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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
11/12/2018 |
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Data da última atualização: |
11/12/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
VIANA, J. P. G.; SIQUEIRA, M. V. B. M.; ARAUJO, F. L.; GRANDO, C.; SUJII, P. S.; SILVESTRE, E. de A.; NOVELLO, M.; PINHEIRO, J. B.; CAVALLARI, M. M.; BRANCALION, P. H. S.; RODRIGUES, R. R.; SOUZA, A. P. de; CATCHEN, J.; ZUCCHI, M. I. |
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Afiliação: |
João Paulo Gomes Viana, UNICAMP; Marcos Vinicius Bohrer Monteiro Siqueira, Universidade do Sagrado Coração; Fabiano Lucas Araujo, Instituto Agronômico de Campinas; Carolina Grando, UNICAMP; Patricia Sanae Sujii, UNICAMP; Ellida de Aguiar Silvestre, UNICAMP; Mariana Novello, UNICAMP; José Baldin Pinheiro, USP; MARCELO MATTOS CAVALLARI, CPPSE; Pedro H. S. Brancalion, USP; Ricardo Ribeiro Rodrigues, USP; Anete Pereira de Souza, USP; Julian Catchen, University of Illinois; Maria I. Zucchi, Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios. |
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Título: |
Genomic diversity is similar between Atlantic Forest restorations and natural remnants for the native tree Casearia sylvestris Sw. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Plos One, v. 13, n. 3, e0192165, p. 1-14, 2018. |
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DOI: |
10.1371/journal.pone.0192165 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The primary focus of tropical forest restoration has been the recovery of forest structure and tree taxonomic diversity, with limited attention given to genetic conservation. Populations reintroduced through restoration plantings may have low genetic diversity and be genetically structured due to founder effects and genetic drift, which limit the potential of restoration to recover ecologically resilient plant communities. Here, we studied the genetic diversity, genetic structure and differentiation using single nucleotide polymorphisms (SNP) markers between restored and natural populations of the native tree Casearia sylvestris in the Atlantic Forest of Brazil. We sampled leaves from approximately 24 adult individuals in each of the study sites: two restoration plantations (27 and 62 years old) and two forest remnants. We prepared and sequenced a genotyping-by-sequencing library, SNP markers were identified de novo using Stacks pipeline, and genetic parameters and structure analyses were then estimated for populations. The sequencing step was successful for 80 sampled individuals. Neutral genetic diversity was similar among restored and natural populations (AR = 1.72 ± 0.005; HO = 0.135 ± 0.005; HE = 0.167 ± 0.005; FIS = 0.16 ± 0.022), which were not genetically structured by population subdivision. In spite of this absence of genetic structure by population we found genetic structure within populations but even so there is not spatial genetic structure in any population studied. Less than 1% of the neutral alleles were exclusive to a population. In general, contrary to our expectations, restoration plantations were then effective for conserving tree genetic diversity in human-modified tropical landscapes. Furthermore, we demonstrate that genotyping-by-sequencing can be a useful tool in restoration genetics. MenosThe primary focus of tropical forest restoration has been the recovery of forest structure and tree taxonomic diversity, with limited attention given to genetic conservation. Populations reintroduced through restoration plantings may have low genetic diversity and be genetically structured due to founder effects and genetic drift, which limit the potential of restoration to recover ecologically resilient plant communities. Here, we studied the genetic diversity, genetic structure and differentiation using single nucleotide polymorphisms (SNP) markers between restored and natural populations of the native tree Casearia sylvestris in the Atlantic Forest of Brazil. We sampled leaves from approximately 24 adult individuals in each of the study sites: two restoration plantations (27 and 62 years old) and two forest remnants. We prepared and sequenced a genotyping-by-sequencing library, SNP markers were identified de novo using Stacks pipeline, and genetic parameters and structure analyses were then estimated for populations. The sequencing step was successful for 80 sampled individuals. Neutral genetic diversity was similar among restored and natural populations (AR = 1.72 ± 0.005; HO = 0.135 ± 0.005; HE = 0.167 ± 0.005; FIS = 0.16 ± 0.022), which were not genetically structured by population subdivision. In spite of this absence of genetic structure by population we found genetic structure within populations but even so there is not spatial genetic structure in any population st... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Single nucleotide polymorphisms; SNP. |
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Thesagro: |
Casearia Sylvestris; Floresta Tropical. |
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Thesaurus Nal: |
Tropical forests. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/188147/1/GenomicDiversity.pdf
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Marc: |
LEADER 02904naa a2200349 a 4500
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Amapá. Para informações adicionais entre em contato com cpafap.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amapá. |
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Data corrente: |
29/10/2015 |
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Data da última atualização: |
03/03/2016 |
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Tipo da produção científica: |
Autoria/Organização/Edição de Livros |
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Autoria: |
YOKOMIZO, G. K.-I.; LOMBA, R. M. (org.). |
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Afiliação: |
GILBERTO KEN-ITI YOKOMIZO, CPAF-AP. |
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Título: |
Potencialidades do Amapá para o desenvolvimento regional. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
Macapá: Editora da Unifap; Rio de Janeiro: Autografia. |
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Páginas: |
132 p. |
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ISBN: |
978-85-5526-243-2 |
|
Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Capítulo 1. Potencialidades da produção agrícola no Estado do Amapá: caracterização dos espaços agrícolas no Amapá; a produção da agricultura familiar no Amapá; a produção do agronegócio no Amapá. Capítulo 2. Potencial produtivo do Cerrado amapaense no Estado do Amapá: caracterização do cerrado amapaense; localização das principais áreas utilizáveis para o sistema de produção de grãos; potencial de produção de milho no cerrado amapaense; potencial de produção de soja no cerrado amapaense. Capitulo 3. Potencialidade da biodiversidade animal no Amapá: a potencialidade dos recursos naturais; a fauna amapaense e suas potencialidades. Capitulo 4. Potencialidade mineral no Estado do Amapá: os recursos minerais no Brasil e na Amazônia: noções gerais; distritos minerais no Amapá; recursos minerais explorados ou com potencialidade no Amapá. Capítulo 5. Potencial do ecoturismo na fronteira setentrional do Brasil. Capítulo 6. Potencial da biodiversidade microbiológica regional. |
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Palavras-Chave: |
Cerrado amapaense; Desenvolvimento socioeconômico; Ecoturismo. |
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Thesagro: |
Biodiversidade; Desenvolvimento sustentável; Produção agricola; Recurso mineral. |
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Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Amapá (CPAF-AP) |
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