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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
05/11/2021 |
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Data da última atualização: |
05/11/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
OKINO, C. H.; CAMINOTTO, L. C. F.; KAPRITCHKOFF, R. T. I.; NICIURA, S. C. M.; ESTEVES, S. N.; SANTOS, I. B. DOS; TOSCANO, J. H. B.; OLIVEIRA, M. C. de S.; CHAGAS, A. C. de S. |
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Afiliação: |
CINTIA HIROMI OKINO, CPPSE; LARA CRISTINA FRIZONI CAMINOTTO, UNICEP; RAFAELA TAMI IKEDA KAPRITCHKOFF, UNESP; SIMONE CRISTINA MEO NICIURA, CPPSE; SERGIO NOVITA ESTEVES, CPPSE; ISABELLA BARBOSA DOS SANTOS, UNESP; JOAO HENRIQUE BARBOSA TOSCANO, UNESP; MARCIA CRISTINA DE SENA OLIVEIRA, CPPSE; ANA CAROLINA DE SOUZA CHAGAS, CPPSE. |
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Título: |
Comparison of ovine B-globin haplotype sequences and a new multiplex PCR for identification. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Veterinary Parasitology, v.300, 109592, dec. 2021. |
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Páginas: |
5 p. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.vetpar.2021.109592 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Deletion of pre-adult BC-globin in sheep harboring BB haplotype of B-globin was associated to decreased tolerance to anemia and hypoxia, and consequently, reduced resistance to Haemonchus contortus infection, which is closely related to severe anemia. Recently, a qPCR using hydrolysis probe was successfully developed for B-globin haplotype identification, and association between resistance against H. contortus and presence of ?A allele was observed in Morada Nova sheep. Thus, this study aimed to better investigate the differences between B-globin haplotypes and to develop a conventional multiplex PCR, as an alternative to qPCR assay for B-globin haplotype identification. A total of 333 Morada Nova lambs had their blood collected and tested by both qPCR and new multiplex PCR, and 100 % of agreement was observed between the results. Since different primers were designed for such assay development, including different target genes, high specificity of both methods may be also highlighted. Three A haplotype samples were submitted to DNA Sanger sequencing of B-globin gene and compared to sequences previously deposited in Genbank. One nucleotide deletion in intronic region was observed only in AA haplotype of Morada Nova animals, while in BB animals the nucleotide remained present. To the best of our knowledge, this is the first report of multiplex conventional PCR for ovine B-globin haplotype identification. The advantages of the developed conventional PCR are reduced reagents costs (less than a half price) and wider reachability, since even labs without real time PCR thermocyclers are able to offer this assay. Therefore, it may become an important tool for sheep producers to improve genetic selection of parasite resistant animals. MenosDeletion of pre-adult BC-globin in sheep harboring BB haplotype of B-globin was associated to decreased tolerance to anemia and hypoxia, and consequently, reduced resistance to Haemonchus contortus infection, which is closely related to severe anemia. Recently, a qPCR using hydrolysis probe was successfully developed for B-globin haplotype identification, and association between resistance against H. contortus and presence of ?A allele was observed in Morada Nova sheep. Thus, this study aimed to better investigate the differences between B-globin haplotypes and to develop a conventional multiplex PCR, as an alternative to qPCR assay for B-globin haplotype identification. A total of 333 Morada Nova lambs had their blood collected and tested by both qPCR and new multiplex PCR, and 100 % of agreement was observed between the results. Since different primers were designed for such assay development, including different target genes, high specificity of both methods may be also highlighted. Three A haplotype samples were submitted to DNA Sanger sequencing of B-globin gene and compared to sequences previously deposited in Genbank. One nucleotide deletion in intronic region was observed only in AA haplotype of Morada Nova animals, while in BB animals the nucleotide remained present. To the best of our knowledge, this is the first report of multiplex conventional PCR for ovine B-globin haplotype identification. The advantages of the developed conventional PCR are reduced reagents co... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Allele; B haplotype; Beta globin C; Morada Nova; Resistance. |
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Thesaurus Nal: |
Sheep. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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| 21. |  | GUARIENTI, E. M.; PIRES, J. L. F.; CUNHA, G. R. da; MIRANDA, M. Z. de; NICOLAU, M.; TIBOLA, C. S.; PASINATO, A.; SANTOS, I. B. S. dos S. Conformidade de requisitos de qualidade tecnológica de trigo para exportação produzido no Rio Grande do Sul, safras 2015, 2016 e 2017. Passo Fundo: Embrapa Trigo, 2020. (Embrapa Trigo. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 94).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 22. | | MORAES, C. V.; CRUVINEL, G. G.; SANTOS, I. B. dos; FIGUEIREDO, A.; COSTELLA, D. M.; OKINO, C. H.; NICIURA, S. C. M. Investigação da ocorrência de eventos epigenéticos em Haemonchus contortus e sua relação com a resistência ao anti-helmíntico monepantel. In: WORKSHOP DO PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM GENÉTICA EVOLUTIVA E BIOLOGIA MOLECULAR, 1., 2019, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: UFSCAR, 2019. p.71| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 24. | | HAEHLING, M. B.; TOSCANO, J. H. B.; GIRALDELO, L. A.; SANTOS, I. B.; ESTEVES, S. N.; BENAVIDES, M. V.; THOLON, P.; CHAGAS, A. C. de S. Is selection for resistance and resilience to Haemonchus contortus possible in Morada Nova sheep? Small Ruminant Research, v.201, aug. 2021, 106447. 10 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Pecuária Sul. |
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| 25. | | TOSCANO, J. H. B.; OKINO, C. H.; SANTOS, I. B. dos; GIRALDELO, L. A.; HAEHLING, M. B. VON; ESTEVES, S. N.; CHAGAS, A. C. de S. Innate immune responses associated with resistance against Haemonchus Contortus in Morada Nova sheep. Journal of Immunology Research, v. 2019, n. 3562672, p. 1-10, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 27. | | FIGUEIREDO, A.; ANHOLETO, L. A.; COLA, D. F.; FANTATTO, R. R.; ALEMÁN GAINZA, Y.; SANTOS, I. B. DOS; VIÇOZZI, G. P.; ÁVILA, D. S.; FRACETO, L. F.; CHAGAS, A. C. de S. Acaricides containing zein nanoparticles: a tool for a lower impact control of the cattle tick Rhipicephalus microplus. Veterinary Parasitology, v. 318, 109918, june 2023. 11 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 28. | | OKINO, C. H.; CAMINOTTO, L. C. F.; KAPRITCHKOFF, R. T. I.; NICIURA, S. C. M.; ESTEVES, S. N.; SANTOS, I. B. DOS; TOSCANO, J. H. B.; OLIVEIRA, M. C. de S.; CHAGAS, A. C. de S. Comparison of ovine B-globin haplotype sequences and a new multiplex PCR for identification. Veterinary Parasitology, v.300, 109592, dec. 2021. 5 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 30. | | HAEHLING, M. B. V.; CRUVINEL, G. G.; TOSCANO, J. H. B.; GIRALDELO, L. A.; SANTOS, I. B. dos; ESTEVES, S. N.; BENAVIDES, M. V.; BARIONI JUNIOR, W.; NICIURA, S. C. M.; CHAGAS, A. C. de S. Four single nucleotide polymorphisms (SNPs) are associated with resistance and resilience to Haemonchus contortus in Brazilian Morada Nova sheep. Veterinary Parasitology, v. 279, 2020, 109053. 11 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 31. | | OKINO, C. H.; NICIURA, S. C. M.; GIARETTA, P. R.; MELITO, G.; KAPRITCHKOFF, R. T. I.; SANTOS, I. B.; RECH, R. R.; MINHO, A. P.; ESTEVES, S. N.; CHAGAS, A. C. de S. Improved mucosal response against hemonchosis related to Beta A allele of ovine beta-globin gene. In: INTERNATIONAL VETERINARY IMMUNOLOGY SYMPOSIUM, 13., 2023, Satellite Meeting. Programme & Abstracts... Kruger Park/South Africa: IVIS, 2023. p. 54-55.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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