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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
23/01/2023 |
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Data da última atualização: |
24/11/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
SANSALONI, C. P. |
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Título: |
Desenvolvimento, caracterização e mapeamento de microssatélites de tetra e pentanucleotídeos em Eucalyptus spp. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
2008. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Dissertação (Mestrado em Biologia Molecular) - Universidade de Brasília, DF. Orientador: Dario Grattapaglia, Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Conteúdo: |
Marcadores microssatélites permitem o gerenciamento de variabilidade genética, proteção varietal e identificação individual em populações de melhoramento e produção de Eucalyptus. A análise de locos microssatélites em sistemas ?multiplex? (i.e. vários locos analisados simultaneamente) vem sendo realizada tradicionalmente com microssatélites dinucleotídeos cujos alelos diferem em apenas dois pares de bases. Entretanto o padrão de qualidade recomendado internacionalmente para a investigação genética forense estabeleceu a utilização exclusiva de microssatélites baseados em repetições de tetra ou pentanucleotídeos. A maior diferença de tamanho entre os alelos e a minimização de artefatos de amplificação permitem uma interpretação significativamente mais robusta de genótipos em comparação a dinucleotídeos e conseqüentemente uma fácil e confiável comparação de perfis genotípicos entre laboratórios. O objetivo deste trabalho foi, portanto, o desenvolvimento, caracterização e mapeamento genético de uma nova categoria de microssatélites para espécies de Eucalyptus, baseados em repetições de tetra e pentanucleotídeos. Um banco de dados de 18.510 mil seqüências genômicas derivadas de clones de cromossomos artificiais de bactérias (BAC) de E. grandis totalizando 9,6 mega pares de bases foram mineradas para repetições de tetra e pentanucleotídeos e pares de iniciadores desenhados automaticamente para flanquear repetições totalizando dez ou mais pb. Dos 304 e 196 pares de iniciadores desenhados para a amplificação de locos tetra e pentanucleotídeos perfeitos, respectivamente, foram selecionados 80 locos de tetra e 30 de pentanucleotídeos para estudos detalhados. Após uma triagem em eletroforese de alta resolução foram selecionados 22 locos tetra e 10 pentanucleotídeos os quais foram geneticamente mapeados e caracterizados para número de alelos, heterozigosidade esperada (He) e observada (Ho), probabilidade de identidade (PI), probabilidade de exclusão de paternidade (PE) e conteúdo de informação polimórfica (PIC) em amostras populacionais de seis procedências das três principais espécies plantadas de Eucalyptus no mundo (E. grandis, E. globulus e E. urophylla). Os locos tetra e pentanucleotídeos selecionados revelaram um conteúdo informativo inferior àquele de dinucleotídeos, embora adequado para discriminar indivíduos e determinar parentesco com elevada precisão. Ao avaliar a capacidade efetiva de discriminação individual em um grupo de 46 clones elite plantados comercialmente 5 locos tetra ou pentanucleotídeos foram suficientes para identificar unicamente todos os clones. A herança mendeliana de todos os 32 locos selecionados foi confirmada. Destes, 23 locos apresentaram uma configuração de segregação que permitiu o seu mapeamento genético em 8 dos 11 grupos de ligação com base em mapas de referência de duas famílias de E. grandis x E. urophylla. Dois sistemas multiplex, cada um com 7 locos selecionados foram testados com sucesso disponibilizando assim os primeiros sistemas de análise genética de alta precisão para espécies de Eucalyptus, passíveis de adoção em escala internacional para a análise genética de clones e populações. MenosMarcadores microssatélites permitem o gerenciamento de variabilidade genética, proteção varietal e identificação individual em populações de melhoramento e produção de Eucalyptus. A análise de locos microssatélites em sistemas ?multiplex? (i.e. vários locos analisados simultaneamente) vem sendo realizada tradicionalmente com microssatélites dinucleotídeos cujos alelos diferem em apenas dois pares de bases. Entretanto o padrão de qualidade recomendado internacionalmente para a investigação genética forense estabeleceu a utilização exclusiva de microssatélites baseados em repetições de tetra ou pentanucleotídeos. A maior diferença de tamanho entre os alelos e a minimização de artefatos de amplificação permitem uma interpretação significativamente mais robusta de genótipos em comparação a dinucleotídeos e conseqüentemente uma fácil e confiável comparação de perfis genotípicos entre laboratórios. O objetivo deste trabalho foi, portanto, o desenvolvimento, caracterização e mapeamento genético de uma nova categoria de microssatélites para espécies de Eucalyptus, baseados em repetições de tetra e pentanucleotídeos. Um banco de dados de 18.510 mil seqüências genômicas derivadas de clones de cromossomos artificiais de bactérias (BAC) de E. grandis totalizando 9,6 mega pares de bases foram mineradas para repetições de tetra e pentanucleotídeos e pares de iniciadores desenhados automaticamente para flanquear repetições totalizando dez ou mais pb. Dos 304 e 196 pares de iniciadores dese... Mostrar Tudo |
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Thesaurus Nal: |
Eucalyptus. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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650 $aEucalyptus
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 33 | |
| 4. |  | SANSALONI, C. P.; MAMANI, E. M.; PAPPAS, G. J.; GRATTAPAGLIA, D. Análise populacional e mapeamento genético de microssatélites tetra e pentanucleotídeos em espécies de Eucalyptus. In : ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 12., 2007, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. p. 158.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 5. | | SANSALONI, C. P.; PETROLI, C. D.; CARLING, J.; ANDRZEJ, K.; GRATTAPAGLIA, D. DArT (Diversity Array Technology): genotipagem de alto desempenho em microarranjos para estudos de diversidade genética e filogenia em Eucalyptus. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 13., 2008, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. Resumo 126. p.176.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 6. | | SANTOS, L. P.; SANSALONI, C. P.; FARIA, D. A.; PAPPAS, M. R.; GRATTAPAGLIA, D. Desenvolvimento de marcadores microssatélites baseados em tetra, penta e hexanucleotídeos para análise genética de espécies de Eucalyptus. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 13., 2008, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. Resumo 127. p.177.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 7. | | RESENDE, M. D. V. de; RESENDE JUNIOR, M. F. R.; AGUIAR, A. M.; ABAD, J. I. M.; MISSIAGGIA, A. A.; SANSALONI, C. P.; PETROLI, C. D.; GRATTAPAGLIA, D. Computação da Seleção Genômica Ampla (GWS). Colombo: Embrapa Florestas, 2010. CD-ROM. (Embrapa Florestas. Documentos, 210).| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 8. | | STEANE, D. A.; MYBURG, A. A.; KILIAN, A.; CARLING, J.; HUTTNER, E.; SANSALONI, C. P.; PETROLI, C. D.; GRATTAPAGLIA, D.; NICOLLE, D.; VAILLANCOURT, R. E. Dart markers herald a new era of eucalyptus phylogenomics. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 17., 2009, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2009. W192| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 9. | | RESENDE JUNIOR, M.; RESENDE, M. D. V. de; MUNOZ, P. R.; TAKAHASHI, E. K.; PETROLI, C.; SANSALONI, C.; KIRST, M.; GRATTAPAGLIA, D. Increase in efficiency of genomic selection sing epistatic interactions and detection of candidate genes for rust resistance in Eucalyptus. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 21., 2013, San Diego. Abstracts... Jersey City: Scherago International, 2013. W287.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 10. | | RESENDE JUNIOR, M.; RESENDE, M. D. V. de; MUNOZ, P. R.; TAKAHASHI, E. K.; PETROLI, C.; SANSALONI, C.; KIRST, M.; GRATTAPAGLIA, D. Increase in efficiency of genomic selection sing epistatic interactions and detection of candidate genes for rust resistance in Eucalyptus. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 21., 2013, San Diego. Abstracts... Jersey City: Scherago International, 2013. W287.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 11. | | GRATTAPAGLIA, D.; RESENDE, M. D. V. de; RESENDE, M. R.; SANSALONI, C. P.; PETROLI, C. D.; MISSIAGGIA, A. A.; TAKAHASHI, E. K.; ZAMPROGNO, K. C.; KILIAN, A. Genomic selection for growth traits in Eucalyptus: accuracy within and across breeding populations. In: IUFRO TREE BIOTECHNOLOGY CONFERENCE, 2011, Arraial d'Ajuda. From genomes do integration and delivery: extended abstracts proceedings. [S.l.]: Embrapa: Veracel: IUFRO, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 12. | | GRATTAPAGLIA, D.; RESENDE, M. D. V. de; RESENDE, M. R.; SANSALONI, C. P.; PETROLI, C. D.; MISSIAGGIA, A. A.; TAKAHASHI, E. K.; ZAMPROGNO, K. C.; KILIAN, A. Genomic selection for growth traits in Eucalyptus: accuracy within and across breeding populations. In: IUFRO TREE BIOTECHNOLOGY CONFERENCE, 2011, Arraial d'Ajuda. From genomes do integration and delivery: extended abstracts proceedings. [S.l.]: Embrapa: Veracel: IUFRO, 2011. 1 CD-ROM| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 13. | | SANSALONI, C. P.; PETROLI, C. D.; STEANE, D. A.; VAILLANCOURT, R. E.; CARLING, J.; MYBURG, A. A.; RESENDE, M. D. V. de; WENZL, P.; KILIAN, A.; GRATTAPAGLIA, D. High-density diversity arrays technology (DArT) genotyping for cost-effective mapping and genome-wide selection in Eucalyptus. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 17., 2009, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2009. Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 14. | | SANSALONI, C. P.; PETROLI, C. D.; CARLING, J.; HUDSON, C.; STEANE, D. A.; MYBURG, A. M.; GRATTAPAGLIA, D.; VAILLANCOURT, R. E.; KILIAN, A. A high-density Diversity Arrays Technology (DArT) microarray for genome-wide genotyping in Eucalyptus. Plant Methods,v.6, n.16, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 15. | | GRATTAPAGLIA, D.; RESENDE, M. D. V. de; RESENDE, M. F. R.; SANSALONI, C. P.; PETROLI, C. D.; MISSIAGGIA, A. A.; TAKAHASHI, E. K.; ZAMPROGNO, K. C.; KILIAN, A. High realized accuracies of genomic selection for volume growth and wood density in Eucalyptus breeding populations with contrasting effective sizes. In: PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 19., 2011, San Diego. Conference... [S.l.]: International Plant & Animal Genome, 2011. Abstract. W235: Forest Trees.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 16. | | GRATTAPAGLIA, D.; RESENDE, M. D. V. de; RESENDE, M. F. R.; SANSALONI, C. P.; PETROLI, C. D.; MISSIAGGIA, A. A.; TAKAHASHI, E. K.; ZAMPROGNO, K. C.; KILIAN, A. High realized accuracies of genomic selection for volume growth and wood density in Eucalyptus breeding populations with contrasting effective sizes. In: PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 19., 2011, San Diego. Conference... [S.l.]: International Plant & Animal Genome, 2011. W235: Forest Trees.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 17. | | GARCIA, M.; VILLALBA, P.; ACUÑA, C.; OBERSCHELP, J.; HARRAND, L.; SURENCISKI, M.; MARTÍNEZ, M.; PETROLI, C.; SANSALONI, C.; FARIA, D.; GRATTAPAGLIA, D.; POLTRI, S. M. A genetic linkage map for a Full sib population of Eucalyptus grandis using SSR, DArT, CG-SSR and EST-SSR markers. BMC Proceedings, v. 5, 2011 Edição dos resumos do IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration and Delivery
Arraial d'Ajuda, 26 June - 2 July 2011.
Poster.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 18. | | GRATTAPAGLIA, D.; SANSALONI, C.; PETROLI, C.; RESENDE JÚNIOR, M. F.; FARIA, D.; MISSIAGGIA, A. A.; TAKAHASHI. E. K.; ZAMPROGNO, K.; KILIAN, A.; RESENDE, M. D. V. de. Realized accuracies of Genomic Selection for volume growth in tropical Eucalyptus: marker assisted selection coming to reality in forest trees. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Resumos... [Curitiba]: UFPR, 2010. p. 192.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 19. | | STEANE, D. A.; NICOLLE, D.; SANSALONI, C. P.; PETROLI, C. D.; CARLING, J.; KILIAN, A.; MYBURG, A. A.; GRATTAPAGLIA, D.; VAILLANCOURT, R. E. Population genetic analysis and phylogeny reconstruction in Eucalyptus (Myrtaceae) using high-throughput, genome-wide genotyping. Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 59, p. 206-224, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 20. | | GRATTAPAGLIA, D.; RESENDE, M. D. V. de; RESENDE JUNIOR, M. F. R.; SANSALONI, C. P.; PETROLI, C. D.; MISSIAGGIA, A. A.; TAKAHASHI, E. K.; ZAMPROGNO, K. C.; KILIAN, A. Breeding by genomic selection: capturing the missing heritability of complex traits in forest trees. In: NEW PHYTOLOGIST SYMPOSIUM, 26., 2011, Nancy. Bioenergy trees. [S.l.]: INRA, 2011. p. 9.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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