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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
04/09/2015 |
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Data da última atualização: |
16/03/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
FONSECA, F. C. de A.; FIRMINO, A. A. P.; MACEDO. L. L. P. de; COELHO, R. R.; SOUSA JÚNIOR, J. D. A. de; SILVA JUNIOR, O. B.; TOGAWA, R. C.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; GÓIS, L. A. B. de; SILVA, M. C. M. da; SA, M. F. G. de. |
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Afiliação: |
FERNANDO CAMPOS DE ASSIS FONSECA, UnB; ALEXANDRE AUGUSTO PEREIRA FIRMINO, UnB; LEONARDO LIMA PEPINO DE MACEDO, UnB; ROBERTA RAMOS COELHO; JOSÉ DIJAIR ANTONINO DE SOUSA JÚNIOR, UnB; ORZENIL BONFIM SILVA-JUNIOR, UnB; ROBERTO COITI TOGAWA, CENARGEN; GEORGIOS JOANNIS PAPPAS JUNIOR, Unb; LUIZ AVELAR BRANDÃO DE GÓIS, USINA TRUNFO, ALAGOAS; MARIA CRISTINA MATTAR DA SILVA, CENARGEN; MARIA FATIMA GROSSI DE SA, CENARGEN. |
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Título: |
Sugarcane giant borer transcriptome analysis and identification of genes related to digestion. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
Plos One, fev., 2015. |
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DOI: |
10.1371/journal.pone.0118231 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Sugarcane is a widely cultivated plant that serves primarily as a source of sugar and ethanol. Its annual yield can be significantly reduced by the action of several insect pests including the sugarcane giant borer (Telchin licus licus), a lepidopteran that presents a long life cycle and which efforts to control it using pesticides have been inefficient. Although its economical relevance, only a few DNA sequences are available for this species in the Gen-Bank. Pyrosequencing technology was used to investigate the transcriptome of several developmental stages of the insect. To maximize transcript diversity, a pool of total RNA was extracted from whole body insects and used to construct a normalized cDNA database. Sequencing produced over 650,000 reads, which were de novo assembled to generate a reference library of 23,824 contigs. After quality score and annotation, 43% of the contigs had at least one BLAST hit against the NCBI non-redundant database, and 40% showed similarities with the lepidopteran Bombyx mori. In a further analysis, we conducted a comparison with Manduca sexta midgut sequences to identify transcripts of genes involved in digestion. Of these transcripts, many presented an expansion or depletion in gene number, compared to B. mori genome. From the sugarcane giant borer (SGB) transcriptome, a of aminopeptidase N (APN) cDNAs were characterized based on homology to those reported as Cry toxin receptors. This is the first report that provides a large-scale EST database for the species. Transcriptome analysis will certainly be useful to identify novel developmental genes, to better understand the insect?s biology and to guide the development of new strategies for insect-pest control. MenosSugarcane is a widely cultivated plant that serves primarily as a source of sugar and ethanol. Its annual yield can be significantly reduced by the action of several insect pests including the sugarcane giant borer (Telchin licus licus), a lepidopteran that presents a long life cycle and which efforts to control it using pesticides have been inefficient. Although its economical relevance, only a few DNA sequences are available for this species in the Gen-Bank. Pyrosequencing technology was used to investigate the transcriptome of several developmental stages of the insect. To maximize transcript diversity, a pool of total RNA was extracted from whole body insects and used to construct a normalized cDNA database. Sequencing produced over 650,000 reads, which were de novo assembled to generate a reference library of 23,824 contigs. After quality score and annotation, 43% of the contigs had at least one BLAST hit against the NCBI non-redundant database, and 40% showed similarities with the lepidopteran Bombyx mori. In a further analysis, we conducted a comparison with Manduca sexta midgut sequences to identify transcripts of genes involved in digestion. Of these transcripts, many presented an expansion or depletion in gene number, compared to B. mori genome. From the sugarcane giant borer (SGB) transcriptome, a of aminopeptidase N (APN) cDNAs were characterized based on homology to those reported as Cry toxin receptors. This is the first report that provides a large-scale EST d... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Broca Gigante; Controle Biológico; Praga. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/129096/1/journal.pone.0118231.pdf
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Marc: |
LEADER 02579naa a2200289 a 4500
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520 $aSugarcane is a widely cultivated plant that serves primarily as a source of sugar and ethanol. Its annual yield can be significantly reduced by the action of several insect pests including the sugarcane giant borer (Telchin licus licus), a lepidopteran that presents a long life cycle and which efforts to control it using pesticides have been inefficient. Although its economical relevance, only a few DNA sequences are available for this species in the Gen-Bank. Pyrosequencing technology was used to investigate the transcriptome of several developmental stages of the insect. To maximize transcript diversity, a pool of total RNA was extracted from whole body insects and used to construct a normalized cDNA database. Sequencing produced over 650,000 reads, which were de novo assembled to generate a reference library of 23,824 contigs. After quality score and annotation, 43% of the contigs had at least one BLAST hit against the NCBI non-redundant database, and 40% showed similarities with the lepidopteran Bombyx mori. In a further analysis, we conducted a comparison with Manduca sexta midgut sequences to identify transcripts of genes involved in digestion. Of these transcripts, many presented an expansion or depletion in gene number, compared to B. mori genome. From the sugarcane giant borer (SGB) transcriptome, a of aminopeptidase N (APN) cDNAs were characterized based on homology to those reported as Cry toxin receptors. This is the first report that provides a large-scale EST database for the species. Transcriptome analysis will certainly be useful to identify novel developmental genes, to better understand the insect?s biology and to guide the development of new strategies for insect-pest control.
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Semiárido. |
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| 222. | | RIBEIRO, T. P.; LOURENCO, I. T.; MELO, B. P. de; MORGANTE, C. V.; SALLES FILHO, A.; LINS, C. B. J.; FERREIRA, G. F.; MELLO, G. N.; MACEDO, L. L. P. de; LUCENA, W. A.; SILVA, M. C. M. da; OLIVEIRA‑NETO, O. B.; SA, M. F. G. de. Improved cotton transformation protocol mediated by Agrobacterium and biolistic combined-methods. Planta, v. 254, 20, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 226. | | BARBOSA, A. E. A. de D.; FRAGOSO, R. da R.; SOUZA, D. dos S. de L.; FREIRE, E.; OLIVEIRA NETO, O. B. de; VIANA, A. A. B.; TOGAWA, R. C.; GUIMARÃES, L. M.; MARTINS, N. F.; CIA, E.; FERNANDEZ, D.; LIMA, L. M. de; SILVA, M. C. M. da; ROCHA, T. L.; SA, M. F. G. de. Differentially expressed genes in cotton plant genotypes infected with Meloidogyne incognita. Plant Science, v. 177, p. 492-497, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 227. | | COSTA, L. S. de L.; ALVES, N. S. de F.; PINTO, C. E. M.; FLORENTINO, L. H.; MELO, B. P. de; MOREIRA, V. J. V.; SÁ, M. E. L. de; ARRAES, F. B. M.; RECH FILHO, E. L.; MORGANTE, C. V.; SA, M. F. G. de. Depleção do quadro de leitura upstream como nova estratégia para manipular a tradução de gmpr10 usando crispr/cas9 para aumentar a tolerância da soja a fitonematoides. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 8, 2023, Florianópolis, SC. Anais... Florianópolis: SBG, 2023. p. 131.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 228. | | COSTA, L. S. de L.; ALVES, N. S. de F.; PINTO, C. E. M.; FLORENTINO, L. H.; MELO, B. P. de; MOREIRA, V. J. V.; SÁ, M. E. L. de; ARRAES, F. B. M.; RECH FILHO, E. L.; MORGANTE, C. V.; SA, M. F. G. de. Depleção do quadro de leitura upstream como nova estratégia para manipular a tradução de gmpr10 usando crispr/cas9 para aumentar a tolerância da soja a fitonematoides. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 8, 2023, Florianópolis, SC. Anais... Florianópolis: SBG, 2023. p. 131.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 235. | | RIBEIRO, T. P.; VASQUEZ, D. D. N.; MACEDO, L. L. P. de; LOURENCO, I. T.; VALENÇA, D. C.; OLIVEIRA-NETO, O. B.; PAES-DE-MELO, B.; RODRIGUES-SILVA, P. L.; FIRMINO, A. A. P.; BASSO, M. F.; LINS, C. B. J.; NEVES, M. R.; MOURA, S. M.; TRIPODE, B. M. D.; MIRANDA, J. E.; SILVA, M. C. M. da; SA, M. F. G. de. Stabilized double-stranded RNA strategy improves cotton resistance to CBW (Anthonomus grandis). International Journal of Molecular Sciences, v. 23, 2022. 13713. Na publicação: Leonardo L. P. Macedo; Isabela T. Lourenço-Tessutti; Maria F. Grossi-de-Sa.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 236. | | CRAVEIRO, K. I. C.; GOMES JÚNIOR, J. E.; SILVA, M. C. M. da; MACEDO, L. L. P.; LUCENA, W. A.; SILVA, M. S.; SOUZA JÚNIOR, J. D. A. de; OLIVEIRA, G. R.; MAGALHÃES, M. T. Q. de; SANTIAGO, A. D.; SA, M. F. G. de. Variant cry1Ia toxins generated by DNA shuffling are active against sugarcane giant borer. Journal of Biotechnology, n. 145, p. 215-221, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 237. | | FONSECA, F. C. de A.; ANTONINO, J. D.; MOURA, S. M. de; RODRIGUES-SILVA, P. L.; MACEDO, L. L. P. de; GOMES JÚNIOR, J. E.; LOURENCO, I. T.; LUCENA, W. A.; MORGANTE, C. V.; RIBEIRO, T. P.; MONNERAT, R. G.; RODRIGUES, M. A.; CUCCOVIA, I. M.; SILVA, M. C. M. da; SA, M. F. G. de. In vivo and in silico comparison analyses of Cry toxin activities toward the sugarcane giant borer. Bulletin of Entomological Research, v. 113, n. 3, p. 335-346, 2023. Na publicação: Leonardo Lima Pepino Macedo; Isabela Tristan Lourenço-Tessuti; Carolina Viana Morgante; Maria Cristina Mattar Silva; Maria Fatima Grossi-de-Sa.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Semiárido. |
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| 238. | | LISEI-DE-SÁ, M. e; RODRIGUES‑SILVA, P. L.; MORGANTE, C. V.; MELO, B. P. de; LOURENCO, I. T.; ARRAES, F. B. M.; SOUSA, J. P. A.; GALBIERI, R.; AMORIM, R. M. S.; LINS, C. B. J. de; MACEDO, L. L. P. de; MOREIRA, V. J.; FERREIRA, G. F.; RIBEIRO, T. P.; FRAGOSO, R. da R.; SILVA, M. C. M. da; ALMEIDA-ENGLER, J. de; SA, M. F. G. de. Pyramiding dsRNAs increases phytonematode tolerance in cotton plants. Planta, v. 254, 2021. Na publicação: Isabela T. Lourenço-Tessutti; Leonardo L. P. Macedo; Rodrigo R. Fragoso; Maria C. M. Silva; Maria F. Grossi-de-Sa.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Semiárido. |
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| 239. | | FREITAS‑ALVES, N. S.; MOREIRA‑PINTO, C. E.; ARRAES, F. B. M.; COSTA, L. S. de L.; ABREU, R. A. de; MOREIRA, V. J. V.; LOURENCO, I. T.; PINHEIRO, D. H.; LISEI‑DE‑SA, M. E.; PAES‑DE‑MELO, B.; PEREIRA, B. M.; GUIMARAES, P. M.; BRASILEIRO, A. C. M.; ALMEIDA‑ENGLER, J. de; SOCCOL, C. R.; MORGANTE, C. V.; BASSO, M. F.; SA, M. F. G. de. An ex vitro hairy root system from petioles of detached soybean leaves for in planta screening of target genes and CRISPR strategies associated with nematode bioassays. Planta, v. 259, 23, 2024. Na publicação: Isabela T. Lourenço‑Tessutti; Maria F. Grossi‑de‑Sa.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 240. | | FRAGOSO, R. da R.; ARRAES, F. B. M.; LOURENCO, I. T.; MIRANDA, V. J.; BASSO, M. F.; FERREIRA, A. V. J.; VIANA, A. A. B.; LINS, C. B. J.; LINS, P. C.; MOURA, S. M.; BATISTA, J. A. N.; SILVA, M. C. M. da; ENGLER, G.; MORGANTE, C. V.; LISEI-DE-SA, M. E.; VASQUES, R. M.; ALMEIDA-ENGLER, J. de; SA, M. F. G. de. Functional characterization of the pUceS8.3 promoter and its potential use for ectopic gene overexpression. Planta, v. 256, n. 4, 2022. Na publicação: Rodrigo Rocha Fragoso; Isabela Tristan Lourenço-Tessutti; Maria Cristina Mattar Silva; Maria Fatima Grossi-de-Sa.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Semiárido. |
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