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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Algodão. |
Data corrente: |
17/03/2005 |
Data da última atualização: |
17/03/2005 |
Autoria: |
VIEGAS, R. A.; SILVEIRA, J. A. G. da; SILVA, L. M. de M.; VIEGAS, P. R. A.; QUEIROZ, J. E.; ROCHA, I. M. A. |
Título: |
Redução assimilatória de NO3 em plantas de cajueiros cultivados em meio salinizado. |
Ano de publicação: |
2004 |
Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Engenharia Agricola e Ambiental, v.8, n.2/3, p.189-195, 2004. |
Idioma: |
Português |
Palavras-Chave: |
Assimilação de N; Estresse salino; Solutos compatíveis. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 00649naa a2200205 a 4500 001 1273718 005 2005-03-17 008 2004 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aVIEGAS, R. A. 245 $aRedução assimilatória de NO3 em plantas de cajueiros cultivados em meio salinizado. 260 $c2004 653 $aAssimilação de N 653 $aEstresse salino 653 $aSolutos compatíveis 700 1 $aSILVEIRA, J. A. G. da 700 1 $aSILVA, L. M. de M. 700 1 $aVIEGAS, P. R. A. 700 1 $aQUEIROZ, J. E. 700 1 $aROCHA, I. M. A. 773 $tRevista Brasileira de Engenharia Agricola e Ambiental$gv.8, n.2/3, p.189-195, 2004.
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Registro original: |
Embrapa Algodão (CNPA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
Data corrente: |
03/01/2018 |
Data da última atualização: |
03/01/2018 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
B - 4 |
Autoria: |
LAGROTTA, M. R.; SILVA, F. F. e; RESENDE, M. D. V. de; NASCIMENTO, M.; DUARTE, D. A. S.; AZEVEDO, C. F.; MOTA, R. R. |
Afiliação: |
Marcos Rodrigues Lagrotta, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri; Fabyano Fonseca e Silva, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; Moysés Nascimento, UFV; Darlene Ana Souza Duarte, UFV; Camila Ferreira Azevedo, UFV; Rodrigo Reis Mota, University of Liège. |
Título: |
Computação paralela aplicada à seleção genômica via inferência Bayesiana. |
Ano de publicação: |
2017 |
Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Biometria, Lavras, v. 35, n. 3, p. 440-448, 2017. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Em seleção genômica (SG), o grande número de marcadores moleculares utilizados, bem como a demanda computacional dos modelos bayesianos, fundamentados nos algoritmos Monte Carlo Via Cadeias de Markov, faz com que as análises exijam semanas ou até meses de processamento. A computação paralela representa uma solução natural para este problema, visto que esta subdividi um algoritmo em várias tarefas independentes, as quais podem ser processadas em paralelo, reduzindo o tempo de processamento. Objetivou-se comparar a eficiência de processamento do método BayesCπ programado em paralelo com o seu algoritmo sequencial padrão. Duas estratégias de paralelização foram estudadas. A primeira envolveu a análise de múltiplas cadeias MCMC em paralelo, e a segunda referiu-se à paralelização de uma única cadeia MCMC. Utilizou-se a biblioteca MPI e o pacote OpenMPI associado ao compilador gfortran para execução em paralelo desses algoritmos. Foram utilizados dados simulados considerando 10.000 marcadores SNPs e 4.100 indivíduos. O algoritmo sequencial padrão foi processado em 77,29 horas. Ao usar múltiplas cadeias em paralelo o processamento foi 77% mais rápido (17,75hs), enquanto que a estratégia de paralelização de uma única cadeia apresentou um ganho de desempenho de 15% (65,37hs). Conclui-se que a computação paralela é eficiente e pode ser aplicada à SG. |
Palavras-Chave: |
Marcadores SNP; Regressão Bayesiana. |
Thesaurus NAL: |
Genetic improvement; Statistics. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/170170/1/2017-M.Deon-RBM-Computacao.pdf
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Marc: |
LEADER 02126naa a2200241 a 4500 001 2084055 005 2018-01-03 008 2017 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aLAGROTTA, M. R. 245 $aComputação paralela aplicada à seleção genômica via inferência Bayesiana.$h[electronic resource] 260 $c2017 520 $aEm seleção genômica (SG), o grande número de marcadores moleculares utilizados, bem como a demanda computacional dos modelos bayesianos, fundamentados nos algoritmos Monte Carlo Via Cadeias de Markov, faz com que as análises exijam semanas ou até meses de processamento. A computação paralela representa uma solução natural para este problema, visto que esta subdividi um algoritmo em várias tarefas independentes, as quais podem ser processadas em paralelo, reduzindo o tempo de processamento. Objetivou-se comparar a eficiência de processamento do método BayesCπ programado em paralelo com o seu algoritmo sequencial padrão. Duas estratégias de paralelização foram estudadas. A primeira envolveu a análise de múltiplas cadeias MCMC em paralelo, e a segunda referiu-se à paralelização de uma única cadeia MCMC. Utilizou-se a biblioteca MPI e o pacote OpenMPI associado ao compilador gfortran para execução em paralelo desses algoritmos. Foram utilizados dados simulados considerando 10.000 marcadores SNPs e 4.100 indivíduos. O algoritmo sequencial padrão foi processado em 77,29 horas. Ao usar múltiplas cadeias em paralelo o processamento foi 77% mais rápido (17,75hs), enquanto que a estratégia de paralelização de uma única cadeia apresentou um ganho de desempenho de 15% (65,37hs). Conclui-se que a computação paralela é eficiente e pode ser aplicada à SG. 650 $aGenetic improvement 650 $aStatistics 653 $aMarcadores SNP 653 $aRegressão Bayesiana 700 1 $aSILVA, F. F. e 700 1 $aRESENDE, M. D. V. de 700 1 $aNASCIMENTO, M. 700 1 $aDUARTE, D. A. S. 700 1 $aAZEVEDO, C. F. 700 1 $aMOTA, R. R. 773 $tRevista Brasileira de Biometria, Lavras$gv. 35, n. 3, p. 440-448, 2017.
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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