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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia. |
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Data corrente: |
11/09/2017 |
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Data da última atualização: |
06/04/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CAMPOS, C. G.; VERAS, H. C. T.; RIBEIRO, J. A. de A.; COSTA, P. P. K. G.; ARAÚJO, K. P.; RODRIGUES, C. M.; ALMEIDA, J. R. M. de; ABDELNUR, P. V. |
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Afiliação: |
CHRISTIANE GONÇALVES CAMPOS, Universidade Federal de Goiás; HENRIQUE CÉSAR TEIXEIRA VERAS, Universidade de Brasília; JOSE ANTONIO DE AQUINO RIBEIRO, CNPAE; PATRICIA PINTO KALIL G COSTA, CNPAE; KATIÚSCIA PEREIRA ARAÚJO; CLENILSON MARTINS RODRIGUES, CNPAE; JOAO RICARDO MOREIRA DE ALMEIDA, CNPAE; PATRICIA VERARDI ABDELNUR, CNPAE. |
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Título: |
New protocol based on UHPLC-MS/MS for quantitation of metabolites in xylose-fermenting yeasts. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of the American Society for Mass Spectrometry, v. 28, n. 12, p. 2646-2657, 2017. |
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Páginas: |
p. 2646-2657 |
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DOI: |
10.1007/s13361-017-1786-9 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Xylose fermentation is a bottleneck in second-generation ethanol production. As such, a comprehensive understanding of xylose metabolism in naturally xylose-fermenting yeasts is essential for prospection and construction of recombinant yeast strains. The objective of the current study was to establish a reliable metabolomics protocol for quantification of key metabolites of xylose catabolism pathways in yeast, and to apply this protocol to Spathaspora arborariae. Ultra-high performance liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry (UHPLC-MS/MS) was used to quantify metabolites, and afterwards, sample preparation was optimized to examine yeast intracellular metabolites. S. arborariae was cultivated using xylose as a carbon source under aerobic and oxygen-limited conditions. Ion pair chromatography (IPC) and hydrophilic interaction liquid chromatography-tandem mass spectrometry (HILIC-MS/MS) were shown to efficiently quantify 14 and 5 metabolites, respectively, in a more rapid chromatographic protocol than previously described. Thirteen and eleven metabolites were quantified in S. arborariae under aerobic and oxygen-limited conditions, respectively. This targeted metabolomics protocol is shown here to quantify a total of 19 metabolites, including sugars, phosphates, coenzymes, monosaccharides, and alcohols, from xylose catabolism pathways (glycolysis, pentose phosphate pathway, and tricarboxylic acid cycle) in yeast. Furthermore, to our knowledge, this is the first time that intracellular metabolites have been quantified in S. arborariae after xylose consumption. The results indicated that fine control of oxygen levels during fermentation is necessary to optimize ethanol production by S. arborariae. The protocol presented here may be applied to other yeast species and could support yeast genetic engineering to improve second generation ethanol production. Graphical Abstract ?. MenosAbstract: Xylose fermentation is a bottleneck in second-generation ethanol production. As such, a comprehensive understanding of xylose metabolism in naturally xylose-fermenting yeasts is essential for prospection and construction of recombinant yeast strains. The objective of the current study was to establish a reliable metabolomics protocol for quantification of key metabolites of xylose catabolism pathways in yeast, and to apply this protocol to Spathaspora arborariae. Ultra-high performance liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry (UHPLC-MS/MS) was used to quantify metabolites, and afterwards, sample preparation was optimized to examine yeast intracellular metabolites. S. arborariae was cultivated using xylose as a carbon source under aerobic and oxygen-limited conditions. Ion pair chromatography (IPC) and hydrophilic interaction liquid chromatography-tandem mass spectrometry (HILIC-MS/MS) were shown to efficiently quantify 14 and 5 metabolites, respectively, in a more rapid chromatographic protocol than previously described. Thirteen and eleven metabolites were quantified in S. arborariae under aerobic and oxygen-limited conditions, respectively. This targeted metabolomics protocol is shown here to quantify a total of 19 metabolites, including sugars, phosphates, coenzymes, monosaccharides, and alcohols, from xylose catabolism pathways (glycolysis, pentose phosphate pathway, and tricarboxylic acid cycle) in yeast. Furthermore, to our knowledge, this is... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Spathaspora arborariae; UHPLC-MS/MS; Xylose fermentation. |
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Thesaurus Nal: |
Mass spectrometry; Metabolomics; Xylose. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/163703/1/Abdelnur-ASMassSoectiometry-2017.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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| Registros recuperados : 110 | |
| 1. |  | MENDONCA, S.; RIBEIRO, J. A. de A. Desafio na destoxificação da torta de pinhão-manso. In: RODRIGUES, C. M.; ABDELNUR, P. V. (Ed.). Destoxificação e aproveitamento das tortas de pinhão-manso e mamona: perspectivas em pesquisa, desenvolvimento e inovação. Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, p. 83-109, 2013. (Embrapa Agroenergia. Documentos, 016).| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 2. | | MENDONCA, S.; RIBEIRO, J. A. de A. Desafios na destoxificação da torta de pinhão-manso. In: RODRIGUES, C. M.; ABDELNUR, P. V. (Ed.). Destoxificação e aproveitamento das tortas de pinhão-manso e mamona: perspectivas em pesquisa, desenvolvimento e inovação. Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2013. p. 95-123. (Embrapa Agroenergia. Documentos, 016).| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 4. | | MELO, R. W. N. de; ANDREANI, L.; RIBEIRO, J. A. de A.; RODRIGUES, C. M. Avaliação do perfil metabólico de extratos aquosos e hidroalcoólicos de sementes de Crotalaria spp. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 6., 2020, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2020. p. 73-80| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 5. | | RIBEIRO, J. A. de A.; SCHWERZ JÚNIOR, P.; SOUZA, P. M. de; MENDONCA, S. Desenvolvimento de processo semiautomatizado para extração e quantificação de ésteres de forbol em torta de pinhão-manso (Jatropha curcas L.) In: CONGRESSO DA REDE BRASILEIRA DE TECNOLOGIA DE BIODIESEL, 4.; CONGRESSO BRASILEIRO DE PLANTAS OLEAGINOSAS, ÓLEOS, GORDURAS E BIODIESEL, 7., 2010, Belo Horizonte. Biodiesel: inovação tecnológica e qualidade: anais. Lavras: UFLA, 2010. v. 3 p. 1241-1242.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 10. | | COSTA, P. P. K. G.; RIBEIRO, J. A. de A.; SOARES, I. P. Monitoramento por CG-DIC da estabilidade química do B7 durante a estocagem. In: CONGRESSO DA REDE BRASILEIRA DE TECNOLOGIA DE BIODIESEL, 6.; CONGRESSO BRASILEIRO DE PLANTAS OLEAGINOSAS, ÓLEOS, GORDURAS E BIODIESEL, 9., 2016, Natal, RN. Biodiesel: 10 anos de pesquisa, desenvolvimento e inovação no Brasil: anais. Lavras: UFLA, 2016. Não paginado.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 12. | | FEITOSA, J. G.; ANDREANI, L.; RIBEIRO, J. A. de A.; RODRIGUES, C. M. Preparação e caracterização química de extratos brutos de Crotalaria juncea e Crotalaria ochroleuca. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 7., 2023, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2023. p. 231.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 13. | | CARVALHO, T. C.; RODRIGUES, C. M.; ABDELNUR, P. V.; RIBEIRO, J. A. de A.; CAMPANHA, R. B.; VAZ, B. G. Análise direta de açúcares em licores de bagaço de cana-de-açúcar por espectrometria de massas com Paper Spray Ionization (PSI). In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE QUÍMICA, 37., 2014, Natal. Abstracts... São Paulo: Sociedade Brasileira de Química, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 16. | | MELO, R. W. N.; ANDREANI, L.; RIBEIRO, J. A. de A.; ROCHA, T. L.; LAVIOLA, B. G.; RODRIGUES, C. M. Caracterização química e avaliação nematotóxica de extratos hidroetanólicos de Brassica carinata. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 7., 2023, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2023. p. 216.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 17. | | MELO, R. W. N.; ANDREANI, L.; RIBEIRO, J. A. de A.; ROCHA, T. L.; LAVIOLA, B. G.; RODRIGUES, C. M. Caracterização química e avaliação nematotóxica de extratos hidroetanólicos de Brassica carinata. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 7., 2023, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2023. p. 216.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 18. | | RICCI-SILVA, M. E.; NETO, J. C. R.; RIBEIRO, J. A. de A.; RODRIGUES, C. M.; ABDELNUR, P. V. Desenvolvimento de protocolo analítico para raízes de dendê utilizando UPLC-ESI-Q-TOF-MS In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 2., 2015, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2015. p. 84-85| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 20. | | NAKAI, D. K.; COSTA, P. P. K. G.; RIBEIRO, J. A. de A.; SOARES, I. P.; SALUM, T. F. C. Desenvolvimento de método de cromatografia líquida para identificação e quantificação simultânea dos principais produtos da transesterificação de óleo de soja. In: CONGRESSO DA REDE BRASILEIRA DE TECNOLOGIA E INOVAÇÃO DE BIODIESEL, 7., 2019, Florianópolis. Empreendedorismo e inovação: construindo um futuro competitivo para o biodiesel: anais. Florianópolis, SC: Rede Brasileira de Tecnologia e Inovação De Biodiesel, 2019. 157-158| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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