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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia. |
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Data corrente: |
15/03/2019 |
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Data da última atualização: |
06/05/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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Autoria: |
CAMPOS, C. G.; RIBEIRO, J. A. de A.; ALMEIDA, J. R. M. de; QUIRINO, B. F.; ABDELNUR, P. V. |
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Afiliação: |
Christiane Gonçalves Campos; JOSE ANTONIO DE AQUINO RIBEIRO, CNPAE; JOAO RICARDO MOREIRA DE ALMEIDA, CNPAE; BETANIA FERRAZ QUIRINO, CNPAE; PATRICIA VERARDI ABDELNUR, CNPAE. |
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Título: |
Targeted metabolomics of Xylose-Fermenting yeasts based on mass spectrometry. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
In: BAIDOO E. (Eds.) Microbial metabolomics. Methods in Molecular Biology. New York, NY: Humana Press, 2019. |
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Volume: |
1859. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Mass spectrometry is a sensitive and selective analytical technique that enables detection and quantitation of low abundance compounds in a complex sample matrix. Targeted metabolomics allows for quantitative analysis of metabolites, providing kinetic information of production and consumption rates, an essential step to investigate microbial metabolism. Here, we describe a targeted metabolomics protocol for yeast samples, from sample preparation to mass spectrometry analysis, which enables the identification of metabolic fluxes after xylose consumption. Sample preparation methods were optimized for quenching of yeast metabolism followed by intracellular metabolite extraction, using cold methanol and boiling ethanol protocols. Ultrahigh performance liquid chromatography tandem mass spectrometry (UHPLC-MS/MS) methods using ion pair chromatography (IPC) and hydrophilic interaction liquid chromatography (HILIC) allowed for the quantitation of 18 metabolites involved in central carbon metabolism (glycolysis, pentose phosphate pathway, and tricarboxylic acid cycle). The protocol here described was successfully applied to quantify metabolites in Scheffersomyces stipitis, Spathaspora passalidarum, Spathaspora arborariae, and Candida tenuis samples after xylose consumption. |
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Palavras-Chave: |
Microbial metabolomics. |
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Thesaurus Nal: |
Biotechnology; Yeasts. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aMass spectrometry is a sensitive and selective analytical technique that enables detection and quantitation of low abundance compounds in a complex sample matrix. Targeted metabolomics allows for quantitative analysis of metabolites, providing kinetic information of production and consumption rates, an essential step to investigate microbial metabolism. Here, we describe a targeted metabolomics protocol for yeast samples, from sample preparation to mass spectrometry analysis, which enables the identification of metabolic fluxes after xylose consumption. Sample preparation methods were optimized for quenching of yeast metabolism followed by intracellular metabolite extraction, using cold methanol and boiling ethanol protocols. Ultrahigh performance liquid chromatography tandem mass spectrometry (UHPLC-MS/MS) methods using ion pair chromatography (IPC) and hydrophilic interaction liquid chromatography (HILIC) allowed for the quantitation of 18 metabolites involved in central carbon metabolism (glycolysis, pentose phosphate pathway, and tricarboxylic acid cycle). The protocol here described was successfully applied to quantify metabolites in Scheffersomyces stipitis, Spathaspora passalidarum, Spathaspora arborariae, and Candida tenuis samples after xylose consumption.
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 110 | |
| 22. |  | CORREIA, M. V.; SOUTO, A. L.; RIBEIRO, J. A. de A.; ABDELNUR, P. V.; RODRIGUES, C. M. Ferramentas metabolômicas aplicadas na identificação de marcadores químicos relacionados ao amarelecimento fatal em folhas de Elaeis guineenses. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 3., 2016, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 290-296.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 23. | | SOUTO, A. L.; RODRIGUES-NETO, J. C.; RIBEIRO, J. A. de A.; RODRIGUES, C. M.; ABDELNUR, P. V. Identificação de marcadores químicos do amarelecimento fatal em Elaeis guineensis por UHPLC-MS e PCA. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE QUÍMICA, 39., 2016, Goiânia, GO. Criar e empreender: anais ... São Paulo: SBQ, 2016. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 24. | | MONTEIRO, S.; RIBEIRO, J. A. de A.; ALMEIDA, E. S. DE.; NETO, B. A. D.; ABDELNUR, P. V. Identification of carotenoid isomers by mass spectrometry in crude and bleached palm oil. In: EURO FED LIPID CONGRESS, 15.; SYMPOSIUM OF THE NORDIC LIPIDFORUM, 29., 2017, Uppsala, Sweden. Oil, fats and lipids: new technologies and applications for a healthier life: book of abstracts. Frankfurt: Euro Fed Lipid, 2017. p. 53.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 27. | | SANTOS, L. K. dos; SANTANA, H.; FAVARO, S. P.; RIBEIRO, J. A. de A.; MIRANDA, C. H. B. Identificação e quantificação de fitormônios em biomassa de microalgas utilizando HPLC-PDA. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 7., 2023, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF : Embrapa, 2023. p. 139.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 28. | | SILVA, C.; NEWMANN, B. C.; RIBEIRO, J. A. de A.; SOUTO, A. L.; ABDELNUR, P. V.; FERREIRA FILHO, E. X. Hydrothermal pretreatment of sugarcane bagasse enhances holocellulases production by Aspergillus foetidus. In: GORDON RESEARCH CONFERENCE - CELLULASES AND OTHER CARBOHYDRATE-ACTIVE ENZYMES, 2017, Andover, US. [Proceedings ...]. [S.l]: GRC, 2017. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 30. | | ABDELNUR, P. V.; RIBEIRO, J. A. de A.; IGLESIAS, A. H.; RODRIGUES, C. M.; LAVIOLA, B. G.; MENDONCA, S. Development of an ultra-fast method to detection of phorbol ester in Jatropha curcas using UHPLC-MS. In: PRIMER CONGRESO ARGENTINO DE ESPECTROMETRÍA DE MASA, 2012, Córdoba, Argentina. [S.l] Sociedad Argentina de Espectrometría de Masa, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 31. | | RICCI-SILVA, M. E.; NETO, J. C. R.; RIBEIRO, J. A. de A.; RODRIGUES, C. M.; ABDELNUR, P. V. Desenvolvimento de protocolo analítico para raízes de dendê utilizando UPLC-ESI-Q-TOF-MS In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 2., 2015, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2015. p. 84-85| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 32. | | NAKAI, D. K.; COSTA, P. P. K. G.; RIBEIRO, J. A. de A.; SOARES, I. P.; SALUM, T. F. C. Desenvolvimento de método de cromatografia líquida para identificação e quantificação simultânea dos principais produtos da transesterificação de óleo de soja. In: CONGRESSO DA REDE BRASILEIRA DE TECNOLOGIA E INOVAÇÃO DE BIODIESEL, 7., 2019, Florianópolis. Empreendedorismo e inovação: construindo um futuro competitivo para o biodiesel: anais. Florianópolis, SC: Rede Brasileira de Tecnologia e Inovação De Biodiesel, 2019. 157-158| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 34. | | GUIMARÃES, M. B.; NAKAI, D. K.; SALUM, T. F. C.; RIBEIRO, J. A. de A.; MENDONCA, S. Nova metodologia para determinação de acidez em óleo de dendê híbrido. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 5., 2018, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2018. p. 14.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 35. | | CAMPOS, C. G.; RIBEIRO, J. A. de A.; COSTA, P. P. K. G.; RODRIGUES, C. M.; ABDELNUR, P. V. Otimização de métodos cromatográficos para separação de ácidos orgânicos, monossacarídeos, álcoois e açúcares fosfatados In: CONGRESSO BRASILEIRO DE QUÍMICA, 55., 2015, Goiânia. Recursos renováveis: inovação e tecnologia. Rio de Janeiro: ABQ, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 36. | | CORREIA, M. V.; SOUTO, A. L.; RIBEIRO, J. A. de A.; ABDELNUR, P. V.; RODRIGUES, C. M. Proposição de um modelo quimiométrico para diferenciação do AF em análises por UPLC-PDA de extratos das folhas de Elaeis guineenses. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE QUÍMICA, 39., 2016, Goiânia, GO. Criar e empreender: anais ... São Paulo: SBQ, 2016. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 39. | | LAVIOLA, B. G.; BHERING, L. L.; MENDONCA, S.; ALBRECHT, J. C.; ROSADO, T. B.; MARANA, J. C.; RIBEIRO, J. A. de A. Caracterização morfo-agronômica do banco de germoplasma de pinhão-manso: resultados do 1º ano de avaliação. Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2010. 8 p. il. (Embrapa Agroenergia. Comunicado técnico, 003).| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
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| 40. | | LAVIOLA, B. G.; BHERING, L. L.; MENDONCA, S.; ALBRECHT, J. C.; ROSADO, T. B.; MARANA, J. C.; RIBEIRO, J. A. de A. Caracterização morfo-agronômica do banco de germoplasma de pinhão-manso: resultados do 1º ano de avaliação. Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2010. 8 p. il. (Embrapa Agroenergia. Comunicado técnico, 03).| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
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