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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
24/04/2020 |
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Data da última atualização: |
24/04/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PEREIRA, W. J.; MELO, A. T. de O.; COELHO, A. S. G.; RODRIGUES, F. A.; MAMIDI, S.; ALENCAR, S. A. de; LANNA, A. C.; VALDISSER, P. A. M. R.; BRONDANI, C.; NASCIMENTO JUNIOR, I. R. do; BORBA, T. C. de O.; VIANELLO, R. P. |
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Afiliação: |
WENDELL JACINTO PEREIRA, UFG; ARTHUR TAVARES DE OLIVEIRA MELO, UFG; ALEXANDRE SIQUEIRA GUEDES COELHO, UFG; FABIANA APARECIDA RODRIGUES; SUJAN MAMIDI, HUDSON ALPHA INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY, Huntsville-AL; SERGIO AMORIM DE ALENCAR, UNIVERSIDADE CATÓLICA DE BRASÍLIA; ANNA CRISTINA LANNA, CNPAF; PAULA ARIELLE M RIBEIRO VALDISSER, CNPAF; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF; IVANILDO RAMALHO DO NASCIMENTO JUNIOR, UNESP, Jaboticabal-SP; TEREZA CRISTINA DE OLIVEIRA BORBA, CNPAF; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF. |
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Título: |
Genome-wide analysis of the transcriptional response to drought stress in root and leaf of common bean. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, v. 43, n. 1, e20180259, 2020. |
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ISSN: |
1678-4685 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1590/1678-4685-gmb-2018-0259 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Genes related to the response to drought stress in leaf and root tissue of drought-susceptible (DS) and tolerant (DT) genotypes were characterized by RNA-Seq. In total, 54,750 transcripts, representative of 28,590 genes, were identified; of these, 1,648 were of high-fidelity (merge of 12 libraries) and described for the first time in the Andean germplasm. From the 1,239 differentially expressed genes (DEGs), 458 were identified in DT, with a predominance of genes in categories of oxidative stress, response to stimulus and kinase activity. Most genes related to oxidation-reduction terms in roots were early triggered in DT (T75) compared to DS (T150) suggestive of a mechanism of tolerance by reducing the damage from ROS. Among the KEGG enriched by DEGs up-regulated in DT leaves, two related to the formation of Sulfur-containing compounds, which are known for their involvement in tolerance to abiotic stresses, were common to all treatments. Through qPCR, 88.64% of the DEGs were validated. A total of 151,283 variants were identified and functional effects estimated for 85,780. The raw data files were submitted to the NCBI database. A transcriptome map revealed new genes and isoforms under drought. These results supports a better understanding of the drought tolerance mechanisms in beans. |
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Palavras-Chave: |
Functional genomics. |
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Thesagro: |
Deficiência Hídrica; Feijão; Folha; Phaseolus Vulgaris; Raiz. |
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Thesaurus Nal: |
Beans; Genomics; Single nucleotide polymorphism; Soil water deficit. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/212487/1/CNPAF-2020-GMB.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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| Registros recuperados : 261 | |
| 121. |  | VESCHI, J. L. A.; ZAFALON, L. F.; BORGES, F. C.; AZEVEDO, V.; MIYOSHI, A.; MEYER, R.; PORTELA, R.; GOUVEIA, A. M. G. Avaliation of antibody anti-Corynebacterium pseudotuberculosis in goats milking of Sisal area in state of Bahia. In: SIMPÓSIO EMBRAPA LABEX EUA DE SANIDADE ANIMAL, 2., Brasília, 2012. Anais... Brasília: Embrapa Estudos e Capacitação, 2012. p. 105-106.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 122. | | VESCHI, J. L. A.; ZAFALON, L. F.; BORGES, F. C.; AZEVEDO, V.; MIYOSHI, A.; MEYER, R.; PORTELA, R.; GOUVEIA, A. M. G. Avaliation of antibody anti-Corynebacterium pseudotuberculosis in goats milking of Sisal area in state of Bahia. In: SIMPÓSIO EMBRAPA LABEX EUA DE SANIDADE ANIMAL, 2., Brasília, 2012. Anais... Brasília: Embrapa Estudos e Capacitação, 2012. p. 105-106.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 123. | | PIRES, C.; SUJII, E.; BORGES, M.; SCHMIDT, F.; ZARBIN, P. H. G.; AZEVEDO, V. C. R.; LACERDA, A. L.; PANTALEÃO, D. Ação cairomonal de componentes do feromônio de alarme do percevejo verde pequeno da soja, Piezodorus guildinii, sobre o parasitóide de ovos Telenomus podisi. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2001. 22 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 19).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 124. | | FERRER, M.; ROSSO, B.; BURLE, M.; SEGUEL, I.; ROBLEDO, L.; ALTIER, N.; CONDÓN, F.; VICENTE, J.; OTONDO, A.; MURILLO, R.; SILVA, F.; PENALOZA, A.; AZEVEDO, V. Acceso a los recursos genéticos: situación en los países del Cono Sur. [S.l.]: Regensur/Procisur, [2013?]. 9 p.| Tipo: Folder/Folheto/Cartilha |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 125. | | GOMES, H. T.; BARTOS, P. M. C.; LOPES, R.; CUNHA, R. N. V. da; AZEVEDO, V. C. R.; SCHERWINSKI-PEREIRA, J. E. Análise da fidelidade genética de clones de dendezeiro (Elaeis guineensis Jacq.) obtidos via embriogênese somática de folhas imaturas por marcadores ISSR. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 4., 2016, Curitiba. Recursos genéticos no Brasil: a base para o desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 126. | | GOMES, H. T.; BARTOS, P. M. C.; LOPES, R.; CUNHA, R. N. V. da; AZEVEDO, V. C. R.; SCHERWINSKI-PEREIRA, J. E. Análise da fidelidade genética de clones de dendezeiro (Elaeis guineensis Jacq.) obtidos via embriogênese somática de folhas imaturas por marcadores ISSR. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 4., 2016, Curitiba. Recursos genéticos no Brasil: a base para o desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 127. | | AZEVEDO, V. C. R.; INGLI, P. W.; AMARAL, Z. P. S.; ALVES, R. B. N.; SILVA, D. B.; FIGUEIRA, G. M.; ZUCCHI, M. I.; VIEIRA, R. F. Aplicação de DNA barcode para identificação molecular de espécies de guaco conservadas nos bancos de germoplasma da Embrapa e da Unicamp. In: SIMPÓSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA E O CARIBE, 10., 2015, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: Aptor Software, 2015. p. 287.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 128. | | SILVA, R. R.; SILVA, F. F.; GUIMARÃES, L. M.; AZEVEDO, V. W. B.; ARAUJO FILHO, J. C. de; GOMES, E. C. Aplicação do MDT na classificação de relevo da carta Piaçabuçu, estado de Alagoas, na escala de 1:100.000. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 31., 2007, Gramado. Conquistas e desafios da ciência do solo brasileira. Porto Alegre: Universidade Federal do Rio Grande do Sul, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 129. | | HEINRICH, A. G.; MENEZES, N. P.; VIEIRA, E. A.; PEREIRA, J. E. S.; FREITAS, F. O.; AZEVEDO, V. C. R.; CIAMPI, A. Y. Análise genética de mandioca (Manihot esculenta) de bancos brasileiros de germoplasma. In: SIMPOSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA Y EL CARIBE, SIRGEALC, 7., 2009, Pucón, Chile. Proceeding... Santiago de Chile: Ministério de Agricultura, Instituto de Investigaciones Agropecuarias, 2009. p. 365-366. p. 365-366| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 130. | | HEINRICH, A. G.; MENEZES, N. P.; VIEIRA, E. A.; PEREIRA, J. E. S.; FREITAS, F. O.; AZEVEDO, V. C. R.; CIAMPI, A. Y. Análise genética de mandioca (Manihot esculenta) de bancos brasileiros de germoplasma. In: SIMPOSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA Y EL CARIBE, SIRGEALC, 7., 2009, Pucón, Chile. Proceeding... Santiago de Chile: Ministério de Agricultura, Instituto de Investigaciones Agropecuarias, 2009. p. 365-366.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 131. | | CRUZ, V. de O.; MENEZES, N.; PEREIRA, M. de F.; CIAMPI, A. Y.; MILLER, R. N. G.; AMORIM, E. P.; AZEVEDO, V. C. R. Caracterização de marcadores SSR identificados em sequencias de cDNA de Musa acuminata. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 1 CD-ROM (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 304). pdf 185.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 132. | | DONATO, S. L. R.; AZEVEDO, V. F. de; ARANTES, A. de M.; MAIA, V. M.; PEREIRA, M. C. T.; SILVA, S. de O. e. Características vegetativas de bananeiras tipo prata de porte alto em condições semiáridas. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE BANANICULTURA, 7., 2010, Registro, SP. Atualidades e perspectivas da bananicultura sustentável. Registro: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010. 1 CD-ROM. 5 p. PDF T9.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 133. | | DONATO, S. L. R.; AZEVEDO, V. F. de; ARANTES, A. de M.; MAIA, V. M.; PEREIRA, M. C. T.; SILVA, S. de O. e. Características de rendimento de bananeiras tipo prata de porte alto em condições semiáridas. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE BANANICULTURA, 7., 2010, Registro,SP. Atualidades e perspectivas da bananicultura sustentável. Registro: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010. 1 CD-ROM. 5 p. PDF T7.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 134. | | PÉREZ, E. L.; WALTER, B. M. T.; SARDINHA, L.; EGITO, A. A. do; SILVA, J. B. T. da; AZEVEDO, V. C. R.; ALBUQUERQUE, M. do S. M. Árvore do conhecimento de recursos genéticos. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia: Fundação de Apoio à Pesquisa Científica e Tecnológica - FUNCREDI, 2008. p.285.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 135. | | RIBEIRO, D.; DORELLA, F. A.; GUIMARAES, A. S.; SILVA, T. M. A. DA; SANTOS, R. DE L.; SILVA, M. X.; GOUVEIA, A. M. G.; AZEVEDO, V. Avaliação do potencial vacinal de uma linhagem recombinante de Corynebacterium pseudoturbeculosis na redução das lesões em linfonodos caprinos causada por linfadenite caseosa. In: Encontro Nacional de Patologia Veterinária, 15., 2011, Goiânia. Anais...| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 137. | | WADT, L. H. de O.; KLIMAS, C. A.; RIGAMONTE-AZEVEDO, V.; SILVA, A. C. C. da; LIMA, L. M. da S.; CORREIA, M. F.; KAINER, K. Produção de sementes de andiroba (Carapa guianensis Aubl.) no período de 2004 a 2008, em dois ambientes de floresta natural, em Rio Branco, Acre. In: SEMINÁRIO MANEJO SUSTENTÁVEL DE PRODUTOS FLORESTAIS NÃO-MADEIREIROS NA AMAZÔNIA, 1., 2008, Rio Branco, AC. Anais... Rio Branco, AC: Embrapa Acre, 2008. p. 75-80. Editora: Lúcia Helena de Oliveira Wadt.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 138. | | VESCHI, J. L. A.; ZAFALON, L. F.; BORGES, F. C.; AZEVEDO, V.; MIYOSHI, A.; MEYER, R.; PORTELA, R.; GOUVEIA, A. M. G. Presence of antibody anti-Corynebacterium pseudotuberculosis in sheep in Dormentes state fo Pernambuco, Brazil. In: SIMPÓSIO EMBRAPA LABEX EUA DE SANIDADE ANIMAL, 2., Brasília, 2012. Anais... Brasília: Embrapa Estudos e Capacitação, 2012. p. 107-108| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 139. | | VESCHI, J. L. A.; ZAFALON, L. F.; BORGES, F. C.; AZEVEDO, V.; MIYOSHI, A.; MEYER, R.; PORTELA, R.; GOUVEIA, A. M. G. Presence of antibody anti-Corynebacterium pseudotuberculosis in sheep in Dormentes state fo Pernambuco, Brazil. In: SIMPÓSIO EMBRAPA LABEX EUA DE SANIDADE ANIMAL, 2., Brasília, 2012. Anais... Brasília: Embrapa Estudos e Capacitação, 2012. p. 107-108| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 140. | | SCIVITTARO, W. B.; DIAS, V. da C.; CAMPOS, A. D. S. de; AZEVEDO, V. J.; GRIEP, S. P.; ROSCHILDT, N.; VASCONCELOS, E. E.; PARFITT, J. M. B. Eficiência de uso da água do arroz sob irrigação por inundação contínua e intermitente. In: CONGRESSOS BRASILEIRO De ARROZ, 12., 2022, Santa Maria. Anais [online]... Santa Maria: SOSBAI, 2022. CBAI.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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