| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
|
Data corrente: |
18/03/2024 |
|
Data da última atualização: |
18/03/2024 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
NICIURA, S. C. M.; SANCHES, G. M. |
|
Afiliação: |
SIMONE CRISTINA MEO NICIURA, CPPSE; GUILHERME MARTINELI SANCHES, Universidade de São Paulo. |
|
Título: |
Machine learning prediction of multiple anthelmintic resistance and gastrointestinal nematode control in sheep flocks. |
|
Ano de publicação: |
2024 |
|
Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária, v. 33, n. 1, jan./mar. 2024. |
|
DOI: |
10.1590/S1984-29612024014 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
The high prevalence of Haemonchus contortus and its anthelmintic resistance have affected sheep production worldwide. Machine learning approaches are able to investigate the complex relationships among the factors involved in resistance. Classification trees were built to predict multidrug resistance from 36 management practices in 27 sheep flocks. Resistance to five anthelmintics was assessed using a fecal egg count reduction test (FECRT), and 20 flocks with FECRT < 80% for four or five anthelmintics were considered resistant. The data were randomly split into training (75%) and test (25%) sets, resampled 1,000 times, and the classification trees were generated for the training data. Of the 1,000 trees, 24 (2.4%) showed 100% accuracy, sensitivity, and specificity in predicting a flock as resistant or susceptible for the test data. Forage species was a split common to all 24 trees, and the most frequent trees (12/24) were split by forage species, grazing pasture area, and fecal examination. The farming system, Suffolk sheep breed, and anthelmintic choice criteria were practices highlighted in the other trees. These management practices can be used to predict the anthelmintic resistance status and guide measures for gastrointestinal nematode control in sheep flocks. |
|
Palavras-Chave: |
Machine learning; Multidrug resistance; Random forest. |
|
Thesaurus Nal: |
Carts; Gastrointestinal nematodes. |
|
Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1162930/1/MachineLearningPrediction.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 01977naa a2200205 a 4500
001 2162930
005 2024-03-18
008 2024 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1590/S1984-29612024014$2DOI
100 1 $aNICIURA, S. C. M.
245 $aMachine learning prediction of multiple anthelmintic resistance and gastrointestinal nematode control in sheep flocks.$h[electronic resource]
260 $c2024
520 $aThe high prevalence of Haemonchus contortus and its anthelmintic resistance have affected sheep production worldwide. Machine learning approaches are able to investigate the complex relationships among the factors involved in resistance. Classification trees were built to predict multidrug resistance from 36 management practices in 27 sheep flocks. Resistance to five anthelmintics was assessed using a fecal egg count reduction test (FECRT), and 20 flocks with FECRT < 80% for four or five anthelmintics were considered resistant. The data were randomly split into training (75%) and test (25%) sets, resampled 1,000 times, and the classification trees were generated for the training data. Of the 1,000 trees, 24 (2.4%) showed 100% accuracy, sensitivity, and specificity in predicting a flock as resistant or susceptible for the test data. Forage species was a split common to all 24 trees, and the most frequent trees (12/24) were split by forage species, grazing pasture area, and fecal examination. The farming system, Suffolk sheep breed, and anthelmintic choice criteria were practices highlighted in the other trees. These management practices can be used to predict the anthelmintic resistance status and guide measures for gastrointestinal nematode control in sheep flocks.
650 $aCarts
650 $aGastrointestinal nematodes
653 $aMachine learning
653 $aMultidrug resistance
653 $aRandom forest
700 1 $aSANCHES, G. M.
773 $tRevista Brasileira de Parasitologia Veterinária$gv. 33, n. 1, jan./mar. 2024.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 645 | |
| 3. |  | NICIURA, S. C. M. Genomic imprinting e suas implicações em produção animal. In: SIMPÓSIO DE BIOLOGIA MOLECULAR APLICADA À PRODUÇÃO ANIMAL, 1., 2007, São Carlos. São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste, 2007. v.1 p.52-66 1 CD-ROM Editado por Luciana Correia de Almeida Regitano, Simone C. Méo.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
|    |
| 6. | | NICIURA, S. C. M. Protocolos genotípicos para nematoides gastrintestinais. In: CHAGAS, A. C. de S.; NICIURA, S. C. M.; MOLENTO, M. B. (Ed.). Manual prático: metodologias de diagnóstico da resistências e de detecção de sustâncias ativas em parasitas de ruminantes. Brasília, DF: Embrapa Informação Tecnológica, 2011. p. 59-82.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| 8. | | MELLO, S. C. M. de. Recursos genéticos de microrganimos. In: ALBUQUERQUE, A. C. S.; SILVA, A. G. da (Ed.). Agricultura tropical: quatro décadas de inovações tecnológicas, institucionais e políticas. Brasília, DF: Embrapa Informação Tecnológica, 2008. Pt. 7. Cap. 3. v. 2. p. 679-700. il. Color.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 9. | | NICIURA, S. C. M.; THOLON, P. Absence of CpG observed/expected ratio depletion in Haemonchus contortus evidences a non-methylated genome. In: WORKSHOP ON OMICS STRATEGIES APPLIED TO LIVESTOCK SCIENCE, 1., 2017, Piracicaba, SP. Proceedings... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste, 2017. p. 21. (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 125) Editores: Luiz Lehmann Coutinho, ESALQ/USP; Luciana Correia de Almeida Regitano, Embrapa Pecuária Sudeste; Gerson Barreto Mourão, ESALQ/USP; Aline Silva Mello Cesar, ESALQ/USP; Bárbara Silva Vignato, FZEA/USP; Mirele Daiana Poleti,...| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| 13. | | MELO, D. F.; MELLO, S. C. M. Method for large-scale production of Dicyma pulvinata. In: CONGRESO LATINOAMERICANO DE MICROBIOLOGÍA, 18.; CONGRESO CHILENO DE MICROBIOLOGÍA, 28.; CONGRESO CHILENO DE MICROBIOLOGÍA E HIGIENE DE LOS ALIMENTOS, 3., 2006, Pucón, Chile. Resúmenes... Santiago, Chile: Sociedad de Microbiología de Chile, 2006. Posters. p. 159.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
|  |
| 14. | | MENEZES, J. E.; MARTINS, I.; MELLO, S. C. M. de. Avaliação da longevidade, pelo método castellani, dos isolados da coleção de fungos fitopatogênicos do Laboratório De Fitopatologia do Cenargen. In. CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Resumo. 618. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 16. | | CARVALHO FILHO, M. R.; MELLO, S. C. M. de. Avaliação de trichoderma spp. no controle de mancha foliar do eucalipto in vitro e esporulação em dois substratos sólidos. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 34, p. S64, 2009. Suplemento. Edição dos Resumos do XLII do Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Rio de Janeiro, RJ, 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 18. | | REIS, M. T.; MARTINS, I.; MELLO, S. C. M. de. Antagonismo de Trichoderma spp. contra Sclerotinia sclerotiorum. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 36, p. 491, 2011. Edição dos resumos do 44º Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2011, Bento Gonçalves. Resumo 1480.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| Registros recuperados : 645 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
