.; RODRIGUES, M. T.; BRITO, L. F.; LOPES, P. S.; SILVA, F. G. da. Modelos de regressão aleatória na avaliação da produção de leite em cabras da raça Saanen. Revista Brasileira de Zootecnia, v.40, n.7, p.1526-1532, 2011.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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16. | | CAVALCANTE NETO, A.; THOLON, P.; LUI, J. F.; LARA, M. A. C.; FONSECA, C.; RIBEIRO, M. N.; SARMENTO, J. L. R. Modelos de regressão aleatória com diferentes estruturas de variância residual para descrever o tamanho da leitegada. Revista Ciência Agronômica, v. 42, n. 4, p. 1043-1050, dez. 2011.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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17. | | TORRES, T. S.; REGO NETO, A. A.; BIAGIOTTI, D.; SOUSA, W. H. de; LOBO, R. N. B.; SARMENTO, J. L. R. Efeitos ambientais sobre o ganho de peso em ovinos Santa Inês no semi-árido nordestino. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendedorismo e progresso científico na zootecnia brasileira: anais. Salvador: SBZ, 2010. 3 f. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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18. | | SOUSA, J. E. R. de; SILVA, M. de A. e; SARMENTO, J. L. R.; SOUSA, W. H. de; SOUZA, M. do S. M. de; FRIDRICH, A. B. Homogeneidade e heterogeneidade de variância residual em modelos de regressão aleatória sobre o crescimento de caprinos Anglo-Nubianos. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 43, n. 12, p. 1725-1732, dez. 2008. Título em inglês: Homogeneity and heterogeneity of residual variance in random regression models on growth trajectory of Nubian goats.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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19. | | REGO NETO, A. A.; DO Ó, A. O.; BIAGIOTTI, D.; SOUSA, W. H. de; LOBO, R. N. B.; SARMENTO, J. L. R. Estimação de componentes de variância e parâmetros genéticos para pesos do nascimento aos 196 dias de idade em ovinos Santa Inês por meio de modelo multicaracterística. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendedorismo e progresso científico na zootecnia brasileira: anais. Salvador: SBZ, 2010. 3 f. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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20. | | ASSIS, G. M. L. de; ALBUQUERQUE, L. G. de; SARMENTO, J. L. R.; CARNEIRO JUNIOR, J. M.; LOPES, P. S.; RODRIGUES, M. T. Estimação de parâmetros genéticos em caprinos leiteiros por meio de análise de regressão aleatória utilizando-se a Amostragem de Gibbs. Revista Brasileira de Zootecnia, v. 35, n. 3, p. 706-714, 2006.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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