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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sudeste. |
Data corrente: |
23/11/2017 |
Data da última atualização: |
28/11/2017 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SANTIAGO, G. G.; SIQUEIRA, F.; CARDOSO, F. F.; REGITANO, L. C. de A.; VENTURA, R.; SOLLERO, B. P.; Souza, M. D.; MOKRY, F. B.; FERREIRA, A. B. R.; TORRES JUNIOR, R. A. de A. |
Afiliação: |
Federal University of Mato Grosso do Sul; FABIANE SIQUEIRA, CNPGC; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; Department of Animal and Poultry Science/University of Guelph/Centre for Genetic Improvement of Livestock -CGIL; BRUNA PENA SOLLERO, CPPSUL; Brazilian Association of Canchim Cattle Breeders - ABCCAN; Brazilian Association of Canchim Cattle Breeders - ABCCAN; ANNA BEATRIZ ROBOTTON FERREIRA, CNPGC; ROBERTO AUGUSTO DE A TORRES JUNIOR, CNPGC. |
Título: |
Genomewide association study for production and meat quality traits in Canchim beef cattle. |
Ano de publicação: |
2017 |
Fonte/Imprenta: |
Journal Animal Science, v. 95, n. 8, p. 3381-3390, Aug. 2017. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The commercial value of the bovine carcass is determined by a set of traits, such as weight, yield, back fat thickness, and marbling; therefore, the genetic improvement of growth, meat, and carcass quality traits is an important tool to add value to the supply chain. Genomewide association studies (GWAS) enable the identification of loci that control phenotypic expression of quantitative traits (QTL). Therefore, the objective of this work was to perform a GWAS to identify genomic regions and genes associated with growth, carcass traits, and meat quality in Canchim beef cattle. These traits were yearling weight (YW), rib eye area (REA), back fat thickness (BFT), and marbling (MARB). To increase sample size and marker density, genotype imputation was performed, and only markers imputed with greater than 95% accuracy were used. Genomewide association study was performed using a Bayesian approach, by the Bayes B statistical method, incorporating genotypes and phenotypes from 614 animals from both the Canchim breed and the MA genetic group (offspring of Charolais bulls and one-half Canchim + one-half Zebu cows). This investigation identified 1 and 4 genomic regions explaining 0.23 and 7.35% of the genetic variance for REA and YW, respectively. These regions harbor a total of 19 genes, 7 of which were classified for biological functions by functional analysis. Significant associations were not observed for BFT and MARB. The identification of QTL that had been previously described in the literature reinforces associations found in this study. MenosThe commercial value of the bovine carcass is determined by a set of traits, such as weight, yield, back fat thickness, and marbling; therefore, the genetic improvement of growth, meat, and carcass quality traits is an important tool to add value to the supply chain. Genomewide association studies (GWAS) enable the identification of loci that control phenotypic expression of quantitative traits (QTL). Therefore, the objective of this work was to perform a GWAS to identify genomic regions and genes associated with growth, carcass traits, and meat quality in Canchim beef cattle. These traits were yearling weight (YW), rib eye area (REA), back fat thickness (BFT), and marbling (MARB). To increase sample size and marker density, genotype imputation was performed, and only markers imputed with greater than 95% accuracy were used. Genomewide association study was performed using a Bayesian approach, by the Bayes B statistical method, incorporating genotypes and phenotypes from 614 animals from both the Canchim breed and the MA genetic group (offspring of Charolais bulls and one-half Canchim + one-half Zebu cows). This investigation identified 1 and 4 genomic regions explaining 0.23 and 7.35% of the genetic variance for REA and YW, respectively. These regions harbor a total of 19 genes, 7 of which were classified for biological functions by functional analysis. Significant associations were not observed for BFT and MARB. The identification of QTL that had been previously described ... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Bayesian inference; Carcaça bovina; Carcass; Growth; Melhoramento genético do crescimento. |
Thesagro: |
Gado canchim. |
Thesaurus Nal: |
Cattle; Genomics; Single nucleotide polymorphism. |
Categoria do assunto: |
-- G Melhoramento Genético |
Marc: |
LEADER 02547naa a2200337 a 4500 001 2080625 005 2017-11-28 008 2017 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aSANTIAGO, G. G. 245 $aGenomewide association study for production and meat quality traits in Canchim beef cattle.$h[electronic resource] 260 $c2017 520 $aThe commercial value of the bovine carcass is determined by a set of traits, such as weight, yield, back fat thickness, and marbling; therefore, the genetic improvement of growth, meat, and carcass quality traits is an important tool to add value to the supply chain. Genomewide association studies (GWAS) enable the identification of loci that control phenotypic expression of quantitative traits (QTL). Therefore, the objective of this work was to perform a GWAS to identify genomic regions and genes associated with growth, carcass traits, and meat quality in Canchim beef cattle. These traits were yearling weight (YW), rib eye area (REA), back fat thickness (BFT), and marbling (MARB). To increase sample size and marker density, genotype imputation was performed, and only markers imputed with greater than 95% accuracy were used. Genomewide association study was performed using a Bayesian approach, by the Bayes B statistical method, incorporating genotypes and phenotypes from 614 animals from both the Canchim breed and the MA genetic group (offspring of Charolais bulls and one-half Canchim + one-half Zebu cows). This investigation identified 1 and 4 genomic regions explaining 0.23 and 7.35% of the genetic variance for REA and YW, respectively. These regions harbor a total of 19 genes, 7 of which were classified for biological functions by functional analysis. Significant associations were not observed for BFT and MARB. The identification of QTL that had been previously described in the literature reinforces associations found in this study. 650 $aCattle 650 $aGenomics 650 $aSingle nucleotide polymorphism 650 $aGado canchim 653 $aBayesian inference 653 $aCarcaça bovina 653 $aCarcass 653 $aGrowth 653 $aMelhoramento genético do crescimento 700 1 $aSIQUEIRA, F. 700 1 $aCARDOSO, F. F. 700 1 $aREGITANO, L. C. de A. 700 1 $aVENTURA, R. 700 1 $aSOLLERO, B. P. 700 1 $aSouza, M. D. 700 1 $aMOKRY, F. B. 700 1 $aFERREIRA, A. B. R. 700 1 $aTORRES JUNIOR, R. A. de A. 773 $tJournal Animal Science$gv. 95, n. 8, p. 3381-3390, Aug. 2017.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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Registros recuperados : 44 | |
1. | | SANTIAGO, G. G.; SIQUEIRA, F.; SILVA, L. O. C. da; FARIA, F. J. C. Testes de parentesco utilizando polimorfismos de nucleotídeo único em dados simulados. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 11., 2015, Campo Grande, MS. Anais... Campo Grande: Embrapa Gado de Corte, 2015. 114 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 213).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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2. | | SOLLERO, B. P.; OLIVEIRA, K. da S. V.; SANTIAGO, G. G.; CARDOSO, F. F. Seleção de marcadores a partir do estudo de associação genômica ampla para resistência ao carrapato em bovinos das raças Hereford e Braford. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 11., 2015, Santa Maria, RS. Melhoramento animal da academia ao campo: uma parceria em construção: anais. Santa Maria, RS: SBMA: UFSM, 2015.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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4. | | SANTIAGO, G. G.; SIQUEIRA, F.; FLORES, F. C.; SILVA, L. O. C. da; FARIA, F. J. C. Diferentes matrizes de parentesco para predição de valores genéticos. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 12., 2016, Campo Grande, MS. Anais... Brasília, DF: Embrapa Gado de Corte, 2016. 112 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 227). Comissão organizadora: Marta Pereira da Silva - Coordenadora; Mateus Figueiredo Santos - Vice-Coordenador; Rodrigo Carvalho Alva - Secretário Executivo e Editoração.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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5. | | CECCON, T. B.; BLECHA, I. M. Z.; SIQUEIRA, F.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SANTIAGO, G. G. Determinação das frequências alélicas e genotípicas do SNP GH/AluI em bovinos de corte. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 8., 2012, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2012. 2 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 198).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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6. | | OLIVEIRA, M. D. S. de; TOSI, H.; SAMPAIO, A. A. M.; VIEIRA, P. de F.; SANTIAGO, G. Avaliação de duas variedades de cana-de-açúcar submetidas a diferentes tempos de armazenamento. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 34, n. 8, p. 1435-42, ago. 1999 Título em inglês: Evaluation of two varieties of sugar cane submitted to different storage times.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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7. | | ROMERO, A. R. S.; SIQUEIRA, F.; SANTIAGO, G. G.; REGITANO, L. C. de A.; GRISOLIA, A. B. Prospecção de genes associados com características de interesse econômico em bovinos Canchim. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 12., 2016, Campo Grande, MS. Anais... Brasília, DF: Embrapa Gado de Corte, 2016. 112 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 227). Comissão organizadora: Marta Pereira da Silva - Coordenadora; Mateus Figueiredo Santos - Vice-Coordenador; Rodrigo Carvalho Alva - Secretário Executivo e Editoração.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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8. | | SOUSA, I. I.; SIQUEIRA, F.; FERREIRA, A. B. R.; SANTIAGO, G. G.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SOUZA JUNIOR, M. D.; FARIA, F. J. C. Análise funcional de genes associados com espessura de gordura subcutânea em bovinos Canchim. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 13., 2017, Campo Grande, MS. [Anais...] Brasília, DF: Embrapa, 2017. p. 42-43.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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9. | | SANTIAGO, G. G.; SIQUEIRA, F.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; FEIJO, G. L. D.; BLECHA, I. M. Z.; CARVALHO, T. D. de. Associação do polimorfismo GH/AluI com características de crescimento e de carcaça em bovinos de corte. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012. 3 p. SBMA 2012. 3 p. SBMA 2012.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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10. | | SANTIAGO, G. G.; SIQUEIRA, F.; BOISON, S. A.; CARDOSO, F. F.; REGITANO, L. C. de A.; TORRES JUNIOR, R. A. de A. Acurácia de imputação de genótipos para estudos de associação genômica em bovinos da raça Canchim. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 10., 2014, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2014. p. 52-53. 2 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 208). Comissão organizadora: Grácia Maria Soares Rosinha, Alexandra Rocha de Oliveir, Rodrigo Carvalho Alva.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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13. | | NOVAES, A. P. de; SIMOES, M. L.; MARTIN-NETO, L.; CRUVINEL, P. E.; SANTANA, A.; NOVOTNY, E. H.; SANTIAGO, G.; NOGUEIRA, A. R. de A. Utilização de uma fossa séptica biodigestora para melhoria do saneamento rural e desenvolvimento da agricultura orgânica São Carlos,SP: Embrapa Instrumentação Agropecuária, 2002. 5 p. (Embrapa Instrumentação Agropecuária. Comunicado Técnico, 46)Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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14. | | NOVAES, A. P. de; SIMOES, M. L.; MARTIN-NETO, L.; CRUVINEL, P. E.; SANTANA, A.; NOVOTNY, E. H.; SANTIAGO, G.; NOGUEIRA, A. R. de A. Utilização de uma fossa séptica biogestora para melhoria do saneamento rural e desenvolvimento da agricultura orgânica. São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação Agropecuária, 2002. 5 p. (Embrapa Instrumentação. Comunicado Tecnico, 46).Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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15. | | SOUSA, I. I.; BLECHA, I. M. Z.; MACIEL, S. da S.; FERREIRA, A. B. R.; FEIJO, G. L. D.; FAVERO, R.; SANTIAGO, G. G.; SIQUEIRA, F. Estudo de associação de polimorfismos nos genes LEP e TG com características de qualidade de carne e carcaça em bovinos da raça Canchim. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 27.; FÓRUM DE ENTIDADES DE ZOOTECNISTAS, 45.; FÓRUM DE COORDENADORES DE CURSOS DE ZOOTENCIA, 12.; SEMINÁRIO NACIONAL DE ENSINO EM ZOOTECNIA, 7.; REUNIÃO NACIONAL DE SINDICATO DE ZOOTECNIA, 5.; FÓRUM DE EMPRESAS JUNIORES DE ZOOTECNIA, 5.; FÓRUM DE ESTUDANTES DE ZOOTECNIA, 13, 2017, Santos. Santos: Associação Brasileira de Zootecnia, 2017.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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16. | | SOUSA, I. I.; BLECHA, I. M. Z.; MACIEL, S. da S.; FERREIRA, A. B. R.; FEIJO, G. L. D.; SANTIAGO, G. G.; FAVERO, R.; SIQUEIRA, F. Genotipagem por PCR-RFLP de um polimorfismo no gene CAST em bovinos da raça Canchim. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 27.; FÓRUM DE ENTIDADES DE ZOOTECNISTAS, 45.; FÓRUM DE COORDENADORES DE CURSOS DE ZOOTENCIA, 12.; SEMINÁRIO NACIONAL DE ENSINO EM ZOOTECNIA, 7.; REUNIÃO NACIONAL DE SINDICATO DE ZOOTECNIA, 5.; FÓRUM DE EMPRESAS JUNIORES DE ZOOTECNIA, 5.; FÓRUM DE ESTUDANTES DE ZOOTECNIA, 13, 2017, Santos. Santos: Associação Brasileira de Zootecnia, 2017.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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17. | | ROMERO, A. R. da S.; NASCIMENTO, A. V.; SANTIAGO, G. G.; SIQUEIRA, F.; REGITANO, L. C. de A.; GRISOLIA, A. B. Genômica para prospecção de genes associados com característica de umbigo em bovinos Canchim. In: ENCONTRO DE ENSINO, PESQUISA E EXTENSÃO, 3., 2016. Dourados. O Impacto da universidade na sociedade. anais... Dourados: UFGD, 2016.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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18. | | NOVAES, A. P. de; SIMÕES, M. L.; INAMASU, R. Y.; JESUS, E. A. P. de; MARTIN-NETO, L.; SANTIAGO, G.; SILVA, W. T. L. da. Saneamento básico na área rural. In: SPADOTTO, C.A.; RIBEIRO, W.C. (Ed.). Gestão de resíduos na agricultura e agroindústria. Botucatu: FEPAF, 2006. 262-269.Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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19. | | XAVIER, S. R.; SIQUEIRA, F.; BLECHA, I. M. Z.; FERREIRA, A. B. R.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SANTIAGO, G. G.; FERRAZ FILHO, P. B. Polimorfismos de nucleotídeos únicos no gene da miostatina em bovinos da raça Senepol. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 9., 2013, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2013. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 204). Comissão organizadora: Denise Baptaglin Montagner, Grácia Maria Soares Rosinha, Rodrigo Carvalho AlvaTipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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20. | | BLECHA, I. M. Z.; SIQUEIRA, F.; FERREIRA, A. B. R.; FEIJO, G. L. D.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SANTIAGO, G. G.; FERRAZ, A. L. J. Prospecção e validação de polimorfismos de nucleotídeo único nos genes bovinos FABP3 e FABP4 In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 9., 2013, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2013. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 204). Comissão organizadora: Denise Baptaglin Montagner, Grácia Maria Soares Rosinha, Rodrigo Carvalho Alva.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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