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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados. |
Data corrente: |
26/07/2011 |
Data da última atualização: |
05/12/2012 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SARDINA, M. T.; ROSA, A. J. de M.; DAVOLI, R.; BRAGLIA, S.; PORTOLANO, B. |
Afiliação: |
M. T. SARDINA, UNIVERSITY OF PALERMO; ARTUR JORDAO DE MAGALHAES ROSA, CPAC; R. DAVOLI, UNIVERSITY OF BOLOGNA; S. BRAGLIA, UNIVERSITY OF BOLOGNA; B. PORTOLANO, UNIVERSITY OF PALERMO. |
Título: |
Polymorphisms of beta-lactoglobulin promoter region in three sicilian goat breeds. |
Ano de publicação: |
2012 |
Fonte/Imprenta: |
Molecular Biology Reports, v. 39, n. 3, 2012. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Several beta-lactoglobulin (BLG) polymorphisms have been described within the proximal promoter region and coding region of the caprine gene, although no genetic variants affecting the protein amino acid composition and/or expression level have been characterized so far. Binding sites for several transcription factors (TFs) are present in the BLG promoter region. The aims of this work were to sequence the full-length promoter region of three Sicilian goat breeds in order to identify polymorphisms, analyze the identified haplotypes, search for differences between breeds for the presence of polymorphisms in this gene region, search for putative TFs binding sites, and check if polymorphisms lay within the identified TFs binding sites. The promoter region of BLG gene in Sicilian goat breeds showed high level of polymorphism due to the presence of 36 single nucleotide polymorphisms (SNPs). Association between polymorphic sites was computed within the whole sample analyzed and 18 haplotypes were inferred. Binding sites for three milk protein binding factors (MPBFs) and four nuclear factor-I (NF-I) were found within BLG promoter region based on the ovine sequence. The identification of some SNPs within TFs binding sites allowed hypothesizing the loss of TFs. Further studies are in progress to evaluate the effect of these mutations on binding affinity of TFs, the functional interaction of the TFs with the goat BLG promoter, and the relationship of the polymorphisms with BLG gene expression and milk production and composition. MenosSeveral beta-lactoglobulin (BLG) polymorphisms have been described within the proximal promoter region and coding region of the caprine gene, although no genetic variants affecting the protein amino acid composition and/or expression level have been characterized so far. Binding sites for several transcription factors (TFs) are present in the BLG promoter region. The aims of this work were to sequence the full-length promoter region of three Sicilian goat breeds in order to identify polymorphisms, analyze the identified haplotypes, search for differences between breeds for the presence of polymorphisms in this gene region, search for putative TFs binding sites, and check if polymorphisms lay within the identified TFs binding sites. The promoter region of BLG gene in Sicilian goat breeds showed high level of polymorphism due to the presence of 36 single nucleotide polymorphisms (SNPs). Association between polymorphic sites was computed within the whole sample analyzed and 18 haplotypes were inferred. Binding sites for three milk protein binding factors (MPBFs) and four nuclear factor-I (NF-I) were found within BLG promoter region based on the ovine sequence. The identification of some SNPs within TFs binding sites allowed hypothesizing the loss of TFs. Further studies are in progress to evaluate the effect of these mutations on binding affinity of TFs, the functional interaction of the TFs with the goat BLG promoter, and the relationship of the polymorphisms with BLG gene exp... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Beta lactoglobulina. |
Thesagro: |
Genética; Polimorfismo. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02105naa a2200205 a 4500 001 1896808 005 2012-12-05 008 2012 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aSARDINA, M. T. 245 $aPolymorphisms of beta-lactoglobulin promoter region in three sicilian goat breeds. 260 $c2012 520 $aSeveral beta-lactoglobulin (BLG) polymorphisms have been described within the proximal promoter region and coding region of the caprine gene, although no genetic variants affecting the protein amino acid composition and/or expression level have been characterized so far. Binding sites for several transcription factors (TFs) are present in the BLG promoter region. The aims of this work were to sequence the full-length promoter region of three Sicilian goat breeds in order to identify polymorphisms, analyze the identified haplotypes, search for differences between breeds for the presence of polymorphisms in this gene region, search for putative TFs binding sites, and check if polymorphisms lay within the identified TFs binding sites. The promoter region of BLG gene in Sicilian goat breeds showed high level of polymorphism due to the presence of 36 single nucleotide polymorphisms (SNPs). Association between polymorphic sites was computed within the whole sample analyzed and 18 haplotypes were inferred. Binding sites for three milk protein binding factors (MPBFs) and four nuclear factor-I (NF-I) were found within BLG promoter region based on the ovine sequence. The identification of some SNPs within TFs binding sites allowed hypothesizing the loss of TFs. Further studies are in progress to evaluate the effect of these mutations on binding affinity of TFs, the functional interaction of the TFs with the goat BLG promoter, and the relationship of the polymorphisms with BLG gene expression and milk production and composition. 650 $aGenética 650 $aPolimorfismo 653 $aBeta lactoglobulina 700 1 $aROSA, A. J. de M. 700 1 $aDAVOLI, R. 700 1 $aBRAGLIA, S. 700 1 $aPORTOLANO, B. 773 $tMolecular Biology Reports$gv. 39, n. 3, 2012.
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Registro original: |
Embrapa Cerrados (CPAC) |
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Biblioteca |
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Registros recuperados : 56 | |
2. | | LIMA NETO, A. F.; BOITEUX, L. S.; LOPES, C. A. Avaliação de acessos da coleção mundial de Solanum chacoense para resistência à murcha bacteriana. Summa Phytopathologica, Botucatu, v. 30, n. 1, p. 107, jan./mar. 2004. Resumo. Trabalho apresentado no 27º Congresso Paulista de Fitopatologia, 2003, Botucatu.Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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3. | | LIMA-NETO, A. F.; BOITEUX, L. S.; LOPES, C. A. Ausência de estabilidade da resistência de acessos de Solanum chacoense a isolados de Ralstonia soalnacearum. Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 25, n. 1, ago. 2007. S32. Suplemento. Trabalho apresentado no 47. Congresso Brasileiro de Olericultura, 4. Simpósio Brasileiro sobre Cucurbitáceas, 2007. Porto Seguro. Resumo 163.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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4. | | LIMA-NETO, A. F.; BOITEUX, L. S.; LOPES, C. A. Ausência de estabilidade da resistência de acessos de Solanum chacoense a isolados de Ralstonia solanacearum. Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 25, n. 1, ago. 2007. Suplemento 2. S32. Suplemento. Trabalho apresentado no 47. Congresso Brasileiro de Olericultura, 4. Simpósio Brasileiro sobre Cucurbitáceas, 2007. Porto Seguro.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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6. | | LIMA-NETO, A. F.; BOITEUX, L. S.; LOPES, C. A. Avaliação da coleção mundial de Solanum chacoense para resposta à murcha bacteriana (Ralstonia solanacearum). Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 25, n. 1, ago. 2007. Suplemento 2. S32. Suplemento. Trabalho apresentado no 47. Congresso Brasileiro de Olericultura, 4. Simpósio Brasileiro sobre Cucurbitáceas, 2007. Porto Seguro.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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7. | | LIMA-NETO, A. F.; BOITEUX, L. S.; LOPES, C. A. Avaliação da coleção mundial de Solanum chacoense para resposta à murcha bacteriana (Raltonia solanacearum). Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 25, n. 1, p. s32, ago. 2007. Suplemento. Resumo 164. Trabalho apresentado no 47. Congresso Brasileiro de Olericultura, 4. Simpósio Brasileiro sobre Cucurbitáceas, 2007. Porto Seguro.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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8. | | LIMA NETO, A. F.; LOPES, C. A.; BOITEUX, L. S. Produção de cultivares de batata em solo infestado com Ralstonia solanacearum. Summa Phytopathologica, Botucatu, v. 30, n. 1, p. 107, jan./mar. 2004. Resumo. Trabalho apresentado no 27º Congresso Paulista de Fitopatologia, 2003, Botucatu.Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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9. | | LIMA NETO, A. F.; BOITEUX, L. S.; COSTA, P. C. Reação de acessos de tomateiro a Erwinia carotovora no Estado do Tocantins. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 31, p. S271, ago. 2006. Suplemento. Resumo 0999. Trabalho apresentado no 39. Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2006, Salvador.Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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12. | | LAMY, A. C. M.; NASSER, L. C. B.; FREITAS, M. A.; LIMA-NETO, A. F. Qualidade sanitaria de sementes de flores importadas e disponiveis no mercado do Distrito Federal. Informativo ABRATES, Brasilia, v. 11, n. 2, p. 160, 2001. Trabalho apresentado no 12. Congresso Brasileiro de Sementes, 2001.Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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14. | | CARVALHO, G. M. C.; FÉ DA SILVA, L. R.; ALMEIDA, M. J. O.; LIMA NETO, A. F.; BEFFA, L. M. Avaliações fenotípicas da raça bovina Curraleiro Pé-Duro do Semiárido do Brasil. Archivos de Zootecnia, v. 62, n. 237, p. 9-20, 2013. Autoria: FÉ DA SILVA, L. R. [i.e. SILVA, L. R. F. da].Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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15. | | COSTA, G. M.; FONSECA, M. E. N.; INOUE-NAGATA, A. K.; LIMA NETO, A. F.; BOITEUX, L. S. Infecção de Begomovirus em mandioca (Manihot esculenta subsp. esculenta) no Brasil. Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 26, n. 2, p. S4817-S4820, 2008. Suplemento. CD-ROM. Trabalho apresentado no 48. COngresso Brasileiro de Olericultura, Maringá, 2008.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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16. | | LIMA NETO, A. F.; BOITEUX, L. S.; SILVA NETO, I. G.; COSTA, P. C.; ALENCAR, R. A.; FERREIRA, F. M. Levantamento das principais doenças da alface no Estado do Tocantins. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 31, p. S271, ago. 2006. Suplemento. Resumo 0900. Trabalho apresentado no 39. Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2006, Salvador.Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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17. | | LIMA NETO, A. F.; FERNANDES, N. A. N.; COSTA, G. M.; COSTA, A. F.; FONSECA, M. E. N. Caracterização de isolados de Begomovirus bipartidos infectando tomateiro no Estado do Tocantins. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 34, p. S270, ago. 2009. Suplemento. Resumo 934. Trabalho apresentado no 42. Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Rio de Janeiro.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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19. | | COSTA, P. C.; BOITEUX, L. S.; LIMA NETO, A. F.; LOPES, C. A.; COSTA, G. M.; LIMA, I. B. Avaliação da resistência de acessos de Solanum (secção Lycopersicon) à Biovar 1 Ralstonia solanacearum. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 33, p. S213, ago. 2008. Suplemento. Resumo MEL 056. Trabalho apresentado no 41. Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 41. Annual meeting of the Brazilian Phytophatological Society, Belo Horizonte, 2008.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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